Heatmap: Cluster_76 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.52 0.58 1.0 0.03 0.25 0.36 0.54 0.25 0.31 0.21 0.24 0.32 0.15 0.15 0.3 0.3 0.27 0.25 0.34 0.23 0.2 0.19
1.0 0.61 0.66 0.03 0.38 0.38 0.49 0.63 0.66 0.61 0.69 0.74 0.26 0.25 0.45 0.44 0.45 0.41 0.44 0.48 0.4 0.64
1.0 0.95 0.64 0.04 0.69 0.63 0.95 0.59 0.68 0.58 0.7 0.61 0.61 0.36 0.64 0.59 0.64 0.63 0.93 0.69 0.78 0.55
0.8 0.37 0.03 0.07 0.04 0.18 0.23 0.33 0.51 0.24 0.28 0.61 0.08 0.66 0.27 0.22 0.25 0.22 0.17 0.1 0.11 1.0
0.48 0.22 0.01 0.06 0.0 0.7 1.0 0.8 0.7 0.6 0.73 0.61 0.26 0.8 0.25 0.14 0.35 0.27 0.33 0.36 0.33 0.42
0.43 0.21 0.0 0.0 0.0 0.25 0.38 0.23 0.17 0.14 0.18 0.19 0.05 0.41 0.12 0.11 0.14 0.11 0.53 0.43 0.37 1.0
0.61 0.37 0.0 0.01 0.01 0.33 0.36 0.5 0.32 0.27 0.28 0.33 0.11 0.58 0.21 0.19 0.23 0.21 1.0 0.85 0.67 0.73
1.0 0.24 0.0 0.08 0.01 0.24 0.1 0.26 0.21 0.07 0.2 0.32 0.1 0.61 0.35 0.26 0.38 0.35 0.5 0.58 0.52 0.07
0.66 0.27 0.01 0.06 0.03 0.11 0.13 0.35 0.16 0.28 0.18 0.17 0.02 0.24 0.06 0.05 0.07 0.04 0.09 0.21 0.2 1.0
0.41 0.04 0.22 0.06 0.02 0.06 0.07 0.36 0.19 0.18 0.29 0.06 0.17 0.19 0.02 0.13 0.06 0.0 0.0 0.05 0.06 1.0
1.0 0.74 0.54 0.03 0.59 0.66 0.69 0.64 0.56 0.58 0.61 0.68 0.55 0.59 0.67 0.64 0.67 0.68 0.83 0.67 0.73 0.71
0.15 0.02 0.0 0.01 0.04 0.14 0.23 0.12 0.12 0.09 0.08 0.09 0.15 0.18 0.11 0.1 0.16 0.14 0.12 0.17 0.1 1.0
0.37 0.33 0.01 0.0 0.0 0.13 0.11 0.63 0.01 0.8 0.69 0.02 0.01 0.1 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.19 1.0
0.34 0.6 0.0 0.08 0.0 0.72 0.38 0.95 0.23 0.65 1.0 0.06 0.44 0.45 0.03 0.04 0.05 0.05 0.01 0.18 0.09 0.17
0.15 0.04 0.0 0.0 0.0 0.18 0.15 0.31 0.26 0.14 0.2 0.2 0.01 0.22 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.24 0.27 1.0
0.36 0.15 0.05 0.0 0.07 0.22 0.3 0.13 0.24 0.13 0.1 0.28 0.14 0.22 0.26 0.22 0.18 0.15 0.13 0.31 0.28 1.0
0.27 0.21 0.02 0.01 0.0 0.38 0.08 0.25 0.56 0.5 1.0 0.35 0.04 0.05 0.07 0.02 0.31 0.06 0.03 0.02 0.14 0.02
0.51 0.3 0.24 0.01 0.14 0.36 0.35 0.87 0.45 0.83 1.0 0.59 0.15 0.19 0.1 0.11 0.13 0.14 0.18 0.18 0.22 0.75
1.0 0.67 0.4 0.03 0.43 0.49 0.58 0.61 0.66 0.54 0.54 0.59 0.53 0.68 0.32 0.33 0.35 0.29 0.49 0.71 0.66 0.64
0.06 0.02 0.06 0.01 0.02 0.18 0.1 0.44 0.37 1.0 0.97 0.25 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.2
0.39 0.32 0.01 0.07 0.0 0.11 0.09 0.82 0.1 0.82 1.0 0.33 0.01 0.14 0.01 0.0 0.01 0.01 0.07 0.02 0.03 0.51
0.08 0.02 0.0 0.03 0.0 0.32 0.07 0.49 1.0 0.47 0.54 0.85 0.29 0.22 0.05 0.06 0.05 0.03 0.03 0.13 0.12 0.13
1.0 0.13 0.0 0.08 0.15 0.26 0.1 0.29 0.47 0.29 0.2 0.27 0.06 0.11 0.55 0.41 0.28 0.36 0.21 0.34 0.92 0.2
0.14 0.05 0.04 0.01 0.04 0.19 0.11 0.8 0.29 0.74 1.0 0.32 0.03 0.05 0.02 0.02 0.04 0.02 0.03 0.03 0.05 0.38
0.33 0.12 0.03 0.24 0.01 0.2 0.32 0.22 0.33 0.29 0.31 0.39 0.17 1.0 0.12 0.16 0.18 0.15 0.18 0.15 0.14 0.74
0.5 0.13 0.0 0.03 0.04 0.62 0.62 0.28 0.98 0.46 0.67 0.74 0.52 1.0 0.2 0.19 0.15 0.25 0.42 0.31 0.23 0.78
0.08 0.03 0.07 0.05 0.0 0.37 0.0 0.59 0.51 0.43 1.0 0.2 0.01 0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.31
0.8 0.38 0.0 0.34 0.18 0.4 0.7 0.55 0.57 0.31 0.3 0.64 0.37 0.63 0.09 0.09 0.14 0.1 0.24 1.0 0.76 0.32
0.06 0.05 0.0 0.0 0.02 0.41 0.24 0.25 1.0 0.39 0.66 0.73 0.11 0.44 0.16 0.12 0.15 0.14 0.1 0.06 0.07 0.23
0.49 0.4 0.02 0.02 0.0 0.15 0.07 0.54 0.06 0.47 0.74 0.1 0.21 0.04 0.02 0.01 0.02 0.02 0.04 0.07 0.11 1.0
0.33 0.44 0.47 0.05 0.13 0.25 0.25 0.59 0.3 0.49 1.0 0.23 0.09 0.22 0.07 0.07 0.07 0.07 0.09 0.12 0.11 0.57
0.87 0.6 1.0 0.12 0.42 0.54 0.47 0.5 0.44 0.49 0.55 0.47 0.33 0.74 0.63 0.6 0.61 0.54 0.58 0.45 0.45 0.21
0.34 0.18 0.02 0.14 0.02 0.1 0.21 0.76 0.06 1.0 0.49 0.02 0.01 0.2 0.01 0.05 0.06 0.03 0.03 0.01 0.0 0.39
0.48 0.02 0.01 0.14 0.01 0.08 0.24 0.39 0.0 1.0 0.48 0.04 0.02 0.3 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.86
0.46 0.23 0.08 0.01 0.0 0.19 0.19 0.14 0.31 0.11 0.13 0.39 0.06 0.14 0.16 0.19 0.15 0.17 0.26 1.0 0.94 0.1
0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.3 0.05 0.1 1.0 0.45 0.79 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31
0.28 0.17 0.0 0.28 0.0 0.17 0.18 0.84 0.0 1.0 0.93 0.24 0.2 0.25 0.04 0.05 0.0 0.0 0.09 0.49 0.22 0.13
0.1 0.12 0.0 0.22 0.01 0.22 0.15 0.53 0.32 0.79 1.0 0.38 0.06 0.29 0.04 0.03 0.05 0.07 0.12 0.02 0.08 0.61
0.28 0.03 0.0 0.0 0.0 0.26 0.22 0.72 0.75 0.66 0.84 0.62 0.14 0.38 0.05 0.05 0.09 0.06 0.12 0.1 0.11 1.0
0.51 0.13 0.01 0.04 0.08 0.22 0.3 0.38 0.43 0.2 0.2 0.46 0.04 0.92 0.21 0.19 0.22 0.22 0.51 0.51 0.46 1.0
1.0 0.61 0.67 0.01 0.36 0.37 0.1 0.32 0.27 0.24 0.26 0.25 0.19 0.29 0.5 0.5 0.52 0.5 0.67 0.35 0.31 0.09
0.93 0.8 0.1 0.01 0.36 0.45 0.6 0.66 1.0 0.88 0.93 0.82 0.67 0.37 0.35 0.35 0.42 0.35 0.41 0.65 0.59 0.63
0.62 0.26 0.03 0.0 0.22 0.25 0.31 0.37 0.26 0.32 0.3 0.31 0.23 0.42 0.12 0.13 0.12 0.12 0.11 0.43 0.39 1.0
0.23 0.1 0.02 0.01 0.03 0.24 0.21 0.6 0.67 0.78 1.0 0.41 0.02 0.13 0.03 0.03 0.05 0.03 0.04 0.03 0.04 0.51
1.0 0.61 0.51 0.03 0.37 0.45 0.59 0.58 0.52 0.5 0.54 0.69 0.52 0.21 0.54 0.47 0.54 0.44 0.54 0.66 0.62 0.76
0.61 0.41 0.09 0.06 0.23 0.33 0.38 0.27 0.5 0.34 0.36 0.61 0.1 0.6 0.2 0.12 0.2 0.21 0.33 0.63 0.35 1.0
0.31 0.16 0.02 0.02 0.01 0.3 0.22 0.72 0.58 0.76 1.0 0.62 0.04 0.23 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 0.05 0.02 0.42
0.13 0.07 0.0 0.03 0.01 0.23 0.16 0.48 0.6 0.64 1.0 0.44 0.06 0.14 0.02 0.01 0.03 0.03 0.03 0.07 0.04 0.22
0.46 0.28 0.16 0.01 0.0 0.55 0.24 1.0 0.78 0.68 0.93 0.58 0.18 0.25 0.07 0.08 0.1 0.06 0.15 0.16 0.15 0.81
0.24 0.12 0.06 0.0 0.0 0.38 0.1 0.73 0.69 0.44 0.7 0.55 0.14 0.14 0.02 0.03 0.05 0.03 0.1 0.1 0.07 1.0
0.36 0.05 0.01 0.0 0.01 0.11 0.2 0.07 0.23 0.25 0.14 0.43 0.02 1.0 0.05 0.05 0.02 0.03 0.18 0.03 0.03 0.65
0.08 0.0 0.0 0.06 0.0 0.3 0.14 0.55 0.4 1.0 0.97 0.27 0.01 0.13 0.01 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07
0.33 0.14 0.02 0.07 0.04 0.89 0.55 0.85 0.41 0.75 1.0 0.26 0.14 0.23 0.07 0.08 0.05 0.05 0.02 0.04 0.07 0.99
0.52 0.15 0.0 0.05 0.03 0.66 0.54 0.79 0.93 0.69 1.0 0.67 0.19 0.39 0.12 0.08 0.11 0.13 0.2 0.06 0.08 0.22
0.14 0.07 0.0 0.03 0.0 0.23 0.15 0.18 1.0 0.24 0.63 0.57 0.02 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.09
1.0 0.22 0.0 0.1 0.0 0.22 0.0 0.82 0.91 0.98 0.99 0.98 0.28 0.5 0.06 0.08 0.09 0.12 0.59 0.19 0.23 0.01
0.32 0.19 0.0 0.0 0.0 0.4 0.74 0.67 0.66 0.28 0.77 0.66 0.03 0.14 0.03 0.03 0.04 0.04 0.01 0.01 0.03 1.0
0.13 0.06 0.0 0.01 0.0 0.32 0.45 0.9 0.47 0.72 1.0 0.39 0.1 0.16 0.04 0.03 0.05 0.04 0.03 0.06 0.11 0.39
0.13 0.02 0.0 0.02 0.0 0.32 0.18 0.65 1.0 0.58 0.84 0.6 0.02 0.14 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.48
0.06 0.04 0.0 0.07 0.0 0.83 0.3 0.47 0.92 0.43 0.55 0.5 0.39 1.0 0.21 0.13 0.26 0.13 0.0 0.11 0.13 0.4
0.67 0.64 0.03 0.04 0.05 0.41 0.54 0.32 0.35 0.31 0.25 0.38 0.05 1.0 0.32 0.28 0.35 0.32 0.39 0.58 0.51 0.73
0.92 0.98 0.0 0.04 0.07 0.49 0.53 0.26 0.55 0.25 0.33 0.62 0.1 0.57 0.57 0.68 0.39 0.45 0.8 1.0 0.72 0.64
0.53 0.23 0.02 0.03 0.07 0.26 0.31 0.35 0.39 0.23 0.32 0.35 0.05 0.56 0.07 0.06 0.08 0.07 0.17 0.1 0.11 1.0
0.27 0.03 0.0 0.16 0.02 0.55 0.44 0.27 1.0 0.38 0.69 0.61 0.25 0.5 0.05 0.01 0.03 0.02 0.1 0.14 0.13 0.2
0.44 0.02 0.12 0.0 0.02 0.25 0.12 0.18 0.27 0.23 0.16 0.59 0.09 1.0 0.08 0.08 0.13 0.02 0.05 0.08 0.12 0.74
0.86 0.21 0.01 0.01 0.11 0.12 0.09 0.38 0.35 0.77 0.36 0.62 0.03 0.52 0.05 0.03 0.03 0.04 0.22 0.55 0.37 1.0
0.38 0.16 0.01 0.01 0.02 0.83 0.18 0.29 0.76 0.25 1.0 0.54 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0 0.03 0.01 0.0 0.03
0.91 0.64 0.07 0.05 0.0 0.33 0.35 0.63 0.84 0.85 0.57 1.0 0.22 0.89 0.14 0.21 0.17 0.19 0.72 0.89 0.89 0.33
1.0 0.73 0.63 0.02 0.64 0.63 0.47 0.63 0.55 0.6 0.55 0.58 0.32 0.5 0.59 0.49 0.57 0.54 0.68 0.53 0.57 0.72
0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.21 0.05 0.4 0.88 0.57 0.73 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.13
0.03 0.02 0.0 0.06 0.0 0.68 0.21 1.0 0.98 0.79 0.97 0.6 0.41 0.11 0.03 0.03 0.03 0.01 0.0 0.55 0.77 0.04
0.84 0.3 0.07 0.11 0.01 0.12 0.18 0.37 0.12 0.4 0.52 0.14 0.06 0.27 0.06 0.05 0.07 0.08 0.04 0.08 0.11 1.0
0.43 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.05 0.09 0.05 0.02 0.13 0.0 1.0 0.06 0.07 0.04 0.07 0.07 0.13 0.08 0.14
0.9 0.07 0.0 0.01 0.0 0.21 0.12 0.73 0.23 0.57 0.43 0.22 0.05 0.25 0.22 0.25 0.23 0.23 0.47 1.0 0.89 0.25
1.0 0.37 0.45 0.11 0.29 0.28 0.0 0.28 0.48 0.31 0.35 0.46 0.23 0.0 0.36 0.39 0.42 0.33 0.21 0.28 0.13 0.0
0.11 0.01 0.0 0.0 0.01 0.39 0.1 0.21 0.94 0.37 0.44 1.0 0.06 0.14 0.02 0.03 0.04 0.04 0.12 0.09 0.06 0.16
0.74 0.23 0.0 0.05 0.03 0.19 0.3 0.72 0.5 0.87 0.73 0.6 0.1 0.72 0.13 0.1 0.13 0.12 0.11 0.7 0.59 1.0
0.33 0.26 0.0 0.12 0.01 0.65 0.41 0.7 0.85 0.58 1.0 0.56 0.5 0.58 0.13 0.14 0.15 0.35 0.2 0.4 0.44 0.35
0.94 0.22 0.04 0.01 0.0 0.28 0.62 0.3 0.39 0.8 1.0 0.44 0.03 0.13 0.07 0.09 0.07 0.07 0.02 0.05 0.02 0.17
0.83 0.5 0.44 0.02 0.34 0.35 0.4 1.0 0.64 0.79 0.94 0.77 0.4 0.37 0.33 0.29 0.35 0.28 0.4 0.42 0.47 0.33
0.28 0.38 0.01 0.01 0.01 0.34 0.52 0.39 1.0 0.56 0.57 0.89 0.12 0.16 0.17 0.19 0.18 0.19 0.1 0.12 0.09 0.26
1.0 0.29 0.12 0.0 0.0 0.28 0.5 0.69 0.65 0.31 0.49 0.47 0.21 0.15 0.14 0.14 0.19 0.19 0.15 0.27 0.28 0.59
0.02 0.01 0.0 0.04 0.0 0.38 0.34 0.53 0.66 0.84 1.0 0.63 0.07 0.06 0.03 0.04 0.05 0.04 0.02 0.03 0.03 0.54
1.0 0.61 0.31 0.02 0.31 0.42 0.49 0.56 0.64 0.81 0.62 0.92 0.27 0.79 0.24 0.23 0.24 0.25 0.26 0.72 0.62 0.82
0.5 0.54 0.3 0.41 0.24 1.0 0.99 0.53 0.93 0.54 0.58 0.75 0.48 0.44 0.24 0.12 0.28 0.18 0.27 0.42 0.41 0.1
0.14 0.12 0.0 0.01 0.31 0.58 0.77 0.38 0.79 1.0 1.0 0.64 0.24 0.15 0.12 0.11 0.11 0.1 0.19 0.13 0.15 0.61
0.23 0.2 0.01 0.0 0.04 0.51 0.59 0.5 0.99 0.97 1.0 0.98 0.24 0.18 0.17 0.15 0.17 0.17 0.39 0.24 0.15 0.65
0.18 0.31 0.07 0.0 0.01 0.29 0.2 0.77 0.62 0.77 1.0 0.54 0.05 0.36 0.1 0.13 0.11 0.07 0.26 0.22 0.22 0.54
0.65 0.47 0.42 0.05 0.03 0.5 0.43 0.47 0.46 0.52 0.69 0.39 0.18 0.3 0.04 0.04 0.05 0.04 0.1 0.09 0.14 1.0
0.16 0.12 0.21 0.04 0.0 0.03 0.16 0.05 0.04 0.1 0.07 0.09 0.02 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.05 0.19
0.15 0.04 0.01 0.01 0.0 0.2 0.09 0.42 0.33 0.44 1.0 0.09 0.03 0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.02 0.39
0.45 0.12 0.01 0.03 0.0 0.14 0.19 0.68 0.18 0.43 0.27 0.13 0.02 1.0 0.14 0.12 0.13 0.13 0.04 0.71 0.59 0.46
0.88 0.5 0.0 0.0 0.0 0.27 0.25 0.52 0.5 1.0 0.94 0.34 0.02 0.06 0.07 0.05 0.09 0.06 0.0 0.01 0.0 0.03
1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.21 0.21 1.0 0.25 0.45 0.48 0.17 0.02 0.39 0.08 0.09 0.08 0.08 0.09 0.75 0.66 0.83
0.91 0.45 0.13 0.02 0.4 0.62 0.8 0.62 0.49 0.41 0.44 0.51 0.36 0.84 0.4 0.41 0.39 0.36 0.25 0.52 0.62 1.0
0.72 0.04 0.0 0.03 0.01 0.06 0.05 0.08 0.04 0.02 0.11 0.14 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.24 0.18 0.15
0.06 0.15 0.23 0.16 0.01 0.53 0.5 0.61 0.31 0.52 1.0 0.09 0.02 0.17 0.14 0.13 0.17 0.09 0.01 0.01 0.0 0.26
0.97 0.4 0.63 0.0 0.19 0.45 0.8 0.33 0.38 0.23 0.69 1.0 0.8 0.11 0.2 0.28 0.58 0.46 0.56 0.45 0.86 0.61

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)