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Heatmap: Cluster_74 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.32 0.76 1.3 -6.03 -1.57 -0.16 -0.24 0.12 0.58 -0.17 -0.14 0.69 -0.83 -0.03 -0.54 -0.54 -0.56 -0.69 -1.21 0.77 0.67 -0.79
0.94 1.13 2.04 -4.38 -0.43 0.22 0.09 -0.18 -0.46 -0.39 -0.28 -0.57 -1.11 -0.81 -0.49 -0.51 -0.47 -0.63 0.01 -0.87 -0.57 -0.24
1.01 0.65 1.47 -4.56 -0.63 0.29 0.47 -0.69 -0.35 -0.58 -0.75 -0.23 -0.54 0.68 -0.46 -0.4 -0.55 -0.57 -0.68 -0.26 -0.35 0.54
1.01 0.65 1.47 -4.56 -0.63 0.29 0.47 -0.69 -0.35 -0.58 -0.75 -0.23 -0.54 0.68 -0.46 -0.4 -0.55 -0.57 -0.68 -0.26 -0.35 0.54
0.9 0.93 1.64 -4.51 -0.82 0.14 0.22 0.07 -0.18 -0.1 -0.19 -0.21 -0.67 0.04 -0.4 -0.54 -0.94 -1.07 -0.27 -0.33 -0.34 0.16
0.78 1.23 1.72 -5.34 -0.54 -0.02 0.07 0.18 -0.06 -0.18 -0.12 -0.32 -1.77 -0.21 -0.26 -0.37 -0.44 -0.32 -0.41 -0.56 -0.7 -0.22
0.41 0.83 1.39 -5.23 -0.17 -0.02 -0.09 0.31 -0.02 0.3 0.33 0.04 -1.2 -0.14 -0.74 -0.77 -0.72 -0.7 -0.29 -0.38 -0.4 0.67
0.87 1.2 1.48 -3.59 -1.18 0.29 0.32 -0.15 0.1 -0.58 -0.57 0.2 -1.16 -0.31 -0.26 -0.23 -0.32 -0.27 -0.11 -0.35 -0.39 -0.81
1.2 0.83 1.78 -3.38 -0.07 0.24 -0.71 -0.28 0.21 -0.66 -0.62 0.14 -1.4 -0.46 -0.77 -0.37 -0.72 -1.11 -0.7 0.05 -0.14 0.24
0.85 0.81 1.63 -3.79 0.09 0.01 0.6 -0.54 -0.26 -0.83 -0.79 0.01 -0.93 -0.41 -0.62 -0.13 -0.56 -0.57 -0.18 -0.35 -0.19 0.36
0.32 1.25 1.47 -5.05 -1.12 0.14 0.09 0.07 0.41 -0.22 -0.16 0.3 -1.04 -0.18 -0.4 -0.62 -0.81 -0.49 -0.08 -0.21 0.05 -0.55
1.2 1.35 1.74 -3.21 -1.93 0.27 0.55 -0.37 -0.24 -0.44 -0.48 0.02 -0.82 -1.06 -0.42 -0.51 -0.36 -0.37 -0.31 -0.84 -0.57 -0.75
0.74 0.83 1.31 -4.39 -0.64 0.14 -0.08 0.36 -0.14 0.16 0.29 -0.23 -1.38 -0.32 -0.69 -0.61 -0.5 -0.58 0.24 -0.26 -0.36 0.41
0.98 0.84 1.02 -3.78 -0.33 0.33 0.0 -0.01 -0.53 -0.45 -0.37 -0.25 -0.24 0.01 -0.4 -0.41 -0.3 -0.34 0.24 -0.1 0.15 -0.23
0.83 0.98 1.83 -2.05 -0.45 -0.01 0.06 -0.18 -0.12 -0.62 -0.14 -0.29 -0.96 -0.35 -0.58 -0.27 -0.54 -0.5 -0.43 -0.23 -0.15 -0.27
0.69 0.98 1.5 -3.27 -1.02 -0.01 0.12 0.12 0.05 0.01 -0.12 0.13 -2.01 0.08 -0.52 -0.53 -0.29 -0.43 -0.11 -0.73 -0.67 0.44
0.78 0.79 1.57 -5.44 -0.75 -0.12 0.46 -0.05 0.3 -0.41 -0.06 0.22 -0.54 -1.09 -0.42 -0.39 -0.46 -0.31 -0.38 -0.2 -0.08 -0.29
0.88 0.68 0.41 -3.88 -0.12 0.42 0.05 0.2 -0.12 -0.3 -0.22 0.19 -0.75 -0.02 -0.3 -0.31 -0.25 -0.19 0.3 0.13 0.04 -0.42
1.0 1.18 1.41 -3.5 -0.39 0.3 0.26 -0.13 -0.58 -0.34 -0.56 -0.7 -1.38 -0.34 0.25 0.24 -0.46 -0.42 -0.47 -0.58 -0.22 -0.27
0.54 0.86 1.57 -4.39 -0.69 0.06 0.45 -0.12 0.21 -0.14 -0.03 0.29 -0.7 -0.18 -0.75 -0.82 -0.87 -0.79 -0.46 -0.22 -0.2 0.34
0.31 0.78 1.48 -6.15 -0.67 -0.03 0.33 0.11 0.08 -0.07 0.08 -0.06 -1.07 0.08 -0.62 -0.63 -0.54 -0.59 -0.07 -0.28 -0.32 0.61
0.96 1.01 1.77 -3.88 -2.79 0.21 0.81 -0.3 0.09 -0.85 -0.46 -0.13 -0.32 -0.08 -0.75 -0.61 -0.8 -0.65 -0.76 -0.44 -0.21 0.06
0.65 1.0 1.83 -3.02 -0.86 0.31 0.45 -0.4 0.24 -0.99 -0.82 0.13 0.16 -0.42 -0.87 -0.68 -0.67 -0.55 -0.49 -0.12 -0.15 -0.71
0.17 1.11 1.75 -3.6 -1.26 0.24 0.28 -0.17 0.52 0.1 0.4 0.34 -0.79 -0.17 -0.98 -0.83 -0.64 -0.93 -0.46 -0.4 -0.58 -0.67
1.0 1.44 1.84 -2.92 -0.71 -0.02 -0.45 0.28 -0.04 -0.21 -0.09 0.03 -1.25 -0.3 -0.88 -1.38 -1.06 -1.13 -1.04 -0.28 -0.25 -0.05
0.44 0.61 1.38 -4.26 -1.01 0.03 -0.09 0.26 0.3 0.21 0.3 0.34 -1.2 -0.05 -0.66 -0.72 -0.57 -0.74 -0.45 -0.09 -0.3 0.62
0.37 0.86 1.69 -4.74 -0.57 0.06 0.08 -0.09 0.1 0.34 0.33 0.14 -1.09 -0.25 -0.87 -0.81 -0.79 -0.9 -0.26 -0.48 -0.6 0.55
0.47 0.26 1.02 -2.03 -0.86 0.13 -0.26 -0.06 0.52 -0.14 -0.17 0.42 -0.4 0.74 -0.36 -0.31 -0.26 -0.46 -0.16 -0.17 -0.12 -0.25
0.75 0.74 1.61 -3.03 -0.23 0.09 0.46 -0.27 0.08 -0.51 -0.19 -0.19 -0.85 0.17 -0.35 -0.47 -0.61 -0.6 -0.28 -0.41 -0.25 -0.09
0.59 1.07 1.25 -4.27 -0.05 0.19 0.6 -0.17 0.11 -0.57 -0.21 -0.01 -0.6 -0.42 -0.65 -0.61 -0.62 -0.64 0.33 -0.22 -0.14 -0.3
0.57 1.25 1.93 -2.68 -0.22 0.0 0.02 -0.08 -0.06 -0.46 -0.35 0.08 -0.55 -0.54 -1.1 -1.5 -1.21 -1.16 -1.58 0.28 0.44 -0.25
0.69 0.57 1.29 -2.29 -0.22 0.35 0.1 -0.65 0.14 -0.91 -0.71 0.18 -0.43 0.74 -0.5 -0.54 -0.33 -0.52 0.31 -0.66 -0.48 0.19
0.26 0.84 1.64 -4.73 -0.32 -0.04 0.08 0.15 0.13 0.12 -0.04 0.26 -0.91 -0.52 -0.73 -0.84 -0.73 -0.72 -0.23 -0.17 -0.17 0.42
0.81 0.29 -0.14 -5.26 -0.04 0.2 -0.58 0.78 0.4 0.65 0.3 0.7 -1.68 -0.37 -0.54 -0.53 -0.51 -0.71 -0.4 -0.04 -0.2 0.54
0.53 0.42 1.4 -2.41 -1.44 0.06 0.01 0.2 -0.56 -0.38 -0.1 -0.15 -0.42 -0.04 -0.31 -0.35 -0.32 -0.11 0.26 0.05 0.21 0.13
0.61 1.21 1.72 -3.97 -1.26 0.24 0.57 0.02 0.11 -0.22 -0.03 -0.08 -1.2 -1.23 -0.73 -0.92 -0.44 -0.61 -0.97 -0.15 -0.15 0.18
0.49 0.8 2.23 -3.6 -1.02 0.25 0.57 -0.65 0.39 -0.95 -0.53 0.35 -0.98 -0.52 -0.83 -0.69 -0.85 -0.89 -1.05 -0.19 -0.16 -0.42
0.86 0.83 2.2 -2.7 -0.45 0.08 0.26 -0.82 0.0 -0.91 -0.79 -0.16 -0.23 -0.76 -0.63 -0.47 -0.62 -0.64 -0.42 -0.33 -0.11 -0.88
0.76 0.93 2.06 -3.29 -0.4 0.01 -0.01 -0.2 0.26 -0.79 -0.3 0.07 -1.56 0.12 -1.17 -1.21 -1.11 -1.27 -1.24 0.55 0.26 -0.72
1.12 0.99 2.09 -3.42 -4.84 0.21 0.7 -0.29 0.37 -0.45 -0.47 0.28 -0.61 -0.51 -0.88 -1.01 -0.8 -0.94 -1.63 -0.7 -0.49 -0.38
0.32 0.8 1.33 -5.5 -0.57 -0.06 0.48 -0.17 0.28 -0.47 -0.2 0.36 -0.1 -0.08 -0.47 -0.6 -0.44 -0.52 -0.42 0.03 0.15 -0.15
0.42 0.83 1.47 -3.72 -0.27 0.05 0.55 -0.3 0.35 -0.49 -0.16 0.22 -0.11 -0.41 -0.56 -0.62 -0.52 -0.6 -0.37 -0.03 -0.04 -0.4
0.76 0.94 1.7 -4.05 -0.64 0.08 -0.54 0.5 0.1 0.03 0.09 -0.1 -1.03 0.14 -0.82 -0.89 -0.88 -0.9 -0.52 -0.43 -0.48 0.34
0.76 0.94 1.7 -4.05 -0.64 0.08 -0.54 0.5 0.1 0.03 0.09 -0.1 -1.03 0.14 -0.82 -0.89 -0.88 -0.9 -0.52 -0.43 -0.48 0.34
0.73 0.63 1.42 -3.96 -0.5 -0.06 0.55 -0.05 0.17 -0.03 0.01 0.3 -1.09 -0.34 -0.66 -0.68 -0.5 -0.54 -0.33 -0.6 -0.47 0.6
0.56 0.5 0.5 -6.23 -0.21 0.5 0.18 -0.18 0.35 -0.28 -0.35 0.24 -0.65 0.73 -0.63 -0.39 -0.46 -0.64 0.28 0.12 -0.21 0.09
0.7 1.03 1.82 -1.16 -0.58 0.19 -0.14 -0.2 -0.3 -0.9 -0.58 -0.24 -0.56 -0.03 -0.68 -0.56 -0.69 -0.38 -0.16 0.01 -0.48 -0.13
0.32 0.95 1.51 -3.33 -0.34 -0.09 0.29 -0.42 0.23 0.01 -0.11 0.26 -0.22 -0.13 -0.52 -0.49 -0.6 -0.68 -0.57 -0.17 0.07 -0.33
0.67 0.76 2.03 -2.49 -0.27 0.0 0.17 -0.44 -0.34 -0.89 -0.56 -0.01 -0.24 -0.42 -0.7 -0.69 -0.7 -0.56 -0.14 -0.26 -0.3 0.11
0.57 0.84 1.37 -3.37 -1.13 -0.03 0.03 0.01 -0.5 -0.08 -0.16 -0.42 -0.8 -0.41 -0.5 -0.41 -0.73 -0.22 0.13 0.64 0.95 -1.14
1.27 1.11 1.92 -3.15 -8.85 -0.18 -0.58 0.83 0.37 0.09 0.13 -0.42 -2.25 0.04 -2.65 -2.84 -4.28 -3.68 -0.8 0.6 0.71 -0.71
0.97 1.06 1.85 -3.86 -0.39 0.12 0.28 -0.42 0.07 -0.36 -0.21 -0.28 -0.71 -0.61 -0.95 -0.98 -0.86 -0.86 -0.48 -0.16 -0.09 0.0
0.75 0.23 0.32 -4.49 0.1 0.26 0.04 0.46 -0.09 0.08 0.19 -0.26 -1.92 -0.15 -0.03 -0.12 -0.13 -0.21 -0.09 0.09 0.06 0.39
0.83 0.92 1.5 -2.84 0.04 0.24 -0.08 -0.41 0.07 -0.54 -0.12 0.07 -0.52 -1.49 -0.47 -0.51 -0.54 -0.5 0.36 -0.31 -0.13 -0.23
0.83 0.42 1.88 -2.17 -1.73 0.06 0.86 -0.31 0.01 -0.86 -0.4 0.18 -0.31 -0.27 -0.6 -0.89 -0.58 -0.82 -0.99 -0.42 -0.09 0.37
0.86 0.54 1.26 -2.63 -0.19 0.07 -0.12 0.28 0.13 -0.23 -0.09 0.25 -1.28 -0.41 -0.77 -0.34 -0.9 -0.76 -0.23 -0.08 -0.15 0.73
0.66 1.13 1.61 -5.95 -1.18 0.11 0.14 0.28 -0.46 0.19 -0.05 -0.42 -1.22 -0.41 -0.18 0.02 -0.04 -0.09 -0.25 -0.74 -0.54 -0.64

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.