Heatmap: Cluster_178 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
38.5 35.16 30.39 0.67 29.42 48.22 47.85 19.28 29.98 17.88 19.87 29.55 16.24 21.96 26.52 27.93 26.36 29.48 31.04 24.13 31.07 25.16
26.53 31.97 31.16 0.84 25.42 31.89 25.72 19.18 28.89 19.14 21.5 27.46 16.06 11.19 13.68 14.57 13.92 13.76 21.26 17.19 18.06 19.76
20.34 19.84 17.95 1.8 16.4 34.33 25.08 22.89 29.29 17.66 23.89 32.59 19.48 18.43 13.36 12.91 12.42 11.57 9.38 18.04 19.68 14.0
18.03 14.11 9.65 0.53 21.08 29.0 27.61 18.14 18.94 12.43 13.85 20.12 9.35 15.23 16.57 18.93 17.38 18.92 20.76 21.72 20.7 25.75
10.15 12.24 9.96 0.52 9.45 13.73 11.79 7.51 9.42 4.59 5.25 8.45 5.14 5.48 6.41 6.79 7.01 5.27 8.6 8.08 12.14 6.39
11.66 12.37 17.53 0.62 3.17 20.25 6.28 4.22 16.96 2.7 5.64 8.52 7.06 6.1 7.57 6.82 3.88 4.62 8.16 6.06 5.22 4.22
16.66 18.23 13.46 0.68 14.94 24.0 21.29 11.0 18.25 8.45 11.94 14.86 13.61 8.91 14.29 13.55 13.2 13.25 16.55 16.94 15.41 12.3
13.47 12.73 12.18 1.69 12.15 26.11 21.39 14.25 17.72 11.29 14.37 17.21 11.93 8.33 8.66 7.83 8.71 7.76 10.95 11.18 15.47 15.87
12.47 12.0 16.04 0.67 6.94 19.97 14.56 6.19 13.44 4.41 5.81 10.96 9.77 5.31 9.18 8.7 9.57 8.89 11.0 7.18 9.32 8.48
9.41 7.1 6.8 0.35 9.78 13.9 11.29 6.45 6.11 3.64 4.62 7.24 3.76 6.49 8.09 7.08 9.22 8.44 10.26 7.87 7.29 7.27
10.46 10.5 6.42 0.49 8.56 17.95 16.86 9.09 14.52 7.95 7.05 12.49 4.84 6.49 8.26 7.11 8.61 6.56 7.98 8.23 7.37 6.89
8.79 9.7 6.01 0.48 7.25 14.26 13.52 4.97 4.64 2.99 4.24 3.72 3.74 4.22 4.53 5.02 4.26 4.36 6.78 4.95 5.39 4.07
16.31 15.69 15.82 0.61 9.16 13.49 9.45 9.81 10.19 7.74 9.77 9.45 4.78 5.38 8.67 8.01 8.96 7.53 11.51 9.34 9.95 9.08
11.09 7.63 7.62 0.34 9.27 51.77 21.7 16.34 48.24 13.91 17.22 40.72 18.99 7.21 7.6 8.71 7.88 6.34 4.59 14.15 14.96 25.37
32.03 26.98 24.54 1.32 26.95 45.14 33.26 24.05 33.52 22.72 27.21 31.73 20.82 29.03 21.72 17.55 23.07 23.11 22.23 23.26 24.25 22.37
21.22 19.81 12.03 0.31 19.5 27.23 24.27 15.73 18.6 13.33 13.37 17.48 10.37 16.89 20.74 21.54 22.01 20.46 28.36 14.73 17.07 20.23
14.76 11.57 7.45 0.55 11.22 17.91 16.08 8.62 12.31 6.74 8.33 11.81 5.73 10.44 13.89 13.43 12.45 11.65 12.61 9.38 10.11 14.32
16.57 16.56 27.96 1.21 14.56 29.2 19.87 8.92 19.58 9.26 11.95 16.17 13.47 9.84 16.66 15.88 15.08 15.05 15.27 11.72 14.7 11.47
3.63 3.79 5.17 0.48 2.6 3.94 3.31 2.84 3.39 2.03 2.84 2.46 1.42 2.25 2.94 3.51 3.27 2.42 2.97 2.63 2.52 4.38
15.66 11.7 15.07 1.67 14.78 24.69 23.59 13.78 18.03 13.1 15.25 16.95 10.43 9.56 10.05 9.7 10.03 8.83 7.73 10.96 11.2 18.13
6.28 5.23 9.31 1.15 4.33 9.0 6.97 4.95 6.06 3.5 3.56 5.49 4.84 4.39 4.64 4.48 5.03 5.01 5.98 5.26 5.67 4.53
5.51 6.59 7.78 0.72 3.15 5.95 4.18 4.42 3.35 3.26 3.05 3.84 2.39 3.17 3.59 3.93 4.24 4.09 4.55 3.63 4.1 3.49
5.83 5.79 4.08 0.7 5.52 7.95 7.15 5.64 6.25 5.47 4.77 6.72 3.21 4.23 5.69 5.38 5.57 5.15 6.47 5.18 4.97 8.42
6.77 5.05 5.79 0.53 3.51 11.36 7.55 5.24 8.32 4.15 5.47 8.01 4.32 4.03 3.22 3.16 3.49 3.41 3.12 4.04 5.13 8.47
6.75 8.05 10.08 0.66 3.97 10.4 5.99 3.12 4.58 1.75 3.07 3.73 2.64 3.25 5.5 4.97 5.24 4.89 3.13 3.57 3.88 3.03
28.07 28.14 24.23 0.84 25.82 34.98 30.78 20.26 26.69 16.17 18.85 26.33 14.59 16.2 19.2 18.02 18.41 18.28 22.3 19.61 21.03 21.45
57.52 69.94 100.5 2.9 39.87 63.18 61.73 48.77 67.23 45.52 47.25 64.33 28.52 19.81 36.79 34.16 35.85 35.55 51.55 38.08 42.1 56.1
4.52 4.56 6.12 0.55 1.52 7.68 5.22 2.58 3.64 3.54 3.12 3.78 7.0 4.87 6.43 5.56 7.09 6.06 3.48 4.07 6.32 1.86
18.47 16.61 14.55 0.63 27.7 35.91 31.58 15.57 31.1 12.71 21.44 25.22 12.48 13.56 17.85 17.94 18.92 17.08 19.88 15.97 15.32 22.99
32.12 30.21 40.9 1.49 22.56 42.69 36.59 16.79 26.63 15.0 18.91 29.1 20.68 14.83 23.93 23.81 24.48 22.56 15.93 25.74 24.84 19.64
7.66 7.45 12.17 1.22 6.27 9.92 11.15 5.09 9.8 4.1 4.66 9.02 6.43 7.93 5.26 4.78 4.8 4.78 6.53 6.85 6.37 6.76
12.58 18.38 19.25 0.81 15.57 24.85 17.26 13.57 21.73 18.81 13.64 17.4 9.75 12.61 15.9 15.6 17.02 15.89 14.67 11.11 12.38 14.9
12.6 13.69 21.78 1.49 23.76 33.23 26.57 18.55 22.64 18.5 17.73 26.25 15.22 12.58 21.76 22.16 22.75 21.65 17.34 15.47 17.66 19.89
5.71 6.32 6.03 0.23 6.34 8.6 7.18 3.83 6.1 2.6 3.5 6.35 3.86 5.14 4.6 5.2 5.05 4.97 5.67 5.35 6.53 4.04
7.47 8.87 7.0 0.35 6.83 11.26 8.27 5.09 7.28 5.0 4.34 7.5 4.68 4.6 5.33 5.78 6.15 5.34 6.71 4.52 5.31 5.88
33.98 48.16 48.85 1.53 20.22 48.21 22.98 29.71 51.42 33.51 38.54 44.5 31.63 24.55 18.96 17.78 22.48 20.3 31.29 30.99 28.56 33.27
8.33 9.57 10.88 0.69 8.49 14.22 9.9 6.5 8.61 5.69 5.64 8.5 3.64 6.75 7.65 6.56 6.73 7.59 9.04 8.23 9.03 6.27
8.35 12.44 18.24 0.38 6.7 11.18 10.35 8.08 10.64 5.61 8.45 7.59 7.42 5.45 6.06 6.38 6.72 5.96 8.84 7.26 8.54 9.57
26.23 35.27 34.89 2.62 8.97 35.77 17.75 13.05 23.26 13.78 15.3 23.45 10.48 17.19 17.24 14.35 16.96 15.57 20.67 12.34 12.61 15.13
12.67 18.97 25.93 1.25 6.78 19.43 8.86 7.85 7.36 6.61 6.89 8.66 5.24 6.82 8.88 10.16 9.14 8.94 15.98 6.83 6.69 6.69
22.34 16.22 58.98 0.99 24.31 35.52 28.64 15.04 21.67 14.45 14.09 18.71 11.94 20.98 30.66 30.18 30.81 29.85 27.85 13.38 14.71 22.49
29.08 39.48 44.33 2.69 41.13 58.21 45.26 43.69 53.66 40.32 45.44 46.42 29.43 35.3 27.6 29.52 28.49 28.22 28.95 39.96 35.27 55.33
14.61 18.13 14.78 0.81 15.48 23.83 19.41 16.14 18.65 14.34 15.86 18.38 13.08 13.38 11.49 12.26 12.69 12.39 14.55 14.75 16.23 13.67
22.95 21.42 16.86 0.73 22.14 37.5 27.86 16.22 22.31 14.11 15.92 21.94 18.56 16.97 21.41 19.95 22.34 19.65 22.62 15.72 17.87 19.99
23.64 26.33 21.99 0.59 19.2 36.93 37.66 17.91 34.95 16.8 18.05 26.13 17.58 19.34 18.97 20.79 20.67 20.42 25.79 16.73 19.76 31.3
28.82 23.71 47.22 2.89 25.6 44.14 32.26 25.17 38.1 24.7 24.68 35.52 22.89 26.8 33.11 31.82 32.57 30.43 35.55 26.73 27.94 27.66
16.87 15.84 14.85 0.77 16.94 21.59 18.94 11.13 16.43 8.99 12.05 15.6 12.87 13.56 12.6 11.49 13.1 11.56 15.81 13.19 12.65 17.2
16.23 20.53 14.67 0.92 14.29 20.66 17.37 12.5 13.13 10.58 10.44 14.11 7.27 5.56 9.12 8.35 10.07 9.15 11.2 11.18 11.44 11.3
15.83 18.51 26.28 1.67 15.08 29.69 21.74 13.25 23.15 12.47 15.38 23.5 14.45 11.31 12.57 11.69 12.89 12.25 14.72 14.32 14.74 16.27
39.25 35.51 22.34 0.94 29.08 55.18 47.86 33.56 50.04 27.97 30.96 38.92 28.26 25.79 25.93 26.31 28.01 26.12 29.53 31.73 29.25 40.97
13.63 15.59 18.95 0.5 12.31 23.65 19.5 11.94 13.01 11.51 12.99 12.13 14.26 11.36 17.7 16.27 15.4 15.05 16.93 11.75 16.02 14.46
27.09 36.06 49.41 1.31 19.65 33.78 27.71 28.17 24.42 24.33 27.14 27.51 16.45 14.05 24.94 22.04 23.14 21.9 29.68 23.13 25.28 24.06
19.31 13.6 6.59 1.0 11.98 22.81 19.17 14.0 16.47 10.88 14.18 16.09 12.99 11.14 9.28 9.16 9.83 9.31 11.98 12.37 15.0 17.82
25.32 34.53 30.67 1.27 15.61 29.96 23.64 19.75 21.43 20.5 22.93 25.4 9.37 13.82 19.19 21.28 22.66 22.34 16.34 14.04 15.83 15.4
15.31 19.11 17.74 0.81 13.25 20.96 17.17 13.04 18.11 15.17 14.87 19.18 7.88 11.52 11.23 10.97 9.73 9.93 11.41 11.29 10.17 12.35
47.78 49.87 75.94 0.83 50.58 82.74 61.95 51.4 55.71 58.67 48.55 56.71 45.86 36.81 58.84 58.51 58.89 56.43 38.56 42.68 46.54 53.03
16.0 12.62 18.15 0.99 14.18 29.76 27.18 11.31 21.21 9.88 12.22 19.78 14.36 12.89 12.19 12.13 13.0 12.66 15.72 14.78 15.51 16.75
9.83 6.14 7.91 0.36 6.21 32.23 11.15 5.24 22.32 5.06 4.65 21.96 10.08 7.0 4.21 4.65 4.18 4.28 3.74 11.58 13.61 4.83
10.42 13.57 14.15 0.74 9.34 26.99 17.76 9.19 22.38 12.38 12.91 21.96 11.35 8.71 9.91 9.6 8.35 9.34 10.45 11.72 13.84 11.41
14.06 14.43 22.45 0.86 6.05 19.94 11.8 7.04 13.13 6.52 7.8 9.07 11.67 5.48 14.67 14.75 13.97 13.09 8.82 8.51 10.28 8.79
20.64 15.39 15.25 1.32 23.47 59.47 26.95 29.08 39.27 24.73 31.5 37.21 22.71 13.46 13.71 11.97 14.62 13.43 17.95 21.19 18.08 27.08
51.41 52.9 62.02 1.44 51.54 72.27 64.97 42.22 45.17 37.59 41.68 46.37 30.31 34.09 32.02 32.37 33.49 30.8 48.34 40.63 41.58 64.72
12.43 10.61 8.37 0.62 14.38 27.59 14.55 9.12 16.7 8.24 7.12 13.72 11.33 7.83 11.76 12.16 11.97 13.06 12.71 13.85 16.19 11.62
13.43 15.25 12.36 0.42 12.08 15.54 15.64 8.84 13.48 7.17 8.84 13.31 6.26 10.29 9.47 9.15 9.39 9.51 10.68 10.12 8.49 11.69

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)