Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Archegoniophore (female)	Antheridiophore (male)	Antheridium (male)	Sperm	Sporeling	Thallus	Thallus (vegetative)	Thallus (MpPAP1OX-1)	Thallus (Tak1-2)	Thallus (MpPAP1OX-3)	Thallus (MpPAP1OX-2)	Thallus (Tak1-3)	mid rib (male)	Gametophyte	Gemmaling (female, hpt2040)	Gemmaling (male, hpt2040)	Gemmaling (BC3-38)	Gemmaling (Tak1)	Gemmaling	Gemma cup	gemma cup (male)	Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Mp1g13170.1	0.09	0.0	0.0	0.5	0.0	0.05	0.0	0.03	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05
Mp2g05220.1	0.06	0.06	0.01	0.13	0.0	0.04	0.11	0.02	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	1.0	0.01	0.0	0.03	0.03	0.08	0.01	0.01	0.09
Mp2g05770.1	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.05	0.07	0.02	0.04	0.03	0.02	0.06	0.02	1.0	0.07	0.05	0.07	0.05	0.13	0.01	0.01	0.1
Mp2g10350.1	0.09	0.01	0.01	0.91	0.02	0.28	0.22	0.08	0.21	0.09	0.09	0.45	0.04	1.0	0.21	0.14	0.22	0.13	0.8	0.22	0.19	0.27
Mp2g21600.1	0.02	0.03	0.05	0.48	0.0	0.17	0.17	0.03	0.08	0.16	0.07	0.19	0.06	1.0	0.2	0.13	0.18	0.16	0.51	0.03	0.04	0.19
Mp2g26080.1	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.04	0.14	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.04
Mp3g02530.1	0.11	0.14	0.11	0.12	0.01	0.15	0.07	0.06	0.08	0.05	0.04	0.11	0.06	1.0	0.11	0.08	0.15	0.12	0.07	0.08	0.05	0.08
Mp3g10280.1	0.01	0.01	0.01	0.17	0.0	0.05	0.07	0.0	0.02	0.0	0.01	0.06	0.03	1.0	0.0	0.01	0.1	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Mp3g10370.1	0.06	0.06	0.0	1.0	0.18	0.2	0.24	0.07	0.18	0.14	0.12	0.25	0.07	0.93	0.21	0.15	0.23	0.18	0.54	0.1	0.09	0.46
Mp3g10720.1	0.0	0.01	0.02	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0
Mp3g16690.1	0.1	0.38	0.0	0.4	0.0	0.09	0.12	0.03	0.03	0.01	0.0	0.07	0.05	1.0	0.1	0.05	0.12	0.13	0.04	0.01	0.02	0.01
Mp3g16700.1	0.04	0.11	0.0	0.22	0.0	0.12	0.28	0.01	0.01	0.0	0.0	0.05	0.04	1.0	0.04	0.02	0.07	0.08	0.01	0.01	0.04	0.03
Mp3g18410.1	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.02	0.04	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g21110.1	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.12	0.11	0.16	0.0	0.19	0.2	0.0	0.02	1.0	0.13	0.06	0.21	0.05	0.0	0.0	0.0	0.41
Mp3g24130.1	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.13	0.0	0.07	0.01	0.01	0.27	0.01	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
Mp4g04010.1	0.03	0.0	0.0	0.36	0.01	0.04	0.0	0.06	0.0	0.07	0.07	0.0	0.0	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02
Mp4g04070.1	0.08	0.08	0.02	0.3	0.0	0.12	0.07	0.07	0.16	0.1	0.11	0.11	0.17	1.0	0.09	0.05	0.08	0.1	0.09	0.15	0.06	0.02
Mp4g04470.1	0.05	0.0	0.0	0.3	0.01	0.08	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.03	0.16	0.0
Mp4g07850.1	0.0	0.0	0.05	0.18	0.0	0.03	0.09	0.0	0.17	0.0	0.0	0.08	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
Mp4g10140.1	0.05	0.11	0.0	0.04	0.0	0.09	0.18	0.03	0.14	0.05	0.07	0.14	0.02	1.0	0.07	0.07	0.07	0.11	0.0	0.01	0.0	0.14
Mp4g16600.1	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.02	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02
Mp4g17410.1	0.0	0.0	0.0	0.24	0.02	0.02	0.05	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0
Mp4g17600.1	0.03	0.03	0.0	0.06	0.0	0.05	0.14	0.03	0.15	0.03	0.03	0.31	0.02	1.0	0.01	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01	0.02	0.09
Mp5g00420.1	0.01	0.05	0.0	0.68	0.02	0.13	0.13	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.02	1.0	0.24	0.07	0.32	0.19	0.0	0.0	0.0	0.04
Mp5g05600.1	0.01	0.01	0.0	0.07	0.0	0.02	0.18	0.02	0.07	0.04	0.06	0.09	0.04	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.14
Mp5g05630.1	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.08	0.03	0.03	0.02	0.06	0.02	0.0	0.13	1.0	0.09	0.05	0.15	0.12	0.16	0.0	0.02	0.0
Mp5g05640.1	0.01	0.03	0.0	0.18	0.0	0.13	0.02	0.01	0.05	0.11	0.07	0.05	0.12	1.0	0.14	0.11	0.16	0.17	0.33	0.03	0.09	0.01
Mp5g05680.1	0.0	0.03	0.02	0.32	0.0	0.1	0.14	0.02	0.0	0.04	0.0	0.05	0.06	1.0	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.0	0.04
Mp5g09790.1	0.12	0.24	0.0	0.23	0.05	0.16	0.1	0.02	0.1	0.05	0.04	0.11	0.08	1.0	0.09	0.06	0.16	0.12	0.27	0.1	0.07	0.06
Mp5g16100.1	0.0	0.0	0.0	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp5g19180.1	0.0	0.0	0.15	0.72	0.02	0.06	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	1.0	0.0	0.09	0.21	0.19	0.23	0.0	0.0	0.16
Mp6g13340.1	0.04	0.0	0.0	0.17	0.0	0.01	0.02	0.0	0.13	0.0	0.08	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.07
Mp6g14030.1	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g14050.1	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g17860.1	0.01	0.02	0.0	0.31	0.01	0.05	0.04	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.03	0.05	0.05	0.35	0.04	0.0	0.0
Mp6g21050.1	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.04	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.07	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0
Mp7g03130.1	0.0	0.01	0.0	0.38	0.0	0.05	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.03	0.0	0.02	0.02
Mp7g05160.1	0.07	0.16	0.32	0.22	0.09	0.08	0.0	0.07	0.02	0.07	0.08	0.08	0.07	1.0	0.06	0.04	0.13	0.08	0.13	0.11	0.15	0.27
Mp8g10410.1	0.0	0.01	0.0	0.36	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.12
Mp8g13600.1	0.03	0.08	0.0	0.07	0.0	0.06	0.07	0.0	0.04	0.0	0.04	0.12	0.04	1.0	0.07	0.09	0.01	0.03	0.03	0.03	0.0	0.07
Mp8g13630.1	0.11	0.25	0.0	0.15	0.0	0.27	0.38	0.06	0.17	0.07	0.13	0.29	0.09	1.0	0.17	0.07	0.21	0.14	0.18	0.07	0.07	0.14
Mpzg00670.1	0.13	0.01	0.0	0.95	0.01	0.11	0.0	0.14	0.0	0.11	0.14	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03
Mpzg00940.1	0.13	0.01	0.0	0.95	0.01	0.11	0.0	0.14	0.0	0.11	0.14	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03
Mpzg01050.1	0.1	0.03	0.0	0.27	0.01	0.01	0.0	0.2	0.0	0.12	0.12	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)