Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
2.52 2.92 2.04 0.39 1.46 3.11 3.23 2.66 2.09 2.43 2.25 2.8 2.04 10.82 1.23 1.18 1.77 1.59 2.69 1.63 1.85 5.1
0.0 0.48 1.96 0.43 0.21 10.26 0.67 1.12 1.43 1.24 0.89 1.37 1.27 2.27 4.03 0.91 2.52 3.37 0.53 0.56 0.0 0.0
0.01 0.07 0.07 0.68 0.0 65.74 16.16 0.23 191.21 6.49 35.3 44.21 60.54 17.37 0.15 0.09 0.18 0.54 0.05 12.94 1.29 0.0
88.4 100.65 32.81 15.44 17.8 113.13 24.34 109.37 174.78 93.16 88.14 217.34 107.68 385.25 48.99 52.22 46.23 47.95 40.31 180.64 144.97 124.92
0.25 0.4 0.04 0.41 0.0 63.08 18.44 3.72 37.07 9.72 5.97 55.11 7.89 9.21 33.01 20.84 36.7 36.82 3.19 11.07 11.04 3.12
0.12 0.0 0.0 1.06 0.04 2.29 0.41 0.0 2.78 1.46 0.58 1.61 0.53 1.24 1.59 1.04 2.39 1.21 0.41 0.87 0.49 0.29
0.52 0.0 0.0 0.64 0.03 0.47 0.04 0.44 0.21 0.37 0.09 0.41 0.0 0.28 0.0 0.08 0.21 0.06 0.0 0.0 0.0 0.11
1.19 0.3 0.0 0.55 2.09 3.56 2.17 0.87 9.87 3.67 3.64 10.47 2.25 1.68 0.04 0.03 0.07 0.0 0.33 0.26 0.5 1.57
0.68 0.15 0.09 0.87 0.04 1.59 1.48 0.8 0.64 1.3 1.34 0.97 2.05 3.99 1.21 0.43 1.02 1.42 0.13 0.86 1.7 2.09
3.54 4.27 7.9 0.2 0.01 6.27 4.81 1.23 0.34 0.9 0.57 2.32 1.7 7.86 0.7 0.9 1.12 0.94 6.35 1.49 1.52 2.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.02 0.75 0.0 0.73 0.09 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 3.61 0.23 0.22 0.05 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.05 0.03 0.2 0.05 3.05 1.21 1.2 1.04 2.79 2.37 1.24 0.51 4.98 2.73 2.03 3.36 3.39 6.41 0.37 0.53 1.74
0.16 0.05 0.03 0.2 0.05 3.05 1.21 1.2 1.04 2.79 2.37 1.24 0.51 4.98 2.73 2.03 3.36 3.39 6.41 0.37 0.53 1.74
0.16 0.05 0.03 0.2 0.05 3.05 1.21 1.2 1.04 2.79 2.37 1.24 0.51 4.98 2.73 2.03 3.36 3.39 6.41 0.37 0.53 1.74
11.11 7.95 0.06 0.44 0.11 32.67 19.48 5.22 4.88 9.51 7.78 13.62 6.64 129.13 10.87 6.19 11.69 7.09 41.2 3.5 7.51 14.66
0.13 0.09 0.0 0.23 0.08 1.08 0.66 0.11 0.77 0.39 0.33 0.69 0.39 3.91 0.62 0.34 0.74 0.73 0.27 0.3 0.32 0.19
4.57 2.95 1.6 1.11 0.82 7.05 7.17 2.69 2.65 1.96 2.37 4.06 2.48 32.66 4.91 6.05 7.04 5.95 2.13 3.24 2.67 7.45
0.12 0.11 0.0 1.86 0.0 8.01 1.96 0.79 0.88 2.4 1.15 1.78 2.57 21.63 6.22 4.57 6.22 4.98 3.85 0.82 1.78 0.0
0.02 0.8 0.17 1.26 0.45 42.77 16.67 2.11 8.15 2.33 1.57 7.01 25.56 136.76 23.82 15.69 20.66 20.05 21.9 9.16 9.47 9.79
0.0 0.0 0.0 1.02 0.0 0.28 0.06 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.25 0.55 0.09 0.09 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.07 0.0 2.05 0.03 147.59 25.48 38.94 56.62 59.84 48.02 59.85 57.24 346.19 101.55 77.18 106.94 121.16 145.21 25.47 30.17 40.01
1.93 1.7 1.13 1.46 1.05 2.32 1.39 1.47 2.63 1.8 1.85 2.53 0.6 2.69 1.11 1.02 1.07 0.96 1.05 1.91 2.33 3.26
0.91 0.48 0.0 0.64 0.15 25.27 14.41 6.48 2.57 9.16 5.38 7.21 5.49 140.16 19.61 15.83 20.43 18.6 25.55 1.86 2.9 41.83
0.01 0.0 0.0 0.9 0.0 1.12 0.01 0.0 0.0 0.06 0.11 0.0 0.79 4.82 0.37 0.11 0.05 0.05 0.0 0.54 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.63 0.58 4.13 0.52 0.07 13.74 1.65 3.77 6.01 5.95 4.8 13.23 2.57 20.65 7.87 5.4 13.7 8.69 4.12 3.38 7.6 2.45
0.0 0.0 0.0 0.78 0.26 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 0.7 0.33 0.88 0.16 3.17 0.98 0.0 0.36 0.48 0.0 0.34 0.78 5.7 0.6 0.93 0.24 1.28 1.05 0.29 0.0 0.18
2.64 0.0 0.0 3.98 1.6 93.82 71.39 16.76 0.0 38.54 40.63 42.02 92.77 344.88 39.71 18.69 42.19 32.05 36.24 47.48 19.31 22.69
1.91 0.01 0.02 0.3 0.0 3.61 6.0 0.12 1.19 0.2 0.45 0.61 10.17 2.83 0.06 0.05 0.29 0.24 0.29 3.39 0.52 1.15
0.01 0.01 0.0 0.7 0.12 0.22 0.61 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 1.73 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0
0.08 0.12 0.12 0.56 0.02 2.69 2.19 0.15 0.68 0.18 0.5 1.08 2.27 7.17 0.26 0.21 0.41 0.39 0.8 2.03 1.35 0.04
0.02 0.0 0.0 0.63 0.35 0.37 0.21 0.02 0.04 0.02 0.02 0.04 0.66 3.55 0.0 0.0 0.03 0.03 0.15 0.27 0.18 0.15
1.25 0.15 0.06 1.73 1.09 5.07 3.96 2.1 7.16 5.43 9.45 5.0 3.82 18.34 0.07 0.0 0.13 0.0 0.0 0.76 1.13 1.32
6.76 1.07 0.0 0.84 4.34 110.84 55.76 0.0 0.0 0.0 6.65 0.0 23.09 313.36 54.54 28.72 46.54 40.8 6.07 7.6 14.27 0.0
0.58 1.26 0.2 1.0 0.06 18.84 7.57 3.55 5.93 5.47 5.23 12.54 6.42 57.43 13.59 8.23 16.46 16.59 0.31 3.56 6.84 6.86
0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.25 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.23 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.15 0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.25 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.23 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.15 0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.1 0.22 0.2 0.73 0.0 0.42 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.06 0.0 0.01 0.05 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0
1.24 0.47 0.04 0.88 0.77 2.06 0.98 1.48 3.84 0.9 1.72 3.46 1.05 6.35 1.29 1.01 1.35 0.94 2.23 1.36 1.52 1.23
0.55 0.21 0.09 0.81 0.19 0.86 0.6 0.49 1.04 0.52 0.67 1.34 0.91 4.1 0.29 0.23 0.18 0.4 0.58 0.48 0.23 0.81
0.63 0.0 0.0 0.38 0.0 11.5 8.21 6.77 12.45 11.24 5.68 21.54 5.09 13.88 12.19 0.68 7.22 6.43 0.62 7.45 14.34 1.15
0.08 0.07 0.0 0.27 0.01 20.47 3.99 1.31 3.76 3.36 3.28 11.16 4.09 86.55 5.5 1.8 6.47 4.75 6.46 1.66 2.75 1.23
5.25 2.29 0.0 0.33 0.0 8.12 6.05 1.04 9.23 1.86 2.4 10.91 2.31 26.49 1.67 1.17 6.26 0.71 0.06 1.02 1.77 1.31
0.08 0.05 0.0 0.47 0.01 1.49 0.49 0.3 0.34 0.41 0.41 0.65 0.61 3.01 1.09 0.73 0.99 0.85 1.34 0.49 0.67 0.92
0.01 0.0 0.02 0.42 0.0 0.36 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 2.9 0.05 0.0 0.41 0.34 0.0 0.01 0.06 0.01
0.01 0.0 0.0 0.41 0.0 0.14 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.2 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25
0.0 0.0 0.04 0.25 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
13.2 20.73 27.38 5.79 6.54 22.14 17.02 10.5 12.66 13.08 10.39 18.86 7.34 71.85 5.82 6.4 7.73 5.56 20.45 10.9 17.54 18.38
0.01 0.07 0.07 0.68 0.0 65.74 16.16 0.23 191.21 6.49 35.3 44.21 60.54 17.37 0.15 0.09 0.18 0.54 0.05 12.94 1.29 0.0
0.45 0.36 0.13 0.33 0.18 1.52 0.94 0.19 0.26 0.6 0.43 0.41 0.81 4.27 1.06 0.75 0.92 0.88 1.52 0.38 0.23 0.58
0.9 0.12 0.0 0.97 0.18 6.06 0.69 0.56 2.87 2.7 1.51 1.36 0.06 1.67 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 50.53 26.63 0.46 6.11 1.01 0.69 9.92 8.28 145.38 22.9 10.37 28.53 22.53 0.85 3.97 5.99 2.7
0.35 0.04 0.0 0.47 0.02 0.22 0.27 0.14 0.02 0.11 0.12 0.05 0.07 0.33 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.08 0.1 0.23
0.47 0.04 0.1 0.49 0.0 21.78 11.87 1.08 7.62 0.73 0.1 8.33 3.37 0.69 2.2 1.42 3.31 0.54 0.0 1.97 4.9 0.16
4.48 2.96 1.82 0.53 0.08 36.68 39.73 28.57 41.73 27.06 18.27 49.12 6.95 9.14 40.66 29.33 41.62 33.04 8.13 24.35 21.7 39.8
13.77 4.37 0.31 0.4 0.02 136.49 186.11 32.53 124.53 35.61 33.54 164.16 45.01 8.76 106.23 77.61 123.17 74.34 2.6 25.63 34.91 24.79
8.21 3.42 0.13 0.81 0.04 109.32 85.07 24.64 82.25 20.14 11.01 113.53 34.67 5.24 85.74 60.52 88.63 54.98 0.9 20.38 30.85 6.67
11.26 7.69 0.03 0.8 0.0 92.78 65.97 20.87 56.19 27.07 16.22 70.39 24.07 7.31 73.81 49.96 92.61 59.95 1.48 14.8 19.33 20.82
7.31 4.73 0.79 1.27 2.52 28.54 10.75 16.46 18.36 13.86 15.76 50.58 4.67 67.69 9.96 13.78 7.07 6.07 31.05 8.52 7.67 19.49
0.38 0.36 0.12 0.62 0.01 1.34 0.57 0.77 0.62 0.37 0.0 0.82 0.09 2.92 0.59 0.14 0.27 0.38 0.31 1.92 1.31 0.11
50.04 0.0 0.0 3.02 0.05 86.84 122.12 0.0 0.0 0.0 0.0 6.69 25.83 88.15 113.12 75.99 104.43 69.27 0.0 3.51 10.84 0.0
0.0 0.0 0.0 0.73 0.43 221.06 24.02 15.03 0.0 40.63 5.51 20.08 80.31 233.65 91.04 75.34 148.38 102.52 0.0 33.94 22.98 0.0
0.31 0.0 0.0 1.29 4.29 14.88 0.07 0.34 1.34 1.45 0.28 1.94 2.67 106.67 6.5 2.65 5.96 2.37 0.5 1.88 5.35 6.63
0.0 0.0 0.0 0.32 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.05 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
12.58 21.24 15.87 0.61 15.61 57.6 28.92 19.02 28.69 30.07 26.59 47.51 32.64 204.25 39.3 29.91 37.55 42.73 56.74 33.39 26.4 31.62
0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.0 0.0 0.98 0.0 0.29 0.7 0.29 0.0 0.47 0.69 0.0 1.1 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.58
1.79 0.22 0.0 0.85 0.0 84.2 25.23 10.8 3.61 9.9 3.13 2.85 20.09 3.76 4.25 12.4 17.57 31.95 0.12 14.04 25.84 0.09
0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 3.69 3.45 0.57 2.17 0.5 0.67 4.18 0.95 1.29 0.38 1.0 1.26 1.84 2.4 0.22 0.48 0.56
0.66 0.05 0.07 1.2 0.06 3.53 0.06 1.32 30.56 7.59 7.72 26.07 0.1 1.23 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.04 0.07 0.0
0.66 0.05 0.07 1.2 0.06 3.53 0.06 1.32 30.56 7.59 7.72 26.07 0.1 1.23 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.04 0.07 0.0
5.02 1.09 0.12 1.82 1.8 11.9 0.1 4.09 58.66 20.35 25.36 66.02 0.32 5.87 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.08 0.07 0.26

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)