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Heatmap: Cluster_178 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.48 0.35 0.14 -5.35 0.09 0.81 0.8 -0.52 0.12 -0.63 -0.47 0.1 -0.76 -0.33 -0.06 0.02 -0.07 0.1 0.17 -0.19 0.17 -0.13
0.38 0.65 0.61 -4.6 0.32 0.64 0.33 -0.09 0.5 -0.09 0.07 0.43 -0.35 -0.87 -0.58 -0.49 -0.55 -0.57 0.06 -0.25 -0.18 -0.05
0.12 0.09 -0.06 -3.38 -0.19 0.88 0.42 0.29 0.65 -0.08 0.35 0.8 0.06 -0.02 -0.48 -0.53 -0.59 -0.69 -1.0 -0.05 0.07 -0.42
0.03 -0.33 -0.87 -5.05 0.25 0.71 0.64 0.04 0.1 -0.51 -0.35 0.19 -0.92 -0.22 -0.09 0.1 -0.02 0.1 0.23 0.3 0.23 0.54
0.36 0.63 0.33 -3.94 0.25 0.79 0.57 -0.08 0.25 -0.79 -0.59 0.09 -0.63 -0.53 -0.31 -0.22 -0.18 -0.59 0.12 0.03 0.62 -0.31
0.6 0.68 1.18 -3.63 -1.28 1.39 -0.3 -0.87 1.14 -1.51 -0.45 0.14 -0.13 -0.34 -0.03 -0.18 -0.99 -0.74 0.08 -0.35 -0.56 -0.87
0.23 0.36 -0.07 -4.38 0.08 0.76 0.59 -0.37 0.36 -0.75 -0.25 0.07 -0.06 -0.67 0.01 -0.07 -0.1 -0.1 0.22 0.26 0.12 -0.2
0.08 -0.01 -0.07 -2.92 -0.07 1.03 0.74 0.16 0.47 -0.18 0.17 0.43 -0.1 -0.62 -0.56 -0.71 -0.55 -0.72 -0.22 -0.19 0.28 0.31
0.38 0.32 0.74 -3.83 -0.47 1.06 0.6 -0.63 0.49 -1.12 -0.72 0.19 0.03 -0.85 -0.06 -0.14 -0.0 -0.11 0.2 -0.42 -0.04 -0.18
0.35 -0.06 -0.12 -4.42 0.41 0.91 0.61 -0.19 -0.27 -1.02 -0.68 -0.03 -0.97 -0.19 0.13 -0.06 0.32 0.19 0.48 0.09 -0.02 -0.02
0.24 0.25 -0.46 -4.16 -0.05 1.02 0.93 0.04 0.71 -0.15 -0.33 0.5 -0.87 -0.45 -0.1 -0.32 -0.04 -0.43 -0.15 -0.1 -0.26 -0.36
0.6 0.74 0.05 -3.6 0.32 1.29 1.22 -0.23 -0.32 -0.96 -0.46 -0.64 -0.64 -0.46 -0.36 -0.21 -0.45 -0.41 0.22 -0.23 -0.11 -0.51
0.77 0.71 0.72 -3.97 -0.06 0.49 -0.02 0.03 0.09 -0.31 0.03 -0.02 -1.0 -0.83 -0.14 -0.26 -0.1 -0.35 0.26 -0.04 0.05 -0.08
-0.57 -1.11 -1.11 -5.6 -0.83 1.66 0.4 -0.01 1.55 -0.24 0.07 1.31 0.21 -1.19 -1.11 -0.92 -1.06 -1.38 -1.84 -0.22 -0.14 0.63
0.34 0.09 -0.04 -4.27 0.09 0.83 0.39 -0.07 0.41 -0.16 0.1 0.33 -0.28 0.2 -0.22 -0.53 -0.13 -0.13 -0.19 -0.12 -0.06 -0.18
0.24 0.14 -0.58 -5.86 0.12 0.6 0.43 -0.19 0.05 -0.43 -0.43 -0.04 -0.79 -0.09 0.21 0.26 0.29 0.19 0.66 -0.29 -0.07 0.17
0.43 0.08 -0.56 -4.32 0.03 0.71 0.55 -0.35 0.17 -0.7 -0.4 0.11 -0.94 -0.07 0.34 0.29 0.18 0.09 0.2 -0.23 -0.12 0.38
0.14 0.14 0.89 -3.64 -0.05 0.96 0.4 -0.75 0.38 -0.7 -0.33 0.1 -0.16 -0.61 0.15 0.08 0.0 0.0 0.02 -0.36 -0.03 -0.39
0.3 0.36 0.81 -2.62 -0.18 0.42 0.17 -0.05 0.2 -0.53 -0.05 -0.26 -1.06 -0.39 -0.0 0.25 0.15 -0.29 0.01 -0.16 -0.22 0.57
0.24 -0.18 0.19 -2.99 0.16 0.9 0.84 0.06 0.45 -0.01 0.21 0.36 -0.34 -0.47 -0.4 -0.45 -0.4 -0.58 -0.77 -0.27 -0.24 0.46
0.26 -0.01 0.82 -2.19 -0.28 0.77 0.41 -0.09 0.2 -0.59 -0.56 0.06 -0.12 -0.26 -0.18 -0.23 -0.06 -0.07 0.19 0.0 0.11 -0.22
0.45 0.7 0.94 -2.5 -0.36 0.56 0.05 0.13 -0.27 -0.31 -0.41 -0.07 -0.76 -0.35 -0.17 -0.04 0.07 0.02 0.17 -0.16 0.02 -0.21
0.09 0.08 -0.42 -2.96 0.02 0.54 0.39 0.05 0.19 0.0 -0.2 0.3 -0.77 -0.37 0.06 -0.02 0.03 -0.08 0.24 -0.08 -0.13 0.62
0.38 -0.04 0.16 -3.28 -0.56 1.13 0.54 0.01 0.68 -0.32 0.08 0.63 -0.26 -0.36 -0.69 -0.72 -0.57 -0.61 -0.73 -0.36 -0.02 0.71
0.54 0.79 1.12 -2.81 -0.23 1.16 0.37 -0.57 -0.02 -1.41 -0.6 -0.32 -0.81 -0.52 0.24 0.1 0.17 0.07 -0.57 -0.38 -0.26 -0.62
0.39 0.4 0.18 -4.67 0.27 0.71 0.53 -0.08 0.32 -0.4 -0.18 0.3 -0.55 -0.4 -0.16 -0.25 -0.22 -0.23 0.06 -0.12 -0.02 0.01
0.27 0.56 1.08 -4.04 -0.26 0.41 0.37 0.04 0.5 -0.06 -0.01 0.43 -0.74 -1.26 -0.37 -0.48 -0.41 -0.42 0.12 -0.32 -0.18 0.24
-0.0 0.01 0.43 -3.03 -1.57 0.76 0.21 -0.81 -0.31 -0.36 -0.54 -0.26 0.63 0.11 0.51 0.3 0.65 0.42 -0.38 -0.15 0.48 -1.29
-0.06 -0.21 -0.4 -4.93 0.53 0.9 0.71 -0.31 0.69 -0.6 0.16 0.39 -0.62 -0.51 -0.11 -0.1 -0.02 -0.17 0.05 -0.27 -0.33 0.26
0.42 0.33 0.77 -4.01 -0.09 0.83 0.6 -0.52 0.15 -0.68 -0.35 0.27 -0.22 -0.7 -0.01 -0.02 0.02 -0.09 -0.59 0.1 0.05 -0.29
0.18 0.14 0.85 -2.48 -0.11 0.55 0.72 -0.41 0.53 -0.72 -0.54 0.41 -0.07 0.23 -0.36 -0.5 -0.5 -0.5 -0.05 0.02 -0.09 -0.0
-0.27 0.28 0.34 -4.22 0.04 0.71 0.19 -0.16 0.52 0.31 -0.15 0.2 -0.64 -0.27 0.07 0.04 0.17 0.07 -0.05 -0.45 -0.29 -0.03
-0.61 -0.49 0.18 -3.69 0.3 0.79 0.47 -0.05 0.23 -0.06 -0.12 0.45 -0.34 -0.61 0.18 0.2 0.24 0.17 -0.15 -0.31 -0.12 0.05
0.15 0.3 0.23 -4.49 0.3 0.74 0.48 -0.43 0.25 -0.99 -0.56 0.3 -0.41 -0.0 -0.16 0.01 -0.03 -0.05 0.14 0.06 0.34 -0.35
0.3 0.55 0.2 -4.11 0.17 0.89 0.45 -0.25 0.26 -0.28 -0.48 0.3 -0.37 -0.4 -0.19 -0.07 0.02 -0.18 0.14 -0.43 -0.19 -0.05
0.13 0.64 0.66 -4.34 -0.62 0.64 -0.43 -0.06 0.73 0.11 0.32 0.52 0.03 -0.34 -0.71 -0.8 -0.46 -0.61 0.01 0.0 -0.12 0.1
0.12 0.32 0.51 -3.47 0.15 0.89 0.37 -0.24 0.17 -0.43 -0.44 0.15 -1.07 -0.18 -0.0 -0.22 -0.19 -0.01 0.24 0.1 0.24 -0.29
0.03 0.6 1.15 -4.45 -0.29 0.45 0.34 -0.02 0.38 -0.55 0.04 -0.11 -0.14 -0.59 -0.43 -0.36 -0.28 -0.46 0.11 -0.17 0.06 0.22
0.52 0.95 0.93 -2.81 -1.03 0.97 -0.04 -0.49 0.35 -0.41 -0.26 0.36 -0.81 -0.09 -0.09 -0.35 -0.11 -0.23 0.17 -0.57 -0.54 -0.28
0.36 0.95 1.4 -2.98 -0.54 0.98 -0.15 -0.33 -0.42 -0.57 -0.51 -0.19 -0.91 -0.53 -0.15 0.05 -0.11 -0.14 0.7 -0.53 -0.56 -0.56
-0.04 -0.5 1.36 -4.53 0.09 0.63 0.32 -0.61 -0.08 -0.66 -0.7 -0.29 -0.94 -0.13 0.42 0.4 0.43 0.38 0.28 -0.78 -0.64 -0.03
-0.37 0.07 0.24 -3.8 0.13 0.63 0.27 0.22 0.51 0.1 0.27 0.3 -0.35 -0.09 -0.45 -0.35 -0.4 -0.42 -0.38 0.09 -0.09 0.56
-0.02 0.3 0.0 -4.19 0.07 0.69 0.39 0.13 0.34 -0.04 0.1 0.32 -0.18 -0.14 -0.36 -0.27 -0.22 -0.25 -0.02 -0.0 0.14 -0.11
0.21 0.12 -0.23 -4.76 0.16 0.92 0.49 -0.29 0.17 -0.49 -0.31 0.15 -0.09 -0.22 0.11 0.01 0.18 -0.01 0.19 -0.33 -0.15 0.02
0.08 0.24 -0.02 -5.25 -0.22 0.73 0.75 -0.32 0.65 -0.41 -0.31 0.23 -0.35 -0.21 -0.24 -0.1 -0.11 -0.13 0.21 -0.42 -0.18 0.49
-0.03 -0.31 0.68 -3.35 -0.2 0.58 0.13 -0.23 0.37 -0.25 -0.26 0.27 -0.36 -0.14 0.17 0.11 0.14 0.05 0.27 -0.14 -0.08 -0.09
0.29 0.2 0.1 -4.17 0.29 0.64 0.45 -0.31 0.25 -0.62 -0.2 0.18 -0.1 -0.03 -0.13 -0.27 -0.08 -0.26 0.19 -0.07 -0.13 0.32
0.46 0.8 0.31 -3.68 0.27 0.81 0.56 0.08 0.15 -0.16 -0.18 0.26 -0.7 -1.09 -0.37 -0.5 -0.23 -0.37 -0.08 -0.08 -0.05 -0.06
-0.01 0.21 0.72 -3.26 -0.08 0.89 0.44 -0.27 0.53 -0.36 -0.06 0.56 -0.15 -0.5 -0.35 -0.45 -0.31 -0.38 -0.12 -0.16 -0.12 0.03
0.3 0.15 -0.52 -5.09 -0.14 0.79 0.58 0.07 0.65 -0.19 -0.05 0.28 -0.18 -0.31 -0.3 -0.28 -0.19 -0.29 -0.11 -0.01 -0.13 0.36
-0.07 0.12 0.4 -4.85 -0.22 0.72 0.45 -0.26 -0.14 -0.31 -0.14 -0.24 -0.01 -0.33 0.31 0.18 0.11 0.07 0.24 -0.28 0.16 0.01
0.11 0.53 0.98 -4.25 -0.35 0.43 0.15 0.17 -0.04 -0.04 0.12 0.13 -0.61 -0.84 -0.01 -0.19 -0.11 -0.19 0.24 -0.12 0.01 -0.06
0.58 0.07 -0.98 -3.7 -0.11 0.82 0.57 0.11 0.35 -0.25 0.13 0.31 0.0 -0.22 -0.48 -0.5 -0.4 -0.48 -0.11 -0.07 0.21 0.46
0.34 0.78 0.61 -3.98 -0.36 0.58 0.24 -0.02 0.1 0.03 0.19 0.34 -1.1 -0.54 -0.06 0.09 0.18 0.16 -0.3 -0.51 -0.34 -0.38
0.21 0.53 0.42 -4.04 0.0 0.66 0.38 -0.02 0.45 0.2 0.17 0.53 -0.75 -0.2 -0.24 -0.27 -0.44 -0.42 -0.21 -0.23 -0.38 -0.1
-0.11 -0.05 0.56 -5.97 -0.03 0.68 0.26 -0.01 0.11 0.18 -0.09 0.13 -0.17 -0.49 0.19 0.18 0.19 0.13 -0.42 -0.28 -0.15 0.04
0.08 -0.26 0.26 -3.93 -0.1 0.97 0.84 -0.42 0.49 -0.62 -0.31 0.39 -0.08 -0.23 -0.31 -0.32 -0.22 -0.26 0.05 -0.04 0.03 0.14
0.1 -0.57 -0.21 -4.65 -0.56 1.82 0.29 -0.8 1.29 -0.86 -0.98 1.26 0.14 -0.39 -1.12 -0.98 -1.13 -1.1 -1.29 0.34 0.57 -0.92
-0.27 0.11 0.17 -4.08 -0.43 1.1 0.5 -0.45 0.83 -0.02 0.04 0.81 -0.15 -0.53 -0.34 -0.39 -0.59 -0.43 -0.27 -0.1 0.14 -0.14
0.35 0.38 1.02 -3.69 -0.87 0.85 0.09 -0.65 0.25 -0.76 -0.5 -0.28 0.08 -1.01 0.41 0.42 0.34 0.24 -0.33 -0.38 -0.11 -0.33
-0.13 -0.56 -0.57 -4.1 0.05 1.39 0.25 0.36 0.79 0.13 0.48 0.72 0.0 -0.75 -0.72 -0.92 -0.63 -0.75 -0.34 -0.1 -0.33 0.26
0.24 0.28 0.51 -4.92 0.24 0.73 0.58 -0.04 0.05 -0.21 -0.06 0.09 -0.52 -0.35 -0.44 -0.43 -0.38 -0.5 0.15 -0.1 -0.07 0.57
0.04 -0.19 -0.53 -4.28 0.25 1.19 0.27 -0.41 0.47 -0.55 -0.76 0.18 -0.09 -0.63 -0.04 0.01 -0.01 0.11 0.07 0.2 0.42 -0.06
0.35 0.54 0.23 -4.66 0.2 0.56 0.57 -0.25 0.36 -0.55 -0.25 0.34 -0.75 -0.03 -0.15 -0.2 -0.16 -0.15 0.02 -0.06 -0.31 0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.