Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- 3.52 - 1.8 - - - - - - - - - - - 4.91 0.55 -0.44 - - - - - - - -0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.31 - - - - - - 1.16 - - - - - - 3.84 1.05 -0.19 - - - - - 0.05 - 2.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.91 4.48 3.57 -1.9 - - - - - - - - - - -6.11 -1.15 2.93 0.08 - - - - - - - 2.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.36 0.5 - - - - - - - - - - - -2.91 - - - - - - - - - - 2.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.31 - 0.76 1.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.92 2.58 - - - - - - - - - - - 5.07 - - - - - - - - - 2.04 - - - -1.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.46 -0.34 1.21 - - - - - - - - - - -4.13 2.4 2.53 -0.64 - - - - - - - 3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.16 -1.59 -0.29 -1.55 -2.31 -2.81 -0.7 1.81 -0.82 - -3.23 -0.27 -1.79 -2.51 0.95 2.17 1.45 - - -0.64 -2.93 - 0.74 -3.45 2.33 - - - -1.03 -1.42 -1.13 - - - - - 0.41 - - -0.24 -0.4 -3.07 - - 0.21 - -
- 4.61 2.49 1.49 1.05 - - - - - - - - - -3.23 - 2.56 -0.22 -1.81 - - - - - - 2.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.52 4.78 2.11 - -2.49 - - - - - - - - - -5.58 1.16 2.85 -1.1 - - - - - - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.7 -0.69 1.48 - 0.18 1.07 -0.4 - 0.08 0.89 0.17 -0.06 0.17 -0.48 2.09 1.08 1.07 - - -2.29 -0.77 - -0.25 -0.98 0.98 -2.46 -1.6 -4.05 -0.47 -1.5 -3.8 -2.6 -2.28 -1.19 -1.06 -2.59 0.63 - -0.54 -1.58 -1.33 -1.49 -3.91 - 0.08 -2.43 -1.25
- 4.19 1.69 1.49 -1.44 2.14 - - - - - - - - - 2.36 3.25 0.07 - - - - - - - 1.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.61 - 0.6 -0.23 - - - - - - - - - - 3.47 3.05 - - - - - - - - 0.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.47 3.26 - - - - - - - - - - - - 2.91 2.42 - - - - - - - - 1.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.45 1.42 2.76 -0.56 1.17 2.93 0.55 1.26 -1.79 -2.63 -0.92 -1.92 -2.32 -3.5 2.21 1.0 -0.2 -0.18 -0.09 -0.42 1.38 - -2.33 -0.58 -0.31 -0.91 - -0.83 -1.21 - - -4.07 -2.99 - - - - - -3.86 - - - -3.14 -0.47 - -3.56 -3.05
- 3.87 0.83 2.8 -0.68 -1.51 1.13 -0.74 0.47 - - - - - -4.49 2.55 2.3 -0.63 - - - -0.77 - -2.23 -2.28 2.71 -1.23 - - -3.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.6 0.66 - - - - - 1.37 - - - - - -2.74 1.75 1.01 0.42 - - - - - 1.26 - 3.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.45 - -0.22 - - - - - - - - - - - 4.23 1.4 -0.06 - - - - - - - 1.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.06 -0.84 2.61 - - - - -0.04 - 0.8 - - - - 0.38 1.0 - - - - - - - - 0.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.93 - - - - - - - - - - - - 5.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.5 - - - - - - - - - - - - 5.13 2.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.97 1.44 -0.64 2.17 0.65 1.73 1.71 1.01 0.17 -1.32 -2.88 -2.49 -2.75 -2.08 -2.18 0.52 2.1 -2.23 2.62 1.48 0.11 0.68 -1.04 -3.52 0.09 -1.79 -0.67 -0.77 0.57 -1.77 -2.15 -3.92 -2.51 -1.02 -4.89 -2.73 -2.19 -2.59 -0.46 -2.44 -2.2 -2.71 -1.76 -1.25 -2.74 -3.01 -1.64 -0.51
- 2.97 2.01 -0.78 0.8 - - -0.52 - - - - - - - 4.43 2.09 -1.25 - - - - -0.06 0.77 - 2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.18 1.79 0.22 -0.71 - - - - - - - - - - - 0.38 0.39 - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.9 -2.87 0.35 - - -1.47 0.16 - - - - - - -6.26 4.34 0.77 -1.99 - - - - - - - 3.0 - - - -6.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.61 5.07 1.64 -0.54 - - - - - - - - - - -1.57 - 2.07 - - - - - - 0.75 - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.41 - - - - - - - - - - - - - - 3.16 1.9 - - - - - - - 3.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.37 - - - - - - - - - - - - - - 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.34 2.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.72 0.85 - - - - - - - - - - - - - 2.04 - - - - - - - - 3.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.63 1.18 2.28 - - - - 0.55 - - - - - - - 2.13 2.19 - - - - - - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.98 2.43 - - - - - - - - - - - - 4.78 1.54 - - - - - - - - 2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.72 - 2.07 -0.22 - - - - - - - - - - 1.47 2.91 - - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.71 -0.5 1.58 - - - - - - - - - - -5.03 4.64 2.52 - - - - - - - - -1.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.53 -0.34 1.09 - - - - - - - - - - - 3.29 1.72 - - - - - - - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.1 1.69 1.68 0.33 - 0.67 0.96 1.98 - - - - - -6.26 2.44 2.06 -2.84 - - - - - -1.67 - 2.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.26 - - - - - - - - - - - - - - 1.48 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.35 - - - - - - - - - - - - - 4.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.37 2.61 0.44 - - - - - - - - - - - - - 1.19 - - - - 3.31 - - 2.53 0.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.09 -3.03 0.09 - - - - - - - - - - - - 3.34 -2.5 -4.03 - - - - - - 1.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.51 - - - - - 1.23 - - - - - - -3.52 - 3.49 1.9 - - - - - 2.06 - 1.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.05 0.35 0.43 0.4 0.78 -0.58 0.83 - -1.99 -1.52 - -2.73 -2.61 -2.34 3.65 0.96 1.05 - 0.02 -1.81 0.79 -0.07 -0.91 -1.04 -1.52 -0.95 -0.27 -0.78 -1.69 -1.33 -2.22 -1.45 -0.9 -2.14 -2.1 -2.5 -1.0 - -1.73 - -0.57 -1.11 -2.26 -0.18 -0.78 -3.0 -1.24
- 4.28 - 0.15 - - - - - - - - - - - 2.52 2.74 - - - - - - - - 3.9 - - - -3.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.42 0.81 1.65 -0.04 - - - - - - - - - - 3.43 2.52 - - - - - - - - 2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.28 -1.1 2.06 -3.17 0.37 0.02 - - -1.78 - - - -1.62 -2.73 2.91 0.48 1.22 -0.95 -0.94 - - - -1.94 - -0.19 - 0.05 0.86 0.06 - - -0.4 0.59 0.18 0.1 0.37 -1.1 -0.38 -0.69 - - 0.56 0.43 -0.05 -1.21 -2.0 0.09
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.07 -0.42 -0.38 - 1.03 0.98 2.04 - -1.41 - - - -0.36 -3.12 - 2.28 -1.53 - - - - - - - 2.66 - 0.98 - -1.72 -1.42 - - 0.4 - - - 0.15 - -0.44 - - -0.95 -1.23 - - 1.04 -
- 4.8 - 1.67 0.02 - - - - - - - - - - 3.3 - - - - - - - - - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.08 - - - - - - - - - - - - 5.33 0.14 - - - - - - 0.25 - 0.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.16 2.97 - 0.92 - - - - - - - - - - - - 1.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.33 - - 2.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.2 - - - 0.82 2.05 - - - - - - - - 4.46 0.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.11 - - - - - - - - - - - - - - 1.84 1.26 - - - - - - - 2.16 1.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.11 - - - - - - - - - - - - - - 1.84 1.26 - - - - - - - 2.16 1.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.38 0.12 - 0.32 - - - 0.08 - - - - - - 4.52 -0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.8 0.33 - - - - - - - - - - - - 4.48 3.2 - - - - - - - - 0.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.79 1.6 - - - - - - - - - - - - 4.72 2.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.15 4.32 2.15 0.62 -3.0 0.51 - - -0.62 - - - - - -4.41 -1.28 3.07 0.99 - 0.58 - - - -1.66 - 2.62 - - - -2.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.59 4.86 - - - - - - - - - - - - - - 3.6 - - - - - - - - 1.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.25 - - 1.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.11 0.39 -0.17 - - - - - - - - - - - - 2.45 - - 0.55 - - - - - 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.8 0.98 2.47 0.03 -2.31 - - - 1.66 - - - - - -4.94 4.47 2.13 -1.88 - - - - - -1.26 - 2.83 - - - -6.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.71 1.26 2.17 2.42 - - - - - - - - - -3.15 - 2.11 1.68 - - - - - - - 0.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.96 - -0.5 -1.16 - 1.04 1.29 - - - - - - - 0.46 3.08 0.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.87
- 3.42 - - - - - - 2.44 - - - - - -2.86 4.42 2.4 - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.82 - - 1.62 - - - - - - - - 1.17 - 3.31 1.6 - - - - - - - - 0.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.55 - - - - - - - - - - - - -4.73 - - - - - - - - - - - - - -0.92 - - - - - - - - - - - - - - - -0.75 - - -
- 5.33 -0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.69 1.61 1.56 - - - - - - - - - - -2.29 - 2.97 - - - - - - 2.29 - 1.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.72 3.18 - - - - - - - - - - - - - 1.92 - - - - - - 1.71 - 2.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.17 - - - - - - - - - - - - - - 2.19 - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.83
0.11 3.81 0.13 -1.51 - - - - 1.87 - - - - - -6.89 4.47 1.66 -0.77 - - - - - - - 0.93 - - - -5.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.34 - - - - - - - - - - - - - - 3.44 - - - - - - - - 4.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.43 1.44 0.18 - -3.43 - -0.02 1.91 - - - - - -5.64 4.24 2.22 -1.83 - - - - - -1.28 - 2.1 - - - -7.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.38 -1.17 1.18 - - -1.61 -1.71 -0.26 - - - - - -3.21 2.16 3.49 - -3.45 - - - - - - 2.79 - - - -2.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.79
- 5.3 -0.61 -1.59 - - - - -1.07 - - - - - -7.02 -1.3 0.85 -0.07 - - - - - - - 1.99 - - -3.44 -6.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.4 4.83 2.58 - -0.49 - - - - -1.99 - - - - -4.52 1.84 -1.51 - - - - - - 2.33 -1.9 1.5 - - - -4.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.98 0.37 0.56 - - - 2.17 - - - 0.55 - - - 3.01 3.28 - - - - - - - - 2.44 - - - -2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.85 3.3 - - - - - - - - - - - -3.16 - 2.44 - - - - - - - - 1.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.01 1.23 - 0.59 - - - 1.79 - - - - - -2.41 - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.37 -1.15 - -1.55 - - 0.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.45 - - - - - - - - - 0.01 - - - - - - - - - - - -1.88
- 5.28 - 3.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.09 - 0.37 - - - - - - - - - - - 2.53 0.81 0.23 - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.22 0.24 - - - - - - - - - - - - - 2.78 -0.0 - - - - - - - -0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12
- 4.93 - - - - - - 2.56 - - - - - - 2.38 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.2 - - - - - - - - - - - - -0.95 - 2.68 - - - - - - - - 2.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.97 - - - - - - 3.0 - - - - - - - 3.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.19 1.99 - - - - - - - - - - - -5.4 4.02 2.4 - - - - - - - - 2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.35 -1.86 - - 1.74 - 1.12 - -1.08 -1.21 - - - -4.09 - -0.04 -1.19 - - - - - - 2.08 2.84 2.97 - - -4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.96
- 4.86 - 4.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.58 4.25 -0.27 0.57 -1.21 - -3.47 - 1.01 - - - - - -4.63 2.38 2.55 -2.02 - - - - - -1.97 - 2.65 - - - -6.04 - - - - - - - -2.62 - - - - - - - - - -
- 4.77 1.37 -0.33 - 1.87 - - - - - - - - - - - - 2.25 - - - - - 1.79 1.83 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.33 0.3 - - 0.64 - 2.61 - -0.79 - - - - -1.54 3.41 2.47 - - - - - - 0.47 - 2.08 - - - -1.99 -0.59 - - - - - - 1.18 - - - - - 0.82 - - 0.08 -1.5
- 5.3 - - - - - - - - - - - - - - 3.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.27 -1.15 -0.83 - - - - - - - - - - - 3.63 3.5 0.48 - - - - - - - 1.34 - - - -3.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.13 1.25 0.11 -1.19 - - - 1.57 - - - - - -4.21 - 2.51 - - - - - - - - -1.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.58 3.19 0.51 - - - - -1.7 - - - - - -5.92 -1.2 1.75 -1.5 - - - - - - - 3.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.74 1.88 4.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.94 0.31 -0.52 - - - - - - - - - - 4.99 - - - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.19 - - - - - - 1.12 - - - - - -3.47 - 1.76 0.17 - - - - - - - - - - - -2.34 - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - 1.5
-1.28 4.71 2.26 1.72 - - - - - - - - - - - - - 2.0 - - - - - - - 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.74 - 0.9 0.47 - - - - - - - - - -2.65 - 3.19 0.37 - - - - - - - 2.38 1.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.49 - 2.3 - - - - - - - - - - - 2.35 - 2.05 - - - - - - - 3.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.45 2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.6 - 0.37 -0.46 - - - - - - - - - - - - 2.41 1.78 - - - - - - 3.39 - - 1.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.83 - 2.18 -0.51 - - - - - - - - - - - 3.3 - - - - - - - - 2.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.47 3.03 - 0.06 - - - - - - - - - -2.97 - 4.0 - - - - - - - - - - - - -1.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.39 -1.31 -1.64 0.82 - - - -0.84 - - - - - -5.18 - 2.04 2.65 - - - - - 0.06 - 3.64 - - - -4.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.33 2.49 - - - - - - - - - - - -4.1 - -0.99 - - - - - - - - 0.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.79 -1.08 1.26 - - - - - - - - - - - 2.13 2.8 -0.75 - - - - - - - 2.42 - - -1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.35 4.25 - 3.64 - - - - - - - - - - - - 1.66 - - - - - - - - 1.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.69 - - - - - - - - - - - - - 5.04 - - - - - - - - - 1.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.