Heatmap: Cluster_99 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.33 1.0 0.1 0.03 0.0 0.19 0.08 0.19 0.36 0.16 0.12 0.24 0.04 0.14 0.13 0.21 0.15 0.19 0.94 0.73 0.79 0.15
0.49 0.74 0.0 0.0 0.0 0.3 0.19 1.0 0.68 0.83 0.71 0.75 0.06 0.45 0.24 0.22 0.22 0.27 0.36 0.69 0.82 0.33
0.43 0.18 0.12 0.01 0.25 0.58 0.45 0.59 0.84 0.68 0.61 0.98 0.31 0.32 0.39 0.41 0.39 0.36 0.24 0.49 0.6 1.0
0.15 1.0 0.04 0.01 0.01 0.25 0.33 0.6 0.61 0.56 0.48 0.51 0.08 0.39 0.19 0.18 0.25 0.3 0.05 0.57 0.37 0.08
0.07 0.05 0.01 0.03 0.06 0.16 0.13 1.0 0.18 0.53 0.6 0.23 0.29 0.16 0.21 0.16 0.27 0.17 0.03 0.14 0.21 0.23
0.11 0.28 0.0 0.01 0.04 0.22 0.22 1.0 0.2 0.46 0.49 0.3 0.05 0.6 0.23 0.16 0.21 0.19 0.4 0.52 0.41 0.38
0.61 0.28 0.08 0.01 0.45 0.79 0.88 0.55 0.92 0.54 0.63 0.75 0.66 0.45 0.61 0.53 0.62 0.53 0.39 0.64 0.59 1.0
0.42 0.16 0.03 0.0 0.02 0.29 0.49 0.81 1.0 0.43 0.8 0.68 0.39 0.25 0.15 0.16 0.18 0.14 0.3 0.56 0.47 0.7
0.36 0.25 0.1 0.0 0.17 0.35 0.6 0.67 0.8 0.78 0.8 1.0 0.4 0.51 0.33 0.34 0.38 0.31 0.5 0.43 0.39 0.71
0.72 0.53 0.38 0.01 0.52 0.79 1.0 0.62 0.87 0.6 0.58 0.81 0.68 0.74 0.65 0.67 0.66 0.6 0.54 0.8 0.69 0.84
0.1 0.03 0.01 0.0 0.04 0.14 0.28 0.8 1.0 0.5 0.77 0.71 0.24 0.07 0.11 0.11 0.13 0.16 0.07 0.31 0.31 0.43
0.0 0.33 0.01 0.12 0.0 0.14 0.19 0.45 0.11 0.43 0.39 0.08 0.09 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.02 1.0 0.92 0.1
0.3 0.15 0.0 0.06 0.0 0.41 0.38 0.57 1.0 0.51 0.74 0.94 0.25 0.64 0.08 0.08 0.11 0.1 0.31 0.26 0.2 0.66
0.29 0.31 0.0 0.22 0.01 0.62 0.43 0.79 0.36 0.45 0.42 0.64 0.09 0.38 0.83 0.88 0.81 0.79 1.0 0.44 0.39 0.4
0.77 0.39 0.12 0.01 0.34 0.71 0.96 0.5 1.0 0.48 0.56 0.89 0.92 0.75 0.74 0.7 0.75 0.7 0.41 0.85 0.73 0.99
0.24 1.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.15 0.57 0.11 0.47 0.3 0.13 0.03 0.02 0.01 0.19 0.15 0.21 0.04 0.34 0.37 0.14
0.15 0.34 0.0 0.33 0.0 0.03 0.15 0.52 1.0 0.46 0.0 0.0 0.5 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0
0.33 0.31 0.12 0.01 0.23 0.38 0.46 0.65 1.0 0.73 0.79 0.98 0.35 0.55 0.18 0.17 0.23 0.2 0.18 0.4 0.41 0.36
0.22 0.24 0.0 0.0 0.0 0.28 0.28 1.0 0.33 0.95 0.62 0.3 0.06 0.05 0.3 0.2 0.36 0.2 0.01 0.07 0.08 0.07
0.14 0.05 0.02 0.0 0.12 0.24 0.48 1.0 0.89 0.89 1.0 0.93 0.33 0.22 0.15 0.09 0.19 0.16 0.05 0.47 0.44 0.74
0.21 0.05 0.01 0.01 0.22 0.5 0.27 0.25 0.64 0.39 0.45 0.53 0.2 0.28 0.29 0.26 0.25 0.31 0.25 0.28 0.3 1.0
0.88 0.44 0.08 0.01 0.28 0.63 0.77 0.54 1.0 0.5 0.47 0.98 0.56 0.39 0.47 0.51 0.48 0.45 0.39 0.61 0.65 0.62
0.39 0.73 0.59 0.12 0.0 0.36 0.07 0.64 0.5 0.79 1.0 0.32 0.22 0.07 0.3 0.14 0.22 0.37 0.05 0.99 0.98 0.08
0.0 0.32 0.0 0.21 0.0 0.12 0.18 1.0 0.12 0.94 0.43 0.16 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.92 0.0
0.23 0.07 0.05 0.0 0.02 0.21 0.54 0.91 0.9 0.43 1.0 0.67 0.57 0.45 0.13 0.09 0.15 0.15 0.07 0.31 0.32 0.89
0.01 0.01 0.0 0.15 0.01 0.21 0.16 0.17 1.0 0.31 0.7 0.56 0.37 0.62 0.07 0.08 0.07 0.09 0.34 0.17 0.16 0.17
0.28 0.33 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.98 0.18 0.52 0.51 0.17 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.02
0.13 0.09 0.0 0.01 0.02 0.34 0.16 1.0 0.26 0.51 0.54 0.4 0.4 0.24 0.18 0.12 0.22 0.12 0.05 0.18 0.23 0.17
0.18 0.11 0.02 0.01 0.0 0.36 0.3 0.72 0.44 0.73 1.0 0.39 0.16 0.26 0.25 0.23 0.24 0.25 0.2 0.87 0.86 0.26
0.1 0.07 0.01 0.03 0.01 0.12 0.41 0.59 0.24 0.35 0.25 0.21 0.56 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.29 0.17 1.0
0.39 0.24 0.0 0.02 0.17 0.24 0.29 0.23 0.33 0.59 1.0 0.54 0.06 0.39 0.05 0.09 0.05 0.09 0.37 0.3 0.37 0.0
0.51 1.0 0.33 0.09 0.01 0.42 0.34 0.62 0.3 0.38 0.41 0.42 0.08 0.23 0.31 0.37 0.41 0.52 0.95 0.99 0.96 0.61
0.15 0.04 0.0 0.04 0.01 0.04 0.17 1.0 0.33 0.19 0.65 0.67 0.2 0.15 0.03 0.01 0.08 0.03 0.0 0.16 0.18 0.17
0.14 0.01 0.03 0.03 0.0 0.06 0.11 0.57 0.85 0.15 0.18 1.0 0.43 0.07 0.04 0.05 0.09 0.07 0.03 0.33 0.3 0.3
0.22 0.07 0.17 0.01 0.03 0.21 0.46 1.0 0.91 0.73 0.99 0.85 0.59 0.19 0.1 0.07 0.13 0.11 0.05 0.47 0.47 0.43
0.13 0.85 0.08 0.0 0.0 0.11 0.2 1.0 0.2 0.39 0.91 0.23 0.22 0.03 0.03 0.03 0.07 0.02 0.07 0.11 0.06 0.0
0.19 0.05 0.0 0.02 0.01 0.43 0.41 1.0 0.36 0.64 0.54 0.3 0.07 0.66 0.56 0.64 0.5 0.57 0.83 0.63 0.52 0.88
0.26 0.42 0.0 0.04 0.0 0.1 0.14 0.4 0.77 0.38 0.81 1.0 0.21 0.23 0.06 0.06 0.15 0.04 0.03 0.07 0.08 0.0
0.49 0.88 0.12 0.11 0.0 0.31 0.15 0.3 0.71 0.32 0.15 0.54 0.12 0.28 0.17 0.21 0.28 0.2 0.32 1.0 0.85 0.11
0.09 0.02 0.0 0.02 0.0 0.2 0.32 0.26 1.0 0.35 0.45 0.54 0.6 0.13 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.26 0.2 0.16
0.19 0.91 0.76 0.03 0.01 0.23 0.31 0.46 0.25 0.18 0.3 0.1 0.09 0.12 0.17 0.15 0.21 0.16 0.14 1.0 0.75 0.07
0.62 0.32 0.03 0.03 0.24 0.41 0.6 0.42 1.0 0.65 0.68 0.88 0.69 0.98 0.34 0.3 0.32 0.33 0.44 0.34 0.41 0.96
0.02 0.01 0.0 0.07 0.0 0.11 0.02 0.61 0.99 0.62 1.0 0.57 0.06 0.28 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01
0.26 0.46 0.17 0.04 0.13 0.49 0.85 1.0 0.81 0.65 0.92 0.66 0.43 0.56 0.32 0.32 0.4 0.31 0.41 0.38 0.41 0.51
0.2 0.35 0.0 0.07 0.0 0.55 0.28 0.62 0.35 0.59 0.53 0.35 0.06 0.37 0.82 1.0 0.82 0.86 0.61 0.56 0.52 0.59
0.46 0.41 0.18 0.02 0.36 0.45 0.67 0.58 0.73 1.0 0.73 0.83 0.53 0.24 0.25 0.21 0.26 0.25 0.28 0.48 0.57 0.49
0.09 0.03 0.0 0.11 0.0 0.04 0.16 0.99 0.7 0.62 1.0 0.75 0.41 0.21 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.25 0.1 0.28
0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.25 0.7 0.9 0.19 0.4 1.0 0.2 0.05 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.14 0.22 0.3
0.01 0.16 0.0 0.18 0.0 0.3 0.25 0.25 0.0 0.45 0.66 0.24 0.14 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.98 0.13
0.16 1.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.1 1.0 0.2 0.8 0.53 0.26 0.06 0.02 0.08 0.07 0.09 0.1 0.0 0.63 0.66 0.06
0.05 0.0 0.0 0.53 0.02 0.48 1.0 0.0 0.69 0.32 0.29 0.66 0.3 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.03 0.0 0.06 0.0 0.07 0.2 1.0 0.22 0.48 0.56 0.21 0.09 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.03 0.1 0.17
0.01 1.0 0.17 0.22 0.01 0.07 0.15 0.41 0.06 0.34 0.23 0.1 0.03 0.09 0.03 0.01 0.0 0.05 0.08 0.73 0.3 0.04
0.26 0.13 0.24 0.14 0.1 0.17 0.23 1.0 0.58 0.35 0.06 0.37 0.45 0.02 0.19 0.0 0.09 0.06 0.0 0.3 0.43 0.1
0.1 0.17 0.0 0.06 0.0 0.11 0.05 0.26 0.09 0.64 1.0 0.1 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.25
0.12 0.25 0.15 0.1 0.0 0.21 0.0 0.32 0.68 0.58 1.0 0.64 0.25 0.22 0.05 0.06 0.06 0.04 0.07 0.2 0.16 0.07
0.08 0.01 0.02 0.0 0.01 0.08 0.3 1.0 0.77 0.68 1.0 0.64 0.28 0.06 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.31 0.24 0.57
0.26 0.09 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 1.0 0.19 0.71 0.36 0.25 0.01 0.23 0.15 0.03 0.0 0.0 0.06 0.5 0.44 0.01
0.47 0.3 0.25 0.02 0.07 0.39 0.61 1.0 0.66 0.63 0.85 0.56 0.52 0.17 0.24 0.2 0.28 0.25 0.14 0.33 0.47 0.48
0.07 0.45 0.0 0.16 0.0 0.12 0.02 0.39 0.65 0.29 0.7 0.31 0.16 0.35 0.0 0.0 0.05 0.12 1.0 0.55 0.37 0.12
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 1.0 0.83 0.41 0.56 0.85 0.24 0.06 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.27 0.27 0.36
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.91 0.77 0.64 1.0 0.81 0.15 0.09 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.18 0.16 0.28
0.07 0.09 0.17 0.0 0.02 0.18 0.54 0.72 1.0 0.48 0.72 0.77 0.58 0.92 0.12 0.08 0.14 0.14 0.08 0.36 0.3 0.92
0.01 0.01 0.0 0.02 0.23 0.18 0.2 0.16 0.87 0.21 1.0 0.66 0.38 0.93 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.18 0.07 0.24
0.49 0.24 0.16 0.01 0.32 0.71 1.0 0.38 0.81 0.38 0.41 0.73 0.48 0.33 0.35 0.43 0.38 0.39 0.23 0.54 0.53 0.87
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.12 0.84 0.66 0.61 1.0 0.62 0.35 0.31 0.02 0.01 0.04 0.02 0.03 0.17 0.16 0.24
0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.11 0.14 0.45 1.0 0.55 0.88 0.8 0.67 0.05 0.02 0.01 0.03 0.02 0.0 0.31 0.15 0.08
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.15 0.17 0.15 0.82 0.2 1.0 0.79 0.59 0.59 0.0 0.05 0.0 0.06 0.05 0.32 0.2 0.0
0.28 0.14 0.0 0.01 0.0 0.62 0.59 1.0 0.85 0.76 0.96 0.8 0.88 0.25 0.21 0.17 0.18 0.19 0.08 0.38 0.62 0.38
0.42 0.46 0.03 0.0 0.0 0.33 0.32 1.0 0.26 0.79 0.63 0.22 0.03 0.24 0.29 0.33 0.32 0.44 0.07 0.43 0.52 0.46
0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.17 0.47 1.0 0.65 0.63 1.0 0.49 0.12 0.11 0.05 0.06 0.06 0.05 0.09 0.07 0.06 0.38
0.21 0.34 0.0 0.04 0.02 0.17 0.1 0.21 0.61 0.63 1.0 0.37 0.03 0.12 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.04 0.01 0.07
0.23 0.22 0.0 0.08 0.0 0.19 0.0 0.35 0.73 0.62 1.0 0.61 0.02 0.21 0.08 0.07 0.05 0.08 0.43 0.07 0.11 0.0
0.12 0.05 0.02 0.0 0.01 0.22 0.48 0.67 1.0 0.66 0.64 0.97 0.34 0.19 0.05 0.05 0.06 0.04 0.04 0.35 0.31 0.21
0.57 0.38 0.2 0.02 0.56 0.77 0.87 0.63 0.79 0.65 0.71 0.78 0.53 0.5 0.52 0.47 0.54 0.49 0.4 0.61 0.59 1.0
0.07 0.22 0.0 0.0 0.0 0.29 0.15 0.53 0.85 0.88 1.0 0.93 0.29 0.3 0.14 0.14 0.19 0.16 0.46 0.25 0.21 0.56
0.01 0.0 0.0 0.05 0.01 0.23 0.53 0.58 0.33 0.16 0.48 0.38 1.0 0.01 0.04 0.05 0.07 0.06 0.03 0.35 0.26 0.58
0.07 0.02 0.0 0.0 0.07 0.18 0.46 0.8 0.91 0.46 0.74 0.77 0.44 0.18 0.08 0.06 0.07 0.07 0.07 0.32 0.23 1.0
0.3 0.03 0.0 0.04 0.02 0.46 0.58 0.4 0.7 0.53 1.0 0.42 0.61 0.24 0.09 0.06 0.1 0.11 0.04 0.5 0.12 0.71
0.3 0.03 0.0 0.04 0.02 0.46 0.58 0.4 0.7 0.53 1.0 0.42 0.61 0.24 0.09 0.06 0.1 0.11 0.04 0.5 0.12 0.71
0.0 0.01 0.44 0.0 0.0 0.13 0.0 1.0 0.33 0.54 0.27 0.63 0.07 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.18 0.44
0.14 0.01 0.01 0.08 0.0 0.34 0.86 0.68 0.0 1.0 0.16 0.0 0.16 0.25 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.19 0.11 0.0
0.09 0.01 0.0 0.02 0.0 0.38 0.77 0.46 0.07 0.54 0.13 0.07 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0
0.46 0.42 0.53 0.02 0.41 0.58 0.53 0.98 0.81 1.0 0.92 0.73 0.29 0.57 0.43 0.31 0.45 0.45 0.3 0.79 0.76 0.69

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)