Heatmap: Cluster_295 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c11_17530V3.1	-1.26	-0.77	-1.34	-2.67	0.55	-0.04	-0.68	-0.31	-1.33	0.85	-1.8	-2.22	0.44	-0.86	0.54	-0.93	-0.59	-0.64	-0.26	-0.13	-0.21	0.36	-2.23	-1.93	0.36	-0.9	-0.21	0.31	0.43	0.22	0.7	0.11	0.77	0.52	-0.19	0.48	0.67	0.7	-0.32	0.61	0.19	-0.15	0.46	0.53	0.3	0.67	0.52	0.14
Pp3c11_23000V3.1	-1.93	-0.92	-0.1	-1.58	1.14	0.93	1.1	1.01	0.17	0.39	-2.36	-2.23	0.52	0.47	0.76	-0.83	0.33	-0.46	0.08	0.58	0.61	0.18	-0.99	-1.5	0.61	0.26	0.82	-0.11	-0.88	-0.4	-0.03	-1.04	-0.1	-0.63	-1.22	-0.34	0.27	-0.05	-0.65	-0.17	-0.26	-0.24	0.4	-0.49	-0.32	-0.17	-0.63	-0.07
Pp3c11_3120V3.1	-1.57	-0.56	-2.67	-3.53	1.25	0.74	0.06	0.21	-1.24	1.64	-3.37	-3.64	1.46	0.87	1.26	-0.89	-0.43	-0.01	-0.09	0.46	0.57	1.19	-4.22	-2.13	0.01	0.38	-1.43	-0.03	-1.08	0.04	0.65	-0.26	0.35	-0.45	-2.0	-0.49	1.08	0.61	-1.87	-0.36	-1.63	-1.91	0.05	-0.59	-0.47	0.73	-0.77	-0.6
Pp3c11_9730V3.1	-0.17	-0.57	-0.55	-1.66	0.95	0.53	-0.12	0.11	-0.69	1.03	-1.5	-1.73	0.54	0.32	0.54	-0.72	0.37	-0.69	0.21	0.41	0.54	0.32	-1.25	-0.93	1.41	0.02	0.95	-0.52	-1.85	-0.77	-0.62	-0.72	0.04	-0.19	-1.29	-0.19	-0.33	0.24	-0.32	0.11	0.07	-0.18	0.4	0.55	0.04	0.24	-0.2	-0.61
Pp3c12_1420V3.1	-0.91	-0.52	-0.42	-2.13	0.13	0.04	-0.23	-0.12	-0.62	0.5	-0.35	-0.4	0.63	0.58	0.31	-0.86	0.06	-0.04	-0.32	0.09	0.43	0.29	-1.73	-0.86	0.2	0.12	-0.08	-0.18	-0.07	0.06	0.33	0.09	0.43	0.2	-0.36	-0.1	0.36	0.24	-0.23	0.16	0.34	0.33	0.29	0.08	0.21	0.34	-0.11	0.01
Pp3c12_3620V3.1	-0.37	-1.9	-0.18	-1.83	0.65	0.44	0.46	0.67	-0.33	0.53	-0.17	-0.2	0.03	-0.94	0.57	-1.27	-0.18	-0.58	0.11	0.29	0.1	-0.01	-1.22	-0.68	0.46	-0.3	0.52	-0.27	-0.45	-0.01	0.36	0.32	0.43	-0.03	-1.68	-0.39	0.51	0.27	-0.98	0.18	0.1	-0.11	0.42	0.46	0.06	0.22	0.17	0.09
Pp3c14_24660V3.1	-0.79	-1.54	-0.64	-3.63	0.44	-0.03	0.08	0.3	-2.83	0.41	-1.19	-1.12	0.6	0.98	0.4	-1.65	-0.09	-0.13	-0.06	-0.19	-0.26	-0.29	-0.66	-1.77	0.02	-0.01	-0.21	0.35	0.03	0.18	0.39	0.25	0.07	0.37	-1.18	0.2	0.79	0.49	-0.43	0.25	0.69	0.45	0.25	0.24	0.17	0.48	-0.18	0.52
Pp3c14_4050V3.1	-1.18	-1.07	-1.01	-3.14	0.39	0.02	-0.53	-0.38	-0.83	0.82	-0.56	-0.93	0.91	0.3	0.73	-0.78	-0.77	-1.06	-0.22	-0.2	-0.42	-0.5	-1.15	-2.23	-0.16	0.08	0.07	0.26	0.03	0.33	0.69	0.76	0.43	-0.15	-0.87	0.1	0.85	0.73	-0.6	0.22	0.52	0.21	0.34	0.03	0.26	0.72	0.23	0.09
Pp3c14_6250V3.1	-0.76	-0.17	-1.17	-2.81	0.9	0.61	0.65	0.42	-0.5	0.92	-1.66	-1.36	0.17	-0.64	0.94	-0.34	-0.0	-0.7	0.5	0.21	0.08	-0.18	-1.32	-1.86	-1.16	0.27	-2.03	0.68	-1.33	0.38	0.49	0.73	0.05	0.3	-1.46	0.14	0.01	0.86	-0.47	-0.24	-0.37	-0.45	0.08	0.08	-0.86	0.79	0.4	0.57
Pp3c14_6300V3.1	-0.77	-1.71	-2.87	-3.43	1.14	-0.21	-0.07	-0.8	-1.47	1.15	0.22	0.34	1.12	0.17	0.78	-0.23	-0.68	-1.29	-0.7	-0.75	-0.31	-0.86	-2.63	-1.58	-0.04	-1.27	0.27	-2.81	-1.26	-0.21	0.17	0.57	0.27	-0.04	-0.0	-0.28	0.35	0.38	0.06	0.98	0.58	0.44	1.1	0.7	0.4	0.43	0.22	-0.69
Pp3c15_13120V3.1	-0.86	-1.75	-0.7	-2.3	0.61	-0.08	0.42	-0.08	-0.66	0.5	-1.98	-2.52	0.39	-0.38	0.41	-1.12	-0.07	-0.81	0.21	0.35	0.46	-0.06	-1.77	-2.07	0.28	0.35	0.59	0.16	-0.18	-0.11	0.53	0.21	0.27	0.21	-0.72	-0.2	0.59	0.67	-0.36	0.0	0.85	0.61	0.17	0.19	0.04	0.6	-0.08	0.12
Pp3c15_15500V3.1	-1.13	-0.96	-0.79	-3.58	1.26	-0.27	-0.04	0.14	-1.39	0.66	-0.11	-0.32	0.59	0.3	0.58	-3.19	-0.56	-1.51	-0.03	0.59	0.77	0.32	-1.92	-2.21	0.13	-1.07	0.24	-0.44	0.13	-0.31	0.17	-0.34	0.45	-0.12	-1.69	-0.1	0.39	0.22	-0.08	0.44	0.87	0.73	0.72	0.22	0.16	0.21	0.03	-0.16
Pp3c16_10047V3.1	-2.61	-1.15	-0.97	-0.54	0.32	-0.34	-1.22	-0.64	-1.87	1.23	0.17	0.27	1.51	0.17	1.24	-2.52	0.53	0.06	0.83	0.31	0.04	0.05	-3.75	-1.96	0.77	-0.26	0.78	-0.18	-1.58	-0.17	0.32	0.26	0.11	-0.07	-1.3	-0.65	0.58	0.74	-1.24	-0.07	-0.04	-0.14	-0.42	-0.0	-0.62	0.67	-0.5	-0.52
Pp3c16_13660V3.1	-8.76	-2.83	-3.54	-5.54	-0.69	-0.09	-0.25	-0.37	-2.24	1.47	-1.64	-1.42	1.43	0.7	1.14	-2.44	-0.99	-0.92	-0.67	-0.17	-1.7	-1.21	-4.74	-0.37	0.72	0.47	0.1	0.14	-0.44	0.32	1.57	0.85	0.6	-0.27	-0.79	-0.3	1.38	1.45	-1.9	-0.54	-0.61	-0.59	-0.1	-0.53	-0.51	1.28	-0.18	0.19
Pp3c16_19150V3.1	-0.78	-1.76	-0.98	-2.5	0.81	-0.22	0.0	0.04	-1.04	0.74	-0.66	-0.71	0.39	-0.24	0.58	-1.46	-0.82	-1.13	-0.22	-0.04	0.12	0.33	0.11	-0.4	0.18	-1.18	0.21	-0.31	-0.24	0.05	0.62	-0.09	0.62	0.16	-0.5	0.4	0.54	0.05	-0.27	0.46	0.56	0.31	0.69	0.45	0.24	0.0	0.3	-0.06
Pp3c16_25540V3.1	-1.69	-1.41	-1.32	-5.05	0.66	0.48	0.72	0.78	-3.57	1.28	-2.7	-2.8	1.24	0.64	0.88	-1.75	-0.83	-1.69	-0.19	0.01	-0.13	-0.45	-0.31	-1.97	0.08	-1.1	0.02	-0.53	-0.8	-0.01	0.52	-0.37	0.58	0.09	-2.43	0.02	0.64	0.44	-0.57	0.27	1.02	0.87	0.71	-0.02	-0.14	0.38	0.02	-0.07
Pp3c17_13550V3.1	-0.82	-1.94	-1.22	-2.47	0.86	0.29	0.13	0.06	-1.26	0.67	-1.44	-1.35	1.09	0.75	0.3	-1.14	-0.82	-1.43	0.29	0.33	0.18	-0.16	-1.6	-3.13	0.53	-0.41	1.29	-0.12	1.08	-0.3	0.25	-0.51	0.24	-0.28	0.54	-0.16	0.49	0.32	-0.28	-0.18	0.07	-0.05	0.4	0.04	-0.26	0.3	-0.34	-0.1
Pp3c17_17390V3.1	-1.79	-0.57	-1.67	-1.49	0.45	0.7	-0.07	-0.32	-2.19	1.06	-0.6	-0.52	1.01	0.03	0.68	-1.87	-1.38	-0.42	-1.0	-0.57	-0.04	0.15	-4.88	-0.3	-0.0	0.3	0.44	-0.28	-1.5	-0.09	0.68	0.49	0.55	-0.0	-0.95	0.08	0.97	0.29	-0.66	0.22	0.4	0.27	0.29	0.65	-0.39	0.33	0.69	0.17
Pp3c17_23200V3.1	-1.08	-0.77	-0.86	-2.2	1.23	0.12	-0.38	0.0	-0.21	0.39	-0.83	-0.79	0.61	0.77	0.39	-0.73	-0.34	-0.46	0.13	0.5	0.39	0.14	-0.42	-1.55	0.58	0.35	0.84	-0.26	-0.57	-0.21	0.32	-0.52	0.25	-0.27	-0.33	-0.32	0.49	0.17	-0.42	0.1	0.23	0.08	0.16	-0.06	0.02	0.27	-0.35	-0.29
Pp3c18_16630V3.1	-0.61	-1.12	-1.06	-2.99	1.08	-0.45	-0.58	-0.4	-0.7	1.01	-0.56	-0.64	0.93	0.59	0.76	-0.07	-0.79	-0.88	-0.72	-0.66	-0.1	0.1	-1.84	-1.59	0.74	0.03	0.5	-0.58	-0.51	-0.39	0.49	0.06	0.53	0.15	-0.56	0.26	0.39	0.43	-0.08	0.14	0.13	0.05	0.38	0.32	0.2	0.48	0.26	-0.46
Pp3c18_21700V3.1	-1.87	-1.19	0.06	-1.52	-0.02	-0.3	-0.89	-0.03	-0.37	0.64	-2.33	-2.37	0.64	0.27	0.12	-0.7	-0.14	-0.68	-0.05	0.29	-0.11	0.18	-2.03	-0.23	0.21	0.08	0.02	0.27	-0.94	-0.15	0.37	-0.05	0.41	0.26	-1.31	0.66	0.64	0.76	-0.11	0.31	0.3	0.52	0.2	0.59	0.15	0.79	0.17	0.26
Pp3c18_22050V3.1	-1.23	-1.88	-1.15	-2.86	0.28	0.16	-0.04	-0.3	-0.62	0.67	-1.33	-1.42	0.28	-0.63	0.55	-0.56	0.11	-1.49	0.64	0.75	0.55	-0.02	0.06	-2.75	0.15	-0.8	0.4	0.05	0.03	0.19	0.89	0.26	0.25	-0.4	-2.82	-0.02	0.69	0.23	-1.19	0.49	0.52	0.4	0.48	0.51	0.11	0.19	0.51	0.11
Pp3c19_20450V3.1	-0.54	-0.46	-0.07	-0.63	0.75	-0.3	-0.57	-0.41	-0.78	0.64	-1.26	-1.35	1.04	0.76	0.65	-0.56	0.14	-0.33	0.54	0.51	0.47	0.53	-0.5	-0.68	0.34	0.27	0.04	-0.19	-0.61	-0.57	0.11	-0.25	0.09	-0.11	-1.14	0.45	0.03	0.29	-0.3	0.1	-0.04	-0.08	0.13	-0.18	-0.1	0.3	-0.65	-0.13
Pp3c19_5060V3.1	-1.44	-1.71	-1.05	-2.85	0.58	0.07	0.62	0.49	0.25	0.59	-1.02	-1.09	0.1	-0.03	0.19	-1.36	0.06	-0.43	0.52	0.69	0.39	0.03	-2.72	-1.79	0.59	-0.06	0.38	0.46	-0.34	0.08	0.42	0.26	0.2	0.19	-1.31	0.23	0.41	0.52	-0.51	-0.19	0.17	0.07	-0.05	0.01	-0.19	0.47	0.2	0.13
Pp3c1_18430V3.1	-0.68	-0.85	-0.23	-2.36	0.06	-0.63	-0.34	-0.15	-0.49	1.15	-0.89	-1.14	1.17	0.58	0.75	-1.75	-0.36	-1.25	-0.52	-0.44	-1.21	-0.74	-3.71	-4.07	-1.47	-1.57	-0.8	0.04	0.26	0.22	0.71	-0.15	0.69	1.23	-0.37	-0.37	0.56	0.79	0.06	0.66	-0.05	0.1	0.86	0.38	0.3	0.71	0.1	0.37
Pp3c1_36370V3.1	-3.61	-2.25	-2.57	-5.04	1.34	0.56	-0.33	-0.07	-3.42	0.6	-2.15	-2.41	0.21	0.04	0.44	-2.78	-1.1	-2.07	0.01	0.49	0.76	0.47	-2.64	-2.1	0.48	-1.68	0.27	0.04	-0.04	-0.0	0.48	-0.06	0.77	0.31	-1.85	-0.2	0.72	0.24	-0.38	0.72	1.02	0.77	0.99	0.55	0.55	0.17	0.33	-0.29
Pp3c1_8270V3.1	-0.11	-1.33	-0.76	-2.42	-0.83	-1.22	-1.76	-1.37	-1.21	0.93	-0.22	-0.27	1.09	0.53	0.62	-2.09	-0.59	-0.28	-0.88	-0.64	-0.54	0.09	-3.29	-1.59	-0.08	0.17	-0.38	0.09	0.16	0.24	0.66	0.34	0.35	0.34	-0.19	0.12	0.62	0.94	-0.0	0.36	0.24	0.2	0.23	0.33	0.15	1.03	0.74	0.17
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Pp3c4_20210V3.1	-2.32	-1.07	-0.67	-2.08	-0.08	-1.28	-0.88	-0.77	-1.4	0.71	-0.84	-1.06	-0.57	-0.64	0.38	-1.41	0.21	0.2	-0.52	-0.0	0.46	0.61	-2.05	-0.5	1.23	0.03	-0.03	-0.16	-0.21	0.24	0.16	0.21	0.51	0.36	-0.79	-0.38	0.0	0.35	-0.32	0.63	0.79	1.06	0.78	0.39	0.53	0.29	0.72	-0.6
Pp3c5_220V3.1	-0.9	-0.87	-0.49	-0.44	0.72	-0.32	-0.38	-0.4	-0.61	0.45	0.11	0.16	0.56	0.8	0.74	-1.29	-0.95	-0.63	-0.43	0.25	0.01	0.05	-1.94	-0.57	0.71	-0.89	0.42	-0.4	-0.46	-0.09	-0.12	-0.27	-0.05	-0.35	-0.79	-0.29	0.09	0.49	-0.22	0.36	0.83	1.0	0.46	0.14	0.03	0.48	-0.16	-0.15
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Pp3c6_17140V3.1	-4.74	-1.98	-2.11	-3.55	0.65	0.87	0.89	0.6	-1.52	0.33	-0.9	-0.83	0.39	-0.26	0.04	-1.17	-0.27	-1.71	0.95	1.06	0.32	0.35	-1.66	-1.22	0.62	0.43	0.14	0.47	-0.31	0.03	0.66	0.61	0.09	-0.12	-1.14	-0.46	0.5	0.35	-0.6	0.01	-0.52	-0.46	-0.18	0.49	-0.22	0.26	0.21	0.15
Pp3c6_21250V3.1	-3.42	-1.89	-1.89	-4.0	-0.54	-1.07	-1.29	-1.03	-2.22	0.8	0.25	0.16	0.57	-0.16	0.96	-1.05	-1.55	-1.33	-0.12	-0.44	-0.8	-0.57	-1.54	-1.92	0.07	-0.01	-0.07	0.45	-0.37	0.67	0.91	0.08	0.68	0.42	-0.58	0.34	0.85	0.8	-0.67	0.24	0.99	1.09	0.12	0.35	0.24	0.72	0.3	0.57
Pp3c8_17530V3.1	-1.06	-1.71	-1.34	-3.06	0.82	-0.16	-0.2	-0.37	-0.82	0.78	-0.32	-0.63	0.96	0.98	0.71	-1.35	-1.64	-1.51	-0.22	-0.04	0.51	0.42	-3.24	-1.85	0.62	-1.13	0.47	-0.91	-0.8	-0.07	0.2	0.05	0.43	-0.16	-1.34	-0.33	0.41	0.16	-0.47	0.52	1.29	0.8	0.7	0.48	0.46	0.11	-0.16	-0.2
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Pp3c9_4770V3.1	-0.62	-1.98	-0.68	-2.79	0.84	0.43	0.13	0.06	-0.82	0.74	-0.19	-0.22	0.78	0.65	0.43	-2.05	-1.44	-1.5	-0.75	-0.32	0.0	0.23	-1.01	-2.04	0.53	-0.56	0.15	0.04	-0.4	-0.2	0.66	0.33	0.26	-0.04	0.28	0.15	0.65	0.19	-0.35	0.19	0.6	0.2	0.37	0.27	-0.11	0.14	0.43	-0.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.