Heatmap: Cluster_70 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
2.24 7.25 45.9 2.17 0.43 0.24 0.12 0.17 0.37 0.13 0.32 0.24 0.13 0.22 0.15 0.3 0.14 0.12 0.31 0.26 0.18 0.32
1.65 10.26 60.26 1.15 0.17 0.39 0.5 0.23 0.66 0.13 0.27 0.28 0.39 1.19 0.36 0.59 0.4 0.41 0.0 0.35 0.52 0.34
0.08 3.62 47.4 1.01 0.09 0.04 0.07 0.04 0.03 0.01 0.09 0.02 0.05 0.03 0.05 0.02 0.03 0.01 0.04 0.03 0.0 0.05
0.48 9.61 72.94 2.16 0.12 0.73 0.93 0.23 0.15 0.2 0.28 0.19 1.17 0.32 0.4 0.33 0.2 0.22 0.29 0.43 0.79 0.18
5.99 32.7 190.57 5.94 3.12 2.94 2.32 3.12 3.47 2.15 1.95 2.81 0.98 4.14 1.52 1.41 1.42 1.7 1.43 2.29 1.98 2.36
0.37 20.04 195.42 7.0 0.14 0.2 0.16 0.0 0.0 0.23 0.05 0.35 0.31 0.12 0.12 0.07 0.07 0.18 0.18 0.34 0.22 0.19
1.86 10.96 57.14 2.06 0.96 0.72 2.07 0.6 1.22 0.58 0.77 1.36 0.63 0.53 0.34 0.29 0.24 0.37 0.35 0.45 0.61 0.74
10.12 59.14 445.97 22.29 2.58 0.46 1.36 0.74 1.09 0.67 1.26 1.45 0.37 0.89 0.11 0.06 0.18 0.31 0.37 1.02 0.96 0.17
0.27 25.12 208.48 4.69 0.49 0.31 0.17 0.15 0.12 0.2 0.18 0.12 0.13 0.13 0.08 0.04 0.08 0.11 0.21 0.16 0.11 0.26
3.8 18.56 118.73 5.71 3.32 2.34 1.86 1.09 1.47 1.28 0.84 2.77 1.29 2.07 1.56 1.6 1.59 1.81 1.24 2.16 2.67 1.42
1.14 10.46 61.89 0.64 0.67 0.01 0.08 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.13 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.12 0.22 0.02
0.12 2.71 17.58 0.99 0.1 0.06 0.02 0.07 0.02 0.03 0.04 0.02 0.03 0.05 0.0 0.05 0.01 0.02 0.09 0.02 0.09 0.02
0.22 1.9 13.8 0.78 0.06 0.09 0.13 0.11 0.08 0.04 0.08 0.08 0.15 0.15 0.09 0.09 0.11 0.08 0.05 0.12 0.14 0.22
0.09 2.49 16.27 0.67 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04 0.08
0.54 3.2 58.11 1.34 0.13 0.11 0.1 0.05 0.1 0.0 0.27 0.29 0.08 0.04 0.06 0.03 0.11 0.06 0.07 0.12 0.0 0.21
0.44 4.74 29.81 0.67 0.02 0.19 0.07 0.04 0.04 0.0 0.05 0.0 0.07 0.05 0.05 0.05 0.03 0.01 0.0 0.03 0.0 0.04
0.33 5.39 36.56 0.75 0.11 0.72 0.98 0.44 0.68 0.26 0.42 0.6 0.99 0.49 0.23 0.36 0.29 0.26 0.25 0.37 0.61 0.78
0.55 3.31 19.86 0.38 0.16 0.38 0.43 0.27 0.45 0.24 0.33 0.47 0.39 0.42 0.26 0.31 0.2 0.29 0.21 0.32 0.42 0.34
0.58 3.6 92.45 0.72 0.03 0.03 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.21 0.0 0.06 0.01 0.01 0.02 0.01 0.06 0.07 0.08 0.18
0.06 2.61 36.78 0.82 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.18 10.97 117.61 4.38 0.02 1.3 1.25 0.64 0.0 0.55 0.38 0.59 1.99 0.59 0.86 2.08 1.5 2.56 0.46 1.7 1.09 0.0
0.34 3.74 48.09 0.95 0.23 0.13 0.2 0.02 0.0 0.03 0.02 0.11 0.13 0.2 0.03 0.03 0.05 0.04 0.08 0.06 0.03 0.08
0.1 1.82 19.0 0.71 0.03 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.08
0.3 86.04 499.54 1.46 0.06 0.25 0.29 0.09 0.41 0.19 0.23 0.06 0.35 0.25 0.24 0.15 0.23 0.2 0.13 0.35 0.21 0.18
0.38 7.04 45.69 1.0 0.22 0.19 0.18 0.1 0.05 0.05 0.09 0.09 0.07 0.21 0.22 0.21 0.16 0.14 0.16 0.12 0.14 0.12
0.27 5.7 37.3 0.83 0.15 0.03 0.56 0.04 0.0 0.03 0.01 0.0 0.09 0.07 0.18 0.19 0.01 0.0 0.02 0.03 0.03 0.18
0.17 8.92 85.38 2.93 0.16 0.22 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.43 0.94 0.33 0.62 0.09 0.08 0.0 0.01
0.74 11.25 66.03 1.97 0.18 0.18 0.03 0.13 0.41 0.26 0.41 0.32 0.26 0.37 0.11 0.25 0.1 0.13 0.12 0.26 0.22 0.34
3.75 18.71 120.56 4.31 2.61 2.15 2.44 1.41 1.53 0.72 0.66 1.69 1.43 1.38 1.54 1.63 1.27 1.55 1.72 1.62 1.56 2.39
0.06 1.96 28.25 0.93 0.11 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.04 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.02 0.02 0.1
0.16 3.25 21.91 0.89 0.09 0.06 0.05 0.04 0.03 0.05 0.04 0.0 0.03 0.08 0.01 0.07 0.06 0.03 0.12 0.07 0.05 0.03
0.43 9.3 41.15 1.01 0.47 0.33 0.21 0.28 0.18 0.2 0.22 0.13 0.15 0.57 0.3 0.18 0.22 0.19 0.34 0.16 0.15 0.59
1.7 15.97 99.34 3.48 1.0 1.8 2.65 1.31 2.19 0.85 1.64 1.93 2.52 0.85 1.24 1.41 0.97 1.2 1.86 1.56 1.73 1.4
0.12 7.7 87.54 3.68 0.14 0.08 0.1 0.09 0.06 0.13 0.16 0.11 0.1 0.14 0.05 0.09 0.13 0.08 0.0 0.07 0.05 0.09
0.3 4.79 44.73 1.23 0.05 0.06 0.05 0.11 0.11 0.07 0.05 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.09 0.25 0.12
0.59 9.28 44.09 0.64 0.13 0.13 0.02 0.15 0.42 0.15 0.15 0.32 0.16 0.11 0.03 0.02 0.11 0.11 0.24 0.36 0.35 0.19
0.97 65.54 332.43 0.6 1.71 1.15 0.39 0.18 0.12 0.19 0.14 0.14 0.26 0.55 1.14 0.78 1.02 1.01 0.99 0.17 0.08 1.45
0.34 5.1 29.53 0.58 0.01 0.2 0.33 0.0 0.0 0.03 0.12 0.19 0.17 0.12 0.11 0.08 0.25 0.19 0.15 0.05 0.12 0.1
0.79 8.96 43.65 0.7 0.2 0.5 0.49 0.25 0.17 0.25 0.23 0.17 0.1 0.4 0.14 0.32 0.21 0.28 0.1 0.49 0.54 0.62
0.46 22.36 106.65 1.23 1.26 0.47 0.32 0.1 0.15 0.17 0.05 0.11 0.13 0.44 0.46 0.39 0.37 0.51 0.33 0.15 0.07 0.39
0.18 19.42 137.39 3.79 0.05 0.07 0.1 0.3 0.08 0.11 0.05 0.24 0.06 0.19 0.11 0.14 0.0 0.03 0.0 0.0 0.22 0.0
0.83 9.98 99.58 3.22 0.11 0.18 0.15 0.26 0.32 0.22 0.46 0.18 0.23 0.51 0.25 0.21 0.19 0.2 0.03 0.22 0.2 0.14
1.03 425.68 3162.15 7.46 0.0 0.17 0.02 0.0 0.2 0.0 0.0 0.19 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.31 0.0 0.0
0.67 2.97 17.52 0.68 0.3 0.27 0.4 0.22 0.33 0.32 0.27 0.23 0.11 0.2 0.16 0.26 0.19 0.25 0.03 0.16 0.07 1.2
0.58 3.08 17.45 0.7 0.05 0.12 0.13 0.05 0.05 0.07 0.1 0.08 0.01 0.12 0.08 0.09 0.07 0.06 0.01 0.05 0.04 0.06
4.04 76.71 466.32 9.04 0.23 2.12 4.49 1.89 0.84 0.85 0.36 1.22 1.21 3.75 1.42 1.12 1.68 1.3 0.31 0.82 1.16 0.79
0.53 3.03 18.72 0.63 0.12 0.38 0.6 0.3 0.55 0.14 0.22 0.39 0.31 0.25 0.06 0.08 0.06 0.07 0.07 0.45 0.24 0.98
0.06 4.44 30.47 0.2 0.01 0.36 0.17 0.0 0.41 0.0 0.08 0.59 0.23 0.28 0.07 0.06 0.07 0.06 0.0 0.16 0.18 0.32
0.16 33.13 501.4 11.44 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)