1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
- - 0.4 4.33 -4.72 -4.51 - - - -1.02 - - - - - - - - - - - -
0.39 -0.33 2.27 3.73 -2.59 -5.45 -2.16 - - - - - - - -0.46 -0.58 - - - - - -
- - 1.28 4.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.48 - 2.87 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.25 4.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.06 3.73 - - - - - - - - - -0.78 1.82 - 1.35 - - - - -
- 0.92 1.68 3.81 - -5.38 - - - - - - - - 0.85 0.09 - - - - - -
-0.29 - - 4.39 - -2.08 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.28 4.26 -1.38 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.83 2.6 3.92 -3.04 -4.77 - - - - - - - -3.56 - - - - - - - -
- - 0.25 4.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.56 4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.2 - 1.4 4.01 -3.32 -2.38 -2.83 - - - 0.23 - - -1.15 - - - - - - - -
0.27 -0.01 2.56 3.64 -1.64 - -2.76 - - - -0.1 - - - - - - - - - - -
- - 1.65 4.07 -0.27 -2.26 -0.87 - - - - - - -1.19 - - - - - - - -
- - 3.02 3.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.03 - 1.87 3.95 - - -1.73 - - - - - - 1.03 - - - - - - - -
-0.78 - - 4.05 -1.75 - - - - - - - 0.77 - - - 1.49 - - - - -
- - -0.02 4.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.4 4.4 -2.86 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.69 - 1.95 4.01 - -2.52 -0.5 - - - - - - -1.1 - - - - - - - -
-0.68 - -0.18 4.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.79 4.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.42 - 3.06 3.55 -0.3 - - -0.42 - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.55 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.98 - - 4.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.1 0.99 2.07 3.87 -2.2 - -3.87 - - - - - - - - - - - - - - -
1.18 - 0.68 4.18 - -5.06 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.82 3.67 1.13 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.12 0.26 3.04 3.53 -2.96 - - - - - - - - -2.85 -0.83 - - - - - - -
0.08 - 1.17 3.74 - -4.56 -1.12 - 2.27 - - - - - - - - - - - - -
-1.55 -1.17 2.42 3.35 -2.48 -0.61 -1.48 - - - - 0.26 -1.96 -2.34 -0.2 - - - - - - 0.95
- - 1.84 3.91 -1.94 -3.93 -1.0 - - - - - -0.38 - - - - - - - - 0.84
- - 2.49 3.91 - - -0.94 - - - - - - -0.35 - - - - - - - -
1.41 - - 4.15 -2.57 - - - - - - - 0.04 -1.45 - - - - - - - -
- - 0.59 4.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.59 4.19 - - -1.72 - - - - - - -1.96 - - - - - - - 0.78
-2.08 0.05 2.38 3.78 -0.24 - - - - - - - - - - -0.09 - - - - - -
- 1.08 2.78 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.54 - 2.65 3.9 -0.63 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.77 - 2.95 3.42 -1.57 - -1.98 - - 1.25 - - - - - - - - - - - -
- - 2.51 3.84 -1.33 - -0.73 - - - - - - -0.05 - - - - - - - -
- -0.35 1.04 4.25 -2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.2 1.04 4.22 -2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.27 3.91 - - - - - - - - 0.36 -0.28 - - - - - - - -
- - 1.98 4.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.48 4.0 -1.35 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.57 0.44 3.0 3.55 -2.76 -2.07 - - - - - - - -2.31 - - - - - - - -
- - -0.14 4.36 - -3.34 -3.36 - - - - - - -1.67 - - - - - - - -
- - 0.48 4.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.52 4.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.62 2.79 3.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.38 - - 4.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.12 0.43 4.32 - -4.84 -2.24 - - - - - - - - - - - - - - -
1.61 - - 4.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.86 - - 3.99 - - - - - - - - - -0.8 1.21 - 1.4 - - - - -
- - 2.31 4.02 -0.68 -2.6 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.41 2.12 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.74 4.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.18 4.1 -1.48 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.16 - 0.38 4.26 - -3.05 -1.63 - - - - - -2.93 - - -1.5 -2.21 - - - - -
-5.73 -2.45 0.95 4.3 - -3.15 -4.12 - - - - - - -4.09 - - - - - - - -
- - 1.42 4.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.2 4.09 - - -2.17 - - - - - - -0.45 0.79 - - - - - - -
- - 2.85 3.7 0.15 - -0.5 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.84 - 0.29 4.33 -3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.88 3.54 -2.14 - - - 2.69 - - - - - - - - - - - - -
-1.54 - 1.17 4.24 -2.56 - - - - - - - - -1.38 - - - - - - - -
- - 0.24 4.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.46 - 1.42 4.24 - -3.95 - - - - - - - - - - - - - -2.25 - -
- - -0.64 4.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.83 4.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.27 3.89 -3.4 -4.36 - - 1.37 - - - - 0.3 - - -0.39 - - - - -
-1.12 - 2.57 3.25 -1.98 -3.96 -2.11 - 1.23 - - 1.17 - -0.11 - - - - - - - -
- - 2.9 3.8 -0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.48 2.29 3.75 -0.58 -5.66 - - 1.17 - - - - - - - - - - - - -
- - 0.78 4.31 - - - - - - - - - -1.06 - - - - - - - -
-0.87 - - 4.32 - - - - - - - - - - - - - - 0.6 - - -
- 0.29 3.12 3.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.64 - - 4.19 -1.42 -2.21 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.0 4.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.02 - 1.9 4.09 -1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.55 - 1.05 3.62 - - - - 0.7 - - - - 1.34 - - - - -0.74 - - -
-0.52 - - 4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.16 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.48 1.15 4.14 - - - - - - - - - -2.69 - - -0.8 - - - - -
- - 2.55 3.78 -1.83 -2.09 - - - - - - - -0.2 - 0.08 - - - - - -
- - 3.35 3.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.98 4.31 -2.68 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.74 - - 4.32 -1.24 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.3 4.09 - -4.43 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.43 4.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.02 - 2.37 3.51 - -4.51 - - - - - - - - - - - - - - 2.14 -
- -0.05 0.45 4.26 -1.88 -3.17 -3.78 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.07 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.55 - 3.18 3.53 -3.6 -3.97 -3.17 - - - - - - -2.49 - - - -0.4 - - - -
-1.55 - 1.29 4.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.92 -0.21 0.46 3.9 -0.14 -4.47 - 0.34 - - - - - - - - -0.49 - - - - -
0.44 0.98 - 4.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.36 4.27 -2.53 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.05 - 0.26 4.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.27 3.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.31 - 1.1 4.23 -0.78 -4.87 -6.25 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.81 3.67 -0.9 -1.45 -0.34 - - - - - - -0.89 - - - - - - - -
-1.42 - 1.01 4.29 - - -3.47 - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.2 2.03 4.07 - -3.42 -4.55 - - - - - -5.19 - - - -4.47 - - - - -
- - 2.43 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.08 -0.08 3.14 3.57 -3.08 -5.99 -5.94 - - - - - - - - -4.38 - - - - - -
-4.71 -0.59 2.48 3.95 -2.96 -4.04 -6.19 - - - - - - - - -4.63 - - - - - -
-0.04 0.8 2.06 3.85 - -2.04 - - - - - - - -1.26 - - - - - - - -
0.48 -0.74 2.43 3.07 -2.47 -0.99 -0.24 -0.8 -0.48 -1.0 - -0.54 -2.02 -3.52 -1.96 - -1.6 -2.06 - - -0.62 -1.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.