Heatmap: Cluster_114 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.46 0.5 0.53 0.02 1.0 0.71 0.53 0.34 0.4 0.28 0.31 0.43 0.17 0.49 0.54 0.56 0.49 0.46 0.92 0.36 0.38 0.43
0.38 0.69 0.84 0.03 1.0 0.75 0.46 0.34 0.4 0.34 0.31 0.39 0.24 0.34 0.72 0.74 0.7 0.72 0.97 0.36 0.37 0.31
0.78 0.42 0.26 0.01 1.0 0.88 0.79 0.6 0.9 0.55 0.57 0.82 0.38 0.74 0.83 0.85 0.86 0.82 0.7 0.49 0.55 0.88
0.62 0.5 0.37 0.02 0.88 0.75 1.0 0.45 0.61 0.41 0.48 0.45 0.31 0.54 0.58 0.61 0.64 0.6 0.72 0.43 0.4 0.69
0.48 0.25 0.02 0.0 1.0 0.8 0.75 0.4 0.42 0.33 0.35 0.3 0.35 0.34 0.74 0.81 0.74 0.76 0.7 0.5 0.58 0.48
0.6 0.28 0.02 0.01 0.97 1.0 0.72 0.43 0.61 0.52 0.41 0.69 0.32 0.35 0.93 0.91 0.87 0.89 0.39 0.63 0.71 0.41
0.45 0.48 0.46 0.03 1.0 0.68 0.56 0.3 0.55 0.28 0.3 0.44 0.31 0.38 0.46 0.58 0.41 0.44 0.65 0.57 0.58 0.31
0.49 0.49 0.45 0.01 1.0 0.74 0.51 0.37 0.43 0.42 0.37 0.47 0.24 0.31 0.64 0.59 0.62 0.62 0.54 0.37 0.44 0.42
0.5 0.63 0.63 0.02 1.0 0.75 0.74 0.46 0.74 0.5 0.45 0.78 0.29 0.57 0.79 0.76 0.74 0.72 0.98 0.51 0.52 0.69
0.56 0.36 0.09 0.01 1.0 1.0 0.91 0.45 0.67 0.46 0.46 0.52 0.57 0.34 0.8 0.81 0.78 0.73 0.59 0.57 0.65 0.82
0.61 0.48 0.1 0.01 1.0 0.94 0.84 0.52 0.61 0.52 0.54 0.6 0.41 0.56 0.81 0.74 0.74 0.65 0.84 0.48 0.54 0.4
0.7 0.5 0.21 0.02 1.0 0.84 0.95 0.33 0.44 0.27 0.3 0.44 0.22 0.4 0.64 0.67 0.62 0.69 0.58 0.47 0.59 0.65
0.62 0.53 0.42 0.01 0.91 0.81 0.87 0.61 0.97 0.49 0.63 0.83 0.23 0.59 0.68 0.67 0.72 0.71 1.0 0.48 0.46 0.69
0.66 0.49 0.13 0.01 0.85 0.95 1.0 0.4 0.48 0.29 0.34 0.39 0.39 0.44 0.94 0.93 0.98 0.94 0.75 0.46 0.55 0.7
0.45 0.49 0.23 0.01 1.0 0.84 0.72 0.55 0.71 0.67 0.59 0.74 0.39 0.37 0.87 0.86 0.85 0.89 0.66 0.49 0.56 0.4
0.48 0.48 0.31 0.01 1.0 0.86 0.8 0.39 0.64 0.38 0.39 0.66 0.37 0.5 0.75 0.75 0.77 0.78 0.73 0.57 0.62 0.4
0.69 0.42 0.21 0.06 0.93 1.0 0.98 0.37 0.4 0.39 0.4 0.38 0.29 0.57 0.99 0.91 1.0 0.95 0.94 0.52 0.48 0.59
0.3 0.3 0.4 0.01 1.0 0.78 0.7 0.14 0.33 0.16 0.19 0.31 0.32 0.44 0.62 0.54 0.54 0.6 0.23 0.31 0.36 0.1
0.71 0.76 0.54 0.01 1.0 0.86 0.7 0.56 0.66 0.73 0.59 0.68 0.21 0.43 0.85 0.82 0.81 0.79 0.81 0.43 0.48 0.59
0.59 0.59 0.45 0.03 1.0 0.98 0.55 0.59 0.76 0.64 0.62 0.74 0.35 0.7 0.84 0.81 0.77 0.77 0.64 0.68 0.65 0.64
0.74 0.42 0.3 0.02 0.9 0.78 0.58 0.32 0.56 0.31 0.38 0.46 0.21 0.24 0.6 0.55 0.5 0.69 0.55 0.3 0.36 1.0
0.41 0.3 0.02 0.01 0.69 1.0 0.87 0.38 0.57 0.44 0.46 0.59 0.71 0.32 0.64 0.59 0.61 0.56 0.6 0.42 0.54 0.38
0.7 0.72 0.24 0.02 1.0 0.95 0.7 0.55 0.71 0.56 0.55 0.72 0.58 0.63 0.76 0.71 0.73 0.72 0.57 0.87 0.93 0.55
0.95 0.76 0.15 0.1 1.0 0.65 0.63 0.32 0.28 0.49 0.4 0.51 0.26 0.38 0.77 0.88 0.81 0.77 0.83 0.25 0.29 0.26
0.56 0.43 0.25 0.01 0.97 0.92 0.97 0.41 0.58 0.38 0.41 0.52 0.4 0.54 1.0 0.93 0.96 0.95 0.81 0.51 0.63 0.61
0.71 0.66 0.39 0.05 1.0 0.88 0.67 0.39 0.5 0.33 0.33 0.44 0.31 0.39 0.64 0.7 0.63 0.67 0.69 0.5 0.55 0.45
0.62 0.48 0.31 0.03 1.0 1.0 0.85 0.23 0.52 0.28 0.39 0.47 0.5 0.29 0.75 0.7 0.64 0.68 0.54 0.47 0.49 0.25
0.43 0.33 0.02 0.0 0.66 0.77 0.61 0.32 0.54 0.39 0.34 0.52 0.34 0.51 1.0 0.92 1.0 0.91 0.79 0.54 0.63 0.34
0.2 0.1 0.07 0.02 1.0 0.85 0.66 0.24 0.65 0.42 0.37 0.72 0.32 0.23 0.75 0.73 0.66 0.66 0.51 0.36 0.5 0.43
0.74 0.68 0.67 0.06 1.0 0.74 0.52 0.42 0.34 0.48 0.37 0.38 0.26 0.46 0.79 0.69 0.76 0.72 0.53 0.49 0.52 0.41
0.52 0.43 0.41 0.04 1.0 0.69 0.62 0.44 0.38 0.45 0.42 0.37 0.3 0.7 0.57 0.58 0.58 0.52 0.79 0.45 0.42 0.67
0.63 0.36 0.18 0.04 0.87 0.92 1.0 0.27 0.42 0.26 0.26 0.28 0.27 0.34 0.64 0.58 0.59 0.67 0.55 0.4 0.48 0.56
0.79 0.67 0.19 0.03 0.86 0.72 0.66 0.45 0.48 0.46 0.42 0.43 0.23 0.46 0.71 0.83 0.76 0.71 1.0 0.52 0.52 0.55
0.53 0.53 0.17 0.03 1.0 0.95 0.91 0.46 0.87 0.54 0.6 0.74 0.54 0.53 0.82 0.88 0.81 0.84 0.91 0.63 0.69 0.58
0.37 0.17 0.02 0.02 0.68 0.75 0.75 0.26 0.35 0.2 0.25 0.31 0.48 0.37 0.39 0.41 0.41 0.44 0.4 0.38 0.42 1.0
0.47 0.49 0.76 0.03 1.0 0.8 0.68 0.57 0.63 0.48 0.44 0.63 0.32 0.63 0.78 0.75 0.81 0.69 0.35 0.69 0.65 0.74
0.31 0.27 0.07 0.0 1.0 0.73 0.63 0.19 0.54 0.27 0.32 0.42 0.27 0.35 0.64 0.6 0.56 0.58 0.74 0.36 0.36 0.22
0.6 0.51 0.18 0.05 0.94 0.83 0.56 0.51 0.51 0.45 0.36 0.48 0.22 0.69 0.71 0.8 0.71 0.71 1.0 0.79 0.85 0.59
0.79 0.66 0.26 0.03 1.0 0.88 0.76 0.45 0.58 0.43 0.4 0.56 0.27 0.49 0.89 0.8 0.85 0.89 0.84 0.71 0.69 0.49
0.42 0.31 0.37 0.07 0.82 1.0 0.9 0.33 0.33 0.45 0.41 0.31 0.16 0.99 0.86 0.91 0.9 0.95 0.49 0.29 0.33 0.63
0.34 0.44 1.0 0.04 0.93 0.77 0.65 0.34 0.52 0.38 0.39 0.49 0.3 0.36 0.73 0.67 0.69 0.7 0.86 0.46 0.42 0.44
0.89 0.79 0.09 0.01 1.0 0.83 0.85 0.4 0.46 0.48 0.43 0.53 0.33 0.44 0.72 0.71 0.69 0.73 0.92 0.72 0.71 0.49
0.63 0.5 0.26 0.02 1.0 0.91 0.96 0.38 0.76 0.37 0.46 0.69 0.45 0.58 0.8 0.73 0.8 0.7 0.77 0.52 0.53 0.42
0.44 0.37 0.74 0.02 1.0 0.69 0.49 0.29 0.51 0.28 0.29 0.47 0.2 0.34 0.52 0.55 0.5 0.48 0.57 0.4 0.38 0.47
0.66 0.29 0.07 0.1 1.0 0.96 0.72 0.54 0.63 0.46 0.4 0.74 0.45 0.64 0.54 0.51 0.58 0.44 0.54 0.61 0.6 0.65
0.5 0.71 0.79 0.02 1.0 0.76 0.48 0.45 0.66 0.39 0.43 0.64 0.32 0.52 0.58 0.56 0.52 0.55 0.91 0.58 0.57 0.66
0.55 0.31 0.06 0.01 0.94 0.77 0.69 0.58 0.82 0.49 0.51 0.72 0.45 0.32 0.59 0.56 0.61 0.6 0.56 0.52 0.56 1.0
0.86 0.58 0.34 0.03 1.0 0.95 0.95 0.49 0.71 0.38 0.5 0.66 0.61 0.77 0.68 0.65 0.67 0.68 0.73 0.77 0.92 0.53
0.54 0.46 0.75 0.03 1.0 0.66 0.47 0.29 0.41 0.35 0.29 0.55 0.28 0.42 0.44 0.43 0.41 0.4 0.4 0.53 0.63 0.5
0.4 0.28 0.08 0.01 1.0 0.83 0.79 0.34 0.55 0.35 0.36 0.5 0.37 0.35 0.85 0.84 0.84 0.8 0.86 0.46 0.55 0.61
0.67 0.67 0.2 0.02 1.0 0.81 0.86 0.67 0.65 0.64 0.7 0.56 0.28 0.67 0.85 0.87 0.81 0.89 0.73 0.5 0.52 0.97
0.88 0.87 0.62 0.01 1.0 0.93 0.97 0.76 0.74 0.65 0.65 0.64 0.37 0.62 0.88 0.81 0.87 0.82 0.81 0.6 0.6 0.82
1.0 0.34 0.05 0.14 0.71 0.75 0.86 0.35 0.58 0.33 0.31 0.61 0.23 0.6 0.51 0.42 0.51 0.45 0.4 0.34 0.3 0.42
0.63 0.37 0.16 0.01 1.0 0.89 0.99 0.5 0.54 0.51 0.62 0.44 0.29 0.57 0.85 0.86 0.84 0.9 0.56 0.44 0.46 0.63
0.72 0.48 0.07 0.03 1.0 0.92 0.84 0.43 0.74 0.59 0.6 0.59 0.31 0.29 0.69 0.74 0.74 0.87 0.86 0.56 0.59 0.48
0.62 0.56 0.25 0.01 0.96 1.0 0.88 0.62 0.79 0.71 0.69 0.8 0.53 0.53 0.88 0.75 0.85 0.8 0.75 0.65 0.68 0.63
0.36 0.55 0.59 0.02 0.91 0.58 0.42 0.29 0.37 0.27 0.25 0.37 0.18 0.33 0.59 0.58 0.55 0.57 1.0 0.3 0.38 0.4
0.89 0.71 0.21 0.04 0.78 1.0 0.71 0.45 0.49 0.43 0.45 0.47 0.52 0.23 0.56 0.54 0.55 0.64 0.65 0.55 0.65 0.32
0.42 0.4 0.22 0.03 1.0 0.91 0.69 0.57 0.56 0.53 0.53 0.47 0.33 0.77 0.81 0.86 0.83 0.85 0.93 0.7 0.8 0.72
0.54 0.52 0.05 0.01 1.0 0.64 0.66 0.69 0.52 0.66 0.65 0.52 0.18 0.37 0.64 0.72 0.69 0.71 0.71 0.52 0.49 0.5
0.48 0.41 0.21 0.01 1.0 0.84 0.81 0.49 0.57 0.53 0.5 0.57 0.25 0.37 0.65 0.67 0.7 0.66 0.85 0.5 0.51 0.5
0.6 0.32 0.16 0.01 0.89 0.96 0.91 0.47 0.63 0.46 0.47 0.67 0.34 0.52 0.9 0.92 0.95 1.0 0.61 0.74 0.77 0.82
0.41 0.38 0.56 0.04 1.0 0.77 0.55 0.22 0.51 0.27 0.31 0.44 0.38 0.55 0.54 0.5 0.47 0.52 0.46 0.55 0.6 0.38
0.47 0.55 0.64 0.01 1.0 0.74 0.6 0.21 0.47 0.24 0.2 0.38 0.35 0.36 0.68 0.66 0.66 0.71 0.87 0.39 0.42 0.24
0.46 0.43 0.39 0.06 0.99 0.86 0.84 0.57 1.0 0.61 0.6 0.95 0.48 0.51 0.76 0.77 0.73 0.7 0.86 0.43 0.49 0.66
0.84 0.64 0.45 0.11 0.81 0.91 1.0 0.52 0.6 0.46 0.48 0.57 0.58 0.41 0.6 0.62 0.64 0.54 0.66 0.59 0.63 0.59
0.3 0.58 1.0 0.03 0.9 0.77 0.49 0.17 0.32 0.19 0.19 0.27 0.29 0.34 0.71 0.7 0.73 0.68 0.4 0.37 0.31 0.23
0.35 0.46 0.47 0.02 0.9 0.63 0.41 0.34 0.45 0.25 0.33 0.43 0.18 0.4 0.43 0.44 0.41 0.43 1.0 0.31 0.33 0.39
0.44 0.41 0.23 0.02 1.0 0.69 0.72 0.44 0.57 0.44 0.45 0.53 0.46 0.44 0.65 0.65 0.66 0.64 0.78 0.5 0.54 0.48
1.0 0.79 0.13 0.09 0.87 0.9 0.83 0.48 0.41 0.36 0.43 0.52 0.27 0.45 0.64 0.53 0.69 0.75 0.69 0.78 0.65 0.46
0.43 0.37 0.12 0.01 0.73 0.98 1.0 0.32 0.83 0.25 0.33 0.63 0.56 0.47 0.74 0.85 0.8 0.89 0.7 0.51 0.54 0.45
0.71 0.48 0.14 0.01 0.94 0.97 1.0 0.63 0.69 0.61 0.57 0.55 0.47 0.45 0.9 0.84 0.81 0.85 0.67 0.77 0.82 0.79
0.53 0.32 0.2 0.05 1.0 0.79 0.57 0.59 0.54 0.53 0.51 0.51 0.19 0.46 0.63 0.69 0.56 0.57 0.7 0.78 0.71 0.44
0.48 0.31 0.09 0.01 1.0 0.98 0.81 0.28 0.64 0.36 0.35 0.62 0.44 0.42 0.94 0.85 0.92 0.87 0.78 0.58 0.63 0.37
0.41 0.47 0.51 0.01 1.0 0.72 0.71 0.32 0.54 0.36 0.37 0.44 0.27 0.29 0.66 0.65 0.66 0.58 0.47 0.4 0.39 0.26
0.42 0.27 0.17 0.01 1.0 0.67 0.72 0.24 0.4 0.28 0.3 0.31 0.29 0.4 0.57 0.59 0.54 0.59 0.45 0.46 0.45 0.41
0.74 0.62 0.23 0.02 1.0 0.78 0.86 0.53 0.72 0.53 0.46 0.68 0.45 0.56 0.75 0.71 0.71 0.69 0.93 0.62 0.65 0.8
0.36 0.29 0.26 0.02 0.97 1.0 0.8 0.29 0.46 0.29 0.29 0.44 0.66 0.48 0.85 0.75 0.86 0.73 0.69 0.41 0.57 0.43
0.35 0.29 0.09 0.01 1.0 0.8 0.38 0.18 0.28 0.22 0.17 0.28 0.37 0.42 0.6 0.48 0.6 0.57 0.38 0.25 0.32 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)