Heatmap: Cluster_175 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.6 0.63 0.19 0.02 0.78 0.69 0.52 0.53 0.5 0.48 0.43 0.48 0.21 0.47 0.55 0.56 0.63 0.63 1.0 0.39 0.39 0.42
0.98 0.91 0.55 0.09 0.99 0.96 0.79 0.52 0.72 0.54 0.5 0.8 0.44 0.42 0.94 0.72 1.0 0.86 0.86 0.65 0.62 0.79
0.43 0.48 0.48 0.01 0.47 0.58 0.68 0.36 0.54 0.31 0.35 0.47 0.2 0.46 0.53 0.51 0.55 0.57 1.0 0.39 0.42 0.61
0.28 0.28 0.73 0.08 0.76 0.71 0.33 0.52 0.89 0.54 0.48 0.81 0.29 0.39 0.27 0.34 0.27 0.31 0.36 0.6 0.69 1.0
0.31 0.31 1.0 0.08 0.64 0.79 0.64 0.39 0.4 0.5 0.45 0.42 0.24 0.43 0.62 0.49 0.67 0.5 0.55 0.33 0.33 0.63
0.73 0.84 0.64 0.03 0.95 0.94 1.0 0.44 0.56 0.38 0.41 0.54 0.39 0.34 0.63 0.6 0.62 0.64 0.76 0.5 0.57 0.48
0.24 0.14 0.02 0.04 0.8 0.98 0.9 0.3 1.0 0.35 0.39 0.89 0.4 0.3 0.46 0.37 0.41 0.44 0.38 0.84 0.69 0.83
0.3 0.29 0.2 0.0 0.75 1.0 0.88 0.29 0.98 0.51 0.5 0.89 0.69 0.4 0.44 0.47 0.47 0.47 0.34 0.79 0.83 0.27
0.31 0.22 0.09 0.01 0.9 1.0 0.71 0.23 0.72 0.27 0.31 0.66 0.47 0.3 0.6 0.61 0.64 0.62 0.54 0.81 0.76 0.31
0.4 0.57 1.0 0.06 0.57 0.71 0.61 0.43 0.57 0.42 0.44 0.74 0.26 0.81 0.52 0.42 0.56 0.54 0.8 0.71 0.58 0.66
0.61 0.57 0.18 0.04 1.0 0.86 0.8 0.71 0.75 0.83 0.64 0.75 0.34 0.56 0.71 0.69 0.65 0.66 0.56 0.6 0.61 0.95
0.51 0.65 0.66 0.03 1.0 0.86 0.89 0.45 0.79 0.39 0.41 0.77 0.35 0.56 0.67 0.65 0.64 0.62 0.97 0.8 0.77 0.76
0.68 0.49 0.1 0.03 0.55 1.0 0.94 0.29 0.39 0.24 0.23 0.38 0.33 0.26 0.59 0.57 0.59 0.52 0.47 0.43 0.46 0.35
0.48 0.43 0.18 0.05 0.75 1.0 0.76 0.49 0.89 0.55 0.52 0.95 0.55 0.66 0.66 0.63 0.64 0.65 0.74 0.82 0.78 0.67
0.46 0.35 0.56 0.04 0.62 1.0 0.67 0.17 0.4 0.11 0.14 0.23 0.54 0.44 0.59 0.47 0.48 0.59 0.44 0.3 0.37 0.23
0.49 0.7 0.66 0.03 0.46 0.61 0.44 0.51 0.64 0.45 0.45 0.64 0.21 1.0 0.39 0.37 0.44 0.41 0.55 0.72 0.64 0.59
0.79 0.76 0.64 0.02 1.0 0.83 0.67 0.61 0.61 0.47 0.57 0.68 0.43 0.6 0.74 0.78 0.69 0.66 0.83 0.54 0.56 0.73
0.61 0.52 0.52 0.02 0.5 1.0 0.81 0.56 0.48 0.35 0.37 0.38 0.23 0.44 0.93 0.83 0.95 0.89 0.41 0.33 0.38 0.6
0.6 0.5 0.59 0.02 1.0 0.78 0.58 0.38 0.42 0.26 0.28 0.41 0.22 0.29 0.72 0.71 0.71 0.68 0.5 0.34 0.42 0.44
0.34 0.28 0.09 0.01 1.0 0.99 0.86 0.3 0.61 0.5 0.51 0.48 0.2 0.29 0.81 0.72 0.69 0.75 0.57 0.33 0.37 0.55
0.66 0.66 0.7 0.03 0.87 0.93 1.0 0.57 0.78 0.65 0.55 0.74 0.41 0.54 0.82 0.79 0.82 0.78 0.7 0.47 0.56 0.61
0.54 0.38 0.63 0.03 0.99 0.8 0.63 0.44 0.52 0.48 0.38 0.54 0.21 0.61 0.67 0.75 0.71 0.67 1.0 0.4 0.43 0.99
0.57 0.63 0.31 0.03 0.91 0.88 0.77 0.5 0.95 0.92 0.68 1.0 0.33 0.35 0.59 0.59 0.61 0.56 0.56 0.51 0.5 0.51
0.69 0.44 0.07 0.01 0.87 0.88 1.0 0.43 0.96 0.39 0.39 0.99 0.69 0.54 0.46 0.44 0.5 0.49 0.4 0.73 0.85 0.69
0.72 0.57 0.65 0.04 0.8 1.0 1.0 0.71 0.55 0.4 0.57 0.49 0.47 0.75 0.96 0.95 0.96 0.88 0.78 0.59 0.69 0.75
0.72 0.65 0.68 0.02 0.95 0.87 0.78 0.4 0.54 0.35 0.37 0.49 0.3 0.56 0.81 0.85 0.83 0.8 1.0 0.49 0.58 0.65
0.42 0.66 0.4 0.03 0.91 1.0 0.83 0.32 0.84 0.39 0.47 0.72 0.61 0.42 0.47 0.43 0.36 0.4 0.58 0.53 0.63 0.36
0.59 0.56 0.51 0.06 0.84 0.98 1.0 0.57 0.75 0.46 0.52 0.81 0.58 0.51 0.83 0.76 0.81 0.84 0.41 0.67 0.71 0.69
0.49 0.51 1.0 0.03 0.54 0.56 0.58 0.43 0.56 0.46 0.44 0.68 0.3 0.59 0.51 0.52 0.55 0.48 0.68 0.39 0.43 0.78
0.62 0.44 0.34 0.05 0.87 0.9 1.0 0.46 0.67 0.37 0.5 0.49 0.67 0.42 0.48 0.49 0.53 0.54 0.6 0.63 0.57 0.74
0.78 0.85 0.78 0.01 0.96 1.0 0.86 0.72 0.74 0.64 0.66 0.73 0.39 0.52 0.83 0.82 0.84 0.79 0.86 0.58 0.6 0.79
0.25 0.35 0.04 0.02 0.5 1.0 0.88 0.18 0.68 0.27 0.21 0.71 0.66 0.39 0.5 0.44 0.55 0.53 0.56 0.62 0.71 0.14
0.31 0.18 0.08 0.01 0.48 1.0 0.58 0.11 0.45 0.12 0.14 0.32 0.25 0.15 0.55 0.41 0.38 0.38 0.18 0.32 0.27 0.11
0.08 0.03 0.02 0.0 0.57 0.91 0.54 0.28 0.53 0.31 0.2 0.66 0.12 0.3 0.27 0.37 0.22 0.21 0.25 1.0 0.84 0.39
0.45 0.25 0.14 0.01 1.0 0.98 0.94 0.4 0.56 0.38 0.49 0.62 0.44 0.44 0.43 0.41 0.44 0.4 0.42 0.51 0.51 0.83
0.27 0.31 0.29 0.02 0.9 0.81 0.34 0.3 0.89 0.43 0.39 1.0 0.59 0.47 0.42 0.43 0.38 0.37 0.4 0.52 0.6 0.48
0.28 0.16 0.06 0.02 1.0 0.89 0.62 0.45 0.63 0.54 0.48 0.74 0.63 0.45 0.47 0.46 0.43 0.4 0.48 0.78 0.81 0.72
0.69 0.82 1.0 0.01 0.64 0.69 0.88 0.57 0.63 0.61 0.48 0.71 0.22 0.57 0.7 0.73 0.76 0.7 0.94 0.38 0.41 0.81
0.59 0.5 0.39 0.02 0.74 0.7 0.84 0.47 0.43 0.33 0.35 0.39 0.19 0.44 0.62 0.64 0.61 0.62 0.99 0.39 0.45 1.0
0.91 0.72 0.49 0.03 0.93 1.0 0.98 0.56 0.57 0.44 0.45 0.52 0.43 0.76 0.95 0.98 0.98 1.0 0.92 0.57 0.67 0.88
0.61 0.49 0.37 0.01 0.73 1.0 0.89 0.32 0.51 0.27 0.31 0.46 0.3 0.42 0.71 0.67 0.69 0.71 0.63 0.5 0.49 0.4
0.21 0.18 0.07 0.02 0.72 0.86 0.61 0.28 1.0 0.3 0.41 0.88 0.71 0.28 0.58 0.55 0.59 0.49 0.39 0.72 0.78 0.48
0.4 0.34 0.04 0.02 0.53 0.75 0.8 0.37 1.0 0.32 0.23 0.91 0.32 0.36 0.15 0.15 0.23 0.17 0.35 0.56 0.54 0.48
0.54 0.44 0.13 0.02 0.56 0.96 0.88 0.33 1.0 0.42 0.55 0.94 0.62 0.54 0.42 0.37 0.34 0.35 0.32 0.57 0.58 0.37
0.66 0.52 0.52 0.02 0.67 0.83 0.68 0.43 0.49 0.33 0.46 0.37 0.39 0.43 0.76 0.74 0.78 0.78 1.0 0.39 0.48 0.83
0.56 0.54 0.42 0.01 0.9 0.85 0.9 0.58 0.58 0.57 0.52 0.58 0.35 0.77 0.74 0.76 0.71 0.67 1.0 0.45 0.59 0.77
0.89 0.6 0.71 0.07 0.96 0.94 1.0 0.44 0.48 0.32 0.38 0.44 0.28 0.41 0.97 0.98 0.9 0.89 0.83 0.5 0.46 0.71
0.14 0.1 0.15 0.03 1.0 0.74 0.32 0.31 0.51 0.32 0.27 0.7 0.31 0.3 0.25 0.26 0.23 0.19 0.1 0.34 0.35 0.67
1.0 0.89 0.36 0.02 0.74 0.96 0.97 0.41 0.51 0.28 0.33 0.43 0.45 0.63 0.83 0.86 0.86 0.84 0.95 0.6 0.68 0.4
0.5 0.45 0.34 0.01 0.83 0.7 0.65 0.41 0.57 0.33 0.34 0.47 0.3 0.55 0.69 0.71 0.72 0.7 1.0 0.36 0.39 0.69

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)