Heatmap: Cluster_85 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_2290V3.1	-	4.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.35	1.38	-	-	-	-	-	-	-	-	3.17	-	-	-	-3.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_14193V3.1	-	3.92	-	-	-0.49	-	-	-	-	-0.18	-	-	-	0.64	-1.54	-	3.48	-	-	-	-	-	-	-	-	2.75	-	-	0.08	-0.21	-	0.33	-	-	-	-	-	1.04	1.17	2.01	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_15720V3.1	1.54	4.3	2.02	2.32	-1.32	-	-0.82	-	1.58	-	-	-	-	-	-	-	3.08	-1.23	-	-	-	-	-	-	-	1.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_1925V3.1	-	3.19	-1.21	0.86	-1.47	0.67	-0.39	0.73	-	-3.17	0.22	0.76	-3.07	-2.62	-1.71	3.74	0.76	0.43	1.61	1.33	-2.09	-1.03	-2.66	-2.08	-0.55	-0.57	-1.65	-3.66	-0.57	-3.12	-3.65	-2.74	-4.08	-2.39	-	-3.0	-2.49	-3.66	-	-3.69	-2.15	-1.95	-0.36	-1.37	-4.44	-	-2.0	-2.2
Pp3c12_22570V3.1	-	4.96	-	-0.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.69	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	1.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_22600V3.1	-	4.96	-	-0.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.69	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	1.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_5590V3.1	-	4.97	1.44	1.06	-2.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.31	-0.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_19910V3.1	-0.17	4.28	2.33	-0.22	-0.87	-1.32	0.4	0.56	-1.81	-1.31	-	-	-	-	-3.73	2.83	1.18	-2.17	-4.77	-2.01	-	-	-	-2.94	-	2.52	-3.02	-	-	-3.63	-2.67	-3.22	-3.36	-	-	-	-	-3.19	-	-2.68	-2.69	-	-2.77	-	-	-3.22	-1.84	-
Pp3c13_22180V3.1	-	5.06	2.06	-	-	-	-	1.78	-	-	-	-	-	-	-	-	1.58	-	-	0.58	-	-	-	-	-	1.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_18300V3.1	1.66	4.69	1.71	1.98	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.21	1.13	-	-	-	-	-	-	0.07	-1.21	2.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_18490V3.1	1.66	4.69	1.71	1.98	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.21	1.13	-	-	-	-	-	-	0.07	-1.21	2.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_6660V3.1	-	4.07	3.32	0.74	3.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.1	-	-	-	-	-	-	-0.52	-0.89	2.43	-1.38	-	-	-4.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_10280V3.1	-	4.86	1.89	-	-0.18	0.56	-	-	-	-1.36	-	-0.36	-	0.39	-3.19	-	2.42	-0.78	-	0.06	-	-	-	0.06	0.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_13380V3.1	-	4.04	0.11	-1.51	-2.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.19	3.74	2.64	0.04	-	-	-	-	-	-	-	3.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_17630V3.1	-	4.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_19430V3.1	-	4.81	2.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_1340V3.1	-	4.81	2.48	-	-	-	-	-	-	-	2.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.02	-	1.06	-	-	1.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_2410V3.1	-	4.99	2.82	-	-	-	-	-	1.91	-	-	-	-	-	-	-	1.45	-0.66	-	-	-	-	-	-	-	0.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_4990V3.1	-	4.99	2.25	2.57	-	-	1.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.36	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_6030V3.1	-	3.44	2.75	2.45	1.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.41	2.44	-	-	-	-	-	1.6	-	3.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_7620V3.1	-	5.02	2.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_13070V3.1	-	4.52	0.83	-0.34	-2.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.77	2.28	1.69	-	-	-	-	-	0.24	-	1.92	0.29	-	-	-3.42	-	-	-	-	-	-	-	-0.99	-	-	-0.68	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_17580V3.1	-	3.48	2.93	0.91	-	-	0.4	-	-	-0.54	1.78	2.07	-	-	-0.15	-	3.17	-	-	-	-	-	-	-	-	2.88	-	-	-	-1.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_19380V3.1	-	3.03	0.08	-2.3	-	-	-	2.21	1.55	-	-	-1.47	-1.67	-	-2.87	4.27	-2.04	-0.14	-	-1.88	-	-	-	-	-2.52	0.21	-0.83	-0.19	-1.37	-1.81	-1.08	-	-2.84	0.24	-1.36	-0.16	-	0.19	-	-	-	-	-	-0.69	-	-0.88	-0.94	-3.46
Pp3c19_23040V3.1	-	3.46	3.27	0.3	-	-	-	-	0.82	-	-	-	-	-	-3.55	3.46	2.48	-	-	-	-	-	-	-	-	2.72	0.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_13240V3.1	-	3.32	3.33	-	0.33	-	-	-	-	0.71	-	-	2.44	-	-	-	1.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.27	-	-	-	3.28	-	-	-	-	-	-	-	1.29	-	-
Pp3c1_32630V3.1	-	5.09	3.09	2.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_8199V3.1	-	3.49	0.91	-1.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.45	3.31	2.96	0.19	-	-	-	-	-0.91	-	3.1	2.39	0.06	-	-	-4.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.14
Pp3c1_870V3.1	-	4.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_1301V3.1	-	4.68	1.4	-	-	-	-	-	0.57	-	-	-	-	-	-	3.42	1.39	-1.9	-	-	-	-	-	-	-	2.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_15320V3.1	-	4.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_3298V3.1	-	4.39	3.17	1.25	-3.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.47	3.35	0.87	-1.81	-	-	-	-	-	-	-	1.65	-	-	-	-4.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_14390V3.1	-	3.88	1.55	1.98	0.15	-	-	-	1.03	-	-	-	-	-	-2.87	-	3.39	-	-	-	-	-	-	-	-	3.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_17680V3.1	-	3.46	2.37	-	-	-	-	-	2.85	-	-	-	-	-	-1.02	4.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_21199V3.1	-	1.98	0.63	-1.76	-1.69	2.18	1.5	0.35	0.29	-	-	-	-	-	-4.62	4.56	1.14	-	-	1.22	0.56	-	-	-1.03	-	0.1	-	-	-1.66	-1.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.92
Pp3c22_20148V3.1	-	2.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.86	1.21	-	-	-	-	-	-	-	-	3.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_10720V3.1	-	4.26	1.68	-	-2.3	-	-	0.13	-	-1.93	-0.19	0.41	-0.64	-	-3.12	-0.61	2.45	-	-	1.04	1.11	-1.2	-	-0.75	0.14	1.54	-0.6	-	0.45	-2.6	-	-	-	-	-1.5	-	-	0.05	-	-0.82	-	-1.0	-	-0.39	-1.57	-	-	-
Pp3c23_10730V3.1	-	4.67	4.08	-	-	-	-	-	-	0.51	-	-	-	-	-1.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_1090V3.1	-	4.82	1.65	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.29	-	-	-	-	-	-	-	-	3.04	-	-	1.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_22690V3.1	-	4.13	-	-1.82	-	-	-0.28	-1.33	-	-	-	-	-	-	-	3.6	2.1	0.25	-	-	-0.1	2.2	-	1.11	-1.2	1.27	-	-	-	-	-1.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.99	-	-	-	-	-
Pp3c23_8030V3.1	-	4.98	0.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.7	1.95	-	-	-	-	-	-	-	-	2.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_13180V3.1	-	4.4	0.87	-	-	-	-	-	-	-1.48	-	-	-	-	-1.14	3.96	0.23	-0.87	-	-	-	-	-	-	-0.67	1.76	0.09	-	-	-	-1.62	-	-	-	-	0.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c26_12510V3.1	-	3.4	2.01	0.71	0.3	-	0.58	-	-	-	-	-	-	-	-4.84	1.58	2.24	0.7	2.79	1.77	-	0.41	-	-	-1.1	2.78	-	-	-	-4.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.52	-
Pp3c27_4220V3.1	-	4.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_29190V3.1	-	4.75	2.81	2.01	-1.34	0.18	-	2.27	-	-3.8	-	-2.8	-	-	-	-	-0.17	-1.22	-	-2.08	-	-	-	-2.38	-	0.37	-	-	-	-4.74	-	-2.67	-	-	-2.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.49
Pp3c2_29219V3.1	-	4.19	1.65	0.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.93	4.46	1.44	-0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_29220V3.1	0.54	2.71	2.38	-0.03	-0.79	-0.35	-0.26	0.02	1.67	-1.34	-0.67	-	-2.84	-	-1.18	0.47	2.37	0.45	-	-3.26	-1.38	-2.19	-0.29	2.47	0.01	1.81	-1.55	-3.25	-2.35	-1.13	-1.62	-0.8	-1.78	-1.08	-3.73	-1.07	-0.82	-1.23	-2.58	-2.62	-	-	-2.25	-3.8	-2.18	-1.09	-2.17	-1.14
Pp3c2_4340V3.1	-	4.6	-	1.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.43	0.8	-	-	-	-	-	-	-	3.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_9780V3.1	-	3.67	3.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_6650V3.1	-	3.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_24780V3.1	-	3.39	2.99	-	-0.56	-	-	-	-	-	0.55	-	-	-	-3.95	-	2.94	-	-	-	-	-	-	-	-	2.73	-	0.69	0.36	-1.6	-	-	-0.13	-	0.24	-	-	0.6	-	-	1.92	-	0.41	-	-	-	-	0.09
Pp3c4_26010V3.1	1.57	4.62	3.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.86	-	-	-	-	-	-	-	-	1.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_15760V3.1	-	4.4	3.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_16535V3.1	0.14	2.75	-0.11	0.39	0.52	-1.12	0.74	0.49	1.46	-4.87	0.18	0.96	-2.8	-2.32	-2.91	4.32	1.54	-0.72	-1.02	-3.44	-2.27	-	-	-1.91	-2.5	-0.4	-	-2.45	-2.93	-1.95	-4.44	-3.88	-	-	-3.88	-3.5	-	-2.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.51	-3.83
Pp3c5_25960V3.1	2.17	4.99	2.98	1.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_710V3.1	-	4.86	1.97	-0.29	-2.32	-1.37	-0.51	0.02	-	-	-	-	-	-	-	-0.13	2.65	-	-	-	-	-	-	-1.77	-	2.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_12165V3.1	-	3.82	0.03	-	3.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.57	1.72	0.63	-	-	-	-	-	2.57	-	-	-	-	-	-2.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.62	-	-
Pp3c6_14640V3.1	-	4.16	1.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.51	1.47	-	-	-	-	-	-	-0.46	-	0.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_19020V3.1	-	4.65	-1.16	0.1	-	-	-	-0.21	-	-	-	-	-	-	-3.0	3.06	2.06	0.44	-	-	-	-	-	-	-0.37	2.08	0.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_29050V3.1	-	4.2	2.0	-	2.02	-	2.68	-	1.82	-	-	-	-	-	-1.32	-	3.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_20990V3.1	0.62	4.73	1.8	-	-	1.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.45	-	-	-	-	-	-	-	-	2.75	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.6	-	-	-
Pp3c7_25700V3.1	-	4.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.68	4.4	-	-1.99	-	-	-	-	-	-	-0.79	1.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_26060V3.1	-	5.0	4.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_25350V3.1	-	5.01	2.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.21	-	3.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_390V3.1	-	2.66	-	0.5	2.98	-	2.49	-	-	-	-	-	-	-	-3.34	-	4.45	0.66	-	-	-	-	-	-	-	1.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_4630V3.1	-	4.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.63	-0.47	-0.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_16400V3.1	-	4.84	-2.74	-2.51	-	-	-	-	-1.7	-	-	-	-	-	-4.39	3.14	2.05	-0.24	-	-	-	-	-	-1.54	-	2.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_1690V3.1	-	3.55	-	-	2.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s76_50V3.1	-	4.1	2.36	1.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.62	-	3.69	-	-	-	-	-	-	-	-	3.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.