Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
9.33 0.0 0.0 50.96 0.34 4.89 0.0 3.49 0.0 1.16 3.12 0.0 0.0 102.74 1.06 0.7 0.17 0.3 1.01 0.18 0.0 5.21
0.44 0.41 0.07 0.92 0.01 0.26 0.74 0.15 0.22 0.25 0.36 0.28 0.11 6.82 0.05 0.02 0.2 0.18 0.53 0.06 0.06 0.6
0.58 0.34 0.0 38.39 0.64 6.88 9.22 1.99 5.87 3.35 2.64 7.8 2.6 132.22 8.87 5.96 8.97 6.37 17.33 1.12 1.43 13.16
0.38 0.05 0.05 3.97 0.07 1.2 0.94 0.34 0.91 0.39 0.38 1.95 0.19 4.36 0.91 0.6 0.98 0.58 3.48 0.98 0.81 1.16
0.09 0.17 0.27 2.72 0.01 0.97 0.96 0.19 0.46 0.9 0.38 1.06 0.37 5.67 1.14 0.72 1.0 0.92 2.89 0.18 0.2 1.05
0.0 0.19 0.0 6.55 0.14 0.08 0.05 4.57 0.0 2.13 6.58 0.0 0.0 48.32 0.0 0.0 0.2 0.0 0.4 0.21 0.0 1.92
0.33 0.41 0.35 0.35 0.03 0.45 0.22 0.18 0.23 0.15 0.13 0.33 0.18 3.03 0.34 0.25 0.44 0.38 0.21 0.25 0.15 0.24
0.06 0.09 0.08 1.35 0.02 0.41 0.57 0.0 0.17 0.0 0.06 0.43 0.24 7.75 0.02 0.06 0.81 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0
0.12 0.11 0.01 1.92 0.34 0.38 0.46 0.14 0.35 0.27 0.22 0.49 0.13 1.79 0.41 0.29 0.44 0.35 1.03 0.18 0.18 0.89
0.0 0.03 0.06 0.45 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 2.48 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0
0.13 0.51 0.0 0.53 0.0 0.12 0.16 0.04 0.03 0.01 0.0 0.1 0.07 1.34 0.13 0.07 0.16 0.17 0.05 0.01 0.03 0.02
0.16 0.47 0.0 0.98 0.01 0.55 1.22 0.05 0.03 0.0 0.0 0.24 0.16 4.42 0.18 0.09 0.31 0.35 0.05 0.06 0.19 0.14
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.02 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.15 0.13 0.19 0.0 0.22 0.24 0.0 0.02 1.19 0.15 0.07 0.25 0.06 0.0 0.0 0.0 0.49
0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.64 4.06 0.13 2.15 0.23 0.42 8.53 0.28 31.44 0.0 0.04 0.28 0.0 0.0 0.1 0.22 0.33
7.39 0.47 0.29 79.94 1.23 9.08 0.06 13.04 0.19 15.41 15.39 0.19 0.35 222.14 1.63 1.59 1.2 1.21 0.99 0.89 0.34 4.5
0.34 0.33 0.09 1.31 0.0 0.53 0.31 0.29 0.68 0.45 0.48 0.49 0.71 4.32 0.4 0.23 0.35 0.42 0.38 0.66 0.25 0.09
0.07 0.0 0.0 0.39 0.01 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 1.29 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.04 0.2 0.0
0.0 0.0 0.16 0.6 0.0 0.11 0.31 0.0 0.57 0.0 0.0 0.27 0.13 3.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15
1.21 2.83 0.0 1.02 0.0 2.4 4.63 0.77 3.73 1.3 1.94 3.56 0.62 26.31 1.74 1.94 1.94 2.87 0.1 0.3 0.09 3.76
0.01 0.0 0.0 0.48 0.0 0.06 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 2.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 1.19 0.09 0.09 0.23 1.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.15 0.0
0.44 0.39 0.0 0.94 0.03 0.7 2.1 0.4 2.22 0.51 0.43 4.61 0.32 15.1 0.08 0.0 0.41 0.12 0.0 0.15 0.23 1.37
0.02 0.07 0.0 0.87 0.03 0.17 0.17 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 1.28 0.31 0.09 0.41 0.24 0.0 0.0 0.0 0.05
0.08 0.05 0.0 0.52 0.0 0.17 1.41 0.16 0.56 0.29 0.48 0.69 0.29 7.68 0.02 0.01 0.05 0.02 0.0 0.1 0.09 1.06
0.02 0.0 0.0 0.89 0.0 0.41 0.14 0.17 0.11 0.3 0.12 0.0 0.65 5.09 0.43 0.25 0.74 0.61 0.84 0.0 0.1 0.0
0.02 0.08 0.0 0.58 0.0 0.41 0.06 0.04 0.16 0.34 0.21 0.15 0.38 3.17 0.45 0.35 0.52 0.53 1.05 0.09 0.28 0.04
0.0 0.05 0.04 0.5 0.0 0.17 0.23 0.03 0.0 0.07 0.0 0.07 0.09 1.58 0.02 0.02 0.07 0.02 0.05 0.05 0.0 0.07
0.2 0.41 0.0 0.39 0.08 0.27 0.16 0.03 0.16 0.08 0.06 0.18 0.13 1.68 0.16 0.09 0.28 0.2 0.46 0.17 0.12 0.1
0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.22 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.3 0.0 0.03 0.06 0.06 0.07 0.0 0.0 0.05
0.22 0.0 0.0 0.99 0.0 0.06 0.11 0.0 0.76 0.0 0.47 0.0 0.0 5.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.4
0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.0 0.47 0.01 0.07 0.05 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 1.5 0.06 0.05 0.08 0.07 0.52 0.06 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 1.68 0.01 0.52 0.24 0.0 0.27 0.06 0.0 0.91 0.29 13.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.24 0.0
0.0 0.01 0.0 0.51 0.0 0.07 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 1.34 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.03 0.03
2.06 4.47 9.01 6.07 2.38 2.2 0.0 1.98 0.64 1.84 2.19 2.16 2.02 27.93 1.72 0.99 3.6 2.26 3.54 3.14 4.25 7.48
0.0 0.16 0.0 6.69 0.19 0.18 0.0 0.25 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 18.66 0.0 0.77 0.16 0.17 0.0 0.0 0.0 2.32
0.25 0.82 0.0 0.72 0.05 0.56 0.7 0.0 0.41 0.0 0.43 1.19 0.36 9.77 0.71 0.83 0.14 0.28 0.31 0.33 0.0 0.65
0.61 1.34 0.0 0.77 0.0 1.41 2.03 0.31 0.9 0.35 0.71 1.56 0.5 5.3 0.88 0.4 1.11 0.75 0.97 0.35 0.39 0.75
4.83 0.24 0.0 36.22 0.43 4.2 0.01 5.19 0.0 4.11 5.43 0.0 0.0 38.21 0.15 0.21 0.16 0.16 0.36 0.37 0.0 1.01
4.83 0.24 0.0 36.22 0.43 4.2 0.01 5.19 0.0 4.11 5.43 0.0 0.0 38.21 0.15 0.21 0.16 0.16 0.36 0.37 0.0 1.01
5.42 1.76 0.0 14.43 0.77 0.45 0.0 10.49 0.0 6.54 6.4 0.0 0.0 53.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.98 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)