Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
140.63 487.51 3458.72 182.56 59.43 74.77 128.31 68.91 132.46 59.75 70.97 113.51 47.73 91.31 65.47 76.94 65.49 66.03 73.27 65.58 65.7 118.8
0.0 4.88 75.87 8.74 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.89 11.43 71.65 2.49 0.0 0.96 0.79 0.91 0.14 0.78 0.47 0.07 0.08 0.44 1.03 0.9 0.89 1.06 0.47 1.47 1.06 1.43
0.88 20.48 145.97 7.21 0.1 0.08 0.09 0.0 0.12 0.1 0.07 0.0 0.09 0.24 0.04 0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.15 0.12
0.11 7.53 89.98 4.39 0.15 0.06 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.07 0.04 0.03 0.02 0.03 0.0 0.04 0.05 0.03
13.86 47.34 461.46 7.01 14.97 13.33 13.77 8.6 15.29 11.65 10.03 12.62 11.41 5.33 9.34 9.31 7.92 8.49 7.21 11.06 12.31 11.89
5.14 14.49 152.73 2.79 6.16 5.94 6.84 3.66 4.85 5.09 3.42 4.71 3.34 2.79 3.64 4.49 3.9 4.37 4.58 4.69 4.5 6.31
0.36 5.87 41.88 0.46 0.68 0.31 0.21 0.15 0.3 0.13 0.23 0.28 0.11 0.16 0.08 0.12 0.2 0.08 0.29 0.18 0.26 0.26
3.96 8.05 117.61 6.25 0.83 3.6 5.44 3.4 4.18 3.04 2.78 5.43 4.52 3.22 2.11 2.0 2.45 2.51 2.41 3.86 3.5 3.94
1.56 10.4 100.19 1.47 0.4 0.33 0.55 0.59 0.67 0.55 0.54 0.52 0.54 0.51 0.06 0.19 0.17 0.1 0.45 0.45 0.12 0.49
0.0 3.45 21.94 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 2.33 24.46 1.91 0.13 0.2 0.23 0.03 0.25 0.33 0.22 0.12 0.03 0.29 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.54 0.11 0.36
8.26 12.96 120.26 12.82 2.05 2.44 3.25 2.05 2.89 4.32 3.73 3.93 0.68 1.76 1.04 1.85 1.49 1.01 1.65 2.99 2.56 5.31
1.22 19.78 188.79 2.31 0.21 4.71 1.83 1.87 6.98 2.6 2.18 9.82 1.48 7.66 3.49 2.02 4.5 4.56 4.27 5.19 3.55 1.04
0.26 1.52 10.21 0.72 0.13 0.12 0.16 0.08 0.23 0.45 0.18 0.2 0.07 0.11 0.05 0.05 0.02 0.09 0.02 0.11 0.12 0.29
0.21 29.61 254.38 3.19 0.12 0.02 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 16.8 116.45 0.52 0.01 0.03 0.11 0.24 0.04 0.17 0.11 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.22 0.15 0.0
1.01 0.39 18.39 0.47 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 85.21 530.36 4.57 0.01 0.02 0.01 0.09 0.0 0.05 0.02 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.28 0.74 0.03
3.59 190.42 1896.42 31.23 0.05 0.4 0.19 0.13 0.0 0.34 0.0 0.24 0.23 0.56 0.1 0.07 0.09 0.0 0.0 0.3 0.22 1.84
1.0 12.15 114.07 2.45 0.29 0.56 0.57 0.56 0.62 0.38 0.38 0.3 0.09 0.34 0.41 0.37 0.41 0.5 0.34 0.37 0.55 0.52
0.01 2.39 17.81 1.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.72 8.46 48.74 4.79 0.36 0.39 0.39 0.33 0.79 0.77 0.85 0.15 0.28 0.3 0.33 0.18 0.11 0.24 0.47 0.12 0.14 0.08
0.71 3.47 23.75 2.42 0.36 0.33 0.51 0.42 0.31 0.47 0.21 0.37 0.37 0.25 0.25 0.29 0.17 0.21 0.63 0.22 0.31 0.56
0.13 5.24 32.94 3.46 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.49 12.37 0.63 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.06 9.18 0.48 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.08 0.0 0.0
0.01 12.87 68.08 1.07 0.06 0.05 0.08 0.72 0.0 0.32 0.18 0.0 0.02 0.27 0.03 0.0 0.03 0.03 0.0 0.3 0.08 0.0
0.5 5.89 46.77 1.13 0.16 0.49 0.15 0.43 0.66 0.47 0.52 0.76 0.34 0.52 0.32 0.42 0.35 0.42 0.45 1.67 0.97 0.48
0.9 7.07 90.04 8.37 3.23 1.84 0.85 0.69 0.54 0.73 0.6 0.93 0.23 1.27 1.51 1.71 1.36 1.48 2.55 0.88 1.39 1.2
1.02 33.42 242.02 21.76 0.17 0.29 0.44 0.32 0.07 0.15 0.11 0.39 0.17 0.31 0.24 0.24 0.2 0.11 0.3 0.13 0.12 0.28
0.0 0.99 7.27 0.43 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.06 0.17 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 39.54 895.51 63.72 0.06 0.19 0.39 0.29 0.0 0.09 0.24 0.55 0.18 0.17 0.07 0.18 0.0 0.13 0.14 0.07 0.0 0.1
0.1 1.54 12.39 1.04 0.03 0.02 0.03 0.0 0.32 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17
0.63 6.54 70.92 5.55 0.24 0.18 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.07 0.3 0.09 0.09 0.0 0.22 0.0 0.26 0.16
0.0 0.0 11.43 0.71 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.19 13.71 224.66 1.55 0.05 0.16 0.13 0.12 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.21 0.13 0.05 0.07 0.09 0.53 0.0 0.0 0.0
1.41 5.65 44.39 2.3 0.07 0.1 0.23 0.29 0.07 0.28 0.27 0.07 0.01 0.26 0.07 0.07 0.09 0.07 0.13 0.18 0.25 1.31
1.06 3.16 57.42 4.11 0.98 0.81 1.12 0.22 0.86 0.69 0.39 0.91 0.62 0.37 0.34 0.37 0.3 0.49 0.51 0.78 0.61 2.45
0.03 2.61 25.39 0.22 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 8.23 69.7 4.03 0.17 0.07 0.09 0.1 0.06 0.06 0.04 0.06 0.0 0.13 0.06 0.09 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.19
0.59 6.58 45.71 1.77 0.1 0.09 0.17 0.11 0.15 0.21 0.14 0.15 0.1 0.14 0.12 0.03 0.05 0.12 0.08 0.08 0.05 0.32
1.57 14.61 181.48 9.97 2.14 2.86 1.8 0.0 4.87 0.0 0.0 2.34 0.6 1.74 4.88 0.73 0.0 0.0 3.59 0.0 0.0 3.8
0.16 5.81 60.28 5.55 0.01 0.25 0.04 0.27 0.51 0.75 0.77 0.5 0.35 0.23 0.12 0.17 0.21 0.09 0.0 0.16 0.23 0.07
4.32 41.64 226.49 21.68 1.38 2.17 4.48 0.8 0.67 0.6 1.31 0.43 0.8 1.65 0.96 0.99 1.35 1.21 0.41 0.65 0.69 1.67
1.36 3.37 37.17 1.82 0.56 0.47 1.02 0.45 0.51 0.29 0.32 0.28 0.81 0.55 0.18 0.29 0.31 0.38 0.11 0.63 0.26 1.18
2.63 11.47 62.85 0.6 0.19 0.24 1.01 0.19 0.43 0.08 0.35 0.19 0.24 0.31 0.06 0.07 0.03 0.02 0.0 0.09 0.1 0.0
3.35 45.29 350.27 34.78 3.36 2.11 7.64 2.53 4.2 3.48 3.47 7.07 1.75 1.64 0.38 1.2 1.3 0.89 1.29 1.53 1.24 9.09
2.34 12.54 103.87 2.54 0.37 0.3 0.24 0.0 0.0 0.0 1.62 0.0 0.54 0.21 0.82 0.0 0.0 1.75 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.81 18.3 1.31 0.07 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.06 2.52 15.83 0.79 0.02 0.03 0.02 0.0 0.0 0.19 0.0 0.4 0.0 0.03 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 37.97 219.38 1.71 0.0 0.11 0.17 0.0 0.14 0.06 0.06 0.0 0.01 0.01 0.09 0.07 0.09 0.06 0.03 0.04 0.04 0.05
1.88 6.33 69.72 1.29 0.53 2.08 1.93 1.6 1.65 1.38 1.32 1.66 1.38 1.18 0.78 0.75 0.8 0.76 0.85 0.99 1.91 1.61
1.42 4.86 40.05 0.64 0.13 0.39 1.01 0.07 0.13 0.04 0.07 0.22 0.21 0.21 0.22 0.21 0.11 0.27 0.07 0.22 0.17 0.08
0.12 1.25 9.27 0.58 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.64 4.02 50.51 3.24 0.76 1.15 1.1 0.31 0.32 0.43 0.31 0.42 0.2 0.44 1.3 1.09 1.27 1.09 2.08 0.13 0.56 0.31
0.47 6.87 74.21 0.52 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.89 25.07 221.91 3.81 0.66 0.63 0.79 1.16 0.71 0.22 1.0 1.36 1.02 0.97 0.55 0.61 0.65 0.94 0.61 0.69 0.84 0.8
0.38 1.61 18.75 1.66 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37
0.55 2.83 28.76 0.88 0.04 0.32 0.39 0.22 0.22 0.18 0.22 0.18 0.22 0.17 0.23 0.29 0.25 0.26 0.19 0.16 0.19 0.27
0.28 4.61 34.64 1.33 0.3 0.16 0.22 0.17 0.47 0.09 0.2 0.11 0.06 0.19 0.08 0.1 0.08 0.06 0.03 0.11 0.08 0.16
0.0 0.16 3.62 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 5.97 50.62 1.68 0.5 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 5.52 30.99 2.44 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 2.6 22.3 0.58 0.14 0.07 0.04 0.07 0.03 0.04 0.02 0.06 0.04 0.09 0.04 0.07 0.03 0.04 0.06 0.01 0.04 0.09
3.28 8.58 61.9 2.26 0.09 0.79 1.36 0.21 0.41 0.93 0.63 0.0 0.09 0.86 0.14 0.36 0.87 1.07 0.0 0.16 0.36 0.32
0.0 0.7 8.02 0.49 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 3.8 25.87 1.37 0.32 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.59 0.16 0.0 0.0
0.0 0.44 26.22 3.01 0.0 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.76 10.54 103.19 5.1 0.09 0.31 0.36 0.17 0.22 0.37 0.3 0.14 0.18 0.25 0.19 0.19 0.12 0.15 0.14 0.22 0.16 0.4
1.61 61.59 809.46 50.21 0.51 0.56 0.27 0.32 0.41 0.27 0.38 0.33 0.1 0.31 0.31 0.43 0.25 0.35 0.79 0.24 0.43 0.32
0.0 4.5 34.85 1.56 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.64 6.09 83.71 2.9 0.07 0.16 0.0 0.0 0.6 0.28 0.0 0.58 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.23 0.0 0.0
3.4 14.75 189.46 13.07 0.33 1.03 0.92 0.48 0.46 0.4 0.25 0.45 1.16 0.71 1.05 1.03 0.89 0.91 0.66 0.55 0.87 0.45
0.06 0.36 10.87 0.11 0.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.79 87.15 1579.21 102.84 0.1 0.06 0.0 0.0 0.24 0.0 0.15 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
0.62 5.28 42.16 2.5 0.13 0.05 0.04 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.04 0.04 0.03 0.06 0.06 0.09 0.0 0.03 0.0 0.0
0.9 28.86 312.27 7.84 0.37 0.8 0.16 0.32 0.41 0.46 0.32 0.52 0.07 0.28 0.79 0.65 0.7 0.87 0.7 0.82 0.72 0.28
0.8 13.09 58.54 0.78 0.76 0.53 0.32 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0
0.1 2.45 20.69 1.12 0.15 0.09 0.15 0.07 0.08 0.13 0.09 0.1 0.09 0.04 0.04 0.05 0.02 0.05 0.04 0.08 0.07 0.3
0.06 2.1 32.01 2.26 0.04 0.05 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 7.42 59.45 1.16 0.06 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01
0.11 18.79 147.77 0.34 0.06 0.13 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0
1.21 6.38 33.42 2.13 0.1 0.72 0.73 0.51 0.49 0.3 0.51 0.53 0.51 0.44 0.47 0.52 0.48 0.47 0.35 0.53 0.53 0.44
1.01 20.34 187.86 4.44 0.25 0.42 0.19 0.34 0.17 0.11 0.19 0.28 0.13 0.57 0.16 0.42 0.22 0.28 0.06 0.15 0.26 0.32
1.56 11.11 91.52 3.36 0.67 1.41 0.22 0.88 1.2 1.24 0.96 0.86 0.61 1.88 0.77 0.97 0.71 0.59 0.88 0.79 0.99 1.05
1.71 5.47 58.52 5.89 1.25 0.81 0.27 0.38 0.16 0.21 0.37 0.94 0.17 0.73 0.54 0.71 0.4 0.32 0.54 0.29 0.5 0.63
2.04 11.28 104.47 7.61 1.27 1.79 1.88 1.3 1.9 1.03 1.41 1.53 3.16 1.64 0.99 0.68 1.35 0.96 0.7 2.06 3.23 1.15
0.08 0.44 7.64 0.32 0.01 0.04 0.05 0.25 0.0 0.27 0.2 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5
1.02 10.15 102.34 6.01 0.41 0.34 0.38 0.13 0.06 0.17 0.12 0.12 0.27 0.15 0.16 0.14 0.06 0.1 0.14 0.26 0.17 0.6
0.0 1.92 27.66 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.64 19.84 182.31 8.42 0.16 0.26 0.07 0.0 0.34 0.04 0.0 0.0 0.02 0.11 0.49 0.2 0.14 0.23 0.06 0.1 0.0 0.0
0.38 11.01 97.77 2.66 0.11 0.08 0.2 0.16 0.15 0.17 0.1 0.15 0.02 0.1 0.08 0.06 0.04 0.05 0.03 0.08 0.24 0.1
0.7 5.33 74.08 6.85 0.06 0.2 0.05 0.06 0.11 0.05 0.07 0.32 0.65 0.27 0.07 0.19 0.03 0.1 0.0 0.18 0.49 0.0
0.43 8.27 69.4 1.62 0.51 0.16 0.7 0.89 0.31 0.23 0.31 0.13 0.07 0.17 0.09 0.04 0.08 0.04 0.07 0.05 0.12 0.49
0.39 78.88 462.26 0.34 0.37 0.33 0.42 1.25 0.97 0.71 0.76 0.94 0.42 2.08 0.1 0.19 0.25 0.15 3.13 2.59 1.78 1.23
0.13 4.67 38.97 1.0 0.19 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.04 0.05 0.03 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02
0.0 0.0 5.75 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 9.28 143.58 3.62 0.36 0.12 0.05 0.0 0.0 0.0 0.57 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.37 0.0 0.48
0.0 0.87 9.25 0.62 0.04 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.08 0.0 0.11 0.09 0.0 0.1 0.36
0.0 1.69 14.58 1.2 0.13 0.21 0.12 0.41 0.0 0.0 0.24 0.0 0.28 0.06 0.0 0.15 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.61
0.0 0.87 9.25 0.62 0.04 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.08 0.0 0.11 0.09 0.0 0.1 0.36

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)