Heatmap: Cluster_178 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.8 0.73 0.63 0.01 0.61 1.0 0.99 0.4 0.62 0.37 0.41 0.61 0.34 0.46 0.55 0.58 0.55 0.61 0.64 0.5 0.64 0.52
0.83 1.0 0.97 0.03 0.8 1.0 0.8 0.6 0.9 0.6 0.67 0.86 0.5 0.35 0.43 0.46 0.44 0.43 0.67 0.54 0.56 0.62
0.59 0.58 0.52 0.05 0.48 1.0 0.73 0.67 0.85 0.51 0.7 0.95 0.57 0.54 0.39 0.38 0.36 0.34 0.27 0.53 0.57 0.41
0.62 0.49 0.33 0.02 0.73 1.0 0.95 0.63 0.65 0.43 0.48 0.69 0.32 0.52 0.57 0.65 0.6 0.65 0.72 0.75 0.71 0.89
0.74 0.89 0.73 0.04 0.69 1.0 0.86 0.55 0.69 0.33 0.38 0.62 0.37 0.4 0.47 0.49 0.51 0.38 0.63 0.59 0.88 0.47
0.58 0.61 0.87 0.03 0.16 1.0 0.31 0.21 0.84 0.13 0.28 0.42 0.35 0.3 0.37 0.34 0.19 0.23 0.4 0.3 0.26 0.21
0.69 0.76 0.56 0.03 0.62 1.0 0.89 0.46 0.76 0.35 0.5 0.62 0.57 0.37 0.6 0.56 0.55 0.55 0.69 0.71 0.64 0.51
0.52 0.49 0.47 0.06 0.47 1.0 0.82 0.55 0.68 0.43 0.55 0.66 0.46 0.32 0.33 0.3 0.33 0.3 0.42 0.43 0.59 0.61
0.62 0.6 0.8 0.03 0.35 1.0 0.73 0.31 0.67 0.22 0.29 0.55 0.49 0.27 0.46 0.44 0.48 0.45 0.55 0.36 0.47 0.42
0.68 0.51 0.49 0.02 0.7 1.0 0.81 0.46 0.44 0.26 0.33 0.52 0.27 0.47 0.58 0.51 0.66 0.61 0.74 0.57 0.52 0.52
0.58 0.59 0.36 0.03 0.48 1.0 0.94 0.51 0.81 0.44 0.39 0.7 0.27 0.36 0.46 0.4 0.48 0.37 0.44 0.46 0.41 0.38
0.62 0.68 0.42 0.03 0.51 1.0 0.95 0.35 0.33 0.21 0.3 0.26 0.26 0.3 0.32 0.35 0.3 0.31 0.48 0.35 0.38 0.29
1.0 0.96 0.97 0.04 0.56 0.83 0.58 0.6 0.62 0.47 0.6 0.58 0.29 0.33 0.53 0.49 0.55 0.46 0.71 0.57 0.61 0.56
0.21 0.15 0.15 0.01 0.18 1.0 0.42 0.32 0.93 0.27 0.33 0.79 0.37 0.14 0.15 0.17 0.15 0.12 0.09 0.27 0.29 0.49
0.71 0.6 0.54 0.03 0.6 1.0 0.74 0.53 0.74 0.5 0.6 0.7 0.46 0.64 0.48 0.39 0.51 0.51 0.49 0.52 0.54 0.5
0.75 0.7 0.42 0.01 0.69 0.96 0.86 0.55 0.66 0.47 0.47 0.62 0.37 0.6 0.73 0.76 0.78 0.72 1.0 0.52 0.6 0.71
0.82 0.65 0.42 0.03 0.63 1.0 0.9 0.48 0.69 0.38 0.46 0.66 0.32 0.58 0.78 0.75 0.7 0.65 0.7 0.52 0.56 0.8
0.57 0.57 0.96 0.04 0.5 1.0 0.68 0.31 0.67 0.32 0.41 0.55 0.46 0.34 0.57 0.54 0.52 0.52 0.52 0.4 0.5 0.39
0.7 0.73 1.0 0.09 0.5 0.76 0.64 0.55 0.66 0.39 0.55 0.48 0.27 0.44 0.57 0.68 0.63 0.47 0.57 0.51 0.49 0.85
0.63 0.47 0.61 0.07 0.6 1.0 0.96 0.56 0.73 0.53 0.62 0.69 0.42 0.39 0.41 0.39 0.41 0.36 0.31 0.44 0.45 0.73
0.68 0.56 1.0 0.12 0.47 0.97 0.75 0.53 0.65 0.38 0.38 0.59 0.52 0.47 0.5 0.48 0.54 0.54 0.64 0.57 0.61 0.49
0.71 0.85 1.0 0.09 0.4 0.76 0.54 0.57 0.43 0.42 0.39 0.49 0.31 0.41 0.46 0.5 0.55 0.53 0.59 0.47 0.53 0.45
0.69 0.69 0.48 0.08 0.66 0.94 0.85 0.67 0.74 0.65 0.57 0.8 0.38 0.5 0.68 0.64 0.66 0.61 0.77 0.61 0.59 1.0
0.6 0.44 0.51 0.05 0.31 1.0 0.66 0.46 0.73 0.37 0.48 0.7 0.38 0.35 0.28 0.28 0.31 0.3 0.27 0.36 0.45 0.75
0.65 0.77 0.97 0.06 0.38 1.0 0.58 0.3 0.44 0.17 0.3 0.36 0.25 0.31 0.53 0.48 0.5 0.47 0.3 0.34 0.37 0.29
0.8 0.8 0.69 0.02 0.74 1.0 0.88 0.58 0.76 0.46 0.54 0.75 0.42 0.46 0.55 0.51 0.53 0.52 0.64 0.56 0.6 0.61
0.57 0.7 1.0 0.03 0.4 0.63 0.61 0.49 0.67 0.45 0.47 0.64 0.28 0.2 0.37 0.34 0.36 0.35 0.51 0.38 0.42 0.56
0.59 0.59 0.8 0.07 0.2 1.0 0.68 0.34 0.47 0.46 0.41 0.49 0.91 0.63 0.84 0.72 0.92 0.79 0.45 0.53 0.82 0.24
0.51 0.46 0.41 0.02 0.77 1.0 0.88 0.43 0.87 0.35 0.6 0.7 0.35 0.38 0.5 0.5 0.53 0.48 0.55 0.44 0.43 0.64
0.75 0.71 0.96 0.03 0.53 1.0 0.86 0.39 0.62 0.35 0.44 0.68 0.48 0.35 0.56 0.56 0.57 0.53 0.37 0.6 0.58 0.46
0.63 0.61 1.0 0.1 0.52 0.82 0.92 0.42 0.81 0.34 0.38 0.74 0.53 0.65 0.43 0.39 0.39 0.39 0.54 0.56 0.52 0.56
0.51 0.74 0.77 0.03 0.63 1.0 0.69 0.55 0.87 0.76 0.55 0.7 0.39 0.51 0.64 0.63 0.68 0.64 0.59 0.45 0.5 0.6
0.38 0.41 0.66 0.04 0.72 1.0 0.8 0.56 0.68 0.56 0.53 0.79 0.46 0.38 0.65 0.67 0.68 0.65 0.52 0.47 0.53 0.6
0.66 0.73 0.7 0.03 0.74 1.0 0.83 0.45 0.71 0.3 0.41 0.74 0.45 0.6 0.53 0.6 0.59 0.58 0.66 0.62 0.76 0.47
0.66 0.79 0.62 0.03 0.61 1.0 0.73 0.45 0.65 0.44 0.39 0.67 0.42 0.41 0.47 0.51 0.55 0.47 0.6 0.4 0.47 0.52
0.66 0.94 0.95 0.03 0.39 0.94 0.45 0.58 1.0 0.65 0.75 0.87 0.62 0.48 0.37 0.35 0.44 0.39 0.61 0.6 0.56 0.65
0.59 0.67 0.77 0.05 0.6 1.0 0.7 0.46 0.61 0.4 0.4 0.6 0.26 0.47 0.54 0.46 0.47 0.53 0.64 0.58 0.64 0.44
0.46 0.68 1.0 0.02 0.37 0.61 0.57 0.44 0.58 0.31 0.46 0.42 0.41 0.3 0.33 0.35 0.37 0.33 0.48 0.4 0.47 0.52
0.73 0.99 0.98 0.07 0.25 1.0 0.5 0.36 0.65 0.39 0.43 0.66 0.29 0.48 0.48 0.4 0.47 0.44 0.58 0.34 0.35 0.42
0.49 0.73 1.0 0.05 0.26 0.75 0.34 0.3 0.28 0.26 0.27 0.33 0.2 0.26 0.34 0.39 0.35 0.34 0.62 0.26 0.26 0.26
0.38 0.28 1.0 0.02 0.41 0.6 0.49 0.26 0.37 0.25 0.24 0.32 0.2 0.36 0.52 0.51 0.52 0.51 0.47 0.23 0.25 0.38
0.5 0.68 0.76 0.05 0.71 1.0 0.78 0.75 0.92 0.69 0.78 0.8 0.51 0.61 0.47 0.51 0.49 0.48 0.5 0.69 0.61 0.95
0.61 0.76 0.62 0.03 0.65 1.0 0.81 0.68 0.78 0.6 0.67 0.77 0.55 0.56 0.48 0.51 0.53 0.52 0.61 0.62 0.68 0.57
0.61 0.57 0.45 0.02 0.59 1.0 0.74 0.43 0.6 0.38 0.42 0.59 0.49 0.45 0.57 0.53 0.6 0.52 0.6 0.42 0.48 0.53
0.63 0.7 0.58 0.02 0.51 0.98 1.0 0.48 0.93 0.45 0.48 0.69 0.47 0.51 0.5 0.55 0.55 0.54 0.68 0.44 0.52 0.83
0.61 0.5 1.0 0.06 0.54 0.93 0.68 0.53 0.81 0.52 0.52 0.75 0.48 0.57 0.7 0.67 0.69 0.64 0.75 0.57 0.59 0.59
0.78 0.73 0.69 0.04 0.78 1.0 0.88 0.52 0.76 0.42 0.56 0.72 0.6 0.63 0.58 0.53 0.61 0.54 0.73 0.61 0.59 0.8
0.79 0.99 0.71 0.04 0.69 1.0 0.84 0.61 0.64 0.51 0.51 0.68 0.35 0.27 0.44 0.4 0.49 0.44 0.54 0.54 0.55 0.55
0.53 0.62 0.89 0.06 0.51 1.0 0.73 0.45 0.78 0.42 0.52 0.79 0.49 0.38 0.42 0.39 0.43 0.41 0.5 0.48 0.5 0.55
0.71 0.64 0.4 0.02 0.53 1.0 0.87 0.61 0.91 0.51 0.56 0.71 0.51 0.47 0.47 0.48 0.51 0.47 0.54 0.57 0.53 0.74
0.58 0.66 0.8 0.02 0.52 1.0 0.82 0.5 0.55 0.49 0.55 0.51 0.6 0.48 0.75 0.69 0.65 0.64 0.72 0.5 0.68 0.61
0.55 0.73 1.0 0.03 0.4 0.68 0.56 0.57 0.49 0.49 0.55 0.56 0.33 0.28 0.5 0.45 0.47 0.44 0.6 0.47 0.51 0.49
0.85 0.6 0.29 0.04 0.53 1.0 0.84 0.61 0.72 0.48 0.62 0.71 0.57 0.49 0.41 0.4 0.43 0.41 0.53 0.54 0.66 0.78
0.73 1.0 0.89 0.04 0.45 0.87 0.68 0.57 0.62 0.59 0.66 0.74 0.27 0.4 0.56 0.62 0.66 0.65 0.47 0.41 0.46 0.45
0.73 0.91 0.85 0.04 0.63 1.0 0.82 0.62 0.86 0.72 0.71 0.91 0.38 0.55 0.54 0.52 0.46 0.47 0.54 0.54 0.49 0.59
0.58 0.6 0.92 0.01 0.61 1.0 0.75 0.62 0.67 0.71 0.59 0.69 0.55 0.44 0.71 0.71 0.71 0.68 0.47 0.52 0.56 0.64
0.54 0.42 0.61 0.03 0.48 1.0 0.91 0.38 0.71 0.33 0.41 0.66 0.48 0.43 0.41 0.41 0.44 0.43 0.53 0.5 0.52 0.56
0.31 0.19 0.25 0.01 0.19 1.0 0.35 0.16 0.69 0.16 0.14 0.68 0.31 0.22 0.13 0.14 0.13 0.13 0.12 0.36 0.42 0.15
0.39 0.5 0.52 0.03 0.35 1.0 0.66 0.34 0.83 0.46 0.48 0.81 0.42 0.32 0.37 0.36 0.31 0.35 0.39 0.43 0.51 0.42
0.63 0.64 1.0 0.04 0.27 0.89 0.53 0.31 0.58 0.29 0.35 0.4 0.52 0.24 0.65 0.66 0.62 0.58 0.39 0.38 0.46 0.39
0.35 0.26 0.26 0.02 0.39 1.0 0.45 0.49 0.66 0.42 0.53 0.63 0.38 0.23 0.23 0.2 0.25 0.23 0.3 0.36 0.3 0.46
0.71 0.73 0.86 0.02 0.71 1.0 0.9 0.58 0.62 0.52 0.58 0.64 0.42 0.47 0.44 0.45 0.46 0.43 0.67 0.56 0.58 0.9
0.45 0.38 0.3 0.02 0.52 1.0 0.53 0.33 0.61 0.3 0.26 0.5 0.41 0.28 0.43 0.44 0.43 0.47 0.46 0.5 0.59 0.42
0.86 0.98 0.79 0.03 0.77 0.99 1.0 0.57 0.86 0.46 0.57 0.85 0.4 0.66 0.61 0.59 0.6 0.61 0.68 0.65 0.54 0.75

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)