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Heatmap: Cluster_130 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.37 0.21 0.34 -2.75 -0.11 0.4 0.52 0.13 0.73 0.21 0.23 0.73 -1.39 0.11 -0.71 -0.64 -0.6 -0.97 0.06 -0.13 -0.4 0.13
0.4 0.55 -0.34 -2.95 -0.19 0.36 0.47 0.39 1.01 0.06 0.44 1.0 -1.02 -0.49 -1.0 -0.92 -0.86 -0.93 -0.21 -0.09 -0.35 0.17
0.26 -0.18 -1.37 -4.19 -0.45 0.63 0.51 0.41 0.57 0.42 0.6 0.66 -0.08 0.14 -0.55 -0.43 -0.42 -0.65 -0.9 0.02 -0.01 0.15
0.06 -0.29 0.1 -3.29 -0.18 0.46 -0.11 0.47 0.18 0.12 0.03 0.19 -1.23 0.21 -0.72 -0.74 -0.49 -0.76 -0.19 -0.14 -0.23 1.72
0.41 0.18 0.29 -4.2 0.19 0.27 0.11 -0.11 0.36 0.0 -0.12 0.49 -1.09 0.38 -0.55 -0.56 -0.64 -0.57 -0.46 0.45 0.13 0.72
-0.13 0.27 0.44 -4.88 -0.02 0.6 0.25 -0.24 0.62 -0.01 -0.22 0.7 -1.08 -0.32 -0.24 -0.35 -0.29 -0.25 0.04 0.52 0.48 -0.93
-0.12 0.19 -0.6 -4.29 0.31 0.42 0.09 0.32 0.22 -0.06 0.12 0.35 -0.62 0.64 -0.35 -0.5 -0.34 -0.43 0.01 0.11 0.15 0.5
-0.25 0.38 1.1 -2.63 0.06 0.41 0.08 -0.49 0.5 0.36 0.23 0.38 -0.54 -0.75 -0.52 -0.36 -0.46 -0.46 0.56 -0.48 -0.51 0.17
0.23 0.14 0.31 -4.2 0.16 0.49 0.2 0.24 0.28 0.08 0.23 0.41 -0.66 -0.27 -0.58 -0.37 -0.32 -0.47 0.06 0.14 -0.1 0.4
0.44 -0.16 -1.39 -4.13 0.11 0.52 0.5 0.11 0.55 0.01 0.18 0.27 -0.68 0.12 -0.61 -0.81 -0.53 -0.59 -0.75 0.42 0.22 1.08
-0.65 0.1 1.44 -4.26 0.02 0.68 -0.09 0.51 0.7 0.73 0.79 0.53 -0.49 -1.12 -1.39 -1.38 -1.36 -1.42 -0.87 -0.33 -0.35 0.34
0.33 -0.11 -2.37 -4.05 0.67 0.81 0.83 -0.4 0.48 -0.26 -0.06 0.43 0.23 -0.57 -0.68 -0.68 -0.62 -0.79 -0.77 0.19 0.28 0.92
0.3 0.27 0.54 -5.19 0.27 0.56 0.33 -0.38 0.22 -0.8 -0.57 0.26 -0.79 0.18 -0.3 -0.44 -0.41 -0.47 0.26 0.23 0.31 0.52
-0.06 0.09 0.59 -2.57 0.33 0.31 0.02 0.06 0.51 -0.22 0.03 0.59 -0.55 0.24 -0.34 -0.46 -0.34 -0.47 -0.07 0.06 -0.2 0.23
-0.0 0.0 -0.38 -3.34 -0.13 0.5 -0.24 0.54 0.59 0.34 0.36 0.53 -0.65 0.66 -0.53 -0.52 -0.58 -0.73 -0.3 0.17 0.21 0.04
0.2 -0.16 -0.53 -4.29 0.48 0.46 0.26 -0.02 0.46 -0.13 0.11 0.59 -0.67 -0.08 -1.09 -0.78 -1.07 -1.0 -0.17 0.41 0.13 1.3
-0.0 -0.63 -2.25 -4.68 -0.08 0.57 0.44 0.05 1.05 0.5 0.26 0.91 -0.4 0.49 -0.82 -0.81 -0.51 -0.64 -0.56 0.3 0.06 0.17
0.67 0.67 1.25 -3.05 0.15 0.31 0.03 0.75 0.16 0.16 0.04 -0.48 -1.54 -0.53 -0.59 -0.8 -0.89 -0.78 -0.28 -0.25 -0.21 0.44
0.27 0.21 0.35 -3.51 0.36 0.46 0.4 -0.14 0.14 -0.31 -0.39 0.08 -0.66 0.11 -0.51 -0.58 -0.53 -0.41 -0.06 0.43 0.63 0.35
-0.17 -0.9 -0.45 -2.82 -0.33 0.55 0.19 0.71 0.54 -0.14 -0.17 0.42 -1.12 0.72 -0.73 -0.83 -0.71 -0.9 -0.74 0.66 0.56 1.01
-0.06 -0.35 -0.72 -4.38 -0.63 0.45 0.39 0.29 0.72 0.02 0.17 0.58 -1.08 -0.26 -0.52 -0.61 -0.4 -0.39 0.15 0.46 0.11 1.03
-1.21 -1.57 -5.18 -1.92 0.92 1.02 0.03 0.01 0.83 0.34 0.34 0.69 -1.4 0.5 -1.03 -1.14 -1.02 -1.41 0.15 -1.0 -0.82 1.72
-0.2 0.45 0.23 -3.61 0.1 0.37 -0.05 0.5 0.58 0.14 0.33 0.79 -1.28 -0.32 -0.86 -0.75 -0.64 -0.89 0.1 0.13 0.15 0.44
-0.01 -0.01 0.7 -3.26 0.29 0.44 0.18 0.09 0.47 0.06 -0.17 0.5 -0.62 -0.09 -0.55 -0.59 -0.42 -0.46 0.1 0.02 -0.06 0.39
0.3 0.17 -1.35 -5.84 -0.28 0.56 0.55 0.55 0.74 0.36 0.55 0.69 -0.27 0.43 -0.79 -1.02 -0.94 -0.95 -0.36 0.0 -0.06 -0.09
0.47 0.43 0.4 -3.18 -0.26 0.35 0.13 0.63 -0.07 0.65 0.51 0.1 -0.7 -0.48 -0.78 -0.87 -0.73 -0.9 -0.91 0.3 0.21 0.64
0.48 0.01 -0.29 -3.03 -0.64 0.58 0.19 0.93 0.28 0.48 0.54 0.62 0.14 -0.5 -1.06 -1.02 -0.86 -1.11 -1.51 0.42 0.41 0.08
0.11 0.37 0.4 -3.16 0.25 0.39 -0.05 0.08 -0.1 -0.11 -0.01 -0.07 -0.95 0.02 -0.44 -0.32 -0.63 -0.49 0.42 0.4 0.49 0.46
0.57 0.39 1.11 -3.43 0.02 0.08 -0.05 0.56 -0.22 0.4 0.36 0.11 -1.72 -0.41 -0.66 -0.73 -0.76 -0.86 -0.34 -0.25 -0.41 1.07
0.15 0.12 -0.97 -5.09 0.11 0.33 0.1 0.17 0.45 0.15 0.24 0.47 -0.06 -0.4 -0.49 -0.33 -0.57 -0.25 -0.07 0.11 0.12 0.88
0.11 -0.4 -1.17 -3.56 0.23 0.75 0.46 0.07 0.66 0.06 0.24 0.33 0.06 -0.6 -0.25 -0.49 -0.38 -0.37 -0.24 0.08 0.01 0.68
-0.14 -0.01 0.3 -5.19 -0.11 0.88 0.95 0.01 1.05 0.62 0.5 1.11 -0.07 -0.63 -1.43 -1.86 -1.69 -2.49 -1.46 -0.18 -0.87 0.51
0.25 0.45 0.24 -3.08 0.16 0.42 0.54 0.17 0.46 -0.26 -0.02 0.4 -0.25 0.14 -1.49 -0.81 -0.87 -0.78 -0.01 0.13 -0.33 0.77
-0.13 -0.12 0.84 -5.37 -0.33 0.37 -0.32 0.4 0.36 -0.36 0.03 0.41 -0.77 0.19 -0.72 -0.85 -0.72 -0.74 0.25 0.02 0.05 1.26
0.23 0.39 0.81 -6.31 0.12 0.5 0.33 -0.22 0.23 -0.5 -0.38 0.31 -1.0 0.36 -0.48 -0.59 -0.5 -0.52 0.11 -0.07 -0.0 0.72
0.2 0.05 -0.39 -5.08 -0.49 0.55 0.13 0.22 0.77 0.24 0.12 0.65 -0.52 0.04 -0.82 -0.97 -0.62 -0.87 0.02 0.3 0.08 0.8
-0.1 -0.21 0.48 -3.22 -0.14 0.51 0.27 0.29 0.38 0.12 0.4 0.08 -0.37 0.79 -0.64 -0.65 -0.66 -1.01 -0.35 -0.08 -0.11 0.67
-0.26 0.01 -0.04 -4.72 0.28 0.38 0.15 0.36 0.62 0.21 0.34 0.52 -0.33 -0.44 -0.73 -0.8 -0.82 -0.9 0.26 -0.1 0.13 0.86
0.11 -0.19 -0.02 -4.62 0.18 0.52 0.36 0.53 0.17 0.19 0.23 0.25 -0.36 -0.19 -1.0 -0.8 -0.85 -0.79 -0.98 0.15 0.05 1.37
-1.04 -0.08 1.29 -4.97 0.17 0.18 -0.35 0.25 0.31 0.27 0.23 0.52 -1.75 0.27 -1.4 -1.42 -1.29 -1.44 -0.39 -0.1 -0.15 1.67
0.11 0.24 -0.18 -4.35 0.18 0.66 0.44 0.35 0.03 -0.28 -0.09 0.1 -1.14 -0.16 -0.79 -0.64 -0.9 -0.89 0.09 0.13 0.22 1.41
-0.09 0.16 1.23 -2.45 0.2 0.38 -0.36 0.33 0.33 0.39 0.55 0.4 -0.91 -0.17 -0.83 -0.9 -0.74 -0.96 -0.35 -0.13 -0.42 0.61
0.5 0.28 0.58 -4.8 -0.29 0.16 0.2 0.3 -0.07 0.31 0.49 0.13 -1.13 -0.48 -0.41 -0.35 -0.55 -0.58 -0.16 -0.34 -0.35 1.2
0.34 -0.13 0.56 -3.53 -0.26 0.31 0.49 0.52 0.52 -0.01 0.29 0.73 0.04 -0.21 -1.04 -0.86 -0.65 -0.73 -0.28 0.34 0.11 -0.53
0.32 0.27 0.8 -3.94 0.22 0.45 0.23 0.2 0.17 -0.0 0.06 0.25 -1.15 -0.19 -0.69 -0.77 -0.71 -1.05 -0.18 0.19 0.04 0.89
-0.15 0.12 1.68 -2.73 -0.29 0.54 -0.23 0.38 0.15 0.18 0.42 0.57 -0.7 0.67 -1.37 -1.33 -1.59 -1.68 -1.35 0.09 -0.06 0.16
0.24 0.73 0.41 -5.36 -0.54 0.42 0.44 -0.13 0.29 -0.05 0.04 0.22 -0.45 0.24 -0.61 -0.44 -0.38 -0.53 0.19 -0.22 -0.1 0.53
0.49 0.05 -0.87 -3.64 0.39 0.55 0.54 0.13 0.41 0.35 0.18 0.3 -0.81 -0.17 -0.74 -0.75 -0.69 -0.64 -0.23 0.32 0.04 0.68
-0.25 -0.36 -1.67 -4.3 -0.46 0.8 0.25 0.29 0.64 0.03 0.16 0.62 -0.88 0.41 -0.16 -0.46 0.11 -0.17 0.15 -0.01 -0.2 0.58
0.38 0.21 0.08 -3.26 -0.25 0.26 0.36 0.34 0.31 0.46 0.37 0.44 -0.56 0.11 -0.74 -0.61 -0.52 -0.66 0.02 -0.0 -0.2 0.38
0.35 -0.4 -0.74 -2.92 -0.33 0.36 0.0 0.38 0.37 0.07 0.06 0.44 -0.56 0.08 -0.23 -0.3 -0.27 -0.3 -0.11 0.18 0.1 0.95
-0.25 0.03 0.37 -3.87 0.39 0.38 0.23 0.04 0.24 0.44 0.53 0.25 -1.13 -0.84 -0.88 -0.92 -1.05 -1.03 0.16 -0.16 0.04 1.43
0.09 0.13 -1.91 -4.75 0.03 0.62 0.39 0.23 0.41 0.13 0.08 0.03 0.09 0.64 -0.25 -0.35 -0.34 -0.24 0.02 -0.12 -0.28 0.44
0.18 -0.53 -0.15 -2.94 -0.99 0.45 0.72 0.71 0.6 -0.14 0.07 0.82 -1.17 -0.06 -0.62 -0.61 -0.01 -0.31 -0.38 -0.12 -0.22 0.76
-0.37 -0.03 - -2.13 -0.3 1.61 0.99 -0.06 0.63 -0.58 -0.16 -0.01 -1.52 0.44 0.1 0.17 0.46 0.04 -2.14 -2.6 -1.46 1.02
-0.1 -0.14 -1.47 -4.43 -0.13 0.42 0.57 0.24 0.09 0.35 0.19 0.25 -0.81 0.51 -0.3 -0.36 -0.13 -0.17 0.22 -0.05 -0.07 0.76
-0.11 0.54 0.7 -3.56 -0.36 0.5 0.21 -0.04 0.31 -0.46 -0.21 0.3 -0.43 0.56 -0.5 -0.44 -0.48 -0.46 0.27 -0.14 0.0 0.37
0.24 0.17 0.72 -3.9 -0.19 0.31 0.31 0.03 0.24 -0.08 -0.11 0.53 -1.06 0.12 -0.41 -0.66 -0.42 -0.55 -0.75 -0.04 0.08 1.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.