Heatmap: Cluster_132 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
43.18 48.35 57.13 0.61 38.71 42.01 49.18 26.5 25.99 23.59 23.63 26.2 14.31 22.78 32.11 33.09 32.02 32.54 46.46 22.28 27.23 42.84
12.12 15.3 16.75 0.41 9.51 12.53 13.89 8.05 8.86 5.93 7.24 8.1 5.57 7.88 8.34 8.37 8.84 8.03 10.24 6.96 8.62 10.63
5.54 4.4 7.06 0.7 4.49 3.84 4.68 2.65 2.67 1.7 1.89 2.9 1.59 2.98 2.61 3.38 2.4 2.54 3.17 2.27 2.03 4.27
16.46 19.87 21.6 0.49 12.04 14.85 12.85 8.84 11.54 6.51 9.47 10.53 6.36 9.25 9.29 10.11 9.17 8.97 13.61 9.02 10.39 9.38
25.75 32.38 35.97 2.84 22.3 20.56 19.82 8.59 13.7 7.2 8.58 12.05 7.59 16.21 12.35 11.91 12.46 12.62 16.63 11.53 11.79 15.69
18.67 21.61 23.75 0.85 13.5 18.4 14.49 9.29 14.52 8.33 8.39 15.25 4.89 10.23 11.97 11.93 11.21 11.31 14.66 9.4 11.48 13.94
41.53 54.77 53.0 1.01 40.01 46.03 47.15 33.79 44.8 31.7 31.5 43.13 21.26 36.57 33.0 32.85 32.69 34.32 38.72 32.71 33.13 38.87
14.42 15.81 12.63 0.28 9.8 12.61 13.72 9.24 9.4 6.79 8.3 10.42 6.75 6.39 7.35 8.06 7.84 7.15 11.76 8.4 8.9 9.91
8.29 9.59 10.36 0.94 6.58 8.02 8.66 5.53 5.93 4.88 4.91 5.59 4.49 5.54 4.92 5.45 5.36 5.16 7.94 5.49 5.36 7.86
26.48 33.06 29.69 1.8 18.94 23.52 24.13 15.44 13.34 10.89 11.09 13.75 7.75 12.33 14.68 15.31 15.09 15.37 20.38 13.25 15.47 16.51
10.44 16.68 17.36 0.59 9.25 13.16 14.03 7.73 9.44 7.41 8.86 10.23 4.71 7.35 9.3 8.96 9.84 9.83 12.51 6.97 8.01 9.72
14.14 16.61 20.69 0.61 9.88 13.87 14.4 8.99 8.08 5.67 6.68 7.9 5.06 6.52 9.39 9.45 10.39 10.4 11.85 8.16 9.13 11.85
21.39 21.98 29.4 1.37 18.5 20.89 20.57 10.96 8.67 9.08 8.6 10.28 8.01 10.66 15.15 13.88 17.39 16.27 14.94 9.03 12.4 17.46
20.8 26.02 32.6 0.73 19.44 20.94 18.35 10.52 14.5 9.03 10.07 15.02 11.94 12.0 14.18 14.84 15.26 13.57 15.62 11.3 14.35 14.11
9.87 12.13 10.77 0.38 8.67 9.03 8.1 6.54 6.02 4.83 4.71 6.17 3.1 5.21 6.56 7.01 6.76 6.42 8.92 6.9 6.96 7.45
25.16 38.47 39.35 0.7 30.93 28.93 22.13 13.8 18.9 11.93 14.58 15.07 10.88 18.32 22.11 21.56 19.21 20.49 34.44 15.25 16.55 17.4
10.37 11.23 17.23 2.04 11.64 8.44 11.21 5.94 5.51 4.71 5.1 5.5 3.65 9.49 7.63 7.42 7.95 7.29 8.78 4.85 5.48 10.87
32.6 37.49 46.09 0.83 28.41 30.05 32.01 22.91 22.06 18.29 18.55 21.7 12.2 22.46 23.31 22.71 23.59 23.81 28.67 19.61 21.03 30.83
14.31 14.38 17.67 1.17 10.51 12.45 12.81 6.8 8.66 5.74 6.26 7.35 3.96 7.63 8.64 8.76 9.0 8.95 11.76 6.36 5.81 7.94
5.55 7.52 8.72 0.78 4.93 6.43 5.97 2.83 6.19 2.51 3.36 5.22 2.97 3.82 4.33 4.58 4.74 4.21 5.06 3.07 3.71 2.89
8.06 10.22 14.19 0.8 9.31 8.65 7.65 4.39 4.86 3.51 4.14 5.2 2.91 4.25 5.61 5.58 5.55 5.36 7.97 4.77 5.32 4.98
5.92 6.2 5.79 0.35 4.3 4.99 5.72 3.47 3.21 2.33 2.62 3.01 2.35 5.25 4.31 4.5 4.15 4.32 5.23 3.08 3.45 5.71
15.39 15.89 21.12 1.6 14.54 11.71 14.7 7.89 8.92 7.41 7.33 8.85 4.99 11.51 8.08 8.54 8.33 8.05 10.24 7.21 7.98 13.49
2.78 3.99 3.89 0.28 2.43 2.42 3.29 1.43 1.39 0.99 0.83 1.5 0.95 1.59 1.72 1.53 1.61 1.64 2.41 1.26 1.33 1.58
15.69 17.78 18.68 1.95 10.46 13.47 13.95 9.81 7.97 8.74 7.61 8.42 5.46 11.62 10.75 10.41 11.26 10.85 12.77 10.62 9.26 9.78
25.17 36.6 39.89 2.07 26.55 27.99 31.17 15.87 23.96 11.41 16.31 19.43 11.2 16.48 21.34 21.75 22.08 21.11 22.75 18.5 20.8 20.87
3.4 5.16 7.55 0.51 4.58 5.61 5.5 2.19 4.9 1.66 2.31 3.52 3.89 2.13 3.16 3.62 3.23 3.33 3.57 3.24 3.11 4.36
7.34 9.63 11.57 0.64 5.79 8.1 6.53 4.28 6.13 2.95 4.2 6.21 3.57 3.82 4.79 4.52 4.44 4.38 6.24 4.79 5.56 4.96
14.35 13.48 16.13 0.94 11.13 11.11 10.23 4.41 7.21 3.89 4.55 9.32 5.0 11.38 6.64 7.31 7.27 7.3 9.16 6.93 6.38 8.82
29.28 32.36 35.26 0.43 25.47 32.66 34.92 21.26 19.9 14.11 18.98 19.39 12.81 24.11 25.97 24.86 25.47 24.14 28.79 20.21 21.96 23.5
8.43 7.89 9.4 0.75 6.82 8.21 9.45 5.28 5.0 3.31 4.21 4.88 3.42 5.59 5.58 6.11 6.2 5.81 7.04 4.69 5.56 6.86
14.06 15.41 18.42 0.62 11.21 14.75 14.23 9.59 11.06 7.65 6.58 11.68 4.85 6.82 9.43 9.16 9.34 9.48 11.05 8.01 9.1 8.59
23.36 29.9 26.71 0.67 20.42 22.3 24.82 15.06 14.13 14.31 13.26 13.32 7.77 13.54 18.67 18.12 17.98 18.9 20.85 14.3 15.74 24.38
42.81 52.72 60.42 2.67 30.99 34.57 32.19 19.57 27.41 13.87 17.29 27.99 13.71 33.12 23.64 28.44 24.88 24.49 38.62 26.05 22.05 25.76
14.16 13.23 19.54 0.39 10.65 8.74 11.95 5.75 9.51 5.01 6.32 7.33 3.45 6.6 5.11 5.16 5.48 5.02 5.86 6.69 7.65 9.88
117.04 163.05 169.02 9.52 88.71 99.44 94.74 70.5 89.81 58.66 60.32 78.8 37.34 59.65 80.56 81.26 73.39 80.0 96.29 63.91 69.82 63.6
56.34 71.89 71.28 0.79 45.62 58.46 60.82 41.64 47.02 33.74 36.15 49.01 30.36 42.62 42.79 43.94 47.05 41.46 48.43 38.56 41.03 49.78
13.51 19.32 25.49 0.82 14.68 14.58 10.39 6.12 11.69 5.92 7.11 11.05 3.81 9.5 11.62 11.79 12.07 12.39 15.05 9.91 10.36 8.13
9.55 13.17 14.42 0.53 10.04 11.67 10.7 5.61 8.18 4.62 5.17 8.05 3.82 5.58 8.3 8.52 8.7 8.49 8.61 6.01 6.89 5.22
31.8 37.53 60.79 1.15 27.0 35.41 31.86 24.09 27.89 16.84 18.04 22.15 13.64 19.07 22.27 22.89 21.37 23.03 28.51 19.69 20.49 31.52
20.68 22.69 23.84 0.4 17.82 21.71 22.51 12.09 19.6 7.24 11.41 19.11 13.66 12.08 13.66 14.14 12.8 13.91 13.8 17.92 19.7 12.29
16.99 16.44 20.24 0.62 10.76 12.78 14.22 6.9 7.88 5.04 5.48 7.97 4.54 11.65 9.51 9.26 9.21 9.57 12.04 7.42 8.39 12.47
18.35 22.42 26.97 0.84 17.6 16.93 14.61 8.54 12.63 6.18 7.72 10.33 4.95 9.88 11.81 10.86 11.87 10.8 17.03 9.07 9.87 11.78
17.4 19.59 19.21 0.65 14.29 16.95 19.39 11.1 14.68 9.42 9.53 13.66 7.98 9.71 11.45 10.62 11.62 11.73 15.31 12.28 13.98 16.12
12.48 16.75 21.46 0.71 16.03 17.03 16.67 7.17 10.89 6.28 7.42 10.72 8.63 9.17 11.49 11.45 11.33 11.23 16.86 9.54 11.18 12.46
6.67 7.81 10.37 0.45 5.89 6.82 6.45 4.78 3.59 3.14 3.64 4.13 2.79 3.96 5.46 5.47 6.03 5.81 7.06 3.93 4.54 6.08
15.65 15.5 21.23 0.89 16.36 17.59 18.69 11.86 15.04 10.37 10.95 14.21 11.79 9.46 12.81 13.56 13.24 12.62 13.25 13.37 13.8 13.23
22.98 21.87 22.14 1.21 19.57 16.1 18.89 12.87 16.02 11.1 10.88 15.88 6.52 12.77 10.9 10.45 10.95 10.47 17.74 10.17 11.52 19.73
8.66 10.47 14.9 0.39 7.02 9.24 8.64 6.19 6.82 4.22 4.69 6.32 3.65 4.74 5.46 5.29 5.04 5.08 8.17 5.47 4.8 7.43
31.06 40.29 48.68 1.35 23.97 31.46 36.71 24.06 28.43 19.84 21.0 25.25 13.97 28.29 22.38 24.19 23.97 24.14 29.43 19.19 19.84 27.56
9.9 11.73 10.03 0.23 8.34 8.28 7.66 6.84 6.12 5.55 5.73 5.54 3.66 5.01 5.78 5.57 5.75 5.9 7.52 6.2 7.05 6.98
10.79 11.75 9.22 0.32 8.93 9.52 10.51 5.97 5.8 4.98 5.22 5.29 4.61 6.74 7.51 8.61 8.78 8.13 8.73 5.18 6.16 9.81
17.93 26.45 33.68 0.64 21.94 21.03 18.49 10.56 14.66 8.73 10.5 14.43 6.34 10.65 15.06 13.8 14.37 15.39 21.19 12.58 14.56 12.08
16.97 20.7 25.36 0.82 15.65 19.27 18.03 10.53 15.25 8.74 11.19 16.05 8.57 18.12 13.45 13.27 14.29 13.17 19.69 11.87 11.86 16.56
8.85 10.58 16.23 0.8 8.49 9.55 8.12 5.44 5.06 3.79 4.01 5.5 3.62 5.71 6.65 6.51 6.41 6.85 8.63 5.21 5.81 8.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)