Heatmap: Cluster_101 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.79 6.08 67.29 11.46 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.07 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.14 0.15 1.17 0.29 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.03 0.3 3.02 0.53 0.0 0.01 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.47 11.08 1.36 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.64 21.62 1.42 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 1.25 12.41 1.14 0.06 0.06 0.09 0.1 0.09 0.1 0.12 0.21 0.01 0.08 0.02 0.01 0.04 0.0 0.06 0.05 0.05 0.79
0.06 0.26 3.3 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 1.02 16.25 2.92 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.35 8.38 1.17 0.28 0.04 0.06 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.38 0.43 0.0 0.49 0.0 0.0
0.0 1.33 9.45 2.89 0.27 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.19 2.14 0.32 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.81 23.47 3.77 0.34 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 2.92 0.28 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 18.13 2.2 0.06 0.1 0.07 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.44 0.11 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.79 20.55 1.93 0.12 0.29 0.26 0.24 0.23 0.05 0.14 0.22 0.14 0.16 0.15 0.04 0.07 0.04 0.09 0.28 0.0 0.18
0.18 0.48 7.39 0.76 0.04 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.31 0.0
0.04 1.66 11.8 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.49 5.7 0.92 0.0 0.07 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.14
0.0 0.96 13.76 1.42 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23
0.0 0.33 5.36 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.28 5.7 1.51 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 7.71 1.63 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 2.47 0.33 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 1.18 26.5 4.24 0.07 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.03 0.06 0.07 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 0.7 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.17 4.29 0.98 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 3.41 209.79 47.65 0.05 0.1 0.04 0.04 0.0 0.07 0.05 0.0 0.05 0.06 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.0 0.0 2.11 0.61 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 5.65 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.82 2.55 13.35 3.54 0.42 0.47 0.42 0.41 0.39 0.35 0.49 0.88 0.11 0.8 0.31 0.41 0.47 0.42 0.39 0.41 0.35 0.2
0.1 0.48 7.11 1.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.0
0.0 0.04 0.61 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 2.29 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.16 2.01 0.52 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.25 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 1.85 0.17 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 7.25 1.29 0.0 0.0 0.19 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.49 4.66 0.87 0.08 0.08 0.08 0.11 0.0 0.09 0.09 0.0 0.1 0.13 0.15 0.0 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.22
0.01 0.29 3.9 0.39 0.0 0.01 0.01 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.48 4.42 0.75 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 2.99 93.11 18.01 0.06 0.16 0.04 0.22 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 6.12 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.52 7.64 1.27 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.7 9.08 1.92 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.25 11.9 2.42 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0
0.13 0.54 5.41 1.48 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 5.84 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.58 4.85 0.78 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.25 3.54 1.06 0.32 0.06 0.04 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.06 0.08 0.0 0.0 0.07 0.08 0.18 0.0 0.0 0.13
0.12 0.55 8.09 1.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.0 12.35 1.72 0.03 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.16 0.08 0.11 0.0 0.12 0.0 0.0 0.13 0.0 0.18
0.09 0.69 8.63 0.79 0.02 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 6.92 0.32 0.07 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 7.75 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.37 8.34 1.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 0.45 7.18 1.62 0.04 0.13 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.51 0.17 0.0 0.09 0.28 0.1 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)