Heatmap: Cluster_120 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
8.11 16.45 96.47 3.66 0.31 0.67 2.05 0.91 1.24 0.6 0.39 0.93 1.3 1.55 0.98 0.51 0.43 0.43 0.2 1.48 1.67 1.15
2.04 4.78 22.22 0.98 0.06 0.65 0.3 0.36 0.52 0.37 0.44 0.25 0.06 0.17 0.47 0.54 0.34 0.36 0.19 0.32 0.46 0.2
7.95 17.91 114.17 0.92 0.4 0.82 2.82 1.69 4.37 1.61 2.33 4.55 2.27 1.28 0.38 0.42 0.77 0.37 0.96 1.22 1.47 1.78
1.18 1.54 10.77 0.73 0.03 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
20.79 42.3 108.84 16.41 3.03 8.03 5.6 6.52 5.63 6.07 4.91 5.54 4.5 5.98 7.48 6.2 6.4 4.84 4.33 5.53 5.73 2.24
0.14 1.82 7.24 1.3 0.06 0.1 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.11 0.0 0.18 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
2.59 2.08 25.83 4.05 0.48 0.55 1.2 0.59 0.82 0.51 0.55 0.65 0.37 0.81 0.27 0.33 0.28 0.29 0.23 0.61 0.52 1.77
2.88 2.51 11.04 0.68 0.07 0.01 0.02 0.04 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.27 0.63 5.41 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 1.88 10.18 0.87 0.11 0.19 0.17 0.09 0.25 0.05 0.17 0.07 0.07 0.15 0.05 0.06 0.0 0.1 0.0 0.06 0.03 0.16
10.41 1.47 35.51 1.91 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0
0.23 1.7 6.48 0.96 0.03 0.18 0.22 0.02 0.04 0.05 0.07 0.04 0.01 0.1 0.06 0.13 0.1 0.09 0.03 0.07 0.09 0.02
1.23 0.31 6.98 1.47 0.1 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.13 7.18 62.84 2.33 1.23 0.74 0.76 0.0 3.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.03 1.96 5.91 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 3.01 14.9 1.89 0.07 0.03 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.31 6.14 15.3 1.18 0.24 0.83 0.66 0.36 0.55 0.16 0.5 0.11 1.14 0.63 0.31 0.29 0.29 0.33 0.19 0.39 0.71 0.23
2.64 0.0 10.53 0.67 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.99 10.82 1.56 0.05 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.42 0.65 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.59 0.0
0.08 0.77 2.29 0.34 0.12 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.05 0.0 0.06 0.0 0.12 0.07 0.0 0.0
0.05 1.97 11.06 1.24 0.18 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.04 3.93 11.86 0.57 0.11 0.11 0.14 0.0 0.0 0.07 0.0 0.17 0.2 0.01 0.05 0.17 0.11 0.0 0.13 0.07 0.0 0.0
0.33 1.39 4.95 0.62 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.62 2.14 7.17 1.24 0.0 0.01 0.01 0.05 0.0 0.05 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12 0.0
0.42 1.98 5.21 1.04 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 1.43 6.86 0.56 0.09 0.22 0.34 0.16 0.19 0.17 0.23 0.18 0.19 0.24 0.16 0.2 0.19 0.23 0.08 0.19 0.17 0.3
4.66 10.58 36.52 3.33 0.01 0.04 0.5 0.69 0.0 0.68 1.01 0.04 0.0 0.05 0.09 0.06 0.08 0.05 0.0 0.02 0.0 4.72
0.0 7.03 41.39 2.7 0.49 0.09 0.1 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.09
0.11 1.19 9.13 1.07 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 4.12 11.45 1.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.97 6.17 1.16 0.13 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.1 0.12 0.0 0.11 0.0 0.0 0.29 0.17
0.05 1.63 3.81 0.43 0.01 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.37 1.56 7.94 1.22 0.09 0.12 0.13 0.3 0.0 0.0 0.12 0.0 0.12 0.23 0.2 0.19 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0
0.03 2.57 7.49 0.87 0.0 0.16 0.05 0.05 0.23 0.12 0.02 0.17 0.01 0.06 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.3 0.04 0.0
0.11 4.93 15.47 2.43 0.33 0.45 0.39 0.11 0.28 0.35 0.38 0.2 0.74 0.13 0.34 0.29 0.28 0.28 0.21 0.35 0.39 0.28
0.11 2.84 8.07 0.79 0.05 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.26 0.02 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.19 5.94 22.94 1.95 0.45 0.26 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 2.59 0.0 0.11 0.0 0.0 0.4 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 1.53 11.34 1.46 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.04 0.14 0.27 0.15 0.0 0.0 0.0 0.4 0.47
7.53 17.63 133.41 1.81 0.0 3.17 9.88 2.5 0.8 0.88 2.81 2.69 0.89 23.88 0.3 0.0 1.65 1.57 0.0 0.46 1.41 2.7
0.0 0.21 3.05 0.26 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.59 2.66 0.24 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.7 21.14 65.42 14.47 4.6 3.83 4.12 1.44 2.77 1.36 1.55 0.53 0.3 1.43 3.85 2.96 3.36 2.93 2.86 2.15 0.49 0.58
2.26 1.54 9.58 1.88 0.49 0.39 0.63 1.0 0.0 0.14 0.74 0.31 0.22 0.23 0.35 0.22 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34
4.47 8.66 33.48 0.72 0.01 0.6 1.25 0.08 0.58 0.0 0.3 0.28 0.1 1.59 0.23 0.17 0.24 0.09 0.0 0.0 0.0 0.38
0.32 2.5 9.06 0.91 0.02 0.09 0.08 0.11 0.05 0.0 0.0 0.1 0.04 0.18 0.02 0.04 0.13 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0
0.02 1.15 6.22 0.59 0.07 0.16 0.0 0.14 0.0 0.0 0.12 0.0 0.06 0.14 0.18 0.11 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44
0.62 1.2 8.05 1.19 0.29 0.36 0.33 0.27 0.32 0.13 0.25 0.19 0.18 0.71 0.28 0.26 0.24 0.35 0.39 0.25 0.26 0.44
47.51 54.96 392.29 19.33 0.27 6.81 17.47 17.59 16.58 13.75 19.24 21.57 6.14 20.13 4.95 3.25 4.63 2.89 1.13 7.71 5.97 8.14
0.07 1.13 10.45 1.03 0.0 0.04 0.19 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.04 0.17 0.33 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0
5.29 5.88 16.42 1.08 1.38 1.59 1.5 1.13 0.94 0.88 0.72 0.75 0.54 1.01 0.72 0.93 0.58 0.57 0.76 0.76 0.82 2.69
1.42 6.81 19.11 2.55 0.26 0.86 0.95 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.96 0.45 0.26 0.74 0.42 1.32 0.35 0.79 0.7
0.6 0.64 6.53 0.63 0.08 0.08 0.23 0.0 0.19 0.09 0.0 0.0 0.08 0.15 0.0 0.11 0.0 0.06 0.0 0.0 0.16 0.1
0.06 0.68 4.9 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.95 5.72 30.83 1.61 0.14 0.45 1.04 0.81 0.18 0.35 0.59 0.35 0.87 0.78 0.53 0.42 0.44 0.43 0.18 0.31 0.37 1.04
4.57 22.11 48.09 0.71 0.62 1.05 0.75 0.0 0.0 0.0 4.94 0.0 0.0 0.32 0.0 2.71 0.0 0.0 0.0 1.6 0.0 0.0
0.3 2.24 13.4 0.86 0.24 0.06 0.06 0.0 0.2 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.08 0.0 0.0
212.26 328.76 1101.43 78.74 58.49 84.97 116.17 84.02 105.15 88.51 76.97 87.23 54.09 108.73 60.8 60.95 59.87 58.85 53.64 66.02 66.88 112.08
1.96 1.4 6.62 0.84 0.16 0.2 0.27 0.17 0.24 0.06 0.06 0.29 0.06 0.37 0.06 0.12 0.07 0.09 0.18 0.05 0.19 0.39
6.53 10.92 51.55 3.75 0.08 0.7 0.54 1.8 1.05 1.11 2.1 1.01 0.33 0.53 1.4 0.71 0.9 0.79 0.0 1.51 1.55 0.73
0.19 1.44 4.16 0.47 0.07 0.2 0.15 0.12 0.23 0.13 0.1 0.15 0.11 0.13 0.03 0.0 0.41 0.37 0.0 0.09 0.14 0.0
1.37 9.42 27.9 2.31 0.13 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.29 10.65 34.32 0.76 1.22 0.82 0.85 0.6 1.32 1.74 1.12 1.83 0.42 0.89 0.72 0.56 0.37 0.35 0.39 0.97 0.98 0.66
0.23 1.25 6.77 0.43 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02
0.18 0.71 2.71 0.55 0.04 0.05 0.08 0.02 0.07 0.02 0.02 0.03 0.06 0.08 0.03 0.02 0.01 0.05 0.0 0.08 0.0 0.04
0.96 2.65 9.43 1.58 0.05 0.09 0.1 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.18 0.31 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 5.92 36.17 3.59 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.43 2.84 7.46 0.55 0.12 0.49 0.39 0.18 0.35 0.47 0.22 0.0 0.09 0.19 0.81 0.23 0.23 0.33 0.26 0.13 0.31 0.36
0.83 2.76 5.81 0.44 0.1 0.28 0.44 0.23 0.88 0.12 0.24 0.14 0.07 0.32 0.43 0.33 0.19 0.33 0.33 0.12 0.13 0.08
14.26 19.88 172.49 4.69 0.01 0.12 0.14 0.0 0.25 0.16 0.13 0.12 0.18 0.48 0.0 0.0 0.18 0.08 0.0 0.35 0.33 0.23
0.08 14.3 59.82 6.37 0.0 0.47 0.07 0.38 0.0 0.0 0.31 0.0 1.72 0.23 0.23 0.0 0.95 0.0 0.54 0.58 0.65 0.0
5.21 6.06 43.98 1.9 0.1 0.5 0.38 0.52 0.74 0.38 0.28 0.8 0.69 0.34 0.24 0.2 0.25 0.28 0.34 0.81 0.86 0.31
0.0 1.69 4.23 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)