Heatmap: Cluster_26 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.14 0.0 11.26 1.34 0.22 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.61 10.06 2.59 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.88 5.06 0.86 0.1 0.05 0.06 0.07 0.07 0.09 0.07 0.03 0.02 0.03 0.0 0.03 0.06 0.05 0.05 0.05 0.06 0.05
0.04 1.9 32.63 0.3 0.23 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29
2.07 1.5 70.2 32.23 0.76 0.44 0.89 0.8 0.58 0.76 0.99 0.56 0.16 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.17 2.2
0.26 0.0 9.63 2.98 0.0 0.03 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 1.22 4.06 0.55 0.0 0.14 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32
0.0 0.0 3.42 1.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.0 4.46 0.15 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.64 2.35 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.93 9.23 88.65 0.54 0.05 1.55 0.91 0.63 1.65 0.41 0.83 2.13 0.09 1.58 0.45 0.5 0.59 0.45 0.48 0.15 0.15 0.79
0.26 0.39 5.88 1.66 0.33 0.23 0.16 0.12 0.2 0.13 0.18 0.11 0.15 0.16 0.07 0.15 0.04 0.15 0.15 0.27 0.32 0.16
0.63 43.06 568.64 0.28 2.29 0.17 0.13 0.07 0.25 0.22 0.36 0.29 0.07 0.15 0.12 0.16 0.1 0.06 0.22 0.24 0.2 0.18
1.69 3.05 35.36 0.55 0.97 0.9 1.24 0.42 1.0 0.3 0.74 0.65 0.51 0.54 0.35 0.56 0.33 0.42 0.4 0.65 0.62 1.19
0.05 0.0 3.34 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 2.11 15.23 0.64 0.14 0.09 0.17 0.31 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.05 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.9 24.79 0.46 0.21 0.02 0.26 0.0 0.0 1.11 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 25.17 6.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.69 0.0 2.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.34 0.0 0.0
0.0 0.0 9.98 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 1.05 2.88 0.59 0.01 0.11 0.04 0.32 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.01 0.06 0.09 0.14 0.11 0.23 0.06 0.14 0.0
0.47 1.49 24.8 0.36 0.04 0.11 0.14 0.21 0.14 0.16 0.0 0.21 0.06 0.03 0.0 0.02 0.15 0.02 0.11 0.23 0.26 0.19
0.43 0.57 3.97 0.57 0.21 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.05 0.6 5.29 0.64 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.64 3.72 0.61 0.05 0.03 0.02 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.77 2.13 0.48 0.0 0.07 0.02 0.01 0.1 0.0 0.03 0.0 0.08 0.04 0.03 0.03 0.02 0.02 0.08 0.03 0.02 0.02
0.26 1.9 10.83 5.51 0.21 0.23 0.19 0.0 0.0 0.08 0.33 0.35 0.08 0.07 0.0 0.0 0.06 0.11 0.0 0.0 0.0 0.09
0.12 0.0 2.56 0.75 0.0 0.04 0.03 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 9.05 137.35 1.12 0.27 0.25 0.12 0.0 0.0 0.58 0.26 0.0 0.0 0.17 0.48 0.0 0.28 0.0 0.0 0.16 0.75 0.44
1.03 2.92 8.71 0.7 0.42 0.43 0.25 0.0 0.0 0.24 0.0 0.55 0.64 0.63 0.36 0.22 0.0 0.16 0.0 0.44 0.0 0.59
0.0 0.0 24.39 4.26 0.05 0.11 0.14 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.3 0.45 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.16 2.7 0.96 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.13 3.22 1.24 0.1 0.06 0.05 0.0 0.26 0.14 0.29 0.0 0.42 0.1 0.04 0.0 0.02 0.04 0.0 0.07 0.06 0.07
0.21 0.37 1.55 0.53 0.01 0.06 0.04 0.06 0.04 0.06 0.02 0.0 0.03 0.15 0.04 0.04 0.02 0.03 0.0 0.01 0.13 0.09
0.05 0.24 1.68 0.6 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 6.38 1.04 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.9 5.26 1.06 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.24 1.11 9.19 1.33 0.1 0.07 0.1 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.19 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.7 3.42 1.05 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 1.59 0.56 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.15 0.0
0.02 0.08 0.71 0.22 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.63 8.67 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 1.42 4.97 0.92 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.68 4.86 0.97 0.07 0.1 0.2 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.04 0.32 0.14 0.0 0.14 0.0 0.0 0.24 0.0 0.11
0.24 1.0 10.09 0.96 0.44 0.46 0.01 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.0 0.0 0.07 0.14 0.18 0.0 0.0 0.0
0.64 0.79 18.66 2.16 0.0 0.02 0.05 0.16 0.0 0.14 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0
0.0 1.33 46.51 1.53 0.5 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.84 0.09 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0
0.0 0.05 0.35 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 2.04 7.48 0.99 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
1.04 20.01 143.93 0.51 0.06 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.55 1.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89
0.19 0.62 4.71 1.66 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.09 0.86 6.9 0.9 0.0 0.08 0.12 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.05 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0
0.15 0.0 2.52 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 2.66 8.63 1.02 0.0 0.1 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35
0.0 0.0 22.64 4.83 0.0 0.33 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.31 7.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.65 2.87 0.34 0.11 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.09
0.0 0.0 2.14 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.35 19.85 0.24 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 1.3 3.81 0.45 0.02 0.01 0.02 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.16 23.55 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 1.35 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.83 19.64 0.5 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.44 6.23 0.26 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 3.0 78.11 8.52 1.12 1.34 1.81 0.0 4.54 1.92 2.82 0.0 1.88 1.44 1.46 1.72 0.0 0.0 3.35 5.48 0.0 2.36
0.0 0.0 6.05 1.43 0.0 0.06 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.35 19.19 3.36 0.0 0.13 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 4.58 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.1 4.44 1.4 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.88 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.61 21.64 1.71 0.13 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)