Heatmap: Cluster_116 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_16670V3.1	-	-	1.1	1.32	0.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.97	1.88	-1.91	-	-	-	-	-	-	-	2.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_20880V3.1	-	-	2.24	-	-	-	-	-	-0.29	-	-	-	-	-	-	4.82	2.5	-	-	-	-	-	-	-	-	3.11	-	-	-	-4.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_21500V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.46	2.21	-	-	-	-	-	3.28	-	-	3.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_1220V3.1	-	-	-	1.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.98	3.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_21070V3.1	-	-	-2.39	-	-1.92	-	-	-	-1.87	1.69	-	-	-0.7	-	-2.88	4.44	2.25	0.02	-	-	-0.39	-1.71	-	-	-	2.2	-	-	-	-1.01	-2.85	0.37	-	-	-	-	-	2.05	-	-	0.26	-1.48	-	-	-	1.3	-	-
Pp3c11_23470V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.08	3.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_23960V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	4.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_260V3.1	-	-	-1.71	0.67	1.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.69	3.1	-	-	0.04	-	-	-	-	-	3.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_2500V3.1	-	-	-1.26	2.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.2	5.07	1.4	-0.78	-	-	-	-	-	-	-	2.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_10240V3.1	-	-	-	0.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.09	2.9	0.01	-	-	-	-	-	-	-	1.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_12150V3.1	-	-	2.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.5	5.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_19470V3.1	-	1.63	-0.12	-	0.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.39	4.91	3.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_2390V3.1	-1.59	2.02	-1.3	-	-1.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.22	0.66	-2.29	-	-	-	-	-	-	-	1.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_5690V3.1	-0.18	-	-	-	-0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.85	5.3	1.59	-	-	-	-	-	-	-	-	1.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c17_11620V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.66	4.12	2.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c17_15370V3.1	-	-	-	-0.93	-	-	-	-	-0.88	-	-	-	-	-	-	5.11	1.81	0.96	-	-	-	-	-	1.06	-	2.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_1150V3.1	-	0.06	-0.2	-1.86	-0.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.82	3.44	-	-	-	-	-	-	-	-	2.54	-	-	-	-2.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_600V3.1	-	-	-	-1.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.05	2.49	-	-	-	-	-	-	-	-	3.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_620V3.1	-	-	-	-	1.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.81	3.73	-	-	-	-	-	-	-	-	1.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_11130V3.1	-	-	-	1.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.4	-0.31	0.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_12440V3.1	-	-0.44	0.28	2.12	-	-	-	-	-0.35	-	-	-	-	-	-	4.7	2.21	1.87	-	-	-	-	-	-	-	2.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_18030V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.28	2.57	0.57	-	-	-	-	-	-	-	0.58	-	-	-	-2.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_20081V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.85	3.38	-	-	-	-	-	-	-	-	3.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_21210V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.2	3.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_18410V3.1	-	-	-	-1.71	-	1.75	1.27	0.9	-	-	-	-	-	-	-	4.94	1.64	-2.14	-	-	-	-	-	-0.98	-	2.1	-	-	-1.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.08
Pp3c20_8700V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.48	4.23	-	-	-	-	-	-	-	-	2.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_9580V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.2	3.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_20820V3.1	-	2.16	0.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.68	2.99	1.16	-	-	-	-	-	-	-	2.59	-	-	-	-2.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_20990V3.1	-	2.26	1.36	0.01	-	-	-	-1.95	1.39	-	-	-	-	-	-5.31	4.45	2.48	-0.72	-	-	-	-	-	-	-	3.04	-	-	-2.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.57
Pp3c21_2870V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.8	4.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_11640V3.1	-	-	-	-	-0.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.79	5.04	3.46	1.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_2320V3.1	-	2.82	1.27	1.43	-3.46	-	-	-	-2.6	-	-	-	-	-	-3.17	4.43	2.77	0.49	-	-	-	-	-	-2.24	-	2.41	-	-	-	-3.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_12200V3.1	-	2.26	1.67	0.95	-2.65	-	-	-	1.9	-	-	-	-	-	-	4.55	1.6	0.02	-	-	-	-	-	-	-	2.75	-	-	-	-4.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_1350V3.1	-	1.16	0.29	1.14	-1.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.77	4.19	3.79	0.31	-	-	-	-	-	0.67	-	2.82	-	-	-	-4.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_8570V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.23	3.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_17790V3.1	-	-	0.51	-0.11	-	-	-	-	1.99	-	-	-	-	-	-	4.76	3.32	-	-	-	-	-	-	-	-	2.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_5380V3.1	-	-	-0.55	1.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.38	5.0	2.09	-	-	-	-	-	-	-	-	2.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c25_1360V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.35	5.37	2.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c25_4470V3.1	-	-	-	2.01	1.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c25_8790V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.76	3.19	1.87	-	-	-	-	-	-	-	3.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c27_3280V3.1	-	-	1.74	-0.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.94	2.58	-0.06	-	-	-	-	-	-	-	2.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_11860V3.1	-	-	-0.54	-0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.93	3.05	-	-	-	-	-	-	-	-	2.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_13094V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.59	5.19	3.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_20V3.1	-	-	0.63	0.4	2.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.73	4.85	1.94	-0.15	-	-	-	-	-	-3.17	-	2.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_26300V3.1	-	1.2	-0.17	0.22	-0.28	-0.46	-	-1.05	-	-	-	-	-	-	-4.22	4.96	1.88	-1.79	1.04	-	-	-	-	-	-	1.41	-	-	-	-3.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.71	-1.05	-	-	-	-1.21	-	-
Pp3c2_29376V3.1	-	-	2.21	1.06	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.74	2.22	0.63	-	-	-	-	-	-	-	2.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_10120V3.1	-	-	-2.12	1.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.41	1.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_12580V3.1	-	-	-0.39	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	5.17	1.5	-	-	-	-	-	-	-	-	2.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_18660V3.1	-	2.51	-	1.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_29090V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.48	-	-	-	-	-	5.07	3.46	0.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_36490V3.1	-	-	1.18	1.62	-3.04	-	-2.71	-2.89	-1.1	-	-	-	-	-	-7.06	5.19	1.25	-0.38	-	-	-	-	-	-2.47	-	1.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_8360V3.1	-	-	1.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.96	3.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_14790V3.1	-	2.05	-0.64	0.77	-2.54	-	-	-	2.18	-	-	-	-	-	-4.7	4.62	2.08	-	-	-	-	-	-	-	-	2.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_17800V3.1	-	-	1.17	-	-0.92	1.15	1.39	-	-	-	-	-	-	-	-4.1	4.79	1.67	-	-	0.73	1.6	-	-	-	-	0.49	0.9	-	-	-	0.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.21
Pp3c4_1940V3.1	-	-	2.43	0.62	-3.7	-	-	-	1.98	-	-	-	-	-	-4.73	4.36	2.68	-0.3	-	-	-	-	-	-1.36	-	3.13	-	-	-	-2.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_20630V3.1	-	-	-	1.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.66	5.15	1.35	-	-	-	-	-	-	-	-	2.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_24900V3.1	-	-	0.11	-0.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.8	3.26	-1.3	-	-	-	-	-	-	-	3.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_24940V3.1	-	-	0.85	2.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.23	2.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_25950V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.2	3.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_7683V3.1	1.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.23	4.75	3.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_18060V3.1	-	-	2.27	0.93	-	-	-	-	-	-	-1.11	-1.4	-	-	-	4.65	3.19	-1.82	-	-	-	-	-0.21	-0.98	-	2.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_21090V3.1	-	-	-	2.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.24	1.82	-	-	-	-	-	-	-	-	1.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_21230V3.1	-	-	1.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.97	3.15	-0.5	-	-	-	-	-	-	-	2.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_26460V3.1	-	-0.64	0.59	0.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.8	5.02	3.01	-0.67	-	-	-	-	-	-	-	1.27	-0.65	-	-	-3.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_29980V3.1	0.59	-2.81	1.59	1.02	-	-	-2.3	-2.59	-	-	-	-	-	-	-4.42	4.94	2.27	-0.46	-	-3.16	-0.98	-	-	-	-	1.87	-	-	-	-5.83	-	-2.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.27	-	-
Pp3c6_360V3.1	-	1.2	0.78	1.29	0.07	0.87	-3.12	-0.55	-	-4.11	-3.34	-3.49	-4.65	-	-3.67	4.85	0.69	-	0.48	0.56	-2.34	-	-	-	-0.34	-4.32	-1.83	-	-3.56	-2.87	-	-	-2.48	0.16	-2.09	-	-	-4.34	-3.66	-3.83	-	-	-2.87	-3.1	-1.62	-3.86	-2.99	-3.36
Pp3c7_24510V3.1	-	0.78	-	1.49	-1.73	-	1.58	-	-	-	-	-	-	-	-4.64	4.94	2.32	-	-	-	-	-	-	-0.38	-	1.89	-	-	-	-3.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_4830V3.1	-	-	1.75	-	1.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.22	5.06	2.8	-	-	-	-	-	-	-	0.02	-	-	-	-	-2.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_10660V3.1	-	-	-	1.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.98	2.79	-	-	-	-	-	-	1.3	-	1.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_17490V3.1	-	-	-	2.38	1.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.83	2.54	-	-	-	-	-	-	-	-	2.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_1940V3.1	-2.28	-	-0.54	-0.84	-3.37	-	-	-	0.79	-	-	-	-	-	-5.28	5.21	1.77	-0.86	-	-	-	-	-	-	-	1.88	-	-	-	-4.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_6600V3.1	-	-	-	-	-	1.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.18	1.35	-	-	-	-	-	-	-	-	2.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_9260V3.1	-	-	2.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.14	1.84	-	-	-	-	-	-	-	-	2.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s203_50V3.1	-	2.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.75	2.92	-	-	-	-	-	-	-	-	2.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.