Heatmap: Cluster_72 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
1.0 0.8 0.66 0.02 0.72 0.83 0.92 0.8 0.69 0.62 0.6 0.67 0.27 0.81 0.83 0.84 0.83 0.78 0.87 0.5 0.56 0.85
0.57 0.74 1.0 0.03 0.42 0.5 0.6 0.48 0.51 0.41 0.44 0.53 0.26 0.32 0.34 0.34 0.36 0.34 0.58 0.49 0.55 0.48
0.9 1.0 0.77 0.01 0.51 0.69 0.86 0.62 0.72 0.55 0.57 0.65 0.49 0.64 0.56 0.53 0.56 0.56 0.61 0.6 0.63 0.7
0.86 0.96 0.79 0.01 0.52 0.75 1.0 0.65 0.68 0.56 0.52 0.7 0.26 0.56 0.66 0.61 0.74 0.74 0.81 0.52 0.58 0.99
0.58 0.68 1.0 0.02 0.41 0.51 0.67 0.33 0.53 0.3 0.32 0.5 0.27 0.39 0.39 0.4 0.4 0.38 0.5 0.34 0.37 0.5
0.68 0.83 1.0 0.09 0.31 0.66 0.48 0.61 0.64 0.55 0.51 0.61 0.13 0.95 0.42 0.38 0.4 0.41 0.57 0.51 0.49 0.71
0.84 0.83 0.71 0.02 0.47 0.65 1.0 0.6 0.71 0.52 0.55 0.66 0.36 0.7 0.46 0.52 0.5 0.48 0.56 0.52 0.53 0.86
0.47 0.8 1.0 0.01 0.27 0.62 0.44 0.3 0.33 0.35 0.26 0.42 0.19 0.2 0.55 0.51 0.54 0.54 0.55 0.23 0.29 0.21
0.97 0.92 0.56 0.01 0.51 0.67 1.0 0.65 0.74 0.48 0.54 0.65 0.3 0.66 0.6 0.6 0.61 0.63 0.71 0.54 0.58 0.72
0.99 0.76 0.66 0.02 0.38 0.7 1.0 0.61 0.58 0.4 0.46 0.67 0.29 0.81 0.52 0.55 0.56 0.49 0.63 0.42 0.49 0.77
0.41 0.82 1.0 0.03 0.36 0.65 0.65 0.28 0.46 0.26 0.22 0.6 0.19 0.69 0.54 0.5 0.65 0.57 0.53 0.31 0.35 0.49
0.64 0.63 1.0 0.08 0.28 0.51 0.83 0.35 0.19 0.21 0.24 0.09 0.06 0.92 0.61 0.62 0.51 0.53 0.37 0.26 0.3 0.45
0.48 0.48 1.0 0.04 0.23 0.42 0.4 0.2 0.28 0.15 0.18 0.27 0.11 0.38 0.41 0.43 0.4 0.42 0.51 0.29 0.34 0.25
0.8 0.72 0.75 0.02 0.54 0.85 1.0 0.51 0.56 0.44 0.33 0.63 0.28 0.54 0.67 0.71 0.73 0.7 0.65 0.32 0.43 0.51
0.68 0.98 1.0 0.01 0.57 0.64 0.76 0.49 0.56 0.48 0.43 0.53 0.22 0.43 0.49 0.48 0.51 0.5 0.69 0.39 0.49 0.6
0.74 0.99 1.0 0.03 0.49 0.7 0.69 0.65 0.71 0.61 0.58 0.74 0.24 0.67 0.57 0.54 0.62 0.59 0.69 0.59 0.6 0.76
0.74 1.0 0.96 0.02 0.59 0.69 0.82 0.62 0.69 0.58 0.51 0.7 0.34 0.42 0.54 0.54 0.57 0.58 0.72 0.5 0.52 0.69
0.79 1.0 0.96 0.02 0.58 0.63 0.54 0.59 0.59 0.49 0.46 0.6 0.17 0.62 0.58 0.54 0.58 0.59 0.77 0.5 0.48 0.66
0.62 1.0 0.62 0.01 0.26 0.57 0.54 0.52 0.52 0.52 0.54 0.51 0.23 0.4 0.37 0.41 0.37 0.37 0.57 0.35 0.4 0.42
1.0 0.88 0.42 0.03 0.54 0.77 0.93 0.66 0.57 0.59 0.54 0.68 0.25 0.64 0.7 0.74 0.75 0.72 0.79 0.46 0.5 0.93
0.71 1.0 0.77 0.06 0.45 0.78 0.66 0.53 0.59 0.56 0.58 0.54 0.36 0.45 0.39 0.42 0.38 0.4 0.56 0.48 0.51 0.36
0.55 0.4 0.44 0.06 0.43 0.48 0.69 0.34 0.27 0.23 0.29 0.25 0.2 0.41 0.42 0.43 0.44 0.4 0.51 0.3 0.32 1.0
0.64 0.85 1.0 0.02 0.42 0.53 0.64 0.43 0.43 0.34 0.34 0.41 0.18 0.4 0.46 0.45 0.43 0.48 0.54 0.34 0.39 0.59
1.0 0.88 0.74 0.02 0.53 0.85 0.78 0.57 0.68 0.52 0.4 0.73 0.27 0.8 0.75 0.76 0.74 0.68 0.87 0.62 0.61 0.52
0.8 1.0 0.89 0.05 0.52 0.85 0.72 0.8 0.79 0.82 0.87 0.79 0.41 0.65 0.59 0.63 0.63 0.6 0.89 0.69 0.72 0.66
0.87 0.7 1.0 0.08 0.22 0.54 0.75 0.28 0.38 0.28 0.25 0.41 0.1 0.27 0.37 0.39 0.38 0.37 0.28 0.22 0.2 0.25
0.65 1.0 0.79 0.03 0.36 0.66 0.66 0.51 0.75 0.48 0.45 0.77 0.29 0.46 0.42 0.42 0.43 0.46 0.77 0.6 0.61 0.45
0.86 0.85 0.57 0.01 0.55 0.77 0.97 0.64 0.62 0.54 0.53 0.63 0.23 0.6 0.7 0.67 0.76 0.74 0.82 0.49 0.56 1.0
0.76 1.0 0.75 0.01 0.32 0.65 0.61 0.57 0.53 0.45 0.42 0.64 0.28 0.6 0.48 0.42 0.48 0.43 0.63 0.47 0.47 0.58
0.91 1.0 0.82 0.01 0.45 0.72 0.87 0.75 0.8 0.68 0.62 0.83 0.28 0.58 0.52 0.52 0.58 0.55 0.83 0.65 0.63 0.96
0.7 1.0 0.84 0.03 0.52 0.65 0.68 0.69 0.53 0.69 0.77 0.68 0.23 0.74 0.54 0.49 0.48 0.61 0.71 0.37 0.41 0.89
0.36 0.68 1.0 0.05 0.34 0.66 0.53 0.38 0.35 0.32 0.35 0.46 0.31 0.26 0.52 0.54 0.59 0.54 0.41 0.31 0.42 0.24
0.58 0.79 1.0 0.01 0.31 0.61 0.6 0.6 0.64 0.69 0.61 0.76 0.21 0.58 0.45 0.45 0.49 0.41 0.52 0.39 0.39 0.62
0.76 0.83 1.0 0.03 0.34 0.59 0.75 0.38 0.38 0.34 0.33 0.34 0.14 0.4 0.56 0.55 0.59 0.58 0.57 0.35 0.38 0.47
0.66 0.38 0.34 0.03 0.39 0.64 0.94 0.39 0.38 0.36 0.28 0.4 0.27 0.5 0.58 0.56 0.63 0.58 0.67 0.42 0.47 1.0
0.95 1.0 0.45 0.03 0.52 0.68 0.96 0.48 0.56 0.57 0.46 0.64 0.25 0.7 0.73 0.71 0.78 0.75 0.87 0.44 0.51 0.71
0.84 0.9 0.66 0.01 0.46 0.73 1.0 0.65 0.62 0.49 0.46 0.58 0.29 0.49 0.62 0.58 0.66 0.62 0.63 0.48 0.51 0.67
0.68 0.82 0.8 0.01 0.41 0.63 1.0 0.45 0.57 0.43 0.37 0.53 0.29 0.46 0.64 0.61 0.65 0.64 0.73 0.38 0.45 0.84
0.85 1.0 0.84 0.02 0.46 0.82 0.75 0.39 0.37 0.32 0.28 0.38 0.22 0.42 0.6 0.57 0.66 0.59 0.68 0.41 0.42 0.37
0.58 0.42 0.26 0.07 0.44 0.64 0.95 0.4 0.39 0.32 0.32 0.42 0.26 0.51 0.61 0.62 0.69 0.62 0.65 0.35 0.42 1.0
0.72 0.75 1.0 0.05 0.33 0.72 0.47 0.36 0.45 0.4 0.43 0.48 0.15 0.39 0.55 0.49 0.5 0.53 0.33 0.33 0.35 0.29
0.76 0.36 0.13 0.07 0.62 0.89 1.0 0.41 0.48 0.39 0.44 0.53 0.26 0.74 0.67 0.55 0.61 0.6 0.93 0.43 0.49 0.74
0.7 1.0 0.96 0.01 0.71 0.63 0.87 0.48 0.48 0.6 0.44 0.54 0.19 0.42 0.5 0.46 0.51 0.47 0.67 0.4 0.39 0.59
0.69 0.6 1.0 0.04 0.47 0.59 0.73 0.31 0.48 0.3 0.29 0.49 0.3 0.39 0.45 0.44 0.47 0.45 0.44 0.49 0.5 0.37
0.74 0.91 1.0 0.06 0.31 0.59 0.86 0.47 0.46 0.31 0.33 0.4 0.2 0.54 0.57 0.57 0.56 0.55 0.5 0.37 0.38 0.6
0.45 0.7 1.0 0.02 0.31 0.38 0.46 0.28 0.33 0.28 0.24 0.34 0.13 0.36 0.34 0.34 0.37 0.33 0.39 0.23 0.26 0.34
0.76 1.0 0.69 0.01 0.35 0.6 0.52 0.5 0.64 0.42 0.45 0.69 0.24 0.62 0.4 0.38 0.43 0.42 0.5 0.62 0.56 0.45
0.66 0.99 1.0 0.02 0.46 0.56 0.61 0.5 0.4 0.46 0.44 0.48 0.14 0.59 0.44 0.39 0.48 0.42 0.53 0.29 0.3 0.72
0.64 0.36 0.14 0.02 0.42 0.66 0.92 0.43 0.39 0.32 0.31 0.36 0.24 0.69 0.6 0.58 0.66 0.62 0.72 0.42 0.49 1.0
0.65 0.96 1.0 0.01 0.49 0.58 0.56 0.37 0.55 0.33 0.34 0.47 0.22 0.57 0.5 0.43 0.49 0.5 0.62 0.3 0.35 0.45
0.81 0.87 0.46 0.02 0.48 0.79 1.0 0.53 0.68 0.35 0.39 0.68 0.23 0.5 0.59 0.59 0.67 0.64 0.98 0.51 0.56 0.79
0.81 0.62 0.43 0.03 0.42 0.65 1.0 0.47 0.4 0.42 0.35 0.41 0.24 0.48 0.59 0.57 0.64 0.61 0.71 0.37 0.45 0.92
0.92 0.81 0.62 0.03 0.39 0.67 1.0 0.56 0.41 0.44 0.4 0.4 0.25 0.72 0.61 0.62 0.68 0.66 0.55 0.37 0.45 0.73
0.73 0.66 0.49 0.01 0.48 0.64 1.0 0.52 0.49 0.45 0.4 0.5 0.2 0.65 0.69 0.64 0.73 0.72 0.74 0.47 0.52 1.0
0.82 0.88 0.58 0.01 0.47 0.73 1.0 0.55 0.75 0.51 0.46 0.71 0.34 0.63 0.56 0.56 0.58 0.58 0.76 0.5 0.54 0.64
1.0 0.86 0.61 0.01 0.79 0.96 1.0 0.71 0.71 0.61 0.56 0.78 0.34 0.95 0.87 0.81 0.89 0.85 0.94 0.58 0.66 0.8
0.53 0.77 1.0 0.02 0.45 0.58 0.67 0.35 0.39 0.43 0.31 0.4 0.22 0.28 0.48 0.48 0.48 0.46 0.51 0.25 0.3 0.33
0.73 0.84 1.0 0.04 0.39 0.56 0.63 0.4 0.42 0.3 0.29 0.47 0.16 0.82 0.56 0.5 0.58 0.57 0.73 0.39 0.43 0.6
0.77 0.89 0.69 0.02 0.48 0.76 1.0 0.57 0.58 0.44 0.4 0.57 0.44 0.76 0.9 0.87 0.98 0.94 0.81 0.49 0.6 0.94
0.88 1.0 0.77 0.02 0.45 0.65 0.79 0.72 0.88 0.51 0.6 0.76 0.52 0.71 0.52 0.53 0.51 0.53 0.69 0.62 0.65 0.58
0.74 1.0 0.99 0.02 0.39 0.69 0.76 0.46 0.51 0.39 0.39 0.59 0.22 0.38 0.54 0.56 0.57 0.58 0.71 0.29 0.35 0.46
0.64 1.0 0.93 0.02 0.48 0.68 0.73 0.62 0.75 0.6 0.59 0.78 0.29 0.67 0.51 0.49 0.54 0.54 0.69 0.54 0.52 0.64
0.53 0.74 1.0 0.01 0.39 0.63 0.39 0.55 0.4 0.55 0.49 0.47 0.19 0.46 0.56 0.56 0.54 0.49 0.38 0.45 0.5 0.43
0.85 0.84 1.0 0.02 0.75 0.93 0.88 0.79 0.78 0.68 0.59 0.76 0.27 0.72 0.95 0.92 0.91 0.92 0.83 0.74 0.69 0.64
0.7 0.87 1.0 0.04 0.71 0.7 0.86 0.54 0.42 0.45 0.44 0.51 0.28 0.43 0.51 0.55 0.57 0.55 0.82 0.41 0.47 0.65
0.87 0.79 1.0 0.04 0.61 0.73 0.96 0.41 0.56 0.55 0.45 0.59 0.2 0.32 0.52 0.51 0.49 0.52 0.47 0.47 0.48 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)