Heatmap: Cluster_143 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
1.24 1.67 1.63 -3.91 -3.82 0.15 0.12 -0.81 -0.72 -1.11 -0.95 -0.87 -2.63 -0.27 0.08 0.31 0.0 0.34 -0.26 -0.59 -0.63 -0.72
0.41 1.04 1.72 -4.55 -0.65 -0.17 0.48 -0.1 0.55 0.31 0.65 0.29 -1.19 -0.05 -1.01 -0.94 -1.26 -1.38 -0.71 -0.91 -0.8 -0.01
0.86 1.32 1.4 -4.41 -0.5 0.24 0.39 -0.36 0.06 0.06 -0.19 0.03 -1.63 -0.21 -0.48 -0.38 -0.47 -0.5 -0.6 -0.59 -0.44 -0.16
0.57 0.46 1.42 -4.05 -0.84 0.18 0.81 0.14 0.28 0.26 0.37 0.25 -0.69 -0.38 -0.97 -0.91 -0.87 -0.9 -1.04 -0.18 -0.36 0.39
1.36 2.94 2.29 -4.64 -5.54 -2.27 0.59 -0.12 -2.16 -0.59 -0.65 -3.12 -2.79 -1.94 -3.67 -3.7 -3.33 -3.36 -2.51 -0.92 -1.24 -0.61
1.28 2.38 2.2 -2.73 -1.91 -0.39 -0.73 -0.39 -0.95 -0.49 -0.59 -0.51 -1.33 -1.14 -0.88 -0.8 -1.31 -1.14 -1.25 -0.9 -0.81 -1.89
0.1 1.8 1.13 -3.48 0.35 0.29 0.66 -0.63 0.46 0.26 0.99 -0.13 -1.86 -0.64 -1.02 -1.15 -0.84 -1.14 -1.44 -1.31 -1.64 0.03
0.27 1.83 1.81 -4.42 -1.22 -0.21 0.09 -0.05 -0.24 -0.01 0.04 -0.12 -2.09 -1.48 -0.59 -0.4 -0.28 0.04 0.16 -0.9 -1.1 -0.75
0.01 0.31 1.05 -3.93 -0.64 0.05 0.3 -0.05 0.31 0.31 0.16 0.28 -0.62 0.21 -0.55 -0.46 -0.57 -0.54 -0.18 -0.54 -0.57 1.07
1.44 1.7 1.2 -4.79 -1.64 0.03 0.15 -0.37 -0.41 -0.33 -0.42 -0.98 -1.79 -0.4 -0.42 -0.37 -0.18 -0.28 -0.02 -0.37 -0.58 -0.04
0.31 1.17 1.96 -1.97 -0.9 -0.0 -0.11 0.21 0.51 0.11 0.64 0.1 -0.54 0.14 -1.21 -0.96 -1.07 -0.76 -1.54 -1.4 -1.02 -0.79
0.5 0.8 0.96 -5.23 -0.42 0.26 0.6 0.1 0.22 -0.14 0.1 0.12 -0.84 -0.11 -0.28 -0.18 -0.22 -0.26 -0.27 -0.46 -0.36 -0.18
-0.63 0.52 1.83 -3.47 -0.38 -0.04 0.14 -0.35 0.42 0.04 0.14 0.55 -0.74 -0.16 -1.01 -0.9 -0.98 -1.01 -0.38 -0.02 0.14 0.42
-0.09 -0.21 1.38 -4.78 -0.75 0.04 0.24 0.2 0.34 0.46 0.16 0.5 -0.92 0.64 -0.86 -0.88 -0.66 -0.85 0.11 -0.33 -0.39 0.52
-0.06 0.53 1.85 -5.15 -0.55 0.1 0.17 -0.01 0.29 0.0 0.43 0.23 -1.02 0.13 -0.93 -1.04 -0.93 -0.85 -0.29 -0.09 -0.29 0.13
0.41 0.5 1.02 -2.51 -0.34 0.23 0.65 0.09 0.18 0.5 0.17 -0.27 -1.28 -0.22 -0.24 -0.28 -0.33 -0.47 -0.25 -0.48 -0.66 0.37
0.55 1.47 0.37 -4.96 -2.24 -0.26 -0.02 0.18 0.04 0.4 0.19 0.31 -2.45 -0.99 -0.32 -0.12 -0.0 0.08 0.89 -0.37 -0.37 -0.54
0.52 0.68 1.04 -3.73 -0.27 0.28 0.88 -0.61 0.49 -0.06 -0.08 0.21 -0.88 -0.15 -0.32 -0.37 -0.37 -0.39 -0.26 -0.69 -0.38 0.1
0.71 1.12 0.77 -4.82 -0.49 -0.17 -0.07 0.28 -0.08 -0.19 -0.32 0.15 -0.96 0.32 -0.31 -0.44 -0.3 -0.47 0.2 -0.22 -0.25 0.35
0.61 1.02 1.48 -3.33 -0.92 0.02 0.33 -0.03 0.52 0.43 0.18 0.47 -1.38 -0.04 -0.9 -0.94 -0.92 -0.88 -0.58 -0.58 -0.71 0.09
0.31 0.32 1.13 -3.08 -0.26 0.37 0.87 -0.3 0.16 0.15 0.09 -0.17 -1.15 0.01 -0.39 -0.35 -0.37 -0.33 -0.21 -0.61 -0.35 0.47
1.09 1.23 0.79 -4.96 -0.43 0.13 -0.1 0.11 -0.12 -0.01 0.14 -0.05 -1.08 -0.01 -0.25 -0.18 -0.2 -0.35 -0.31 -0.45 -0.41 -0.35
0.5 0.56 0.65 -2.29 -0.49 0.34 0.72 -0.58 0.33 0.03 0.09 0.12 -0.97 -0.32 -0.31 -0.36 -0.43 -0.44 -0.03 -0.39 -0.47 0.82
0.49 0.5 1.06 -4.29 -1.33 0.29 0.32 0.22 -0.13 -0.21 -0.28 -0.22 -1.53 1.01 -0.34 -0.37 0.04 -0.5 -0.42 -0.15 -0.25 0.48
0.5 0.59 1.56 -4.34 -0.03 0.1 0.23 0.74 -0.16 0.53 0.83 -0.24 -1.08 -0.53 -0.89 -0.98 -0.93 -1.17 -0.89 -0.39 -0.46 0.01
0.22 1.0 1.27 -4.21 0.37 0.09 0.2 0.22 0.15 0.62 0.73 0.09 -1.31 -0.49 -0.9 -0.67 -0.87 -0.9 -0.35 -0.69 -1.02 0.08
0.95 0.98 1.38 -3.66 -0.93 0.14 0.95 -0.57 0.2 -0.69 -0.38 0.08 -0.77 0.19 -0.79 -0.89 -0.78 -0.81 -1.02 -0.41 -0.26 0.6
0.1 1.09 1.23 -4.65 -2.59 -0.02 0.22 -0.13 -0.02 0.81 0.64 0.13 -0.75 0.06 -0.8 -0.46 -0.46 -0.62 0.0 -0.56 -0.49 0.12
1.3 1.76 1.28 -3.72 -1.32 -0.27 0.24 -0.12 -0.59 0.07 -0.76 -0.34 -1.32 -0.46 -0.77 -1.34 -0.66 -0.74 -0.46 -0.47 -0.29 0.69
-0.31 2.42 3.14 -1.71 - -1.3 -1.15 -3.52 - -3.15 -3.85 - 0.68 -1.88 -1.02 -2.64 -0.62 -1.19 - -0.4 -0.44 -1.07
1.18 1.38 1.26 -3.1 -1.16 0.05 -0.03 0.08 -0.02 -0.24 -0.1 -0.4 -0.92 -0.25 -0.27 -0.55 -0.56 -0.41 -0.31 -0.17 0.01 -0.82
0.86 1.31 0.94 -3.27 -1.18 -0.36 -0.16 0.03 0.33 0.41 0.34 0.46 -1.95 0.46 -0.59 -0.47 -0.63 -0.61 -0.13 -0.56 -0.69 -0.35
0.78 1.52 1.08 -4.71 -1.77 0.06 -0.06 0.31 -0.06 0.2 0.37 0.05 -1.35 -0.04 -0.6 -0.39 -0.28 -0.43 -0.43 -0.48 -0.62 -0.28
0.37 0.72 1.66 -2.48 -0.7 0.11 0.79 -0.46 0.57 -0.09 0.07 0.37 -0.77 0.43 -1.07 -0.98 -1.27 -1.23 -0.57 -0.67 -0.87 0.25
0.69 0.86 1.63 -2.14 -0.71 0.14 0.54 -0.41 0.54 -0.13 -0.26 0.29 -1.61 -0.37 -0.56 -0.48 -0.61 -0.61 -0.42 -0.84 -0.8 0.28
0.61 1.36 1.24 -2.9 -1.27 0.13 0.29 -0.14 0.18 0.23 0.73 0.01 -0.95 -0.09 -0.61 -0.89 -0.66 -0.81 -0.8 -0.22 -0.46 -0.33
0.5 0.76 1.79 -4.64 -1.03 -0.09 0.13 0.43 0.19 0.46 0.83 -0.15 -1.35 -0.28 -0.99 -0.79 -0.74 -0.78 -0.69 -0.63 -0.7 -0.04
0.91 2.22 2.75 -3.88 -2.94 -1.07 0.24 -1.0 -0.88 -1.02 -1.36 -1.1 -1.33 -1.08 -1.32 -1.4 -1.43 -1.74 -2.35 -0.75 -1.26 -0.03
0.52 0.91 0.14 -3.56 0.0 0.25 0.41 0.0 -0.03 0.15 0.23 -0.12 -1.0 0.14 -0.13 -0.09 0.02 -0.09 -0.06 -0.33 -0.51 -0.09
0.97 1.29 0.65 -6.09 -0.53 -0.14 -0.03 0.43 -0.24 0.34 0.41 -0.33 -2.24 0.26 -0.3 -0.34 -0.24 -0.45 -0.2 -0.32 -0.53 -0.17
0.73 1.68 1.65 -4.93 -0.98 -0.08 0.11 -0.56 0.54 0.18 0.48 0.31 -1.1 -0.7 -1.04 -0.96 -0.93 -1.07 -0.38 -0.81 -0.99 -0.71
0.57 0.86 0.55 -4.23 -0.75 -0.14 0.06 0.13 0.1 -0.11 -0.15 0.23 -0.72 -0.14 -0.2 -0.01 -0.07 -0.12 0.25 0.12 0.07 -0.15
0.5 1.37 1.35 -3.13 -1.65 0.27 0.1 0.22 0.12 0.13 0.1 -0.06 -1.24 -0.59 -0.2 -0.28 -0.24 -0.4 -0.31 -0.8 -0.76 0.01
1.56 1.77 0.7 -1.88 0.08 0.32 -0.55 0.16 -0.35 0.14 0.06 -0.72 -2.27 -1.77 -0.68 -0.4 -0.71 -0.52 -1.24 -0.01 -0.03 -0.9
0.43 0.69 1.33 -2.64 -0.39 0.04 0.5 -0.48 0.54 0.1 0.36 0.36 -0.59 -0.37 -0.57 -0.46 -0.42 -0.58 -0.32 -0.36 -0.32 -0.49
0.12 2.62 2.89 -1.83 -5.72 -2.42 -2.15 -0.49 -0.67 0.16 0.47 -0.46 -5.0 -2.55 -2.63 -4.39 -4.75 -3.2 - -0.44 -0.84 -2.35
-0.11 1.65 1.73 -4.2 0.25 -0.13 -0.09 -1.0 0.62 0.31 0.83 0.22 -2.06 -0.87 -0.7 -0.95 -0.98 -1.04 -0.84 -1.13 -1.05 -0.15
1.16 2.39 1.42 -3.4 -2.47 -1.3 -0.76 -0.14 -0.74 0.63 0.64 -0.77 -1.83 0.09 -1.6 -1.55 -0.8 -1.56 -0.59 -0.53 -1.25 -0.57
0.5 0.59 0.65 -3.79 -0.6 -0.05 -0.02 0.39 0.25 0.0 0.21 0.31 -0.41 0.12 -0.28 -0.38 -0.23 -0.27 -0.04 -0.02 0.12 -0.37
0.75 1.36 1.21 -3.44 -2.17 0.44 0.15 -0.24 0.5 -0.55 -0.8 0.5 -0.14 0.14 -1.09 -0.7 -0.49 -0.53 -0.48 -0.27 -0.65 0.03
0.48 1.7 1.46 -3.65 0.05 -0.01 0.53 -0.83 0.28 -0.16 0.35 -0.31 -0.36 -0.36 -0.53 -0.6 -0.86 -0.91 -1.15 -0.42 -0.59 -1.2
0.21 1.06 1.25 -4.14 -1.22 -0.08 -0.1 -0.24 0.46 0.51 0.12 0.74 -1.15 -0.3 -0.57 -0.56 -0.44 -0.53 -0.01 -0.14 -0.27 -0.25
0.66 1.45 1.64 -5.14 -4.44 0.12 0.24 0.22 -0.23 0.09 0.39 -0.13 -1.42 -0.79 -0.56 -0.67 -0.41 -0.49 -0.29 -0.74 -0.89 0.33
0.28 0.67 1.27 -4.66 -0.27 0.1 0.26 0.4 -0.2 0.54 0.5 -0.14 -1.87 -0.29 -0.35 -0.29 -0.29 -0.33 -1.16 0.12 -0.03 -0.22
-0.03 0.89 1.35 -4.38 -0.23 0.1 0.57 -0.56 0.65 0.15 0.13 0.69 -1.54 -0.14 -0.81 -0.81 -0.83 -0.74 -0.36 0.12 -0.14 -0.36
0.11 0.5 1.35 -4.99 -0.62 -0.08 0.23 0.25 0.45 0.39 0.26 0.49 -1.04 -0.31 -0.84 -0.89 -0.81 -0.84 -0.32 -0.7 -0.52 1.03
0.42 0.72 1.28 -2.31 -1.58 0.33 0.47 -0.04 0.45 0.14 -0.19 0.6 -0.76 -0.44 -0.48 -0.53 -0.43 -0.48 -0.96 -0.44 -0.4 0.45
0.72 1.3 0.8 -5.75 0.03 0.16 0.3 -0.15 -0.22 -0.51 -0.15 -0.18 -1.56 -0.3 -0.17 -0.21 -0.06 -0.08 0.29 -0.3 -0.47 -0.04
1.22 1.6 0.97 -2.29 -4.78 -0.74 0.39 -0.15 -0.48 -0.85 -0.33 -0.27 -1.5 1.03 -0.63 -0.45 -1.02 -0.82 0.01 -0.13 -0.37 0.28
0.74 1.89 2.66 -3.72 -2.09 -1.41 -0.61 -0.1 -0.88 -0.02 -0.04 0.07 -1.81 -1.35 -2.78 -2.95 -2.55 -3.21 -2.11 0.09 -0.13 0.08
-0.2 2.78 3.29 -1.56 -7.59 -1.01 -1.71 -2.27 -1.08 -2.49 -2.21 -0.17 -2.27 -2.2 -3.38 -3.88 -3.63 -4.38 -4.77 -1.71 -1.92 -3.69
0.71 1.25 0.65 -4.11 -0.09 0.03 0.19 -0.01 -0.33 -0.16 -0.11 -0.44 -1.18 0.1 0.08 0.02 0.1 0.12 0.37 -0.84 -0.77 -0.41
0.42 0.62 1.03 -3.47 0.1 0.18 0.37 -0.12 0.09 0.33 0.2 0.03 -0.83 -0.45 -0.12 -0.16 -0.18 -0.2 -0.11 -0.76 -0.39 -0.07
0.12 0.18 1.24 -3.72 -0.15 0.11 -0.0 0.37 0.03 0.23 0.36 -0.1 -0.78 0.01 -0.4 -0.51 -0.47 -0.55 -0.07 -0.08 -0.22 0.54

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.