Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.56 0.47 0.28 0.03 0.3 0.84 1.0 0.46 0.59 0.45 0.43 0.32 0.28 0.5 0.63 0.49 0.78 0.47 0.47 0.42 0.62 0.58
0.52 0.5 0.67 0.09 0.63 0.98 1.0 0.45 0.79 0.61 0.58 0.77 0.42 0.67 0.45 0.45 0.47 0.47 0.58 0.76 0.68 0.7
0.52 0.56 0.5 0.09 0.29 0.84 1.0 0.31 0.3 0.3 0.26 0.33 0.14 0.66 0.58 0.36 0.6 0.51 0.4 0.27 0.26 0.87
0.38 0.27 0.41 0.1 0.31 1.0 0.93 0.66 0.78 0.56 0.73 0.71 0.8 0.43 0.32 0.25 0.32 0.29 0.33 0.63 0.55 0.65
0.37 0.25 0.05 0.08 0.24 0.71 1.0 0.35 0.28 0.33 0.3 0.37 0.11 0.73 0.48 0.54 0.59 0.46 0.26 0.46 0.51 0.37
0.25 0.61 0.72 0.1 0.28 0.88 0.59 0.45 0.51 0.34 0.38 0.72 0.34 0.81 0.65 0.46 0.69 0.64 1.0 0.52 0.51 0.65
0.79 0.68 0.59 0.02 0.56 0.77 1.0 0.34 0.49 0.28 0.36 0.53 0.25 0.56 0.46 0.45 0.46 0.44 0.64 0.45 0.46 0.71
0.42 0.45 0.69 0.21 0.45 0.78 0.98 0.3 0.33 0.31 0.25 0.3 0.15 0.55 0.44 0.49 0.52 0.49 0.61 0.26 0.26 1.0
0.37 0.12 0.04 0.01 0.11 0.91 1.0 0.34 0.93 0.21 0.38 0.76 0.77 0.46 0.18 0.16 0.17 0.19 0.15 0.97 0.63 0.26
0.72 0.84 0.07 0.07 0.49 0.96 0.85 0.68 0.84 0.55 0.51 1.0 0.28 0.76 0.46 0.45 0.58 0.5 0.51 0.62 0.5 0.71
0.09 0.31 0.25 0.16 0.37 1.0 0.42 0.2 0.63 0.45 0.72 0.64 0.28 0.33 0.23 0.21 0.27 0.24 0.22 0.51 0.5 0.3
0.12 0.09 0.08 0.08 0.34 0.68 0.37 0.07 1.0 0.16 0.58 0.62 0.22 0.44 0.02 0.05 0.17 0.18 0.37 0.11 0.13 0.63
0.38 0.64 1.0 0.02 0.06 0.77 0.15 0.46 0.4 0.29 0.45 0.58 0.71 0.8 0.37 0.42 0.37 0.43 0.46 0.5 0.38 0.16
0.4 0.24 0.23 0.01 0.43 0.82 1.0 0.42 0.78 0.42 0.53 0.61 0.61 0.23 0.61 0.56 0.54 0.52 0.39 0.54 0.57 0.71
0.43 0.54 0.58 0.05 0.22 1.0 0.84 0.6 0.58 0.6 0.61 0.56 0.46 0.42 0.36 0.37 0.41 0.35 0.31 0.47 0.42 0.72
0.38 0.54 0.24 0.18 0.31 0.92 0.3 0.53 0.65 0.04 0.31 0.54 0.3 1.0 0.74 0.59 0.62 0.64 0.41 0.18 0.08 0.73
0.36 0.36 0.06 0.11 0.2 1.0 0.8 0.4 0.4 0.3 0.34 0.47 0.54 0.6 0.59 0.59 0.64 0.52 0.72 0.35 0.55 0.17
0.6 0.69 0.21 0.07 0.37 0.87 1.0 0.49 0.4 0.36 0.6 0.4 0.36 0.3 0.53 0.5 0.47 0.57 0.53 0.56 0.5 0.7
0.39 0.47 1.0 0.03 0.14 0.66 0.7 0.19 0.3 0.15 0.15 0.22 0.22 0.66 0.33 0.3 0.41 0.34 0.33 0.18 0.23 0.72
0.31 0.43 0.63 0.2 0.27 0.99 1.0 0.44 0.16 0.41 0.42 0.61 0.39 0.58 0.74 0.67 0.87 0.65 0.59 0.42 0.75 0.28
0.31 0.39 0.65 0.02 0.22 0.5 0.45 0.38 0.44 0.27 0.32 0.38 0.17 0.24 0.17 0.2 0.19 0.19 0.24 0.28 0.26 1.0
0.34 0.43 0.29 0.06 0.24 0.76 0.18 0.49 0.28 0.29 0.23 0.16 0.18 0.47 0.8 0.93 1.0 0.82 0.59 0.24 0.16 0.55
0.71 0.44 0.15 0.03 0.28 1.0 0.94 0.46 0.65 0.3 0.43 0.55 0.37 0.38 0.4 0.41 0.39 0.38 0.33 0.39 0.38 0.73
0.53 0.3 0.09 0.03 0.49 0.92 0.8 0.61 0.81 0.57 0.68 0.76 0.26 0.95 0.27 0.21 0.23 0.24 0.29 0.38 0.31 1.0
0.72 0.53 1.0 0.32 0.38 0.91 0.59 0.38 0.56 0.12 0.27 0.72 0.43 0.16 0.85 0.69 0.8 0.87 0.42 0.11 0.58 0.68
0.8 0.67 0.67 0.02 0.53 0.98 1.0 0.4 0.71 0.3 0.4 0.59 0.42 0.68 0.47 0.49 0.46 0.47 0.63 0.44 0.48 0.63
0.69 0.61 0.43 0.01 0.62 0.76 1.0 0.43 0.73 0.41 0.45 0.62 0.36 0.63 0.4 0.44 0.42 0.41 0.53 0.41 0.45 0.92
0.53 0.11 0.0 0.02 0.0 0.72 1.0 0.2 0.75 0.09 0.33 0.41 0.39 0.3 0.39 0.5 0.46 0.5 0.1 0.15 0.17 0.15
0.69 0.43 0.0 0.01 0.03 0.93 1.0 0.38 0.76 0.26 0.3 0.66 0.25 0.41 0.64 0.65 0.61 0.72 0.55 0.31 0.3 0.38
0.36 0.06 0.0 0.26 0.04 0.93 1.0 0.21 0.4 0.09 0.13 0.19 0.19 0.45 0.46 0.26 0.46 0.18 0.15 0.24 0.54 0.21
0.32 0.23 0.0 0.03 0.09 1.0 0.61 0.19 0.88 0.7 0.8 0.5 0.23 0.17 0.51 0.45 0.48 0.54 0.91 0.14 0.14 0.0
0.13 0.11 0.0 0.02 0.03 0.92 0.37 0.21 0.67 0.35 0.4 0.47 0.14 0.3 0.6 0.49 0.5 0.55 1.0 0.29 0.3 0.0
0.44 0.23 0.12 0.04 0.18 0.62 0.4 0.2 0.3 0.13 0.2 0.43 0.25 1.0 0.39 0.35 0.4 0.38 0.3 0.17 0.26 0.53
0.19 0.36 0.31 0.62 0.16 0.72 0.3 0.17 0.28 0.2 0.31 0.27 0.09 1.0 0.45 0.42 0.63 0.9 0.62 0.2 0.49 0.35
0.16 0.01 0.0 0.03 0.33 0.88 0.81 0.35 0.93 0.55 0.79 1.0 0.38 0.17 0.17 0.2 0.12 0.24 0.19 0.16 0.07 0.92
0.12 0.11 0.0 0.03 0.0 0.36 0.18 0.17 0.1 0.17 0.06 0.22 0.03 0.04 0.73 0.57 0.9 0.79 0.18 0.11 0.13 1.0
0.45 0.45 0.33 0.02 0.35 0.81 0.69 0.6 0.69 0.57 0.53 0.74 0.29 0.49 0.27 0.27 0.28 0.32 0.42 0.5 0.51 1.0
0.07 0.1 0.04 0.06 0.13 0.99 0.51 0.33 0.52 0.24 0.26 0.69 0.24 0.8 0.1 0.1 0.11 0.06 0.17 0.38 0.46 1.0
0.57 0.19 0.61 0.23 0.11 1.0 0.19 0.69 0.77 0.34 0.5 0.96 0.55 0.41 0.24 0.65 0.96 0.74 0.57 0.73 0.78 0.06
0.79 0.74 0.52 0.01 0.17 1.0 0.79 0.52 0.66 0.6 0.46 0.7 0.33 0.44 0.46 0.4 0.36 0.31 0.37 0.31 0.32 0.42
0.32 0.12 0.0 0.02 0.0 0.66 0.14 0.24 1.0 0.25 0.24 0.83 0.13 0.6 0.01 0.03 0.08 0.05 0.22 0.19 0.17 0.15
0.77 0.63 0.58 0.02 0.55 0.74 1.0 0.33 0.52 0.24 0.35 0.51 0.3 0.48 0.38 0.38 0.41 0.37 0.59 0.44 0.46 0.57
0.9 0.38 0.46 0.33 0.68 1.0 0.74 0.48 0.24 0.24 0.23 0.51 0.23 0.93 0.58 0.58 0.56 0.59 0.68 0.55 0.13 0.81
0.59 0.6 1.0 0.02 0.36 0.74 0.69 0.48 0.47 0.31 0.35 0.4 0.22 0.23 0.46 0.51 0.47 0.47 0.46 0.4 0.43 0.73
0.81 0.7 0.43 0.05 0.56 0.76 1.0 0.41 0.63 0.32 0.38 0.54 0.32 0.59 0.57 0.53 0.55 0.53 0.73 0.47 0.46 0.75
0.29 0.09 0.03 0.01 0.22 0.64 0.64 0.62 0.36 0.52 0.47 0.36 0.21 0.39 0.24 0.25 0.34 0.26 0.51 0.34 0.25 1.0
0.71 0.26 0.04 0.17 0.06 0.7 0.73 0.22 0.21 0.22 0.26 0.34 0.15 1.0 0.45 0.44 0.29 0.61 0.26 0.25 0.5 0.85
0.18 0.17 0.1 0.08 0.07 0.54 0.21 0.06 0.16 0.0 0.12 0.19 0.34 0.92 0.87 0.93 1.0 0.93 0.32 0.11 0.07 0.59
0.11 0.08 1.0 0.2 0.0 0.62 0.01 0.26 0.41 0.28 0.16 0.21 0.71 0.1 0.22 0.1 0.2 0.15 0.24 0.34 0.22 0.0
0.21 0.29 0.47 0.02 0.15 0.54 0.01 0.42 0.61 0.4 0.38 0.6 0.31 0.28 0.23 0.28 0.25 0.22 0.18 0.33 0.32 1.0
0.77 0.85 0.15 0.14 0.41 0.98 0.53 0.48 0.74 0.82 0.6 0.37 0.2 0.6 0.88 1.0 0.88 0.87 0.8 0.57 0.5 0.39
0.0 0.0 0.0 0.48 0.28 1.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.27 0.03 0.0 0.21 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.16
0.37 0.2 0.02 0.04 0.3 0.39 0.12 0.16 0.35 0.2 0.18 0.26 0.19 1.0 0.79 0.65 0.72 0.71 0.47 0.28 0.31 0.34
1.0 0.19 0.38 0.14 0.01 0.79 0.71 0.14 0.55 0.12 0.09 0.53 0.31 0.26 0.33 0.37 0.48 0.17 0.07 0.11 0.32 0.28
0.32 0.53 1.0 0.02 0.27 0.54 0.36 0.17 0.28 0.14 0.18 0.26 0.23 0.15 0.27 0.28 0.26 0.28 0.34 0.26 0.29 0.28
0.5 0.62 1.0 0.04 0.34 0.83 0.65 0.32 0.58 0.37 0.38 0.35 0.32 0.38 0.46 0.46 0.51 0.47 0.62 0.34 0.38 0.61
0.26 0.23 0.38 0.07 0.36 0.5 0.46 0.4 0.49 0.45 0.43 0.42 0.13 1.0 0.5 0.46 0.57 0.46 0.57 0.36 0.39 0.77
0.73 1.0 0.33 0.06 0.23 0.82 0.67 0.27 0.67 0.39 0.5 0.41 0.32 0.46 0.62 0.61 0.57 0.62 0.46 0.66 0.53 0.29
0.48 0.44 1.0 0.1 0.44 0.62 0.52 0.38 0.35 0.15 0.23 0.3 0.13 0.4 0.39 0.34 0.43 0.43 0.34 0.34 0.37 0.59
0.75 0.87 0.71 0.02 0.52 1.0 0.91 0.62 0.72 0.47 0.55 0.56 0.43 0.48 0.56 0.59 0.59 0.44 0.53 0.53 0.59 0.44
0.37 0.32 0.08 0.02 0.13 0.44 0.43 0.15 0.2 0.17 0.16 0.27 0.09 0.14 0.31 0.24 0.42 0.28 0.36 0.16 0.23 1.0
0.51 0.22 0.09 0.01 0.23 0.81 0.7 0.35 0.62 0.28 0.42 0.64 0.64 1.0 0.37 0.31 0.42 0.37 0.51 0.45 0.41 0.33
0.52 0.64 0.59 0.02 0.52 0.86 0.62 0.46 0.49 0.33 0.34 0.49 0.18 1.0 0.56 0.55 0.63 0.52 0.63 0.39 0.44 0.42
0.03 0.13 0.02 0.01 0.01 0.75 0.33 0.95 0.42 0.64 1.0 0.24 0.05 0.06 0.01 0.05 0.02 0.02 0.04 0.02 0.01 0.66
0.23 0.26 0.4 0.17 0.21 0.67 0.56 0.13 0.46 0.15 0.27 0.24 0.23 0.92 0.33 0.34 0.64 0.69 0.62 0.36 1.0 0.52
0.39 1.0 0.09 0.0 0.29 0.81 0.52 0.32 0.57 0.5 0.36 0.36 0.18 0.21 0.58 0.43 0.42 0.47 0.44 0.37 0.56 0.28
0.47 0.46 0.08 0.15 0.23 0.93 0.64 0.3 0.33 0.26 0.33 0.29 0.08 1.0 0.81 0.79 0.8 0.65 0.97 0.4 0.39 0.46
0.68 0.67 0.19 0.02 0.21 1.0 0.84 0.37 0.73 0.4 0.46 0.58 0.17 0.47 0.79 0.78 0.69 0.72 0.8 0.56 0.5 0.4
0.59 0.33 0.1 0.09 0.25 1.0 0.7 0.47 0.56 0.47 0.41 0.53 0.31 0.44 0.34 0.33 0.32 0.3 0.37 0.3 0.39 0.59
0.59 0.94 1.0 0.03 0.45 0.8 0.91 0.35 0.25 0.19 0.22 0.29 0.17 0.92 0.5 0.51 0.62 0.58 0.59 0.28 0.34 0.68
0.51 0.36 0.11 0.02 0.42 1.0 0.93 0.68 0.83 0.37 0.6 0.58 0.49 0.4 0.51 0.5 0.53 0.52 0.5 0.64 0.68 0.57
0.55 0.33 0.07 0.03 0.32 0.89 1.0 0.65 0.58 0.43 0.48 0.6 0.29 0.57 0.46 0.47 0.47 0.48 0.38 0.51 0.52 0.74
0.75 0.66 0.27 0.02 0.61 0.78 0.92 0.38 0.83 0.56 0.44 1.0 0.28 0.48 0.5 0.48 0.51 0.49 0.55 0.38 0.41 0.56
0.77 1.0 0.11 0.02 0.39 0.84 0.7 0.41 0.49 0.44 0.41 0.42 0.21 0.38 0.71 0.75 0.73 0.6 0.42 0.4 0.42 0.44
0.73 0.6 0.2 0.02 0.42 0.92 0.89 0.56 0.46 0.46 0.64 0.43 0.27 0.38 0.46 0.4 0.45 0.39 0.62 0.43 0.38 1.0
0.11 0.05 0.0 0.01 0.03 0.91 0.3 0.17 0.58 0.26 0.41 0.56 1.0 0.13 0.16 0.09 0.08 0.13 0.06 0.3 0.51 0.26
0.16 0.88 0.39 0.1 0.02 0.98 0.02 0.67 0.74 0.14 0.31 0.18 0.57 0.37 0.18 0.14 1.0 0.53 0.07 0.36 0.85 0.14
0.06 0.13 0.82 0.03 0.07 0.5 0.08 0.37 0.36 0.49 0.7 0.81 0.41 0.12 0.16 0.05 0.11 0.22 0.27 0.61 0.32 1.0
0.13 0.21 0.04 0.03 0.16 0.33 0.46 0.16 0.28 0.27 0.11 0.22 0.07 1.0 0.15 0.24 0.23 0.23 0.15 0.21 0.29 0.31

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)