Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.04 0.0 0.09 0.06 0.15 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.13 0.29 0.09
0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 1.0 0.1 0.06 0.29 0.05 0.13 0.14 0.08 0.63 0.09 0.3 0.05 0.07 0.51 0.06 0.05 0.1
0.16 0.14 0.02 0.02 0.0 1.0 0.36 0.13 0.17 0.13 0.1 0.12 0.05 0.05 0.1 0.09 0.07 0.07 0.0 0.02 0.0 0.22
0.47 0.32 0.15 0.02 0.24 1.0 0.36 0.28 0.59 0.21 0.25 0.4 0.51 0.26 0.36 0.42 0.38 0.28 0.21 0.28 0.32 0.43
0.04 0.05 0.0 0.02 0.0 0.91 0.16 0.53 0.73 0.19 0.39 0.31 0.0 0.23 0.01 0.02 0.02 0.02 0.05 0.0 0.04 1.0
0.37 0.22 0.01 0.01 0.02 1.0 0.28 0.19 0.55 0.36 0.32 0.57 0.07 0.26 0.12 0.09 0.11 0.08 0.25 0.04 0.03 0.98
0.03 0.13 0.15 0.69 0.0 1.0 0.15 0.08 0.0 0.04 0.05 0.15 0.17 0.66 0.05 0.07 0.29 0.2 0.11 0.12 0.0 0.0
0.26 0.48 0.7 0.07 0.15 1.0 0.3 0.21 0.35 0.17 0.26 0.27 0.12 0.18 0.21 0.19 0.23 0.15 0.35 0.22 0.14 0.55
0.04 0.27 0.0 0.06 0.0 1.0 0.24 0.26 0.05 0.21 0.23 0.08 0.1 0.17 0.06 0.05 0.09 0.11 0.06 0.19 0.11 0.04
0.04 0.03 0.04 0.01 0.01 1.0 0.06 0.03 0.05 0.04 0.06 0.05 0.02 0.03 0.03 0.05 0.02 0.01 0.01 0.02 0.03 0.05
0.03 0.25 0.17 0.18 0.03 0.79 0.14 0.01 0.53 0.12 0.13 0.45 0.04 0.59 0.1 0.07 0.21 0.11 1.0 0.16 0.18 0.43
0.28 0.21 0.18 0.09 0.08 1.0 0.13 0.19 0.65 0.2 0.17 0.61 0.05 0.14 0.06 0.09 0.12 0.06 0.09 0.05 0.1 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 1.0 0.1 0.01 0.14 0.01 0.01 0.05 0.17 0.5 0.24 0.19 0.18 0.27 0.02 0.05 0.05 0.03
0.14 0.24 0.18 0.17 0.04 0.92 0.31 0.38 0.71 0.35 0.6 0.79 0.16 1.0 0.05 0.13 0.09 0.13 0.22 0.06 0.04 0.44
0.37 0.33 0.12 0.04 0.24 1.0 0.45 0.35 0.43 0.27 0.32 0.44 0.28 0.24 0.28 0.23 0.27 0.27 0.38 0.36 0.41 0.44
0.04 0.01 0.0 0.43 0.01 0.91 0.3 0.31 0.8 0.44 0.52 0.5 0.1 0.13 0.12 0.13 0.21 0.15 0.24 0.09 0.0 1.0
0.03 0.03 0.0 0.31 0.01 1.0 0.11 0.5 0.65 0.56 0.59 0.39 0.06 0.11 0.04 0.17 0.12 0.13 0.36 0.22 0.11 0.06
0.36 0.16 0.02 0.07 0.0 1.0 0.1 0.24 0.36 0.05 0.1 0.31 0.02 0.14 0.19 0.32 0.19 0.18 0.37 0.07 0.03 0.06
0.1 0.15 0.0 0.12 0.21 1.0 0.02 0.08 0.15 0.1 0.0 0.0 0.02 0.11 0.07 0.02 0.07 0.05 0.05 0.08 0.33 0.15
0.07 0.0 0.04 0.62 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.5 0.04 0.16 0.17 0.1 0.09 0.13 0.1 0.16 0.08 0.14 0.14 0.14 1.0 0.06 0.07 0.09
0.07 0.08 0.0 0.04 0.0 1.0 0.11 0.17 0.44 0.07 0.19 0.18 0.06 0.2 0.22 0.15 0.18 0.2 0.53 0.03 0.04 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.07 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.11 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.09 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.14 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.1 0.48 0.11 0.09 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.06 0.27 0.05 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.14 0.03 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.28 0.09 0.59 0.06 0.12 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.03 0.23 0.02 0.03 0.78 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.24 0.06 0.45 0.03 0.06 1.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.19 0.0 0.17 0.02 1.0 0.12 0.15 0.22 0.08 0.1 0.27 0.17 0.06 0.03 0.01 0.05 0.04 0.07 0.11 0.11 0.36
0.01 0.04 0.15 0.05 0.02 1.0 0.02 0.01 0.15 0.01 0.01 0.1 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.04 0.03 0.02
0.37 0.05 0.04 0.01 0.1 1.0 0.03 0.0 0.43 0.0 0.04 0.14 0.03 0.01 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.46 0.08 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.35
0.01 0.0 0.0 0.25 0.02 1.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3
0.0 0.0 0.0 0.5 0.01 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
0.01 0.03 0.0 0.51 0.02 1.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.36
0.02 0.01 0.0 0.33 0.0 1.0 0.12 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.08 0.01 0.01 0.04 0.01 0.0 0.02 0.0 0.11
0.02 0.01 0.0 0.5 0.0 1.0 0.08 0.04 0.06 0.06 0.02 0.06 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.03 0.23 0.65 0.31 0.36 0.38 0.41 0.04 0.06 0.15 0.03 0.05 0.12 0.19 0.12 1.0
0.06 0.01 0.0 0.16 0.02 0.94 0.12 0.19 0.22 0.17 0.19 0.27 0.22 1.0 0.24 0.17 0.14 0.29 0.78 0.09 0.08 0.63
0.05 0.03 0.0 0.02 0.01 1.0 0.14 0.17 0.21 0.11 0.17 0.1 0.01 0.14 0.03 0.02 0.03 0.02 0.06 0.0 0.01 0.58
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.47 0.1 0.06 0.0 0.22 0.08 0.12 0.09 0.06 0.08 0.09 0.08 0.04 1.0 0.05 0.11 0.13
0.16 0.0 0.0 0.17 0.0 1.0 0.09 0.35 0.34 0.15 0.07 0.16 0.15 0.04 0.11 0.05 0.13 0.05 0.0 0.07 0.0 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.23 0.32 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.36 0.25 0.14 0.37 0.12 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.2
0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.19 0.33 0.15 0.14 0.43 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.45
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.27 0.15 0.03 0.04 0.12 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29
0.02 0.06 0.06 0.13 0.0 1.0 0.1 0.03 0.26 0.08 0.12 0.16 0.15 0.05 0.13 0.05 0.07 0.1 0.08 0.06 0.07 0.03
0.01 0.01 0.0 0.39 0.19 1.0 0.13 0.02 0.09 0.15 0.16 0.17 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.2
0.01 0.01 0.01 0.3 0.0 1.0 0.38 0.09 0.23 0.25 0.2 0.26 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.03 0.04 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)