Heatmap: Cluster_122 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.11 0.0 0.0 0.76 0.39 0.26 1.0 0.0 0.0 0.36 0.64 0.0 0.49 0.12 0.0 0.52 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.4
0.17 0.11 0.01 0.06 0.0 0.12 0.36 0.16 0.03 0.04 0.07 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 1.0
0.06 0.02 0.0 0.14 0.01 0.21 0.43 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 1.0
0.13 0.05 0.0 0.23 0.0 0.25 1.0 0.09 0.1 0.02 0.1 0.11 0.04 0.2 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0
0.05 0.08 0.0 0.01 0.44 0.3 1.0 0.17 0.46 0.16 0.2 0.31 0.23 0.42 0.08 0.14 0.08 0.12 0.26 0.38 0.23 0.64
0.53 0.67 0.93 0.01 0.6 0.63 1.0 0.62 0.98 0.69 0.73 0.81 0.47 0.28 0.45 0.45 0.47 0.46 0.23 0.46 0.44 0.61
0.22 0.06 0.0 0.0 0.29 0.29 0.77 0.22 0.6 0.2 0.22 0.74 0.16 0.52 0.2 0.24 0.21 0.18 0.49 0.13 0.16 1.0
0.13 0.09 0.0 0.0 0.18 0.24 0.77 0.15 0.32 0.18 0.14 0.39 0.11 0.45 0.17 0.19 0.19 0.19 1.0 0.14 0.15 0.99
0.02 0.0 0.0 0.17 0.0 0.31 0.59 0.21 0.23 0.28 0.33 0.21 0.41 1.0 0.07 0.1 0.17 0.11 0.09 0.13 0.2 0.97
0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.01 1.0 0.04 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
0.19 0.14 0.0 0.06 0.01 0.26 0.85 0.36 0.1 0.4 0.38 0.27 0.06 0.65 0.2 0.32 0.28 0.19 0.2 0.09 0.1 1.0
0.13 0.0 0.0 0.16 0.06 0.27 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.73 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.04 0.06 0.21 0.09 0.14 1.0 0.07 0.13 0.11 0.13 0.12 0.31 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.15 0.11 0.39
0.22 0.18 0.0 0.01 0.0 0.38 1.0 0.92 0.51 0.86 0.79 0.87 0.25 0.63 0.27 0.17 0.34 0.24 0.36 0.67 0.72 0.55
0.06 1.0 0.35 0.05 0.1 0.18 0.7 0.18 0.8 0.61 0.25 0.94 0.16 0.39 0.13 0.11 0.15 0.18 0.15 0.11 0.11 0.07
0.0 0.06 0.0 0.08 0.0 0.03 1.0 0.04 0.06 0.09 0.09 0.1 0.03 0.14 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.13
0.5 0.0 0.0 0.19 0.01 0.14 1.0 0.05 0.0 0.3 0.53 0.09 0.12 0.23 0.16 0.06 0.48 0.06 0.07 0.0 0.0 0.1
0.05 0.16 0.0 0.09 0.0 0.29 0.98 0.1 0.87 0.11 0.1 1.0 0.48 0.45 0.06 0.01 0.11 0.08 0.05 0.39 0.43 0.01
0.27 0.18 0.04 0.0 0.13 0.22 0.55 0.38 0.45 0.28 0.45 0.3 0.33 0.36 0.14 0.12 0.13 0.15 0.22 0.15 0.16 1.0
0.02 0.05 0.06 0.04 0.02 0.29 1.0 0.33 0.25 0.36 0.48 0.2 0.11 0.24 0.14 0.12 0.03 0.02 0.03 0.59 0.41 0.05
0.3 0.04 0.05 0.03 0.21 0.17 0.53 0.19 0.05 0.1 0.08 0.05 0.03 0.27 0.07 0.05 0.06 0.03 0.53 0.19 0.18 1.0
0.13 0.1 0.0 0.19 0.0 1.0 0.6 0.71 0.27 0.67 0.71 0.13 0.81 0.65 0.14 0.06 0.08 0.14 0.73 0.2 0.18 0.53
0.3 0.16 0.01 0.03 0.07 0.28 1.0 0.08 0.14 0.09 0.09 0.1 0.5 0.16 0.23 0.18 0.24 0.33 0.17 0.26 0.2 0.07
0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.21 1.0 0.19 0.02 0.59 0.21 0.0 0.43 0.19 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.03 0.51
0.27 0.18 0.08 0.04 0.0 0.12 1.0 0.59 0.18 0.5 0.42 0.36 0.28 0.44 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.16 0.18 0.45
0.44 0.16 0.09 0.03 0.03 0.17 1.0 0.37 0.51 0.2 0.47 0.39 0.11 0.16 0.08 0.08 0.06 0.07 0.08 0.11 0.11 0.55
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.13 1.0 0.02 0.07 0.07 0.1 0.49 0.05 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03
0.02 0.04 0.0 0.26 0.0 0.04 0.79 0.05 0.14 0.03 0.02 0.05 0.28 1.0 0.03 0.04 0.03 0.01 0.01 0.22 0.19 0.08
0.15 0.01 0.73 0.25 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.18 0.0 0.0 0.21 0.01 0.12 0.25 0.12 0.12 0.0 0.0 0.0 0.29 0.18 0.08 0.07 0.12 0.12 0.53 0.0 0.11 1.0
0.04 0.03 0.0 0.07 0.19 0.17 0.95 0.38 0.94 0.35 0.42 1.0 0.42 0.42 0.03 0.04 0.11 0.1 0.12 0.6 0.41 0.65
0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.32 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.16 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.1 0.2 0.32 0.25 0.31 0.28 0.17 0.06 0.28 0.01 0.02 0.02 0.04 0.09 0.14 0.14 1.0
0.08 0.02 0.03 0.0 0.06 0.07 0.39 0.09 0.16 0.05 0.06 0.1 0.14 0.11 0.05 0.05 0.07 0.06 0.09 0.11 0.08 1.0
0.02 0.04 0.0 0.03 0.0 0.34 0.45 0.0 1.0 0.06 0.08 0.96 0.51 0.07 0.05 0.07 0.15 0.15 0.55 0.35 0.44 0.52
0.0 0.01 0.0 0.48 0.16 0.16 0.43 0.11 0.03 0.04 0.07 0.07 0.05 0.18 0.0 0.01 0.05 0.06 0.41 0.04 0.0 1.0
0.38 0.0 0.28 0.94 0.0 0.01 0.42 0.0 1.0 0.21 0.31 0.48 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
1.0 0.24 0.07 0.88 0.03 0.49 0.94 0.13 0.4 0.14 0.43 0.31 0.15 0.11 0.13 0.18 0.16 0.25 0.12 0.09 0.14 0.04
0.06 0.09 0.05 0.4 0.01 0.26 1.0 0.8 0.18 0.41 0.34 0.26 0.27 0.23 0.13 0.32 0.18 0.24 0.34 0.11 0.0 0.43
0.0 0.0 0.3 0.16 0.0 0.11 0.56 0.0 0.0 0.3 0.0 0.62 0.13 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 1.0
0.33 0.28 0.35 0.22 0.07 0.22 1.0 0.16 0.17 0.15 0.2 0.12 0.03 0.36 0.03 0.06 0.03 0.03 0.05 0.1 0.19 0.42
0.14 0.12 0.13 0.16 0.06 0.23 1.0 0.13 0.14 0.18 0.38 0.27 0.02 0.18 0.02 0.16 0.09 0.06 0.0 0.55 0.38 0.48
0.11 0.08 0.0 0.01 0.07 0.27 0.79 0.16 0.34 0.15 0.23 0.25 0.26 0.26 0.16 0.18 0.15 0.15 0.1 0.16 0.18 1.0
0.32 0.17 0.24 0.06 0.09 0.38 1.0 0.16 0.43 0.21 0.16 0.49 0.28 0.14 0.06 0.07 0.07 0.07 0.1 0.25 0.27 0.23
0.49 0.73 1.0 0.03 0.7 0.58 0.78 0.31 0.47 0.3 0.3 0.41 0.25 0.4 0.44 0.47 0.4 0.44 0.58 0.43 0.49 0.31
0.46 0.47 0.62 0.05 0.55 0.82 1.0 0.56 0.58 0.5 0.56 0.58 0.39 0.42 0.4 0.44 0.4 0.42 0.64 0.53 0.48 0.7
0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.04 0.22 0.42 0.0 0.37 0.3 0.0 0.02 0.1 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 1.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.35 0.37 0.01 0.15 0.23 0.0 0.07 0.07 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.04 0.04 1.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.38 0.18 0.0 0.22 0.19 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0
0.02 0.02 0.0 0.01 0.36 0.12 0.52 0.67 0.02 0.61 0.64 0.02 0.08 0.41 0.05 0.05 0.07 0.07 0.02 0.04 0.04 1.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.27 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.09 0.22 0.15 0.3 0.14 0.3 0.29 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0
0.07 0.0 0.0 1.0 0.04 0.04 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0
0.25 0.01 0.0 0.0 0.06 0.1 0.61 0.38 0.39 0.15 0.29 0.42 0.09 0.07 0.04 0.04 0.08 0.04 0.09 0.17 0.18 1.0
0.08 0.09 0.0 0.07 0.0 0.23 0.67 0.18 0.09 0.15 0.09 0.22 0.01 0.16 0.01 0.0 0.04 0.01 0.0 0.02 0.0 1.0
0.09 0.25 0.0 0.1 0.26 0.68 0.66 0.1 0.48 0.53 0.42 0.37 0.22 0.48 0.29 0.71 0.47 0.59 1.0 0.0 0.0 0.25
0.33 0.09 0.0 0.47 0.01 0.25 1.0 0.0 0.27 0.25 0.0 0.26 0.3 0.22 0.26 0.16 0.4 0.18 0.2 0.22 0.72 0.28
0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.18 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0
0.18 0.13 0.0 0.01 0.01 0.05 0.34 0.16 0.11 0.12 0.13 0.14 0.06 0.07 0.03 0.03 0.04 0.03 0.08 0.13 0.14 1.0
0.01 0.0 0.0 0.25 0.06 0.08 0.49 0.3 0.11 0.33 0.48 0.25 0.03 0.1 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 1.0
0.07 0.23 0.0 0.3 0.04 0.31 0.79 0.17 1.0 0.0 0.14 0.0 0.23 0.24 0.11 0.25 0.12 0.0 0.0 0.39 0.29 0.69
0.04 0.12 0.07 0.61 0.0 0.16 0.93 0.0 0.23 0.26 0.14 0.11 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.24
0.25 0.45 0.28 0.06 0.45 0.37 1.0 0.27 0.49 0.44 0.42 0.53 0.11 0.79 0.25 0.25 0.46 0.22 0.53 0.25 0.24 0.46
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.06 1.0 0.38 0.01 0.48 0.52 0.0 0.04 0.28 0.04 0.03 0.08 0.08 0.04 0.03 0.03 0.95
0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.09 0.92 0.29 0.01 0.21 0.22 0.02 0.13 0.53 0.09 0.05 0.09 0.06 0.13 0.06 0.1 1.0
0.12 0.1 0.03 0.03 0.04 0.34 0.88 0.37 0.39 0.26 0.37 0.43 0.36 0.26 0.2 0.17 0.23 0.22 0.17 0.19 0.22 1.0
0.07 0.22 0.0 0.0 0.35 0.17 0.79 0.28 0.75 0.37 0.37 1.0 0.07 0.35 0.07 0.07 0.03 0.07 0.55 0.82 0.47 0.36
0.06 0.07 0.06 0.01 0.0 0.25 0.35 0.48 0.51 0.14 0.17 0.4 0.17 0.16 0.07 0.24 0.16 0.03 0.38 0.89 1.0 0.21
0.04 0.08 0.0 0.3 0.0 0.3 1.0 0.52 0.25 0.0 0.0 0.0 0.28 0.1 0.09 0.07 0.08 0.08 0.0 1.0 0.89 0.52
0.03 0.03 0.0 0.01 0.01 0.43 1.0 0.25 0.34 0.22 0.32 0.27 0.34 0.29 0.26 0.16 0.24 0.18 0.17 0.2 0.21 0.26
0.06 0.02 0.0 0.01 0.0 0.18 0.23 0.05 0.1 0.11 0.11 0.13 0.05 0.16 0.01 0.01 0.02 0.01 0.1 0.03 0.02 1.0
0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.06 0.49 0.09 0.15 0.02 0.06 0.16 0.02 0.38 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.1 0.06 1.0
0.17 0.19 0.0 0.31 0.06 0.28 0.55 0.15 1.0 0.07 0.0 0.41 0.03 0.18 0.14 0.43 0.47 0.22 0.0 0.28 0.25 0.3
0.31 0.44 0.86 0.21 0.01 0.19 1.0 0.29 0.24 0.04 0.32 0.15 0.09 0.18 0.24 0.21 0.15 0.08 0.06 0.22 0.14 0.08
0.0 0.0 0.64 0.19 0.0 0.51 1.0 0.41 0.4 0.34 0.17 0.0 0.45 0.03 0.0 0.12 0.0 0.13 0.0 0.0 0.35 0.0
0.0 0.0 0.0 0.24 0.04 0.07 0.65 1.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.43 0.51
0.07 0.0 0.02 0.47 0.05 0.02 1.0 0.06 0.06 0.14 0.52 0.28 0.02 0.97 0.01 0.01 0.04 0.0 0.04 0.0 0.04 0.07
0.03 0.0 0.08 0.2 0.0 0.11 1.0 0.05 0.11 0.08 0.22 0.12 0.06 0.09 0.05 0.02 0.04 0.04 0.04 0.01 0.0 0.68
0.02 0.01 0.02 0.06 0.05 0.09 1.0 0.07 0.24 0.1 0.39 0.13 0.36 0.66 0.01 0.0 0.03 0.03 0.0 0.1 0.09 0.31
0.04 0.0 0.0 0.52 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.05 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.15 0.06 0.04 0.03 0.02 0.09 0.36 0.21 0.26 0.25 0.32 0.19 0.05 0.11 0.01 0.01 0.01 0.01 0.1 0.03 0.03 1.0
1.0 0.18 0.08 0.67 0.02 0.07 0.99 0.18 0.05 0.28 0.32 0.05 0.03 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.04 0.13
0.26 0.0 0.16 0.28 0.08 0.33 0.73 0.32 0.09 0.24 0.07 0.17 0.22 0.1 0.27 0.08 0.21 0.18 0.0 0.11 0.23 1.0
0.07 0.01 0.0 0.03 0.0 0.1 0.27 0.07 0.13 0.07 0.1 0.11 0.06 0.62 0.07 0.06 0.08 0.07 0.11 0.18 0.24 1.0
0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.16 0.06 0.02 0.01 0.04 0.0 0.03 0.13 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.11 0.12 1.0
0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.27 0.17 0.18 0.08 0.13 0.11 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 1.0
0.43 0.0 0.0 0.51 0.26 0.31 1.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.36 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.01 0.0 0.0 0.01 0.1 0.42 0.12 0.03 0.08 0.07 0.1 0.15 0.21 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.08 1.0
0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.23 0.11 0.03 0.18 0.35 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.04 0.26 0.02 0.07 0.0 0.01 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0
0.01 0.01 0.04 0.02 0.0 0.11 1.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.06 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.37
0.12 0.0 0.0 0.31 0.06 0.2 1.0 0.01 0.04 0.04 0.05 0.03 0.26 0.53 0.04 0.1 0.14 0.02 0.0 0.05 0.09 0.67
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.25 0.76 0.26 1.0 0.3 0.34 0.77 0.88 0.62 0.1 0.06 0.07 0.09 0.05 0.24 0.38 0.43
0.04 0.35 0.0 0.3 0.0 0.22 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.32 0.52 0.21 0.11 0.1 0.13 0.23 0.02 0.09 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.45 0.05 0.11 0.08 0.1 0.1 0.25 0.01 0.1 0.14 0.16 0.11 0.0 0.14 0.22 1.0
0.19 0.07 0.21 0.14 0.0 0.09 0.39 0.11 0.27 0.1 0.16 0.24 0.07 0.47 0.05 0.03 0.07 0.06 0.03 0.09 0.07 1.0
0.06 0.09 0.1 0.04 0.06 0.21 0.81 0.38 0.1 0.24 0.26 0.05 0.33 0.28 0.2 0.2 0.3 0.21 0.24 0.21 0.29 1.0
0.0 0.04 0.0 0.61 0.01 0.04 1.0 0.07 0.14 0.06 0.11 0.0 0.12 0.42 0.09 0.0 0.09 0.09 0.1 0.05 0.0 0.99
0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.37 1.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.27 0.23 0.0 0.18 0.22 0.0 0.87 0.46 0.0 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.22 0.16 0.07 0.12 0.11 0.13 0.05 0.18 0.07 0.08 0.06 0.08 0.54 0.06 0.12 1.0
0.13 0.3 0.07 0.12 0.08 0.33 0.55 0.49 0.79 0.42 0.5 1.0 0.18 0.12 0.13 0.09 0.15 0.19 0.18 0.95 0.61 0.54
0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 1.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.04 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.13 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.36 0.53 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.21 0.02 0.07 0.24 0.12 0.4 0.13 1.0 0.0 0.17 0.78 0.06 0.34 0.06 0.17 0.07 0.22 0.44 0.75 0.59 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.16 0.08 0.05 0.15 0.04 0.02 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)