Heatmap: Cluster_176 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.52 0.6 1.0 0.08 0.46 0.46 0.59 0.3 0.31 0.18 0.24 0.32 0.21 0.36 0.32 0.31 0.33 0.38 0.38 0.32 0.36 0.36
0.79 0.79 0.78 0.01 0.73 0.64 1.0 0.57 0.67 0.53 0.48 0.74 0.3 0.55 0.53 0.53 0.57 0.56 0.89 0.54 0.56 0.66
1.0 0.82 0.52 0.13 0.95 0.67 0.93 0.53 0.66 0.24 0.51 0.59 0.48 0.54 0.51 0.59 0.48 0.46 0.66 0.49 0.66 0.75
0.55 0.45 0.36 0.09 0.96 0.58 0.77 0.27 0.39 0.2 0.27 0.31 0.19 0.47 0.46 0.51 0.47 0.52 1.0 0.35 0.34 0.86
0.43 0.72 1.0 0.02 0.37 0.42 0.51 0.41 0.45 0.38 0.46 0.52 0.27 0.27 0.18 0.19 0.2 0.2 0.24 0.39 0.4 0.58
0.43 0.35 1.0 0.17 0.26 0.29 0.36 0.19 0.31 0.31 0.28 0.32 0.12 0.19 0.15 0.13 0.14 0.15 0.14 0.25 0.3 0.31
0.68 0.45 0.5 0.03 0.81 0.98 1.0 0.3 0.58 0.31 0.34 0.54 0.63 0.68 0.6 0.55 0.51 0.56 0.84 0.42 0.51 0.78
0.63 0.64 1.0 0.02 0.5 0.53 0.68 0.27 0.42 0.22 0.31 0.44 0.23 0.33 0.32 0.32 0.33 0.32 0.38 0.31 0.33 0.43
0.71 0.68 1.0 0.07 0.71 0.5 0.79 0.35 0.33 0.17 0.31 0.29 0.19 0.32 0.26 0.23 0.24 0.27 0.36 0.34 0.35 0.5
0.82 0.92 1.0 0.02 0.76 0.59 0.9 0.42 0.59 0.37 0.5 0.57 0.33 0.51 0.44 0.46 0.5 0.48 0.68 0.39 0.41 0.48
0.58 0.63 0.53 0.03 0.86 0.77 1.0 0.43 0.66 0.35 0.46 0.61 0.38 0.54 0.42 0.42 0.4 0.42 0.64 0.64 0.56 0.85
0.69 1.0 0.92 0.05 0.65 0.67 0.78 0.38 0.61 0.31 0.44 0.48 0.34 0.38 0.46 0.4 0.35 0.34 0.58 0.47 0.59 0.52
0.67 0.63 0.46 0.07 0.94 0.7 1.0 0.37 0.44 0.23 0.32 0.39 0.34 0.37 0.5 0.5 0.48 0.53 0.76 0.45 0.54 0.56
0.78 0.83 0.92 0.02 0.58 0.66 1.0 0.21 0.49 0.21 0.26 0.39 0.25 0.34 0.36 0.37 0.38 0.42 0.43 0.34 0.42 0.38
0.73 1.0 0.75 0.03 0.57 0.62 0.81 0.43 0.51 0.33 0.39 0.39 0.24 0.25 0.35 0.32 0.42 0.4 0.45 0.41 0.48 0.44
0.51 0.6 0.51 0.01 0.73 0.7 1.0 0.41 0.44 0.31 0.4 0.45 0.25 0.62 0.4 0.36 0.41 0.37 0.71 0.51 0.46 0.44
0.78 1.0 0.8 0.02 0.79 0.57 0.68 0.29 0.63 0.34 0.37 0.68 0.21 0.41 0.41 0.4 0.42 0.41 0.52 0.31 0.31 0.38
0.78 0.95 0.63 0.06 0.79 0.66 0.76 0.56 0.69 0.45 0.48 0.64 0.33 0.88 0.49 0.66 0.54 0.62 1.0 0.47 0.55 0.51
0.58 0.67 1.0 0.02 0.35 0.32 0.53 0.26 0.3 0.39 0.27 0.28 0.08 0.36 0.22 0.21 0.23 0.23 0.22 0.21 0.2 0.19
0.61 0.63 0.71 0.01 0.95 0.86 0.96 0.46 0.64 0.42 0.46 0.67 0.35 0.41 0.51 0.56 0.55 0.56 1.0 0.65 0.69 0.86
0.78 0.96 1.0 0.08 0.64 0.65 0.71 0.52 0.61 0.46 0.46 0.79 0.36 0.45 0.39 0.4 0.38 0.45 0.7 0.64 0.7 0.99
0.94 1.0 0.94 0.15 0.71 0.69 1.0 0.42 0.58 0.29 0.45 0.44 0.38 0.48 0.44 0.5 0.41 0.4 0.63 0.52 0.56 0.7
0.43 0.55 1.0 0.03 0.18 0.25 0.29 0.24 0.36 0.14 0.34 0.33 0.1 0.32 0.08 0.1 0.09 0.09 0.12 0.4 0.3 0.26
0.64 0.65 0.61 0.04 0.64 0.74 0.88 0.39 0.38 0.32 0.33 0.55 0.3 1.0 0.38 0.39 0.42 0.4 0.62 0.37 0.43 0.69
0.71 0.56 1.0 0.03 0.59 0.53 0.77 0.28 0.61 0.24 0.31 0.53 0.37 0.41 0.35 0.34 0.37 0.36 0.51 0.3 0.31 0.79
0.33 0.5 1.0 0.02 0.37 0.31 0.41 0.3 0.31 0.23 0.25 0.31 0.17 0.2 0.2 0.2 0.21 0.2 0.29 0.28 0.26 0.43
0.7 0.56 0.4 0.06 0.93 0.64 0.84 0.36 0.52 0.27 0.37 0.43 0.28 0.36 0.5 0.53 0.48 0.48 1.0 0.51 0.58 0.62
0.57 0.54 1.0 0.02 0.29 0.33 0.48 0.25 0.56 0.34 0.45 0.46 0.19 0.12 0.13 0.12 0.14 0.13 0.18 0.32 0.24 0.27
0.68 0.91 1.0 0.01 0.42 0.37 0.54 0.47 0.45 0.45 0.36 0.48 0.15 0.47 0.2 0.22 0.21 0.23 0.44 0.34 0.34 0.42
0.79 0.9 1.0 0.08 0.72 0.69 0.83 0.55 0.37 0.38 0.43 0.59 0.35 0.49 0.41 0.46 0.38 0.38 0.5 0.43 0.46 0.66
0.79 0.68 1.0 0.18 0.81 0.62 0.87 0.39 0.4 0.25 0.3 0.43 0.38 0.58 0.55 0.62 0.62 0.61 0.92 0.51 0.56 0.92
0.45 0.66 1.0 0.01 0.33 0.38 0.44 0.36 0.58 0.44 0.38 0.63 0.24 0.43 0.22 0.21 0.24 0.22 0.31 0.43 0.39 0.54
0.6 0.51 0.58 0.05 0.8 0.67 1.0 0.5 0.41 0.33 0.4 0.39 0.31 0.57 0.65 0.68 0.7 0.65 0.74 0.54 0.59 0.83
0.82 0.88 0.87 0.07 0.86 0.75 1.0 0.37 0.48 0.27 0.36 0.42 0.29 0.49 0.45 0.5 0.43 0.49 0.53 0.5 0.52 0.72
0.95 1.0 0.59 0.01 0.69 0.53 0.72 0.35 0.41 0.2 0.32 0.38 0.25 0.42 0.47 0.48 0.44 0.44 0.48 0.29 0.3 0.29
0.9 1.0 0.87 0.02 0.66 0.61 0.67 0.31 0.46 0.29 0.35 0.46 0.25 0.38 0.37 0.38 0.34 0.36 0.38 0.37 0.39 0.33
0.72 1.0 0.84 0.03 0.58 0.53 0.74 0.64 0.74 0.86 0.63 1.0 0.34 0.62 0.26 0.3 0.33 0.33 0.34 0.87 0.86 0.45
0.56 0.53 1.0 0.03 0.48 0.43 0.54 0.24 0.48 0.31 0.34 0.48 0.21 0.23 0.27 0.29 0.26 0.25 0.13 0.49 0.43 0.59
0.69 0.54 0.77 0.08 0.71 0.62 1.0 0.37 0.39 0.29 0.38 0.39 0.33 0.41 0.45 0.49 0.52 0.5 0.68 0.44 0.43 0.91
0.82 0.91 1.0 0.02 0.5 0.41 0.63 0.21 0.5 0.3 0.34 0.45 0.22 0.34 0.27 0.28 0.27 0.28 0.2 0.28 0.27 0.37
0.91 0.91 0.64 0.01 0.58 0.66 1.0 0.41 0.73 0.31 0.41 0.62 0.37 0.37 0.54 0.55 0.56 0.54 0.46 0.48 0.44 0.49
0.73 0.38 0.3 0.03 1.0 0.7 0.91 0.29 0.46 0.24 0.43 0.4 0.31 0.36 0.25 0.27 0.25 0.26 0.57 0.26 0.31 0.54
0.9 0.88 1.0 0.03 0.56 0.65 0.79 0.4 0.39 0.31 0.34 0.41 0.39 0.35 0.47 0.38 0.41 0.38 0.64 0.49 0.37 0.42
0.54 0.65 0.75 0.07 0.67 0.64 1.0 0.29 0.56 0.27 0.32 0.48 0.4 0.29 0.29 0.31 0.39 0.36 0.43 0.5 0.58 0.65
0.84 1.0 0.76 0.02 0.77 0.68 0.64 0.64 0.48 0.5 0.58 0.42 0.12 0.49 0.4 0.39 0.43 0.42 0.86 0.25 0.23 0.65
0.49 0.56 0.74 0.03 0.81 0.62 1.0 0.26 0.39 0.22 0.25 0.37 0.19 0.41 0.34 0.38 0.36 0.38 0.77 0.33 0.32 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)