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Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.07 -0.18 -1.04 -1.72 -4.54 1.26 1.33 0.0 -0.07 -0.26 0.09 -0.25 -0.13 -0.16 0.26 0.12 0.34 0.1 -0.22 -0.82 -0.46 0.06
-2.45 - -0.17 -2.68 -4.85 2.33 2.04 - - -1.93 -3.03 -1.81 1.58 -3.09 0.2 -0.66 0.29 -1.06 -1.2 0.93 0.87 -2.7
-0.32 -0.36 -1.98 -4.48 -0.46 0.93 0.5 -0.68 -0.26 -0.7 -0.57 -0.49 0.41 -0.48 0.88 0.89 0.83 0.74 -0.11 0.01 0.29 -1.86
0.24 0.25 0.2 -4.46 -0.05 0.89 0.47 -0.05 0.06 -0.08 -0.03 -0.01 -0.18 -0.96 0.25 0.33 0.19 0.02 -0.19 -0.32 -0.28 -0.31
0.99 -0.56 -4.1 -6.14 -2.24 1.12 1.06 -1.38 0.84 -0.56 -0.62 0.32 0.62 -1.36 0.43 -0.11 0.59 0.42 -0.15 -0.25 0.15 -2.69
-0.0 -0.14 0.66 -5.23 -0.54 0.64 0.5 -0.33 0.43 -0.49 -0.36 0.44 -0.45 -0.41 0.17 0.2 0.36 0.43 -0.38 -0.46 -0.17 0.08
0.1 0.12 -2.24 -4.58 -0.39 0.6 0.54 -0.29 0.21 -0.08 0.01 0.1 -0.63 0.16 0.28 0.25 0.34 0.31 0.36 -0.21 -0.09 0.14
0.57 1.28 -1.71 -4.48 -2.72 1.34 0.81 -2.17 -0.47 -0.98 -0.82 -0.79 -0.99 -0.5 0.76 -0.03 0.39 0.63 1.02 -1.53 -1.45 0.28
0.68 -2.02 -4.75 -7.01 -8.48 1.67 1.42 0.32 -1.06 -0.35 -0.01 -0.24 0.83 0.19 -1.34 -0.65 -1.44 -1.59 - -0.39 0.64 1.56
0.51 -2.36 -2.09 -1.92 -6.29 0.98 0.62 -0.43 0.66 -0.32 -0.1 0.47 0.24 -0.06 0.18 -0.08 0.58 0.36 0.77 -1.35 -0.94 0.38
-0.48 -0.47 -3.07 -6.1 0.29 0.97 0.12 -0.52 -0.12 -0.47 -0.08 -0.36 -0.2 -0.04 0.53 0.48 0.58 0.49 0.0 0.39 0.35 -0.09
-0.38 -0.52 -0.34 -5.42 0.45 0.19 0.05 -0.11 0.4 0.0 -0.19 0.28 -0.7 -0.27 0.6 0.58 0.49 0.32 0.3 -0.75 -0.53 0.28
-0.3 -0.59 -2.06 -4.06 -0.1 1.13 0.68 -0.27 -0.11 -0.32 -0.26 -0.27 0.79 -0.92 0.12 0.15 -0.0 0.06 0.06 0.26 0.32 0.36
-2.38 -6.36 -10.17 -4.39 -1.51 1.54 1.77 -0.34 -0.7 -0.78 -0.34 -1.09 0.48 -0.57 0.65 0.37 0.87 0.64 0.07 -0.57 -0.42 0.05
-0.5 -0.88 -2.69 -5.06 0.15 0.97 0.6 -0.91 0.7 -0.73 -0.59 0.8 0.36 -1.03 0.34 0.23 0.17 0.25 0.04 0.11 0.41 -0.23
-0.22 -0.51 -1.84 -4.21 0.58 1.14 0.59 -0.91 0.08 -0.34 -0.29 -0.12 -0.64 -1.21 0.6 0.54 0.55 0.47 0.73 -0.17 -0.07 -1.35
0.19 -0.38 0.06 -5.21 -1.57 0.72 0.66 -0.15 -0.2 -0.28 -0.67 -0.27 -0.28 0.15 0.44 0.12 0.58 0.51 -0.06 -0.12 0.29 0.0
-0.28 -0.5 -0.39 -4.96 -0.48 0.45 0.57 -0.67 -0.13 -0.99 -0.66 -0.37 0.03 0.37 0.59 0.51 0.62 0.47 0.28 -0.08 0.13 0.31
0.02 0.03 -2.53 -5.27 -0.14 0.46 0.66 -0.28 0.39 -0.3 -0.12 0.42 -0.65 0.05 0.02 -0.11 0.11 -0.01 0.44 -0.04 -0.08 0.8
-0.13 -1.45 -5.36 -6.92 -1.5 0.9 0.36 -0.03 -0.06 0.69 0.01 -0.15 -0.47 -0.2 0.38 0.28 0.3 0.31 0.05 0.41 0.44 0.52
0.55 0.16 -3.73 -4.74 -9.39 0.89 0.91 -0.12 -0.23 0.01 -0.18 0.09 0.11 -0.05 0.32 0.48 0.45 0.51 0.01 -0.48 -0.25 -0.35
0.58 -0.21 -2.04 -5.28 0.3 0.72 -0.16 -0.23 -0.03 -0.51 -0.31 -0.22 -1.27 -0.08 0.62 0.65 0.74 0.73 0.47 -0.42 -0.41 -0.49
1.35 -0.61 -5.7 -2.03 -5.82 1.96 1.61 -1.6 1.15 -2.03 -1.11 -0.52 -0.25 -0.2 0.58 0.71 -0.19 -0.69 -5.18 -1.36 -0.57 -2.44
0.56 0.44 -0.09 -4.4 -0.21 0.79 -0.22 -0.43 -0.23 -0.19 -0.64 -0.01 -0.14 -0.43 0.54 0.38 0.44 0.33 -0.35 -0.22 -0.08 0.03
-0.49 -0.31 -1.26 -6.1 0.19 0.77 0.19 -0.26 0.04 -0.33 -0.57 -0.07 -0.88 -0.32 0.76 0.7 0.84 0.68 0.29 -0.21 -0.14 -0.45
-0.5 -0.4 0.06 -4.04 0.52 1.03 0.26 -0.83 -0.39 -1.33 -1.16 -0.67 0.14 -0.17 0.76 0.59 0.75 0.68 0.14 -0.52 -0.15 -0.34
-0.28 -0.75 -3.12 -5.45 0.13 0.84 -0.07 -0.29 0.17 -0.22 -0.22 0.09 0.0 -0.49 0.58 0.5 0.89 0.75 -0.06 0.02 0.19 -0.74
0.09 -0.31 -2.31 -5.42 0.4 0.59 -0.05 0.04 0.26 0.08 0.14 0.07 -0.97 -0.26 0.51 0.66 0.49 0.38 -0.7 -0.07 -0.04 0.13
0.12 -0.17 -2.86 -5.6 0.36 0.67 0.03 -0.28 0.05 0.11 -0.2 0.04 -0.85 -1.57 0.57 0.7 0.56 0.75 0.67 -0.45 -0.15 -0.39
-0.25 -0.42 -5.18 -5.7 -1.24 0.67 0.12 0.3 0.64 -0.37 -0.01 0.8 -1.04 0.38 0.04 -0.18 0.17 0.06 0.65 0.33 0.41 -0.09
0.81 -0.33 -3.7 -0.04 -0.02 1.29 1.74 -0.75 -0.01 -1.44 -0.87 -1.07 0.09 1.09 -1.66 -0.14 -0.14 -0.23 -0.45 -0.49 -0.78 -1.22
-0.27 -0.19 -4.42 -4.65 -8.54 1.1 0.36 0.07 -0.25 0.03 -0.06 0.11 -0.17 0.04 0.68 0.66 0.7 0.53 0.13 -0.29 -0.12 -0.26
0.1 -0.04 -0.59 -5.41 -0.16 0.48 0.19 0.15 -0.07 0.1 -0.02 -0.17 -0.83 0.22 0.32 0.13 0.31 0.22 0.13 0.07 -0.04 0.3
-0.37 -0.36 -0.06 -4.16 0.47 0.82 -0.08 0.07 0.04 0.1 -0.02 0.07 -0.64 -0.23 0.34 0.08 0.24 -0.05 0.08 0.02 0.19 -0.03
0.39 0.11 0.13 -2.61 -3.39 1.07 0.6 -0.22 -0.19 -0.14 -0.47 0.12 -0.26 0.42 0.37 -0.23 0.5 0.12 0.18 -0.86 -0.57 0.05
-0.47 0.13 0.61 -2.75 -2.24 0.81 0.71 -0.37 0.04 -0.88 -0.49 -0.21 0.15 0.39 0.06 0.2 0.18 0.2 -0.4 -0.06 0.1 0.39
-0.33 -0.45 -1.46 -4.31 -2.51 0.87 0.77 0.21 0.23 0.22 0.08 -0.08 0.14 -0.59 0.53 0.52 0.46 0.37 -0.07 -0.24 -0.17 -0.23
0.17 0.1 -0.39 -5.82 -0.89 0.72 0.72 -0.58 -0.09 -0.95 -0.6 -0.26 0.19 -0.21 0.56 0.45 0.6 0.5 0.16 -0.25 0.11 -0.4
-0.02 -0.5 -1.85 -5.03 -0.1 0.76 0.23 -0.78 0.68 -0.57 -0.42 0.78 0.78 -0.06 0.01 0.19 -0.1 -0.03 -0.17 0.52 0.47 -1.17
0.32 0.0 -0.95 -5.24 0.43 0.52 -0.11 -0.09 -0.11 -0.44 -0.5 -0.36 -1.23 -0.14 0.48 0.33 0.51 0.44 0.68 -0.07 0.05 0.07
0.16 -1.01 -0.36 0.11 -0.32 1.48 2.21 -1.35 - -1.53 0.48 - -0.27 1.66 -0.82 -0.48 -1.09 -0.98 -0.85 -1.73 -0.59 -1.36
-0.57 -0.6 -0.99 -4.2 0.68 1.2 0.1 -1.04 -0.08 -0.89 -0.88 -0.14 -0.04 -0.76 0.44 0.6 0.38 0.62 0.41 0.29 0.4 -0.81
-4.09 -3.72 -1.37 -4.5 -3.41 1.9 1.73 -0.93 0.46 -0.0 0.41 1.07 1.09 -2.13 0.29 -0.31 -1.16 -0.3 - -0.46 0.51 -2.48
0.31 -0.28 -2.49 -4.82 0.51 0.63 0.13 -0.36 -0.0 -0.32 -0.38 -0.43 -0.58 -0.71 0.85 0.81 0.78 0.67 -0.28 -0.13 0.06 -0.63
-0.17 -0.31 -1.29 -5.62 -0.34 0.49 -0.17 0.15 0.31 -0.44 -0.44 -0.19 -0.94 0.53 0.57 0.39 0.54 0.47 -0.05 0.33 0.38 -0.06
0.05 -0.25 -0.75 -3.08 0.48 0.44 -0.06 -0.13 -0.15 -0.09 -0.29 -0.43 -0.18 -0.27 0.45 0.45 0.62 0.38 0.08 -0.21 -0.03 0.29
0.23 -0.02 -2.39 -6.71 0.32 0.75 0.07 -0.49 0.18 -0.48 -0.51 0.1 -0.59 -0.8 0.61 0.59 0.68 0.66 0.15 -0.06 0.11 -0.44
-0.24 -0.12 -0.03 -5.05 -1.42 1.13 0.5 -1.11 -0.19 -0.43 -0.66 -0.39 0.66 -0.64 0.74 0.51 0.55 0.46 -1.26 0.23 0.69 -1.31
0.52 0.33 -0.58 -6.61 -1.46 0.9 0.92 -0.26 0.74 -0.64 -0.66 0.37 1.0 -1.84 -0.33 -0.52 -0.55 -0.28 -0.01 0.27 0.7 -1.59
0.47 -0.03 -1.45 -4.21 -0.5 0.7 0.73 -0.16 0.09 -0.17 0.3 0.02 -0.44 -0.06 0.46 0.31 0.18 0.18 0.06 -0.61 -0.31 0.06
0.1 0.05 -1.18 -5.12 -0.08 0.78 0.01 -0.22 0.23 -0.31 -0.3 0.05 -0.53 -0.27 0.54 0.48 0.58 0.55 0.16 -0.19 -0.13 -0.26
-4.04 -4.18 -3.73 0.35 -1.62 1.78 1.75 -3.57 0.37 - -3.32 -0.1 -0.46 -1.59 0.72 0.59 0.2 0.83 1.02 -0.98 -0.81 -0.41
0.38 0.24 -3.41 -4.65 -0.27 0.41 0.62 -0.26 0.36 -0.05 -0.25 0.18 -0.75 -0.19 0.42 0.57 0.46 0.37 0.4 -0.35 -0.29 -0.44
-0.37 -0.98 -4.23 -5.28 0.53 1.04 0.33 -0.54 -0.3 -0.79 -0.64 -0.52 -0.29 -0.38 0.92 0.76 0.99 0.86 -0.26 0.2 0.13 -1.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.