Heatmap: Cluster_120 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.08 0.17 1.0 0.04 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01
0.09 0.22 1.0 0.04 0.0 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01
0.07 0.16 1.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.04 0.01 0.02 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02
0.11 0.14 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.39 1.0 0.15 0.03 0.07 0.05 0.06 0.05 0.06 0.05 0.05 0.04 0.05 0.07 0.06 0.06 0.04 0.04 0.05 0.05 0.02
0.02 0.25 1.0 0.18 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.1 0.08 1.0 0.16 0.02 0.02 0.05 0.02 0.03 0.02 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.07
0.26 0.23 1.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.12 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.18 1.0 0.09 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02
0.29 0.04 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.03 0.26 1.0 0.15 0.0 0.03 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
0.18 0.05 1.0 0.21 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.11 1.0 0.04 0.02 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.33 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.2 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.4 1.0 0.08 0.02 0.05 0.04 0.02 0.04 0.01 0.03 0.01 0.07 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.05 0.01
0.25 0.0 1.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 1.0 0.14 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0
0.04 0.34 1.0 0.15 0.05 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0
0.0 0.18 1.0 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.33 1.0 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.07 0.28 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.3 1.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.08 0.38 1.0 0.2 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.21 1.0 0.08 0.01 0.03 0.05 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.01 0.03 0.02 0.04
0.13 0.29 1.0 0.09 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.0 0.17 1.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
0.01 0.13 1.0 0.12 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.36 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.16 1.0 0.19 0.02 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.03
0.01 0.43 1.0 0.11 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.05 0.2 1.0 0.15 0.01 0.01 0.02 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.34 1.0 0.12 0.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0
0.01 0.32 1.0 0.16 0.02 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.05 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02
0.01 0.35 1.0 0.1 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.01 0.26 1.0 0.09 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04
0.06 0.13 1.0 0.01 0.0 0.02 0.07 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.18 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02
0.0 0.07 1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.22 1.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.32 1.0 0.22 0.07 0.06 0.06 0.02 0.04 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.06 0.05 0.05 0.04 0.04 0.03 0.01 0.01
0.24 0.16 1.0 0.2 0.05 0.04 0.07 0.1 0.0 0.01 0.08 0.03 0.02 0.02 0.04 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.13 0.26 1.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.04 0.28 1.0 0.1 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.19 1.0 0.1 0.01 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.08 0.15 1.0 0.15 0.04 0.04 0.04 0.03 0.04 0.02 0.03 0.02 0.02 0.09 0.03 0.03 0.03 0.04 0.05 0.03 0.03 0.05
0.12 0.14 1.0 0.05 0.0 0.02 0.04 0.04 0.04 0.04 0.05 0.05 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02
0.01 0.11 1.0 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.32 0.36 1.0 0.07 0.08 0.1 0.09 0.07 0.06 0.05 0.04 0.05 0.03 0.06 0.04 0.06 0.04 0.03 0.05 0.05 0.05 0.16
0.07 0.36 1.0 0.13 0.01 0.04 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.02 0.01 0.04 0.02 0.07 0.02 0.04 0.04
0.09 0.1 1.0 0.1 0.01 0.01 0.04 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01
0.01 0.14 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.19 1.0 0.05 0.0 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03
0.1 0.46 1.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.02 0.17 1.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.19 0.3 1.0 0.07 0.05 0.08 0.11 0.08 0.1 0.08 0.07 0.08 0.05 0.1 0.06 0.06 0.05 0.05 0.05 0.06 0.06 0.1
0.3 0.21 1.0 0.13 0.02 0.03 0.04 0.03 0.04 0.01 0.01 0.04 0.01 0.06 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.06
0.13 0.21 1.0 0.07 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.04 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.0 0.03 0.03 0.01
0.05 0.35 1.0 0.11 0.02 0.05 0.04 0.03 0.06 0.03 0.02 0.04 0.03 0.03 0.01 0.0 0.1 0.09 0.0 0.02 0.03 0.0
0.05 0.34 1.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.31 1.0 0.02 0.04 0.02 0.02 0.02 0.04 0.05 0.03 0.05 0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02
0.03 0.18 1.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.26 1.0 0.2 0.01 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01
0.1 0.28 1.0 0.17 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.38 1.0 0.07 0.02 0.07 0.05 0.02 0.05 0.06 0.03 0.0 0.01 0.03 0.11 0.03 0.03 0.04 0.03 0.02 0.04 0.05
0.14 0.48 1.0 0.08 0.02 0.05 0.08 0.04 0.15 0.02 0.04 0.02 0.01 0.05 0.07 0.06 0.03 0.06 0.06 0.02 0.02 0.01
0.08 0.12 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.24 1.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.12 0.14 1.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01
0.0 0.4 1.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)