Heatmap: Cluster_37 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.52 0.37 0.01 0.01 0.66 0.71 0.49 0.77 0.32 0.85 1.0 0.26 0.5 0.24 0.39 0.32 0.26 0.3 0.38 0.36 0.48 0.77
0.5 0.58 0.3 0.07 0.44 0.59 0.85 0.33 0.39 0.41 0.52 0.44 0.3 0.2 1.0 0.85 0.75 0.83 0.74 0.35 0.59 0.27
0.13 0.38 1.0 0.04 0.0 0.3 0.41 0.05 0.55 0.1 0.16 0.32 0.05 0.23 0.15 0.11 0.13 0.14 0.69 0.07 0.04 0.35
0.2 0.12 0.22 0.03 0.25 0.78 0.28 0.15 0.29 0.24 0.16 0.39 0.23 0.27 0.41 0.39 0.34 0.39 0.3 0.32 0.35 1.0
0.0 0.58 0.0 0.53 0.0 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.36 0.22 0.04 0.0 1.0 0.93 0.37 0.95 0.38 0.33 0.79 0.25 0.98 0.58 0.65 0.81 0.91 0.47 0.1 0.17 0.26
0.33 0.07 0.3 0.0 0.26 0.35 0.18 0.16 0.7 0.5 0.24 1.0 0.03 0.23 0.02 0.02 0.02 0.02 0.05 0.52 0.42 0.46
0.16 0.15 0.0 0.7 0.09 0.53 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.17 0.55 1.0 0.27 0.96 0.0 0.17 0.38 0.22
0.12 0.59 1.0 0.39 0.03 0.3 0.27 0.15 0.35 0.06 0.12 0.2 0.08 0.14 0.37 0.31 0.4 0.32 0.26 0.16 0.06 0.04
0.06 0.0 0.0 0.17 0.0 1.0 0.15 0.11 0.0 0.0 0.13 0.0 0.39 0.13 0.19 0.06 0.0 0.07 0.0 0.16 0.18 0.0
0.29 0.0 0.0 0.98 0.53 1.0 0.13 0.45 0.88 0.41 0.0 0.0 0.2 0.42 0.55 0.67 0.32 0.79 0.65 0.35 0.0 0.0
0.39 0.09 0.0 0.08 0.01 0.94 0.53 0.13 0.0 0.12 0.16 0.0 0.23 0.39 1.0 0.56 0.72 0.8 0.96 0.3 0.46 0.0
0.11 0.98 1.0 0.25 0.0 0.24 0.1 0.13 0.11 0.15 0.08 0.03 0.06 0.05 0.06 0.02 0.0 0.03 0.32 0.13 0.42 0.15
0.41 0.0 0.0 0.24 0.03 0.26 0.23 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.39 0.14 1.0 0.68 0.71 0.65 0.0 0.18 0.0 0.68
0.6 0.07 0.0 0.83 0.16 1.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.14 0.0 0.36 0.63 0.3 0.07 0.0 0.27 0.0 0.0 0.4 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.52 0.05 0.48 0.13 0.0 0.0 0.27 0.0 0.62 0.3 0.2 0.65 0.19 0.61 0.0 0.47 0.26 0.0 1.0
0.17 0.16 0.0 0.02 0.44 0.72 0.77 0.25 0.13 0.36 0.24 0.23 0.52 0.32 0.78 0.72 0.71 0.82 1.0 0.25 0.43 0.26
0.41 0.13 0.08 0.33 1.0 0.74 0.59 0.06 0.26 0.19 0.17 0.33 0.14 0.89 0.3 0.3 0.38 0.31 0.95 0.32 0.17 0.58
0.34 0.36 0.0 0.01 0.0 0.89 1.0 0.85 0.91 0.7 0.76 1.0 0.78 0.57 0.56 0.51 0.4 0.36 0.24 0.36 0.5 0.44
0.04 0.05 0.14 0.13 0.0 0.21 0.06 0.16 0.15 0.41 0.92 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.44 0.22 0.02 0.01 0.59 0.72 0.74 0.66 0.79 0.84 0.92 0.54 0.38 0.25 0.43 0.42 0.4 0.34 0.48 0.45 0.44 1.0
0.0 0.0 1.0 0.09 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.48 0.57 0.12 0.31 0.26 0.54 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.74 0.33 0.3 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0
0.5 0.0 0.0 0.22 0.24 0.29 0.47 0.62 0.0 0.0 1.0 0.0 0.15 0.34 0.0 0.0 0.18 0.2 0.0 0.0 0.0 0.94
0.19 0.09 0.0 0.0 0.16 0.56 0.73 0.12 0.79 0.45 0.24 1.0 0.17 0.19 0.33 0.42 0.37 0.57 0.04 0.37 0.35 0.37
0.58 0.43 0.0 0.39 0.0 1.0 0.16 0.45 0.0 0.2 0.72 0.42 0.0 0.41 0.27 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.0 0.0 0.12 0.03 1.0 0.0 0.24 0.0 0.41 0.29 0.45 0.32 0.15 0.77 0.45 0.33 0.13 0.0 0.0 0.41 0.0
0.01 0.0 0.0 0.03 1.0 0.84 0.36 0.01 0.24 0.07 0.08 0.16 0.22 0.4 0.32 0.57 0.19 0.34 0.64 0.18 0.17 0.21
0.02 0.0 0.0 0.49 0.01 0.23 0.19 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.19 0.34 0.19 0.1 0.44 0.25 0.0 0.0 0.17
0.0 0.0 0.86 0.0 0.11 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0
0.15 0.02 0.04 0.01 0.66 0.83 1.0 0.46 0.65 0.44 0.35 0.58 0.21 0.36 0.08 0.07 0.05 0.08 0.11 0.91 0.8 0.78
0.2 0.0 0.0 0.62 0.22 0.7 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.18 0.16 0.02 0.66 0.54 0.5 0.31 0.61 0.55 0.42 0.58 0.49 0.53 0.5 0.48 0.47 0.53 1.0 0.54 0.6 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 1.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.56 0.32 0.2 0.77 0.24 0.26 0.6 0.14 0.21 0.3 0.24 0.28 0.34 1.0 0.23 0.18 0.28
0.23 0.12 0.06 0.01 0.38 0.75 1.0 0.36 0.42 0.47 0.8 0.25 0.28 0.09 0.17 0.16 0.11 0.12 0.04 0.26 0.12 0.13
0.36 0.3 0.01 0.01 0.98 1.0 0.68 0.26 0.75 0.31 0.53 0.54 0.12 0.7 0.41 0.39 0.34 0.31 0.85 0.07 0.11 0.52
0.05 0.05 0.0 0.03 1.0 0.49 0.04 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.03 0.08 0.1 0.08 0.1 0.19 0.02 0.03 0.05
0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.08 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 1.0 0.0 0.88 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.0 0.0 1.0 0.0 0.94 0.23 0.76 0.75 0.63 0.0 0.72 0.35 0.06 0.52 0.0 0.0 0.21 0.0 0.59 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.04 0.04 1.0 0.3 0.0 0.0 0.11 0.0 0.25 0.05 0.79 0.16 0.81 0.24 0.23 0.56 0.0 0.0 0.26
0.07 0.13 0.0 0.11 0.0 1.0 0.39 0.37 0.7 0.15 0.8 0.34 0.07 0.08 0.11 0.0 0.12 0.0 0.0 0.14 0.31 0.18
0.13 0.11 0.0 0.23 0.09 0.87 0.42 0.18 0.35 0.31 0.69 1.0 0.13 0.2 0.37 0.41 0.28 0.29 0.26 0.23 0.31 0.3
0.03 0.0 0.0 0.35 0.0 0.68 0.09 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.1 0.09 0.12 1.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0
0.09 0.0 0.0 0.71 0.05 1.0 0.0 0.4 0.0 0.36 0.0 0.0 0.66 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.69 0.41
0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.28 0.23 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.17 0.15 0.1 0.4 0.39 0.11 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.28 0.23 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.17 0.15 0.1 0.4 0.39 0.11 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.35 0.0 0.08 0.44 0.15 0.94 0.0 0.0 0.0
0.36 0.0 0.0 0.26 0.0 0.38 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.2 0.0 0.0 0.82 0.82 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.05 1.0 0.09 0.03 0.25 0.07 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.06 0.0 0.0 0.0 0.52 0.31 0.03 0.02 0.04 0.02 0.02 0.09 0.26 0.89 0.97 0.73 0.79 1.0 0.23 0.3 0.01
0.57 0.53 0.68 0.19 0.92 0.96 0.5 0.39 0.45 0.42 0.5 0.5 0.3 1.0 0.62 0.51 0.4 0.51 0.7 0.26 0.42 0.68
0.3 0.15 0.22 0.02 0.79 1.0 0.42 0.41 0.61 0.4 0.53 0.62 0.28 0.61 0.57 0.52 0.53 0.51 0.82 0.15 0.15 0.35
0.11 0.09 0.03 0.02 0.54 1.0 0.38 0.31 0.52 0.4 0.42 0.44 0.17 0.36 0.64 0.53 0.67 0.53 0.8 0.11 0.15 0.5
0.36 0.0 0.0 0.0 0.24 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.4 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.84 0.06 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0
0.49 0.0 0.0 1.0 0.27 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.0 0.0 0.04 0.07 0.55 0.51 0.86 0.83 0.26 0.21 1.0 0.36 0.08 0.13 0.58 0.42 0.52 0.46 0.99 0.18 0.11
0.28 0.34 0.37 0.06 0.64 0.81 1.0 0.78 0.74 0.86 1.0 0.61 0.41 0.62 0.32 0.35 0.35 0.36 0.6 0.59 0.53 0.72
0.31 0.0 0.0 0.0 0.04 0.17 0.31 0.0 0.0 0.72 0.32 0.0 0.25 0.12 0.5 0.0 1.0 0.35 0.0 0.21 0.0 0.54
0.13 0.0 0.52 1.0 0.11 0.75 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.01 0.0 0.0 0.61 0.41 0.31 0.28 0.19 0.21 0.26 0.13 0.12 0.19 0.55 0.46 0.33 0.36 0.77 0.11 0.12 1.0
0.01 0.02 0.0 0.01 0.88 1.0 0.85 0.18 0.29 0.3 0.18 0.27 0.49 0.36 0.77 0.8 0.6 0.91 0.98 0.24 0.35 0.33
0.51 0.4 0.06 0.02 0.46 0.81 0.51 0.81 0.8 0.62 0.63 1.0 0.14 0.36 0.15 0.15 0.15 0.14 0.17 0.27 0.23 0.8
0.08 0.11 0.0 0.01 0.29 0.33 0.43 0.14 0.12 0.22 0.29 0.14 0.06 0.13 0.13 0.14 0.1 0.16 0.7 0.07 0.09 1.0
1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.98 0.04 0.01 0.14 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
0.34 0.09 0.0 0.01 0.0 0.37 0.27 0.75 0.8 0.55 0.29 1.0 0.54 0.06 0.13 0.19 0.3 0.18 0.02 0.17 0.23 0.13
0.79 0.0 0.0 1.0 0.4 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.08 0.14 0.51 0.43 1.0 0.56 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.14 0.32 0.1 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
0.14 0.0 0.0 0.39 0.0 0.11 0.15 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.22 0.11 0.03 0.26 0.44 0.74 0.2 0.03 0.17 0.18 0.02 0.25 0.29 0.41 0.39 0.38 0.33 0.3 0.18 0.21 1.0
0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.27 0.14 0.42 0.0 0.74 0.91 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 1.0 0.79 0.15 0.47 0.27 0.46 0.3 0.16 0.3 0.36 0.52 0.32 0.39 0.62 0.22 0.25 0.22
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.55 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 1.0 0.43 0.53 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.71 0.26 0.17 0.26 0.25 0.23 0.21 0.54 0.77 0.49 0.38 0.41 0.49 1.0 0.44 0.33 0.25
0.0 0.0 1.0 0.17 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)