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Heatmap: Cluster_155 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.49 0.67 0.55 -5.63 -0.19 -0.01 0.3 0.01 0.39 -0.01 -0.05 0.45 -0.9 -0.33 -0.39 -0.38 -0.38 -0.42 0.18 0.03 0.09 0.26
0.66 0.95 0.95 -4.5 0.07 0.34 0.53 -0.78 -0.34 -0.52 -0.71 0.02 -1.56 -0.27 0.21 0.04 0.25 0.28 0.69 -0.9 -0.67 -0.9
1.16 0.97 0.93 -4.46 0.17 0.04 0.23 -0.44 -0.67 -0.68 -0.87 -0.17 -2.28 0.57 0.18 0.19 0.23 0.08 0.08 -1.15 -0.95 -0.18
0.33 0.8 0.85 -5.6 -0.02 -0.04 0.28 -0.14 0.29 -0.21 -0.14 0.4 -0.76 -0.25 -0.4 -0.48 -0.32 -0.34 0.36 -0.1 -0.1 0.21
0.64 0.7 -0.5 -6.89 -0.02 0.16 0.43 0.46 0.26 0.18 0.27 0.14 -0.84 0.08 -0.28 -0.32 -0.22 -0.35 0.16 -0.44 -0.35 0.14
0.41 1.23 -0.8 -5.4 -0.3 0.03 0.45 -0.48 0.65 0.38 0.58 0.31 -1.34 -0.52 0.03 0.13 0.1 0.04 -0.01 -0.58 -0.59 -0.77
0.15 0.64 0.02 -5.74 0.49 0.09 0.67 -0.39 0.16 0.16 -0.2 0.2 -1.07 0.0 -0.18 -0.21 -0.04 -0.15 0.52 -0.28 -0.16 -0.04
0.7 0.67 0.7 -4.15 -0.35 -0.11 0.34 -0.05 0.19 -0.1 -0.24 0.41 -0.41 -0.35 -0.19 -0.24 -0.19 -0.24 -0.05 -0.16 -0.04 0.13
0.82 0.71 -0.02 -4.56 0.01 0.12 0.51 -0.1 0.22 0.02 -0.26 0.46 -1.9 0.26 -0.07 -0.12 -0.14 -0.25 0.02 -0.28 -0.34 0.03
0.36 0.57 0.87 -4.19 -0.01 0.13 0.58 -0.39 0.53 -0.56 -0.45 0.59 -0.61 0.08 -0.3 -0.25 -0.3 -0.3 0.08 -0.11 -0.19 -0.34
0.24 0.35 0.45 -4.29 -0.05 0.02 0.48 0.05 0.25 -0.16 -0.09 0.23 -0.57 0.31 -0.4 -0.39 -0.3 -0.29 0.25 -0.17 -0.11 0.55
0.92 0.79 0.18 -4.87 0.2 0.37 0.59 -0.06 -0.25 -0.43 -0.52 -0.04 -1.16 -0.51 -0.14 -0.13 -0.06 -0.05 0.43 -0.34 -0.31 0.29
0.34 0.69 0.78 -6.64 -0.42 -0.05 0.6 -0.05 0.17 -0.08 -0.05 0.19 -0.84 -0.05 -0.15 -0.11 -0.09 -0.13 0.12 -0.35 -0.35 0.21
0.55 0.6 0.16 -7.14 -0.09 -0.01 0.48 -0.08 -0.05 -0.43 -0.49 -0.03 -1.23 0.17 0.1 0.0 0.18 0.07 0.4 -0.41 -0.26 0.6
0.46 -0.12 1.37 -2.32 -0.05 -0.31 0.22 -0.38 0.23 -0.61 -0.43 0.53 -0.13 -0.73 -1.0 -0.45 -0.45 -0.21 -0.5 0.42 0.55 0.43
1.22 0.92 0.44 -3.89 -0.12 -0.04 0.83 -0.55 -0.44 -0.99 -0.91 -0.46 -0.83 0.13 -0.25 -0.17 -0.27 -0.08 -0.11 0.15 0.24 0.17
0.9 0.59 1.35 -3.79 -0.23 -0.13 0.46 -0.33 0.18 -0.75 -0.63 0.12 -1.28 0.66 -0.36 -0.37 -0.33 -0.39 0.15 -0.72 -0.66 0.21
0.25 0.75 0.14 -7.99 0.06 -0.09 0.43 -0.01 0.07 0.53 0.07 0.34 -1.26 0.16 -0.1 -0.13 -0.02 -0.14 0.27 -0.59 -0.43 -0.0
0.47 0.44 0.78 -4.01 -0.31 0.17 0.68 -0.1 0.22 -0.07 -0.15 0.29 -0.45 0.22 -0.37 -0.5 -0.27 -0.3 -0.15 -0.2 -0.08 0.05
0.5 0.6 0.81 -4.19 -0.11 0.14 0.54 -0.25 0.49 -0.58 -0.21 0.33 -0.48 -0.28 -0.29 -0.32 -0.33 -0.3 0.18 -0.12 -0.11 -0.0
1.53 1.43 1.18 -3.79 0.07 0.13 -0.18 -0.45 -1.26 -0.51 -0.92 -0.96 -1.84 -0.12 0.39 0.15 0.22 -0.02 -1.34 -0.53 -0.27 -1.07
0.52 0.76 1.03 -4.49 -0.6 -0.05 0.56 0.02 0.13 0.37 0.05 0.31 -1.65 0.11 -0.43 -0.51 -0.43 -0.34 -0.01 -0.56 -0.5 0.33
0.53 0.42 1.11 -3.7 -0.33 -0.28 0.69 -0.08 0.42 -0.22 -0.31 0.47 -0.93 0.2 -0.52 -0.34 -0.42 -0.49 0.24 -0.51 -0.49 0.23
0.88 0.84 -2.91 -4.04 -0.31 0.33 0.56 0.11 0.06 -0.07 -0.19 0.14 -2.34 -0.1 0.02 -0.07 0.15 0.14 0.32 -0.04 -0.21 0.26
0.51 0.73 1.08 -4.92 -0.42 -0.06 0.34 -0.4 -0.01 -0.61 -0.33 -0.15 0.17 0.19 -0.26 -0.24 -0.19 -0.19 0.28 0.03 0.17 -0.64
0.46 0.7 0.23 -5.1 0.12 -0.06 0.43 0.03 0.46 -0.18 -0.11 0.32 -0.8 -0.18 -0.32 -0.37 -0.3 -0.32 0.32 -0.09 0.05 0.11
0.32 0.53 0.15 -5.44 -0.08 -0.0 0.38 0.03 0.52 -0.39 -0.17 0.56 -0.35 -0.04 -0.2 -0.12 -0.06 -0.04 0.2 -0.16 -0.1 -0.17
0.38 0.39 -0.14 -5.3 0.04 0.15 0.21 0.32 -0.15 0.23 0.19 -0.19 -0.26 -0.52 -0.17 -0.19 -0.15 -0.16 0.29 0.02 0.08 0.51
0.07 1.65 -0.07 -6.22 0.19 0.36 0.93 -0.44 0.98 0.33 0.87 0.1 -2.57 0.03 -0.46 -0.56 -0.66 -0.57 -1.31 -0.81 -1.12 -1.67
0.15 0.53 1.0 -2.27 -0.03 -0.0 0.27 0.01 0.27 -0.24 -0.15 0.31 -0.38 0.01 -0.33 -0.29 -0.24 -0.36 -0.08 0.07 -0.05 -0.19
0.28 0.55 0.46 -4.78 0.25 -0.15 0.51 -0.01 0.3 -0.1 -0.15 0.27 -0.88 -0.13 -0.12 -0.18 -0.09 -0.15 0.28 -0.15 -0.17 0.02
0.28 0.44 0.71 -4.95 -0.11 -0.07 0.6 0.0 0.34 0.16 0.05 0.42 -0.68 -0.15 -0.32 -0.35 -0.26 -0.29 -0.02 -0.36 -0.32 0.35
1.01 1.21 1.15 -4.9 -0.08 0.09 0.44 -1.0 -1.13 -0.7 -1.25 -0.75 -1.75 0.71 0.24 0.18 0.46 0.34 0.15 -1.25 -0.99 -0.81
0.78 0.84 0.28 -3.41 -0.45 -0.09 0.67 -0.27 0.12 -0.43 -0.34 0.08 -1.07 0.09 -0.08 -0.07 0.0 -0.03 0.18 -0.35 -0.15 0.23
0.21 0.59 1.0 -4.09 -0.26 0.01 0.37 0.02 0.14 0.0 -0.21 0.09 -0.06 -0.52 -0.24 -0.38 -0.16 -0.29 0.11 -0.06 0.2 -0.12
0.51 0.4 0.23 -3.78 0.16 -0.42 0.64 0.1 0.4 0.19 0.27 0.43 -0.98 -0.47 -0.65 -0.63 -0.37 -0.39 -0.04 -0.41 -0.35 0.96
0.48 0.61 0.63 -3.98 0.09 0.02 0.44 -0.1 -0.04 -0.46 -0.31 -0.17 -1.07 0.1 0.05 -0.02 0.11 0.03 0.62 -0.61 -0.45 0.15
0.48 0.24 0.21 -4.49 0.13 -0.02 0.52 -0.19 0.45 -0.54 -0.35 0.42 -0.73 0.17 -0.08 -0.11 -0.15 -0.1 0.39 -0.27 -0.21 0.26
0.37 0.72 1.08 -6.07 -1.02 0.18 0.54 -0.26 0.32 -0.35 -0.25 0.27 -0.9 0.35 -0.2 -0.43 -0.22 -0.32 -0.24 -0.18 -0.3 0.41
0.79 0.64 0.19 -6.37 0.21 0.06 0.56 0.34 -0.13 0.16 0.22 -0.04 -2.46 0.03 -0.1 0.1 0.02 0.06 0.38 -1.07 -1.11 -0.11
0.54 0.62 -0.39 -6.47 0.11 0.01 0.67 -0.12 0.24 -0.31 -0.13 0.16 -0.5 -0.09 -0.15 -0.12 -0.06 -0.07 0.16 -0.36 -0.18 0.55
0.52 0.89 1.24 -5.84 0.14 0.03 0.85 -0.27 -0.05 -0.7 -0.29 -0.48 -1.23 -0.15 0.02 0.05 -0.06 0.06 0.05 -0.8 -0.73 -0.21
0.64 0.73 0.41 -5.38 -0.04 -0.08 0.32 -0.09 0.45 -0.14 -0.16 0.4 -0.58 -0.6 -0.11 -0.11 -0.02 -0.13 0.24 -0.37 -0.22 -0.09
0.49 0.45 1.33 -3.91 -0.69 0.06 0.69 -0.21 0.44 -0.41 -0.32 0.29 -0.15 0.19 -0.78 -0.66 -0.68 -0.71 -0.38 -0.14 -0.08 0.3
0.59 0.59 1.23 -3.62 -0.08 -0.05 0.29 -0.31 0.22 -0.57 -0.63 0.2 -1.25 0.0 0.04 0.02 0.07 -0.02 0.42 -0.71 -0.44 -0.34
0.69 0.79 1.09 -5.19 -0.25 -0.55 0.73 -0.08 0.33 -0.87 -0.4 0.41 -0.66 -0.25 -0.68 -0.44 -0.59 -0.4 -0.29 -0.05 0.06 0.48
0.35 1.08 1.34 -5.12 -0.76 -0.1 0.36 -0.27 -0.03 0.08 -0.04 0.07 -0.16 -0.15 -0.2 -0.48 -0.08 -0.24 -0.54 -0.54 -0.3 -0.01
0.52 0.67 0.73 -5.91 0.03 0.02 0.59 -0.3 0.01 -0.63 -0.43 -0.13 -0.74 -0.25 0.05 0.04 0.08 0.07 0.25 -0.44 -0.18 0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.