Heatmap: Cluster_125 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
36.19 50.15 107.47 4.13 21.46 51.35 42.22 35.57 34.17 29.73 34.51 34.82 37.14 20.1 20.59 19.81 25.27 23.62 31.57 31.75 33.6 36.41
25.66 50.9 62.93 1.77 21.15 30.17 19.83 18.9 20.72 17.9 18.48 20.66 11.29 8.41 15.23 13.31 15.22 14.45 23.48 22.05 20.95 22.82
26.63 38.09 57.57 1.28 19.94 27.51 27.06 17.98 22.97 14.36 16.52 21.33 14.1 15.91 16.72 16.36 16.72 17.66 25.08 17.21 18.24 22.57
18.88 20.46 41.87 2.5 13.92 21.28 16.94 12.44 16.23 12.91 12.55 16.33 8.93 8.09 13.33 13.86 12.94 12.67 19.64 13.33 14.93 12.65
38.33 37.71 74.11 2.31 20.77 47.85 34.04 26.29 47.26 37.12 36.54 39.11 22.78 22.11 25.02 24.63 23.6 20.3 24.81 21.29 26.49 41.43
23.87 40.65 42.48 0.8 16.96 20.88 14.49 13.96 13.32 11.44 15.23 11.35 8.66 7.75 11.31 12.8 10.76 11.77 13.56 9.83 10.97 7.16
34.48 49.38 73.2 1.89 28.11 36.05 30.38 22.68 33.73 17.89 22.16 34.5 14.07 27.35 25.91 24.51 26.99 24.29 26.84 21.72 24.4 26.15
21.47 28.27 53.91 2.32 11.35 25.67 21.82 14.94 24.37 18.95 20.56 23.58 14.11 19.31 12.82 13.6 13.17 13.4 20.87 14.97 18.42 21.64
47.34 69.33 100.15 1.93 34.36 58.1 37.81 58.01 54.57 49.11 51.3 56.22 27.95 25.24 37.03 37.02 38.01 37.78 35.69 39.4 41.57 38.93
18.06 16.18 24.77 1.14 5.31 12.86 12.25 10.98 9.52 8.26 7.88 9.06 5.3 6.28 7.23 8.2 7.28 7.45 10.75 8.36 10.26 8.49
32.99 40.3 48.47 1.99 22.42 27.23 23.67 14.55 16.89 13.44 15.51 17.27 8.37 18.69 19.45 21.57 18.75 19.08 27.06 15.41 16.11 17.7
21.19 27.9 38.79 1.87 11.53 24.25 22.35 18.61 16.4 16.67 17.14 19.96 11.06 12.01 12.37 11.34 13.59 12.09 14.12 20.3 17.64 22.73
19.08 24.48 40.52 0.86 10.65 16.21 15.43 12.78 12.96 9.76 11.43 14.53 10.39 7.01 7.92 9.32 7.37 8.01 9.82 11.07 11.35 8.34
54.36 75.48 160.05 13.4 42.11 57.25 52.49 57.89 61.48 63.64 62.94 59.48 33.08 15.7 23.99 20.18 27.36 27.67 38.44 49.35 45.82 46.44
9.16 14.17 24.19 0.23 8.11 10.55 10.84 9.95 9.33 7.31 7.51 10.29 4.85 8.28 5.56 5.37 6.0 5.57 8.37 9.41 9.98 13.2
16.32 28.47 58.85 0.88 17.23 21.21 17.71 12.65 16.87 11.95 12.94 17.99 6.65 10.48 12.53 10.65 11.07 10.89 18.98 10.94 10.52 16.37
8.96 13.21 23.88 0.43 6.42 12.39 11.21 5.32 6.37 3.32 4.31 6.57 6.36 4.68 5.75 6.69 6.67 5.28 7.73 7.29 7.35 6.21
25.7 46.82 46.76 2.07 21.13 31.74 26.58 32.33 29.94 27.17 28.8 28.37 21.99 20.4 19.47 16.16 18.38 14.64 16.92 27.09 29.59 18.24
30.69 49.02 60.52 0.32 24.59 33.38 28.33 26.8 21.76 20.71 23.25 25.41 14.57 13.88 18.04 16.06 19.55 18.26 22.38 24.06 27.24 31.29
19.19 28.41 42.43 0.78 9.02 20.67 17.62 16.73 22.39 13.92 16.29 21.32 8.3 15.9 8.78 7.99 10.03 9.24 16.34 20.82 17.69 20.57
30.4 35.12 59.63 1.02 18.43 27.89 26.61 17.59 24.38 12.08 16.95 26.55 11.57 20.6 17.19 17.9 16.72 16.8 21.47 15.99 15.73 20.77
14.43 19.88 43.15 1.27 9.19 20.24 11.7 12.66 10.65 9.57 10.07 9.92 4.47 8.25 11.28 11.36 10.86 11.45 15.49 10.52 9.94 11.02
26.12 30.98 50.26 1.2 19.34 24.78 24.03 15.46 18.03 12.86 14.22 17.69 6.76 20.99 16.4 17.33 16.53 16.21 20.9 12.59 13.63 20.33
22.76 36.54 39.35 0.54 15.22 23.3 20.85 10.98 14.97 11.17 11.74 14.3 6.85 14.37 16.53 16.57 16.26 15.5 19.85 11.73 12.19 11.61
11.22 19.7 39.58 0.44 9.63 14.81 11.01 9.26 9.67 8.65 11.03 12.36 6.39 6.47 8.69 8.99 6.35 7.25 7.58 7.66 6.42 8.72
12.26 19.15 37.46 0.69 13.47 16.66 14.5 10.33 14.99 7.13 8.78 15.84 9.75 9.28 8.54 8.52 8.74 8.26 12.94 11.45 11.33 14.04
26.77 38.3 65.35 5.48 22.98 30.2 17.24 15.05 16.75 14.68 15.05 14.33 8.82 12.57 15.33 16.14 16.76 16.95 20.47 15.94 16.76 16.09
13.01 14.45 27.68 2.07 9.35 14.62 13.32 9.71 9.52 6.76 9.2 8.35 7.7 7.85 7.83 6.86 6.66 7.1 9.69 8.13 10.13 11.21
19.69 31.96 31.73 4.23 19.8 21.24 18.12 16.54 21.36 13.58 15.03 21.36 14.45 14.52 11.44 11.98 11.9 12.21 18.46 18.55 14.06 11.2
41.35 63.01 102.41 0.83 28.23 45.67 51.27 20.82 40.0 20.38 24.83 31.8 19.01 30.93 23.44 22.6 21.81 22.37 28.0 27.59 25.71 30.67
17.78 22.27 34.46 0.96 10.32 18.82 16.49 6.47 13.47 5.21 5.99 11.21 6.46 9.82 9.31 9.14 8.59 9.14 10.05 10.39 12.22 11.62
13.76 17.24 25.98 0.88 9.24 11.38 11.14 6.86 6.23 5.96 5.36 7.93 3.21 4.82 8.41 7.47 8.15 8.06 9.94 7.39 6.91 6.37
25.88 31.9 74.26 4.84 19.42 29.51 29.2 19.45 30.45 20.28 20.93 30.88 11.06 29.17 14.55 12.83 12.95 13.09 15.59 28.15 21.76 26.7
18.32 33.59 45.39 1.21 14.2 18.08 18.95 11.33 13.81 8.81 10.28 13.53 7.51 13.05 11.61 12.21 10.57 11.44 12.0 9.79 11.66 10.81
11.31 14.53 25.23 1.41 9.2 12.49 12.14 6.13 7.96 4.58 5.86 7.79 3.04 11.4 7.81 7.37 7.38 7.64 9.58 6.45 6.76 9.2
17.72 27.46 31.58 1.01 12.97 15.22 13.72 7.87 11.26 6.15 8.46 7.55 6.78 8.29 12.61 12.84 11.46 11.86 21.69 10.37 10.87 7.71
6.61 6.71 15.96 2.12 6.58 9.76 9.27 3.54 4.43 3.73 2.89 6.0 4.7 5.13 3.7 4.43 2.89 3.91 5.11 6.58 4.53 5.21
6.19 9.85 17.41 1.63 7.0 10.94 9.0 6.52 7.02 4.6 5.84 8.32 5.71 7.58 5.29 5.17 5.06 4.81 7.57 9.38 7.99 4.85
22.36 34.71 47.16 1.14 19.52 27.66 22.57 15.35 20.08 10.44 12.04 17.56 7.65 20.36 17.98 15.93 16.39 16.87 22.34 12.57 14.88 16.25
12.42 18.33 26.44 0.74 9.16 12.99 9.77 8.55 9.22 7.99 7.12 8.06 4.29 5.49 7.85 7.47 7.43 7.01 11.31 8.2 8.29 9.18
26.19 44.18 59.96 1.4 21.37 35.04 22.63 22.24 19.46 17.93 18.82 22.0 11.68 14.51 18.6 20.55 18.09 18.6 20.45 19.11 19.59 25.44
33.48 43.78 88.66 3.57 25.42 52.83 46.32 34.93 39.5 27.08 31.27 42.16 31.42 27.81 29.17 29.33 23.82 29.59 40.87 44.98 45.2 41.29
16.15 19.71 33.13 1.59 12.76 16.98 14.56 9.43 12.4 6.09 7.81 13.44 9.54 12.34 11.09 11.08 10.64 9.48 13.76 11.53 12.09 10.0
25.09 35.81 58.09 0.6 15.88 28.59 27.29 14.84 16.86 10.21 12.4 15.69 10.43 15.98 15.7 15.82 16.48 16.42 17.74 14.7 16.3 18.38
18.15 26.9 38.44 0.49 11.3 20.7 17.37 14.97 18.6 12.85 14.54 18.33 7.6 15.93 12.77 11.74 12.71 12.62 14.21 14.82 13.44 15.67
17.29 26.0 36.25 2.37 12.89 20.87 14.89 11.49 14.68 11.12 11.46 14.91 12.42 16.48 11.32 10.31 10.42 9.46 16.14 15.53 16.66 12.11
18.4 26.13 50.17 1.03 15.79 20.54 20.6 9.69 18.46 10.65 13.9 17.69 10.56 18.45 9.91 9.23 9.12 8.85 16.26 13.11 15.25 23.63
15.76 29.45 76.7 0.77 17.04 27.99 22.3 22.35 23.57 17.93 19.41 25.59 8.52 11.6 11.78 12.26 14.51 13.54 16.89 20.42 17.71 15.15
7.36 8.98 15.89 0.97 4.87 7.53 5.65 3.89 5.0 3.3 2.99 3.79 2.32 3.14 3.76 3.22 3.06 3.2 5.02 3.47 4.05 5.31
9.75 13.37 19.67 0.82 8.59 11.34 10.3 7.25 11.13 5.25 5.97 8.93 5.22 3.67 5.94 3.96 4.26 4.6 5.17 8.76 6.2 8.47
7.7 10.93 23.05 0.77 6.19 10.68 5.76 6.88 9.47 5.0 5.95 9.61 4.7 5.35 7.73 5.56 7.55 6.74 9.31 6.4 6.69 5.73
22.0 36.81 47.87 3.12 12.63 22.86 21.24 22.55 21.43 19.37 20.76 17.7 13.75 14.4 13.79 12.53 14.32 13.18 15.11 21.98 20.24 21.66
23.58 30.24 38.88 1.31 17.44 23.49 19.4 16.48 17.27 14.06 13.37 16.94 7.8 16.16 16.76 16.92 16.12 16.36 18.95 12.69 13.7 21.01
19.75 28.16 41.63 0.71 17.43 20.35 15.48 10.79 15.24 7.96 8.68 14.67 6.41 15.44 14.87 14.68 14.6 13.67 21.18 12.6 13.53 15.14
28.44 39.22 58.2 0.68 20.68 30.93 25.19 22.05 31.25 17.01 20.2 31.41 16.31 15.24 15.3 15.43 15.65 16.22 19.52 24.28 24.21 20.21
8.65 13.01 33.73 0.91 8.18 12.76 15.06 8.0 11.52 6.05 7.91 11.52 6.49 6.92 3.83 4.39 4.34 4.41 5.83 8.48 7.47 12.05
45.08 47.26 108.51 9.07 30.57 46.41 34.61 31.55 41.92 26.06 28.43 41.49 23.26 27.04 29.26 29.65 27.82 26.69 34.54 31.34 27.52 36.8
15.97 26.8 52.0 0.6 11.94 17.41 11.58 15.44 13.06 12.43 12.15 13.5 7.8 7.43 9.46 8.35 9.14 9.2 10.41 11.41 12.4 10.68
11.32 15.78 27.19 0.94 6.13 16.03 11.01 15.0 13.55 17.49 15.23 18.75 5.16 8.08 6.7 5.63 6.29 6.03 7.16 10.06 9.4 14.73
50.3 61.81 119.85 3.56 33.79 51.7 29.97 30.79 47.93 31.03 29.74 53.43 24.88 29.35 30.99 29.41 28.49 26.31 34.75 44.07 42.91 35.7
48.62 71.19 100.51 6.29 47.16 55.82 39.45 31.54 43.49 33.4 33.46 41.05 26.26 36.19 32.32 31.17 31.25 29.4 43.52 39.05 39.1 35.85
33.64 53.58 67.74 2.58 28.57 28.75 22.96 17.1 25.16 16.35 18.58 28.11 22.15 21.37 23.29 23.58 20.35 18.98 18.07 22.08 23.65 14.6
30.19 48.71 65.14 2.1 27.61 27.69 26.07 17.44 20.7 14.3 17.19 18.47 11.06 19.45 22.41 22.29 21.13 20.06 30.71 16.48 18.73 17.97
23.61 24.2 62.32 1.91 13.14 27.14 24.18 19.73 29.02 17.47 16.47 27.62 15.08 22.6 9.9 8.34 8.94 9.87 16.9 15.93 19.56 29.55
28.49 47.47 50.66 0.5 21.17 26.85 19.95 14.04 18.1 13.86 15.78 20.23 11.9 14.08 17.56 19.59 19.33 19.13 21.57 16.25 17.8 18.03
10.21 15.47 25.59 0.24 2.87 12.17 11.79 5.78 9.94 4.69 5.08 5.07 7.2 4.46 4.33 3.78 4.54 4.03 5.61 7.13 11.9 6.38
21.32 26.25 59.48 2.1 10.67 28.94 16.05 17.63 26.25 16.61 17.1 22.23 12.22 10.55 10.88 10.26 9.71 9.18 12.15 16.35 17.37 23.53
21.31 26.99 37.48 0.86 12.77 22.83 19.4 15.28 12.68 12.56 14.2 12.21 9.7 10.8 12.36 12.04 11.72 12.77 14.85 11.2 11.04 19.78
10.89 14.69 24.53 0.84 3.14 11.86 9.89 6.74 7.09 4.78 5.44 7.67 4.62 5.45 5.41 5.95 5.82 6.33 5.23 7.4 8.16 9.07
32.61 45.02 62.31 2.66 18.79 34.92 35.43 26.41 33.71 21.12 29.46 25.96 17.47 12.69 17.13 17.7 17.64 18.88 22.08 25.9 29.45 25.63
33.41 46.65 57.03 1.4 22.08 29.33 23.73 19.16 19.8 15.09 19.98 16.49 8.51 10.42 17.01 18.16 17.74 17.04 22.87 16.62 17.37 15.98
7.55 11.85 15.9 0.28 6.64 7.5 6.86 4.7 6.61 3.98 4.85 4.73 5.81 2.88 3.9 4.15 3.96 4.88 6.59 6.7 7.54 5.35
13.05 18.28 30.25 1.53 12.06 13.85 12.15 9.13 13.67 10.16 10.87 14.79 8.47 10.66 7.98 8.1 8.7 8.54 11.16 9.9 10.63 13.23
48.81 58.42 122.8 2.06 32.05 43.8 41.06 37.19 31.37 29.42 39.51 27.02 16.32 19.72 24.8 24.02 24.36 23.56 27.87 26.4 24.71 38.23
18.29 31.23 38.78 1.84 16.91 25.19 16.85 16.87 18.49 14.35 14.61 16.69 11.4 14.47 13.42 12.93 13.89 13.67 18.51 17.09 17.48 13.94
10.87 13.5 21.2 0.38 6.39 9.74 8.23 5.51 7.92 6.36 7.15 7.76 4.26 3.08 6.89 6.59 5.89 7.18 3.82 5.23 5.11 8.15
23.58 37.27 47.85 1.1 16.69 26.69 20.16 17.28 19.21 12.88 14.82 18.49 8.99 15.54 18.11 17.74 17.98 19.32 22.39 14.84 16.68 16.82
42.41 52.53 81.25 0.79 24.87 44.46 41.81 35.67 34.41 27.73 31.27 32.62 24.05 37.48 28.65 29.11 28.26 30.45 37.92 31.49 37.45 28.56
17.03 35.93 61.74 1.0 12.43 22.96 12.89 10.98 26.53 9.39 9.8 29.07 10.13 14.86 8.64 7.02 8.57 9.02 14.02 17.76 16.56 17.63
34.07 49.66 42.85 2.26 22.84 31.99 27.73 30.3 27.13 25.72 33.51 26.94 18.45 13.48 17.16 14.53 12.55 13.16 40.05 27.41 21.76 19.39
77.35 88.29 176.16 5.42 29.64 71.54 42.97 56.96 96.56 54.16 54.4 111.32 33.95 64.48 28.41 36.57 32.27 31.56 21.38 64.8 63.44 72.66
31.69 33.08 55.97 1.72 21.25 30.59 27.61 15.96 26.34 15.02 16.61 24.63 16.07 22.76 15.39 17.03 14.66 16.27 22.98 25.4 23.23 18.68
46.41 84.99 107.93 2.73 35.96 67.31 54.76 59.75 65.61 52.83 63.68 61.02 42.05 31.66 27.49 27.25 30.14 28.96 32.93 43.71 44.4 56.15
30.08 39.28 49.65 2.86 18.32 23.86 14.4 14.18 17.67 12.45 12.33 12.46 6.62 14.14 16.95 14.83 15.58 16.03 21.99 14.0 13.36 8.97
49.53 67.3 115.25 6.59 38.78 54.33 57.74 32.07 43.87 27.09 31.07 40.04 27.59 33.19 33.52 33.64 32.31 31.08 45.92 32.26 33.2 44.7
16.2 20.16 50.54 0.67 11.6 19.27 16.46 12.53 15.76 10.51 11.25 13.29 8.61 8.21 8.9 8.22 8.14 8.01 10.41 13.48 13.91 16.06
42.08 54.67 89.81 2.82 24.69 42.41 52.26 23.05 43.29 19.45 22.77 35.8 23.44 31.31 25.45 26.4 26.32 27.6 30.6 29.41 29.21 33.02
8.18 16.65 31.42 1.01 7.88 11.84 7.57 9.69 9.2 7.36 10.02 9.98 6.26 6.97 5.97 5.92 5.72 5.2 6.14 8.57 9.41 8.01
5.27 6.47 8.02 0.37 2.88 4.34 4.6 3.22 3.27 2.45 3.18 2.65 2.06 1.81 2.5 1.95 2.51 2.37 2.7 2.94 2.76 3.15
25.21 37.56 46.52 0.58 17.57 22.48 20.35 15.66 17.19 10.76 13.19 17.49 9.67 11.44 14.98 15.45 15.11 16.06 17.78 14.72 15.26 11.0
18.61 26.96 34.67 0.84 15.89 15.33 10.56 11.38 10.55 9.69 9.67 12.23 7.61 10.39 10.38 10.7 10.51 11.28 15.83 14.0 11.98 7.41
6.9 11.47 16.58 1.62 7.59 11.01 9.98 2.36 11.09 3.87 5.66 9.42 4.16 6.43 5.62 6.29 3.48 5.45 3.37 5.43 9.23 4.75
19.96 29.1 41.34 0.56 15.39 17.61 14.07 10.16 11.34 8.57 8.78 10.98 5.45 8.78 9.86 11.41 11.09 11.03 13.01 10.3 10.35 9.41
41.63 50.23 82.04 1.53 27.28 33.56 29.61 21.42 30.56 14.61 20.13 28.92 16.11 17.86 19.09 24.31 21.48 20.98 25.73 21.63 24.07 20.14
21.88 25.34 47.06 1.85 14.24 19.62 19.0 12.24 15.84 11.16 11.6 13.82 5.36 12.06 12.26 12.35 12.9 12.15 14.92 11.66 10.82 13.98

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)