Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
6.97 2.28 0.0 0.93 0.03 2.41 4.45 0.87 4.21 2.39 2.09 5.27 0.93 1.31 0.97 0.65 2.22 3.8 0.0 1.31 1.49 1.97
43.9 135.39 155.76 3.22 22.83 89.18 198.05 27.83 220.74 37.2 37.79 275.7 201.26 149.85 42.5 46.75 57.46 54.62 87.44 124.42 141.03 17.07
2.36 1.62 0.0 0.4 0.01 2.73 3.67 0.95 2.49 1.54 2.2 1.24 0.58 11.55 1.11 0.3 2.59 0.97 0.0 0.24 1.24 0.66
3.47 3.75 5.87 4.28 0.01 2.86 6.82 0.96 0.69 1.24 1.1 1.6 0.77 10.44 0.88 0.4 1.92 1.09 1.4 0.11 0.25 5.93
64.01 59.74 0.04 0.66 0.02 24.27 34.79 24.26 21.98 35.34 32.17 37.23 5.05 175.07 11.85 14.37 14.99 11.49 13.53 8.92 10.01 20.31
9.96 7.45 0.0 0.18 0.0 7.01 17.16 4.55 2.92 4.81 3.57 4.43 0.69 53.41 1.68 0.36 4.58 1.91 0.17 0.27 1.29 13.64
2.45 1.08 0.06 0.56 0.01 1.94 2.54 1.07 0.95 0.98 0.84 0.75 0.56 7.2 1.33 1.08 1.7 1.36 1.81 0.12 0.65 3.47
2.32 1.35 1.15 0.6 0.11 1.21 1.2 0.71 0.8 0.89 0.56 0.91 0.4 4.13 1.18 0.48 1.29 1.04 2.47 0.88 0.92 3.95
0.39 0.49 0.0 0.31 0.0 0.07 0.39 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.04 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.25 1.02 0.0 0.14 0.1 0.6 1.93 0.51 0.47 0.47 0.52 0.32 0.22 5.22 0.2 0.04 0.52 0.35 0.45 0.28 0.29 1.72
0.07 0.0 0.0 0.41 0.03 0.4 0.72 0.0 0.0 0.0 0.02 0.21 0.05 3.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.33
1.28 2.05 0.0 0.39 0.04 1.33 3.42 0.62 0.51 1.02 0.79 0.64 0.13 10.54 0.46 0.12 1.0 0.75 0.08 0.29 0.33 4.5
0.63 0.27 0.83 0.3 0.0 0.37 1.03 0.19 1.29 0.07 0.13 1.86 0.19 2.32 0.02 0.07 0.28 0.07 0.0 0.17 0.06 0.04
1.87 2.46 0.81 1.17 0.0 1.03 1.56 0.55 0.0 0.41 0.25 0.85 0.6 5.36 0.66 0.55 0.99 0.7 1.95 0.49 0.47 1.37
1.13 1.96 0.02 0.3 0.0 0.72 1.65 0.38 0.36 0.47 0.42 0.38 0.12 4.37 0.49 0.39 0.69 0.52 0.39 0.13 0.12 0.96
5.9 3.59 0.0 0.68 0.0 2.77 4.76 0.86 1.64 1.26 1.8 1.29 0.31 29.07 0.31 0.2 1.66 0.07 0.0 0.23 0.6 2.05
2.18 1.52 0.28 0.21 0.0 1.14 0.77 0.22 0.49 0.47 0.44 1.18 0.28 1.73 1.05 0.69 0.87 0.68 2.17 0.45 0.38 0.51
17.46 14.49 0.67 2.99 1.8 11.52 21.41 5.37 12.1 10.04 9.7 11.85 3.37 54.23 5.05 2.33 6.75 5.95 5.26 2.54 3.44 14.71
4.16 7.04 0.04 0.61 0.18 6.73 13.9 3.63 2.81 2.79 3.57 3.09 0.98 38.74 1.75 0.4 4.79 2.58 0.0 0.46 0.67 6.55
0.65 0.42 0.04 0.52 0.01 1.31 2.9 0.43 0.36 0.29 0.4 0.34 0.17 13.15 0.09 0.1 0.62 0.29 0.0 0.14 0.17 1.56
0.47 0.29 0.0 0.5 0.0 0.17 0.32 0.04 0.16 0.08 0.03 0.09 0.06 1.03 0.15 0.06 0.11 0.09 0.37 0.03 0.01 0.65
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.74 0.83 0.0 0.45 0.0 0.22 0.76 0.0 0.02 0.0 0.1 0.06 0.04 0.43 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01
0.74 0.83 0.0 0.45 0.0 0.22 0.76 0.0 0.02 0.0 0.1 0.06 0.04 0.43 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01
0.25 1.65 0.0 0.59 0.0 1.67 2.31 0.5 2.02 0.62 0.59 1.02 0.59 10.39 0.18 0.03 0.58 0.27 0.0 0.21 0.19 0.17
11.66 10.99 0.12 0.33 0.04 6.87 6.05 2.31 2.39 2.15 2.12 3.62 1.26 21.24 2.75 2.63 3.25 2.97 3.11 0.54 0.81 2.31
29.1 20.29 0.0 1.63 0.01 9.43 26.66 3.68 4.1 7.63 5.09 1.08 1.75 107.82 2.78 0.54 6.77 3.26 0.0 0.88 0.99 7.36
7.96 8.99 3.87 0.29 0.0 2.37 4.47 1.08 1.07 1.46 1.29 0.89 0.46 7.84 0.63 0.29 1.36 0.67 0.0 0.21 0.27 0.48
3.38 2.04 0.03 0.18 0.01 2.1 1.14 0.53 0.54 0.92 0.7 0.73 0.49 3.41 2.99 1.9 2.79 2.41 3.82 0.15 0.29 1.82
2.4 2.14 0.12 0.33 0.01 1.45 1.55 0.95 0.61 0.83 1.02 0.79 0.37 6.03 2.4 1.42 1.78 1.62 6.48 0.96 0.9 0.53
4.03 8.76 0.0 2.43 0.0 4.69 2.01 1.14 2.2 2.23 1.48 2.65 1.26 17.14 3.24 2.91 3.94 4.17 3.2 0.68 0.97 1.68
14.79 2.42 0.07 0.17 0.16 4.86 9.22 0.33 0.32 0.84 0.3 0.46 4.42 9.01 0.25 0.17 0.51 0.68 0.24 1.21 3.27 0.0
0.01 0.9 0.0 0.58 0.0 0.22 2.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.53
0.03 0.9 0.03 0.73 0.0 0.22 3.15 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 5.86 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
20.44 11.28 0.65 0.52 0.03 13.76 33.77 3.06 4.23 3.26 3.11 3.66 3.4 55.46 3.1 0.61 6.82 3.82 0.13 1.63 1.68 4.31
11.71 16.83 0.0 1.0 0.01 6.02 16.13 5.35 29.24 6.85 6.06 25.92 4.4 57.78 2.11 0.76 5.17 3.65 0.19 3.12 2.29 2.33
5.58 3.39 0.02 0.8 0.04 1.72 3.76 1.1 3.19 0.99 1.37 4.47 0.9 23.04 0.0 0.03 0.14 0.0 0.0 0.43 0.92 0.41
0.75 1.13 0.0 1.13 0.0 1.69 2.63 0.6 0.26 0.51 0.53 0.5 0.15 7.75 0.44 0.04 0.71 0.45 0.09 0.15 0.34 0.47
5.51 4.03 0.46 0.4 1.2 1.96 2.35 1.05 0.91 0.79 0.74 1.29 0.49 5.31 2.46 1.63 2.32 1.87 4.42 0.7 0.55 3.75
8.04 5.33 0.0 0.59 0.04 2.57 5.39 1.3 0.8 0.98 0.85 1.83 0.54 7.69 0.92 0.46 2.38 1.04 0.0 0.24 0.18 2.03
3.7 0.96 0.0 0.61 0.1 2.86 6.76 0.23 3.27 1.0 0.26 3.66 0.44 7.23 2.89 1.62 2.54 3.41 1.24 0.56 0.6 1.6
8.61 5.64 0.0 0.27 0.0 10.69 16.33 1.04 3.16 2.08 1.67 5.01 2.19 65.77 0.69 0.48 2.7 1.92 0.0 0.61 1.18 2.6
1.38 3.24 0.0 1.08 0.01 3.0 7.8 1.51 2.01 1.75 2.12 1.76 0.78 20.76 1.1 0.38 1.68 1.15 0.27 0.14 0.65 2.95
21.39 29.41 0.14 0.97 0.0 17.92 46.54 9.93 7.42 10.01 8.59 8.2 4.03 139.81 4.04 0.62 12.33 5.74 0.61 1.89 3.16 16.13
9.84 11.86 28.71 0.39 1.85 9.53 24.49 11.59 25.41 6.57 6.18 21.95 9.9 45.83 4.38 3.79 5.25 4.36 2.82 17.6 15.78 3.6
6.35 7.27 0.0 1.08 0.04 6.81 23.41 2.88 2.64 2.75 2.42 2.59 1.62 44.35 1.49 0.3 4.32 2.33 0.04 0.85 1.12 3.6
0.33 0.04 0.03 0.43 0.05 0.67 1.34 0.11 0.05 0.28 0.06 0.26 0.45 5.75 0.02 0.0 0.22 0.03 0.0 0.29 0.33 0.03
4.13 2.3 0.0 0.5 1.87 3.96 5.96 3.86 0.65 4.08 2.64 1.06 6.62 5.2 1.92 1.9 2.24 1.58 1.0 2.45 5.73 2.09
8.88 2.97 0.0 0.37 0.0 4.14 4.5 3.13 4.08 3.51 2.54 4.63 1.09 13.39 1.7 0.32 3.93 2.01 0.0 0.31 0.15 3.41
0.42 0.07 0.0 0.15 0.0 0.44 0.64 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.31 2.23 0.14 0.0 0.43 0.07 0.13 0.36 0.24 0.28
1.04 0.09 0.0 0.43 0.0 1.39 6.55 0.0 0.21 0.22 0.0 0.23 0.38 17.83 0.13 0.05 0.42 0.0 0.0 0.1 0.13 0.0
10.16 9.97 0.2 0.01 0.0 5.17 10.01 2.94 2.13 2.74 2.31 1.53 1.68 35.03 2.03 0.52 4.69 2.72 0.0 0.7 0.71 3.4
23.39 26.09 0.0 0.39 0.0 9.68 23.42 6.76 4.65 5.81 5.69 4.56 2.69 69.37 2.13 0.38 5.21 3.21 0.45 0.93 2.02 7.98
8.93 5.38 0.0 1.07 0.0 2.58 7.62 0.58 0.77 0.59 0.52 1.53 0.34 27.1 0.42 0.21 1.52 0.28 0.0 0.01 0.65 1.44
10.7 6.15 0.0 0.04 0.0 2.62 11.52 0.65 2.31 1.42 0.71 1.12 0.95 75.02 0.31 0.06 1.37 0.7 0.0 0.43 0.58 1.31
7.95 11.5 0.0 0.28 0.0 11.42 25.65 4.14 4.06 4.96 3.49 8.32 4.19 51.1 2.13 0.18 4.6 2.26 0.06 2.05 3.36 1.71
7.64 15.47 0.0 0.46 0.03 13.17 30.26 3.62 4.63 4.77 3.89 5.94 3.17 53.49 2.94 0.27 7.64 4.86 0.06 1.53 2.73 4.73
0.92 0.21 0.04 0.26 0.01 1.23 1.67 0.09 0.88 0.39 0.22 0.59 0.46 11.32 0.12 0.14 0.87 0.06 0.0 0.31 0.47 0.05
1.25 0.0 0.0 0.08 0.02 0.1 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.11 0.0 0.0 0.19 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0
43.74 53.52 69.53 1.91 27.16 51.44 109.7 41.55 78.39 38.05 44.09 78.41 58.64 78.22 32.06 28.75 33.9 32.37 40.01 36.91 38.13 21.48
3.26 1.2 0.0 0.47 0.24 1.5 3.03 0.61 1.06 1.17 0.65 0.77 0.93 7.78 0.36 0.32 1.0 0.19 0.0 0.45 1.09 0.34
0.73 0.62 0.0 1.0 0.0 1.0 1.82 0.83 0.23 0.26 0.52 0.89 0.39 9.19 0.71 0.11 0.93 0.47 0.0 0.23 0.71 0.48
6.43 4.3 2.49 0.55 1.07 3.81 3.61 3.63 4.06 3.51 2.98 4.82 2.02 14.23 4.88 3.1 4.39 4.28 10.07 2.85 2.57 7.92
3.97 4.7 0.05 0.86 0.07 8.28 20.32 2.11 1.38 3.0 2.5 1.72 3.07 64.88 2.13 0.46 4.87 2.47 0.18 1.09 2.16 3.22
3.72 4.33 1.43 1.68 0.05 1.1 4.15 0.54 0.48 0.56 0.67 0.43 0.67 2.0 1.88 1.98 0.77 0.75 0.08 0.56 0.82 0.89
51.05 50.05 0.22 0.6 0.0 26.01 60.7 18.99 8.9 25.82 21.56 12.41 6.55 181.84 5.47 1.43 12.93 10.27 3.13 2.53 4.8 63.47
120.49 14.17 0.26 0.91 3.79 101.24 52.52 47.52 37.99 46.28 48.03 42.1 61.43 271.34 112.4 80.52 122.83 118.24 83.98 100.3 92.36 35.76
48.03 31.81 2.89 0.91 0.08 15.15 11.33 8.75 9.13 7.94 6.97 13.15 2.87 94.46 22.48 17.33 12.91 10.08 31.18 4.83 4.85 14.82
1.37 1.39 0.0 0.24 0.06 0.98 1.66 0.37 0.66 0.6 1.07 0.25 0.48 1.2 0.72 0.49 0.46 0.77 0.1 0.26 0.17 0.14
2.64 3.08 0.3 0.55 0.0 2.91 7.22 1.45 0.88 1.1 1.13 1.16 0.63 21.25 0.83 0.13 2.21 1.42 0.02 0.21 0.56 3.13
9.82 3.39 0.06 0.77 0.0 2.45 7.11 1.0 1.15 1.12 0.98 1.23 0.5 30.42 0.3 0.13 2.07 0.49 0.0 0.3 0.68 1.26
0.82 1.69 0.02 0.53 0.01 0.32 2.32 0.05 0.6 0.04 0.04 0.5 0.16 3.87 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
1.78 1.96 0.0 5.54 0.0 5.2 12.98 2.49 1.93 2.68 2.98 2.76 1.26 55.53 1.08 0.32 2.85 1.62 0.26 0.67 0.44 6.78
22.45 38.32 0.0 0.57 0.01 16.59 39.87 2.62 15.05 6.93 4.15 12.36 15.66 47.43 12.05 10.21 9.27 9.49 0.53 4.22 5.57 8.66
0.91 0.9 0.0 0.43 0.0 0.72 1.11 0.2 0.22 0.21 0.19 0.32 0.14 6.21 0.12 0.07 0.48 0.25 0.06 0.11 0.1 0.2
26.47 5.6 0.0 0.85 0.01 10.0 23.77 5.56 7.03 4.74 6.47 9.39 8.68 8.08 0.47 0.49 2.41 0.37 0.0 5.94 9.23 3.3

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)