Heatmap: Cluster_10 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
1.5 3.15 0.45 0.62 0.45 1.75 6.5 11.12 0.6 7.27 9.12 0.72 0.0 1.33 0.06 0.06 0.05 0.14 0.44 0.23 0.26 55.57
0.19 0.0 0.0 0.1 0.06 1.89 0.8 15.3 0.0 14.46 17.72 1.7 0.0 0.42 0.0 0.26 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 51.75
2.88 1.6 0.02 0.51 6.74 7.61 10.51 11.39 10.05 14.62 21.04 7.8 7.86 26.35 2.03 3.33 2.18 1.79 4.33 3.92 3.39 95.76
0.16 0.05 0.0 0.2 1.14 0.62 0.54 2.55 0.6 2.25 4.17 0.95 0.11 0.11 0.08 0.05 0.05 0.05 0.33 0.06 0.08 6.54
3.52 3.0 0.0 0.85 179.95 44.16 6.93 331.15 6.07 208.03 245.77 7.82 3.72 17.77 8.03 6.99 8.81 8.18 14.23 3.66 6.23 918.51
1.25 9.34 12.03 0.64 6.51 2.53 2.37 9.01 5.89 5.17 5.48 7.17 0.62 10.25 1.03 0.77 0.99 0.96 4.98 4.33 3.58 47.34
4.65 0.12 0.09 1.03 162.74 2.03 29.23 33.76 0.37 21.49 42.61 0.18 0.08 8.21 0.25 0.4 0.12 0.24 20.98 0.15 0.0 839.05
2.11 0.13 0.19 1.67 104.01 1.57 14.94 16.5 0.37 12.32 27.04 0.0 0.0 2.72 0.0 0.22 0.0 0.19 14.54 0.07 0.0 791.04
17.83 2.93 0.54 1.13 0.19 1.96 4.06 71.82 4.82 57.61 89.72 4.28 0.13 4.31 0.08 0.03 0.0 0.15 0.44 0.0 0.12 238.27
0.46 0.01 0.0 0.44 0.0 0.91 3.24 0.74 0.0 0.88 1.66 0.86 0.24 19.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.2 27.28
0.56 0.03 0.0 0.32 0.0 1.14 4.54 1.02 0.46 1.02 1.23 2.11 0.73 8.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.37 26.84
0.94 0.96 1.21 0.65 0.01 0.92 2.26 1.26 0.0 0.15 0.8 0.0 0.24 0.89 0.11 0.37 0.59 0.43 0.52 0.14 0.0 14.72
0.04 0.02 0.0 0.27 0.03 0.04 0.0 0.08 1.17 0.02 0.1 0.69 0.02 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.32 0.2 2.87
1.08 1.34 0.17 0.3 0.56 1.19 3.23 0.65 1.44 2.43 3.57 2.08 1.32 0.99 0.59 0.87 0.86 1.12 0.4 1.2 0.64 26.56
62.09 96.64 0.23 0.98 0.24 15.38 34.04 74.47 10.79 62.97 63.73 11.61 2.26 44.77 7.9 9.26 11.43 11.01 3.85 5.49 5.9 336.65
0.0 0.06 0.03 1.38 0.03 0.09 0.09 0.09 1.73 0.09 0.2 1.21 0.0 0.59 0.0 0.0 0.02 0.0 0.44 0.08 0.37 6.63
0.35 0.0 0.0 0.1 0.02 0.02 0.1 0.22 0.0 0.24 0.29 0.0 0.03 0.08 0.0 0.04 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 11.78
0.0 0.0 0.05 0.81 0.47 0.16 0.16 0.51 0.4 1.54 0.96 1.08 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 6.04
0.11 0.03 0.0 0.49 0.04 0.07 0.3 0.1 0.41 0.26 0.17 0.39 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 3.17
0.06 0.0 0.0 0.33 0.38 0.64 1.49 1.39 0.92 1.97 1.27 2.19 1.01 13.55 0.44 0.18 1.07 0.37 0.03 0.3 0.84 16.49
18.52 39.97 1.37 1.35 0.02 8.81 27.33 44.03 3.4 28.4 36.41 3.41 3.06 11.05 1.84 1.45 2.15 2.3 7.84 1.67 1.5 148.63
4.66 1.64 0.0 4.82 0.01 0.61 1.91 4.93 0.75 2.62 2.54 0.96 0.44 3.55 0.0 0.07 0.08 0.16 2.68 0.53 0.22 27.13
0.04 0.02 0.03 0.34 0.02 0.06 0.23 0.35 0.18 0.56 0.92 0.69 0.03 3.9 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 8.1
0.02 0.06 0.05 0.88 0.12 0.15 0.99 2.67 0.16 2.27 3.45 1.51 0.04 6.82 0.03 0.03 0.16 0.01 0.1 0.05 0.25 55.89
0.02 0.02 0.0 0.33 0.02 0.08 0.05 0.3 0.4 0.25 0.68 0.11 0.15 0.47 0.1 0.02 0.04 0.13 0.04 0.18 0.1 2.96
0.01 0.06 0.0 0.43 0.0 0.18 0.06 0.66 0.49 0.66 1.01 0.41 0.07 0.37 0.27 0.18 0.18 0.18 0.0 0.5 0.7 2.33
37.26 62.08 19.52 1.3 70.7 86.25 92.98 111.94 115.79 131.65 154.13 99.55 51.83 127.29 54.32 52.42 52.57 51.78 70.12 38.79 42.13 344.47
0.27 0.0 0.0 0.54 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 5.28
0.01 0.0 0.0 0.56 0.03 0.15 0.06 0.17 0.0 0.14 0.09 0.22 0.05 2.95 0.04 0.07 0.0 0.11 0.67 0.09 0.0 4.94
0.07 0.0 0.0 0.27 0.0 0.2 0.7 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 1.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.8
0.11 0.0 0.0 0.16 0.0 0.12 0.64 0.29 0.0 0.21 0.73 0.0 0.04 3.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.67
0.08 0.0 0.0 0.18 0.0 0.71 0.35 1.73 0.45 2.4 1.09 2.16 0.22 11.92 0.53 0.37 1.36 0.53 2.57 0.14 0.3 16.49
34.66 27.02 0.22 0.22 74.69 22.51 11.91 11.73 3.78 10.51 13.84 6.67 4.7 77.13 20.73 25.72 18.31 22.82 55.17 4.18 5.39 508.74
4.25 7.91 0.05 0.82 0.01 0.85 8.16 20.41 1.29 21.92 27.06 1.62 0.12 23.29 1.45 1.84 0.93 0.9 0.8 0.21 0.39 100.0
10.05 3.64 1.77 0.53 19.09 8.19 12.59 18.39 10.16 15.53 20.14 10.17 0.78 7.86 2.24 2.16 3.03 2.48 2.89 3.46 3.86 148.35
59.83 40.35 47.37 21.41 86.41 30.78 56.62 149.48 40.83 183.77 136.41 50.0 8.39 59.65 18.01 17.34 24.68 15.69 17.79 21.49 23.99 913.45
0.09 0.0 0.0 0.65 0.01 0.44 0.54 0.52 0.0 0.49 0.68 2.12 0.0 19.91 0.0 0.0 0.09 0.0 0.49 0.06 0.0 18.0
0.28 0.0 0.05 0.38 0.04 0.4 0.66 1.14 0.0 0.87 1.09 1.59 0.12 19.63 0.07 0.07 0.23 0.04 1.5 0.23 0.29 20.61
38.46 14.27 4.84 0.9 153.02 79.22 142.55 153.67 86.19 167.35 150.65 98.49 21.49 277.42 61.13 50.3 56.31 57.45 199.62 87.92 77.85 1777.79
26.05 7.07 0.0 0.46 0.0 2.23 19.47 39.93 0.0 44.22 49.58 0.62 0.47 5.6 0.0 0.28 0.11 0.09 1.42 0.25 0.0 139.22
0.0 0.0 0.0 0.54 0.02 0.06 0.1 0.21 0.0 0.52 0.67 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.48
2.98 1.24 0.0 1.16 10.28 17.71 67.49 89.5 17.9 69.81 81.23 21.1 5.36 123.77 1.62 2.19 2.27 2.13 10.19 8.63 12.43 1260.35
1.67 0.19 0.04 1.37 0.01 13.53 42.06 29.61 4.45 27.5 21.96 7.95 3.83 52.2 1.74 2.5 3.6 3.77 1.58 2.15 3.04 214.42
0.26 0.0 0.0 0.52 0.89 7.41 14.84 7.89 2.59 7.39 7.34 7.76 2.43 148.08 7.4 2.95 15.31 12.59 23.23 1.08 2.83 172.2
0.0 0.0 0.0 0.63 0.03 0.03 0.19 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.22 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.89
93.54 32.77 0.43 0.68 0.01 14.88 74.37 84.66 62.8 46.67 58.3 59.09 33.39 99.28 3.48 2.89 3.61 1.87 1.24 35.74 44.99 442.27
0.32 0.05 0.0 0.37 0.0 0.13 0.54 1.45 0.55 2.3 2.62 0.53 0.02 0.31 0.0 0.0 0.03 0.02 0.05 0.05 0.06 18.51
0.02 0.05 0.58 0.63 1.46 0.17 0.89 8.96 0.05 8.1 8.76 0.0 0.06 4.44 0.08 0.1 0.23 0.06 0.18 0.06 0.0 15.95
0.26 0.0 0.0 0.13 0.03 0.0 0.14 0.09 0.0 0.0 0.04 0.17 0.02 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.68
14.31 14.69 1.26 0.9 8.51 0.79 7.94 12.96 1.62 10.28 16.0 1.17 0.61 6.07 0.93 0.52 1.18 0.91 0.9 1.6 1.44 138.52
1.39 0.39 0.04 0.89 7.85 19.27 0.78 18.7 10.91 37.64 19.85 23.43 0.36 3.95 0.04 0.12 0.35 0.12 0.47 5.67 3.12 381.33
34.18 1.88 2.24 1.13 16.69 27.63 11.13 64.67 51.09 108.71 59.97 73.19 3.95 27.12 3.54 2.94 3.92 2.86 2.21 21.63 23.13 703.17
53.86 47.87 0.62 1.86 0.12 29.98 36.78 70.35 17.73 68.33 86.68 17.66 3.31 26.79 5.2 4.26 6.7 10.49 2.14 1.96 2.39 145.37
0.48 0.17 0.0 0.48 0.39 3.24 1.59 3.27 0.82 6.14 5.78 0.95 0.11 3.77 0.24 0.0 0.05 0.0 0.12 0.07 0.0 93.07
0.21 0.03 0.0 0.16 0.0 1.0 1.76 1.78 0.44 2.25 1.48 1.44 0.55 4.65 0.67 0.24 1.07 0.69 0.33 0.14 0.78 18.0
4.09 1.58 3.6 15.25 4.56 2.92 3.6 2.31 4.53 4.1 1.4 2.47 6.71 75.15 1.56 0.0 1.58 0.0 0.0 4.44 8.02 121.8
0.11 0.0 0.1 0.4 0.01 0.28 0.43 2.07 0.34 2.6 3.73 0.08 0.0 0.08 0.08 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 29.0
0.12 0.06 0.0 0.31 0.29 0.28 0.62 1.37 0.21 1.09 0.87 0.13 0.15 0.2 0.06 0.09 0.07 0.08 0.97 0.14 0.05 5.45
0.14 0.12 0.0 0.51 0.2 0.17 0.74 1.72 0.31 1.07 1.24 0.18 0.08 0.14 0.01 0.01 0.04 0.05 0.18 0.05 0.1 10.69
15.17 4.91 0.0 0.35 0.01 27.26 21.84 208.71 21.44 167.37 161.0 29.7 8.22 10.91 7.13 6.05 6.37 4.03 6.41 8.01 16.36 713.25
0.2 0.19 0.0 0.65 0.0 0.35 0.79 0.15 0.84 0.76 1.16 0.27 0.18 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.33 0.0 6.87
0.11 0.0 0.11 0.33 0.02 1.42 3.16 4.41 1.96 1.5 5.69 0.88 0.06 0.19 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.07 255.15
0.07 0.0 0.0 0.28 0.0 2.22 4.02 3.84 2.11 1.6 5.96 0.65 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 348.23
0.04 0.0 0.0 0.24 0.01 0.0 0.12 1.18 0.0 0.29 2.51 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 29.42
0.04 0.0 1.15 0.25 0.1 0.09 0.52 0.38 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 14.34
0.02 0.0 0.0 0.17 0.01 0.16 1.29 2.46 3.63 1.15 3.51 1.46 0.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 99.55
0.03 0.05 0.11 0.35 0.01 0.24 0.09 0.62 0.49 0.29 1.53 0.0 0.07 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 70.81
0.03 0.16 0.0 0.17 0.01 0.89 0.22 1.36 0.2 0.42 0.73 0.45 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 33.86
0.03 0.0 0.07 0.54 0.0 0.01 0.17 0.11 0.0 0.07 0.49 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 55.67
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.68
0.08 0.25 1.22 0.03 0.21 0.12 0.25 0.73 0.0 1.24 2.81 0.0 0.18 4.14 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.27 0.0 7.05
2.2 0.71 0.36 0.4 0.01 2.56 7.25 13.52 8.46 12.01 14.75 8.56 0.5 14.67 0.33 0.28 0.43 0.5 2.33 1.01 0.51 99.3
1.35 0.88 0.0 0.9 1.4 4.36 10.61 5.19 3.36 5.18 14.3 1.29 0.6 2.19 1.6 1.89 1.91 3.4 0.5 0.53 0.59 96.71
1.47 0.66 0.0 1.06 0.62 0.47 0.0 0.0 1.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.3
0.09 0.0 0.0 0.42 0.71 0.74 1.07 9.5 0.77 6.09 13.92 0.15 0.28 2.61 0.81 0.56 0.15 0.71 0.0 0.44 0.0 38.98
0.05 0.0 0.08 0.7 0.04 0.0 0.05 0.08 0.0 0.13 0.0 0.14 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 6.7
2.34 0.17 0.0 0.4 0.36 1.07 3.02 7.3 3.7 10.81 12.82 5.52 0.81 5.76 0.9 0.93 1.08 0.75 1.47 2.12 1.51 39.57
0.58 0.24 0.05 0.0 0.97 0.36 1.79 2.78 0.0 5.24 14.5 0.27 0.0 3.13 0.05 0.0 0.08 0.17 0.0 0.11 0.0 33.28
0.16 0.0 0.0 0.07 0.01 0.03 0.02 2.44 0.0 1.74 3.84 0.0 0.02 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18.65
0.32 0.0 0.0 1.01 0.24 0.65 1.08 0.94 0.0 1.05 0.98 0.0 0.02 0.65 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 54.87
0.03 0.0 0.0 0.34 0.0 0.32 1.53 1.41 0.0 0.96 1.88 0.0 0.09 0.17 0.17 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 35.82
5.4 0.11 0.0 0.36 5.57 13.46 74.62 120.03 85.93 70.85 88.63 94.44 53.83 203.79 9.91 6.56 14.56 9.59 19.64 45.27 47.81 597.06
1.49 1.8 0.0 1.11 1.51 25.34 126.26 75.83 3.92 117.43 98.08 6.58 4.15 5.59 5.34 6.01 21.03 27.41 8.81 7.82 3.73 1403.86
0.16 0.0 0.0 0.38 0.01 0.12 2.33 0.97 0.05 0.71 1.28 0.14 0.17 3.18 0.04 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.09 19.85
0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 6.34 1.37 0.0 0.53 1.7 4.22 1.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.92 43.98
0.16 0.19 0.08 0.72 0.0 0.26 1.07 1.28 1.67 2.88 4.43 2.27 0.09 0.76 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.12 23.55
0.84 0.03 0.05 0.68 1.49 1.18 6.58 9.01 0.64 6.37 8.38 2.51 1.18 40.41 0.14 0.23 0.72 0.37 1.22 0.68 0.98 200.79
118.24 91.06 15.23 0.9 120.72 131.41 162.91 251.95 385.91 293.92 293.79 308.85 91.92 146.84 80.85 94.21 75.48 82.67 117.16 68.99 78.89 367.54
0.11 0.0 0.0 0.4 0.12 0.14 0.41 1.34 0.35 0.68 1.69 0.25 0.19 0.37 0.0 0.09 0.05 0.05 0.0 0.14 0.08 41.24
5.57 3.18 0.0 1.27 0.0 1.06 10.45 27.11 2.67 18.89 20.93 4.48 1.6 4.21 1.1 0.82 1.2 1.0 3.3 2.52 2.13 84.26
10.34 0.17 1.5 0.5 8.36 15.15 13.76 98.5 14.84 73.46 73.47 38.94 18.05 6.21 5.64 6.05 7.86 3.55 43.43 7.59 14.25 692.64
0.02 0.0 0.05 0.32 0.04 0.09 0.13 0.11 0.0 0.47 0.16 0.11 0.02 0.81 0.04 0.11 0.04 0.14 0.08 0.0 0.0 0.8
0.24 0.0 0.0 0.26 0.62 1.3 0.38 2.64 6.44 1.94 2.47 7.12 0.4 9.12 0.07 0.04 0.03 0.07 7.58 12.48 6.81 100.11
1.19 0.31 0.02 0.35 2.09 0.38 1.24 1.34 1.0 0.8 0.82 1.79 0.38 6.13 0.07 0.06 0.05 0.05 0.44 0.12 0.18 31.48
2.81 6.37 0.04 0.49 0.16 3.44 4.07 5.05 2.3 4.81 4.61 2.6 0.67 22.57 3.77 2.73 3.95 3.29 8.65 0.71 1.09 57.76
2.33 2.57 4.23 0.25 3.39 9.53 9.46 19.8 12.79 21.6 32.92 12.78 6.15 51.7 4.52 6.11 5.35 4.84 6.57 13.42 14.75 108.14
0.33 0.1 0.92 0.54 0.27 0.22 0.07 4.3 0.0 1.38 2.5 0.28 0.0 2.07 0.09 0.0 0.0 0.0 1.72 0.39 0.51 32.17
3.43 0.21 0.0 0.85 0.01 1.12 0.89 4.63 1.87 1.47 2.19 1.2 0.14 0.87 0.0 0.09 0.21 0.19 0.0 1.1 0.55 15.85
0.26 0.2 0.0 0.91 0.0 0.79 0.14 0.29 0.0 0.24 0.47 0.0 0.0 0.23 0.0 0.55 0.0 0.19 0.84 0.23 1.01 26.08
0.04 0.0 0.33 0.84 0.0 0.1 0.58 0.0 0.0 0.52 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 5.78
1.85 0.16 0.0 0.33 0.35 1.6 27.97 35.28 11.96 19.61 42.31 8.19 0.86 5.54 0.34 0.44 0.34 0.37 1.02 0.64 0.61 353.28

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)