Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - 2.27 -0.38 -0.92 - - - - - - - - - - 5.22 0.52 - - - - - - - - 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.32 - 0.72 - 0.49 - - - - - - - - 5.24 0.62 - - - - - - - - 2.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.55 - -1.01 - - - - - - - - - - 4.85 2.93 -0.02 - - - - - - - 2.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -0.24 - - - -0.72 - - - - - - - 5.38 1.32 - - - - - - - - 1.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.05 - 1.61 - - - - 2.38 - - - - - -3.21 4.85 2.12 - - - - - - - - 1.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.86 - - - - - 1.82 - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.35 2.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.18 - - - - - - - - - - - - 5.14 3.21 - - - - - - - - 1.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.07 - 2.14 - - - - - - - - - - - 4.57 - - - - - - - - - 1.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.9 1.59 0.37 - - - - - - - - - - -4.31 4.85 1.17 -0.08 - - - - - - - 2.99 - - - -6.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.49 - - - - - - - 1.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.07 2.91 - - - - - - - - 2.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.7 - - - - - - - - - - - 5.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.64 - - - - - - - - - - - - 5.5 - - - - - - - - - 1.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - -3.56 5.51 - -0.16 - - - - - - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.95 0.56 1.02 - - - - -0.47 - - - - -1.7 -3.85 4.25 2.54 -0.83 - - - - - -1.59 - 3.2 -1.09 - - -5.91 - - - - - - - -2.31 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.36 -0.59 -0.33 - - - - - - - - - - -2.07 3.44 2.99 1.01 - - - - - 1.58 - 1.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.94 0.5 -0.24 - - - - - - - - - - - 4.98 2.0 - - - - - - - - 1.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.27 - - - - - - - - - - - - 5.07 2.65 - - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.93 - - - - - - - - - - - - 5.15 - - - - - - - - - 2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.17 1.06 1.12 -1.26 -0.16 1.22 0.54 0.53 1.77 -1.84 - -5.24 -0.95 -1.84 -1.31 3.27 1.29 1.0 1.32 0.34 0.03 -0.39 1.87 0.43 -0.21 -0.5 -1.59 -6.26 -6.94 -5.46 -4.86 - - - - - - -2.72 - -4.45 -2.02 -1.83 -1.97 -5.59 -5.77 -3.22 -6.33 -7.03
2.14 2.32 -1.06 -0.51 -1.28 -1.46 -3.54 - -3.99 -0.32 - - -0.41 -2.6 -1.12 4.01 1.48 -0.23 -1.63 -0.77 -1.9 -2.37 1.79 -2.01 0.03 2.08 -2.41 - -2.58 -2.18 -2.72 -3.91 -1.0 -4.11 - -1.2 0.15 -3.89 - -2.41 -2.38 -3.55 -3.38 -2.95 - -2.12 -2.53 -2.65
- - - - 1.18 - - - - - - - - - - 5.23 2.52 - - - - - - - - 1.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.35 -0.5 - - - - 3.02 - - - - - - 4.91 2.2 -1.93 - - - - - - - 1.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.14 - - - - - 2.5 - - - - - - - 4.5 1.6 2.67 - - - - - - - - - - - - - 0.52 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.08 1.75 1.63 - - - - - - - - - -2.79 5.11 1.84 - - - - - - - - 0.09 - - - -2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.27 2.06 - - - - - - - - 2.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.34 0.48 0.91 - - - - - - - - - - - 5.02 - - - - - - - - - 1.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.71 2.74 0.69 - - - - - - - - - - -4.15 4.57 1.15 0.0 - - - - - - - 2.56 - - - -2.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.84 - - - - - - - - - - - - 5.47 0.79 - - - - - - -1.91 - 0.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.25 - - - - - - - - - - - - 5.06 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.15 2.22 - - 1.6 - - 1.08 - - - 4.68 - - - - - - - - - 2.56 - - - - - 1.21 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.77 - - - - - - - - - - - - 5.19 2.24 -0.56 - - - - - - - 2.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.69 1.02 - - - - - - - - - - - - 5.05 2.07 - - - - - - - - 1.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.7 - - - - - - -1.49 - - - - - 5.26 0.72 - - - - - - - - 1.57 - -0.1 - - - - - -0.56 - - - - - - - - - - - 0.64 - -
- 3.69 - 0.28 - - - - 2.82 - - - - - -2.38 4.24 1.66 1.62 - - - - - - - 0.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.43 2.45 - - - - - - - - - - - 5.24 1.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.44 - - - - -
- - 1.04 - - -0.61 - - - -2.05 - - -1.69 - -1.82 4.99 -0.32 0.64 - -0.23 - - - -0.0 - 0.72 - -0.1 -1.79 -1.39 -0.49 - - -1.02 -1.58 - 0.03 - - -1.47 - - 0.05 - 0.31 - - -
- 2.45 1.07 - - - - - 2.35 - - - - - - 4.98 1.34 - - - - - - - - -0.01 - - - -2.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.42 - 0.63 0.71 - - - - - - - - -3.7 5.33 - -1.75 - - - - - - - -1.15 - - - -3.31 -2.18 - - - - - - -1.17 - - - - - - - -1.16 - -
- - 0.68 1.12 - - - - 3.23 - - - - - - 4.91 1.28 1.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.35 2.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.94 - - -1.75 - - - - - - - - - - 5.14 2.79 - - - - - - - - 0.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.31 2.28 -4.26 -3.23 - - - 2.91 - - - - - - 4.45 -0.45 -1.05 - - - -8.7 - - - 1.25 - - - -4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.92 - - - - - - - - - - - - 5.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.16 1.81 0.39 -0.92 -0.69 1.16 0.49 0.38 2.3 -0.83 -2.45 -3.11 -1.03 -2.47 -0.37 3.6 0.38 -1.87 -0.48 0.07 0.9 0.38 1.26 -3.8 -3.22 -5.53 -7.09 -9.74 - -3.83 -2.27 -4.83 -5.69 -10.24 - -8.91 -8.38 -0.45 -5.62 -1.63 -5.76 -2.91 0.38 -1.74 -3.57 -0.35 -2.83 -7.52
- - - -0.26 -1.38 - - - - - - - - - -2.85 5.24 2.71 - - - - - - - - 1.18 - - - -3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.18 - - - - - - - - - - 5.42 - -0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.97 1.3 - - - - - - - - - - - - 5.19 - 0.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.32 - - -1.24 - - - - - - - - - - 5.27 1.2 - - - - - - - - 0.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.95 - - - - - - - - - - - - 5.17 3.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.27 - - - 3.51 - - - - - - 4.91 1.82 - - - - - - - - 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - -2.57 5.47 0.53 - - - - - - - - 1.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.46 -1.03 -0.9 - - - - - - - - - -2.1 5.25 0.43 - - - - - - -0.62 - 2.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.67 - - - - - - - - - - - -1.81 4.9 2.27 - - - - - - - - 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.17 - 1.74 - - - - - - - - - - - 5.23 1.9 -0.43 - - - - - - - 1.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.23 1.92 -0.28 - - - - 1.83 - - - - - -4.13 3.83 2.23 - - - - - - - - 1.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.5 0.73 -0.93 - - - - 2.29 - - - - - - 4.92 -0.31 - - - - - - - - 2.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.43 0.57 0.34 - - -0.17 -0.16 - - - - - - -5.49 5.15 0.63 -1.27 - - - - - - - 2.23 - - - -4.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.48 - 1.76 -0.52 - - 2.68 - - - - - - -4.5 2.95 1.67 - - - - - - - - 1.84 - - -0.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.41 -1.39 1.87 -0.39 2.26 3.21 0.21 -1.11 -3.31 - -0.96 - - -3.61 3.79 -0.52 - - - - - - - - 0.49 -2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.8 -0.19 -1.82 - - - -0.01 - - - - - -4.21 5.16 -10.84 -21.95 - - - - - - - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.94 - - - - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - -0.03 - - - - -2.77 - - - - - - - - - 0.86 - - - - - - - -
- 0.32 -0.55 -0.28 -2.22 -1.31 - - - - - - - - -7.31 5.35 1.0 -1.76 - - - - - -2.93 - 0.55 - - - -6.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.04 - - - - - - - - - - - - - 5.07 - - - - - - - - - 2.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.68 - - - 2.9 - - - - - - - - -3.49 4.62 - - - - - - - 2.57 - - - - - -2.68 - - - - - - - - - - - - - - - 1.41 - -0.48
- 4.2 - - 0.79 - - - 2.57 - - - - - - 3.39 2.67 - - - - - - - - 2.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.5 1.22 - - - - - - - - - - - - 5.31 1.58 -1.75 -0.65 -0.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.23 1.73 -0.23 -1.35 - - - - - - - - - -5.66 4.64 2.32 - - - - - - - - 2.05 - - - -5.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.07 2.41 -0.29 - -0.55 -2.32 - -0.4 -2.75 -0.09 1.21 -1.07 -2.9 - -1.06 3.65 -0.69 -0.87 - - 0.8 -0.41 - -1.15 0.34 -0.44 1.14 - 0.07 -0.77 -0.69 0.53 0.68 -2.63 1.73 -1.55 -1.4 - -2.34 -0.91 -2.13 - -1.57 - -2.25 -2.58 0.32 -1.46
- 2.07 0.45 0.79 2.09 - - - - - - - - - -5.2 4.86 1.99 - - - - - - -0.94 - 1.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.5 - - - - - - - - - - - - 5.23 1.83 - - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.18 -1.46 -3.01 - - - - - - - - - - 4.94 2.95 -0.91 - - - - - -1.8 - 1.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.41 - - - - - - 5.01 1.78 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.51 2.03 - - - - - 3.09 - - - - - - 4.54 1.1 -0.17 - - - - - - - 1.22 - - - - - - - - - - - - - - - -0.01 - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.