Heatmap: Cluster_170 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.71 0.6 0.34 0.01 0.24 0.89 0.79 0.88 0.87 0.75 0.72 0.78 0.41 1.0 0.63 0.59 0.62 0.59 0.85 0.56 0.64 0.6
0.42 0.24 0.1 0.01 0.12 0.4 0.44 0.44 0.41 0.47 0.43 0.38 0.31 0.29 0.32 0.37 0.29 0.29 0.29 0.26 0.33 1.0
0.48 0.67 0.16 0.01 0.07 0.48 0.71 0.95 1.0 0.78 0.89 0.83 0.48 0.28 0.37 0.13 0.42 0.39 0.46 0.51 0.49 0.02
0.49 0.13 0.02 0.0 0.06 0.33 0.53 0.24 1.0 0.45 0.42 0.7 0.31 0.07 0.08 0.06 0.09 0.05 0.12 0.19 0.2 0.21
0.6 0.49 0.05 0.0 0.22 0.62 0.71 0.89 0.5 0.76 0.77 0.41 0.16 0.4 0.62 0.5 0.62 0.67 0.68 0.51 0.6 1.0
0.37 0.14 0.02 0.0 0.09 0.33 0.38 0.58 0.41 0.58 0.5 0.4 0.16 0.33 0.2 0.17 0.2 0.17 0.14 0.3 0.28 1.0
0.64 0.68 0.47 0.01 0.19 0.77 0.74 1.0 0.7 0.96 0.9 0.71 0.65 0.58 0.51 0.49 0.49 0.52 0.67 0.53 0.77 0.53
0.96 0.76 0.27 0.01 0.49 0.58 0.8 0.63 0.76 0.58 0.54 0.76 0.16 0.85 0.72 0.61 0.72 0.74 1.0 0.62 0.6 0.99
0.56 0.53 0.03 0.03 0.14 0.78 0.68 1.0 0.49 0.73 0.94 0.58 0.17 0.53 0.49 0.67 0.51 0.48 0.27 0.5 0.51 0.36
1.0 0.68 0.06 0.01 0.33 0.36 0.58 0.48 0.48 0.46 0.46 0.47 0.09 0.8 0.37 0.34 0.38 0.37 0.69 0.39 0.34 0.56
0.38 0.34 0.08 0.01 0.22 0.61 0.73 0.62 0.78 0.88 0.82 1.0 0.32 0.27 0.47 0.4 0.55 0.51 0.27 0.42 0.43 0.42
0.46 0.48 0.1 0.01 0.11 0.54 0.69 0.43 0.6 1.0 0.71 0.65 0.12 0.28 0.25 0.28 0.27 0.29 0.35 0.16 0.22 0.21
0.6 0.68 0.15 0.01 0.21 0.9 1.0 0.94 0.73 0.85 0.63 0.85 0.48 0.65 0.77 0.81 0.91 0.9 0.61 0.38 0.54 0.62
0.65 0.33 0.0 0.0 0.0 0.5 0.57 0.41 1.0 0.55 0.45 0.73 0.45 0.39 0.36 0.36 0.35 0.31 0.16 0.7 0.7 0.14
0.38 0.28 0.1 0.02 0.34 0.7 0.96 0.63 0.92 0.83 0.75 1.0 0.38 0.42 0.5 0.51 0.5 0.48 0.48 0.35 0.35 0.87
0.49 0.14 0.01 0.0 0.18 0.33 0.73 0.52 1.0 0.84 0.67 0.8 0.15 0.25 0.28 0.32 0.27 0.25 0.45 0.19 0.2 0.76
0.38 0.32 0.25 0.0 0.31 0.54 0.64 0.59 0.43 0.6 0.65 0.42 0.15 0.44 0.3 0.33 0.34 0.3 0.4 0.27 0.26 1.0
0.45 0.53 0.16 0.01 0.22 0.36 0.29 0.53 0.32 0.42 0.36 0.4 0.09 0.24 0.24 0.21 0.23 0.23 0.18 1.0 0.8 0.29
0.61 0.1 0.0 0.01 0.03 0.25 0.49 0.57 0.88 0.77 0.7 0.91 0.07 0.18 0.06 0.05 0.09 0.07 0.06 0.1 0.09 1.0
0.75 0.54 0.19 0.03 0.02 0.57 0.57 0.84 0.59 0.74 0.74 0.62 0.08 0.27 0.32 0.36 0.4 0.41 0.21 1.0 0.84 0.32
0.19 0.32 0.05 0.01 0.05 0.34 0.27 0.37 0.2 0.3 0.22 0.28 0.07 0.39 0.22 0.19 0.23 0.21 0.24 1.0 0.98 0.26
0.71 0.56 0.59 0.02 0.45 0.6 0.72 0.68 0.62 0.64 0.58 0.64 0.27 1.0 0.77 0.71 0.79 0.72 0.7 0.47 0.43 0.95
0.47 0.52 0.7 0.0 0.09 0.53 0.44 0.62 0.31 0.38 0.34 0.33 0.11 0.4 0.48 0.5 0.53 0.56 1.0 0.28 0.27 0.24
0.54 0.35 0.0 0.1 0.01 0.69 0.76 1.0 0.37 0.79 0.71 0.71 0.08 0.42 0.29 0.46 0.36 0.38 0.19 0.26 0.55 0.55
0.62 0.5 0.1 0.0 0.04 0.64 0.83 0.85 0.53 1.0 0.96 0.81 0.23 0.8 0.69 0.65 0.81 0.75 0.75 0.64 0.51 0.61
0.66 0.76 0.15 0.0 0.08 0.63 0.62 0.93 0.73 1.0 0.96 0.68 0.34 0.21 0.51 0.57 0.54 0.54 0.87 0.88 0.73 0.76
0.43 0.17 0.09 0.03 0.0 0.46 0.65 0.7 1.0 0.56 0.6 0.93 0.43 0.69 0.02 0.08 0.23 0.11 0.69 0.46 0.46 0.16
0.47 0.9 0.24 0.02 0.31 0.63 0.42 0.75 0.69 0.5 0.46 0.7 0.27 0.76 0.4 0.38 0.39 0.37 0.72 1.0 0.98 0.54
0.41 0.59 0.0 0.01 0.1 0.49 0.78 0.49 1.0 0.76 0.76 0.93 0.54 0.34 0.36 0.32 0.32 0.34 0.3 0.51 0.47 0.16
0.9 0.59 0.08 0.02 0.38 0.52 0.56 0.65 1.0 0.62 0.52 0.96 0.32 0.82 0.58 0.5 0.6 0.54 0.72 0.4 0.38 0.53
0.5 0.62 0.31 0.05 0.01 0.62 0.51 0.81 0.78 1.0 0.99 0.9 0.3 0.54 0.39 0.39 0.33 0.38 0.59 0.71 0.63 0.57
0.55 1.0 0.21 0.01 0.0 0.44 0.4 0.64 0.23 0.64 0.44 0.32 0.26 0.4 0.62 0.61 0.58 0.57 0.75 0.69 0.66 0.23
0.47 0.16 0.0 0.0 0.0 0.32 0.23 0.32 0.47 0.25 0.29 0.47 0.06 0.21 0.28 0.29 0.29 0.28 0.15 1.0 0.75 0.2
0.64 0.58 0.15 0.01 0.35 0.71 0.79 1.0 0.74 0.89 0.98 0.74 0.37 0.58 0.65 0.59 0.67 0.71 0.85 0.88 0.89 0.72
0.33 0.53 0.0 0.02 0.0 0.34 0.16 0.3 0.36 0.23 0.22 0.32 0.06 0.27 0.2 0.25 0.16 0.21 0.02 1.0 0.93 0.11
0.46 0.2 0.05 0.02 0.17 0.5 0.73 0.51 0.25 0.43 0.43 0.27 0.5 0.53 0.34 0.3 0.37 0.31 0.31 0.27 0.35 1.0
0.44 0.02 0.0 0.0 0.0 0.18 0.32 0.52 0.35 0.3 0.24 0.32 0.11 0.61 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 1.0 0.7 0.44
0.68 0.46 0.01 0.01 0.07 0.94 1.0 0.9 0.71 0.68 0.73 0.58 0.89 0.52 0.81 0.7 0.85 0.7 0.56 0.47 0.61 0.09
0.66 0.59 0.07 0.1 0.2 0.74 0.65 0.59 0.78 0.81 1.0 0.93 0.17 0.56 0.72 0.66 0.77 0.58 0.89 0.47 0.49 0.53
0.59 0.52 0.1 0.08 0.4 0.55 0.99 0.79 0.72 0.91 0.97 1.0 0.31 0.6 0.4 0.5 0.41 0.49 0.46 0.94 0.89 0.65
0.92 0.16 0.0 0.02 0.0 0.65 0.84 0.56 0.36 0.6 0.56 0.25 1.0 0.53 0.48 0.54 0.6 0.61 0.11 0.31 0.63 0.64
0.34 0.19 0.0 0.0 0.0 0.44 0.33 0.2 1.0 0.24 0.73 0.91 0.03 0.14 0.37 0.38 0.42 0.48 0.07 0.01 0.01 0.12
0.8 0.71 0.57 0.07 0.01 0.55 0.25 0.57 0.29 0.49 0.45 0.58 0.05 0.47 0.24 0.25 0.29 0.23 0.1 1.0 0.86 0.32
0.56 0.83 0.63 0.06 0.31 0.68 0.78 0.64 0.75 0.85 0.91 0.53 1.0 0.39 0.47 0.44 0.44 0.37 0.36 0.63 0.71 0.45
0.65 0.44 0.07 0.01 0.04 0.66 0.74 0.7 0.6 0.83 0.69 0.62 0.33 0.31 0.56 0.48 0.69 0.66 0.38 0.28 0.38 1.0
1.0 0.92 0.01 0.01 0.0 0.64 0.29 0.82 0.31 0.64 0.53 0.25 0.14 0.53 0.34 0.4 0.37 0.37 0.34 0.99 0.98 0.36
0.93 0.14 0.0 0.0 0.0 0.59 0.58 0.48 0.78 0.61 0.55 0.88 0.19 0.71 0.51 0.37 0.56 0.4 0.25 0.43 0.36 1.0
0.42 0.72 0.01 0.18 0.03 0.45 0.38 0.5 0.75 0.37 0.47 0.54 0.08 0.68 0.23 0.28 0.23 0.22 0.32 1.0 0.7 0.28
1.0 0.66 0.39 0.14 0.01 0.74 0.7 0.59 0.86 0.74 0.55 0.83 0.45 0.35 0.61 0.57 0.46 0.6 0.77 0.72 0.71 0.65
0.79 0.52 0.01 0.0 0.01 0.82 0.93 1.0 0.75 0.75 0.69 0.84 0.28 0.65 0.62 0.72 0.69 0.57 0.44 0.69 0.71 0.89
0.73 0.42 0.0 0.04 0.06 0.72 0.61 0.75 0.65 0.55 0.65 1.0 0.42 0.36 0.43 0.54 0.78 0.62 0.42 0.55 0.68 0.68
0.24 0.55 0.47 0.19 0.1 0.42 0.39 0.61 0.26 0.43 0.11 0.29 0.11 0.92 0.32 0.17 0.23 0.16 0.38 0.94 1.0 0.43
0.3 0.54 0.06 0.01 0.05 0.51 0.6 0.56 0.6 0.84 1.0 0.61 0.34 0.29 0.41 0.36 0.36 0.37 0.28 0.37 0.39 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)