Heatmap: Cluster_122 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - 0.42 4.06 - - - - 2.22 - - - - - -4.06 0.64 3.56 - - - - - - - - 3.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.16 - - - 2.27 - - - - - - - 3.63 1.91 - - - - - - - - 3.12 - - 1.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.11 0.53
-0.51 -1.94 -2.36 2.48 -2.72 -0.33 -1.87 -0.96 1.28 -4.55 -5.74 -6.04 -4.32 -3.29 -6.1 -2.26 3.94 -2.16 0.51 -2.3 -4.94 -2.05 1.02 -4.08 3.04 -1.14 2.84 -3.99 -2.91 -3.55 -6.78 -6.76 -4.13 -2.09 -3.04 -6.14 -4.53 -6.1 -4.63 -5.53 -5.23 -3.98 -4.17 -4.23 -4.96 -5.35 -6.41 -2.16
- 2.52 -0.39 2.45 - - - - - - - - - - - 4.67 2.22 1.37 - - - - - - - 1.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.56 -0.86 4.6 -1.33 0.71 0.94 0.56 - -3.02 - - - -1.57 -1.14 1.36 1.16 1.07 0.4 -0.09 0.16 1.2 - - - -1.54 - - -1.91 - -1.46 - -1.76 - -2.04 - - - - - - -1.69 - - -2.1 -0.61 - -3.18
- - 1.32 2.85 - - - - - - - - - - - 3.31 3.9 0.61 - 2.74 - - - 0.72 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.06 -3.73 -10.8 5.19 -3.31 0.99 -1.73 0.65 1.81 - - - -6.8 -10.25 -10.01 -1.12 -8.6 -2.6 -9.28 -11.27 - -7.66 -0.68 -5.17 -5.54 0.79 - - - -15.15 -13.54 - -13.41 - - - - - - -12.63 - - -12.11 - - - - -
- - 1.13 4.16 - - - - - - - - - - - - 3.66 0.73 - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.13 - - - - - - - - - - -1.42 - 2.66 - - - - - - - - 2.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.91 2.27 - - - - - 3.24 - - - - - 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.7 - - - - - - - - - - - 4.38 3.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.7 -0.6 2.38 2.89 -0.6 - - - 1.56 - - - - - -5.71 3.94 1.53 0.18 - - - - - -0.58 - 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.1 2.36 -3.08 - -0.28 - - -1.66 -1.07 0.39 -0.21 -0.74 -0.98 3.69 2.65 1.06 - 0.03 0.62 -1.99 - -0.53 -1.9 0.75 - -0.26 1.12 -1.02 -0.55 - -1.35 - -2.29 - -0.62 0.39 - -0.2 -1.06 - -2.12 -1.5 - -24.28 - -1.84
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.3 3.66 - - - - - - - - - - - - 4.55 1.23 - - - - - - - 2.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.62 2.83 - - - - - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - 3.18 - - - -1.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.5 1.43 3.16 -1.35 - - - - - - - - - -5.92 4.58 2.54 -1.5 - - - - - - - 2.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.01 - - - - - - - - - - - - 4.01 - - - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.05 1.81 - - - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - 3.97 - - - -0.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.93 - - - - - - - - - - - - 4.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.69 4.77 - - 1.68 - - - - - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - 0.05 - - 1.39 - - - - - - - - - - - - - - - -1.16
- - 0.48 3.2 - - - - 0.84 - 2.0 3.25 - - - - 2.98 - - - - - - - 0.57 2.0 - - 0.9 -2.31 - 0.92 - - - 1.52 - 0.95 - - - - - - - - - -
- - 1.45 4.36 - - - - - - - - - - -2.66 - 3.03 3.16 - - - - - 1.68 - - - 2.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.66 - 4.33 - 2.8 0.82 3.28 - - - - -2.64 0.69 -5.08 - - -2.56 - - - -1.72 - 1.19 - 0.39 - - -0.45 -1.15 -0.98 - - - - - - - - - - - -2.2 - - - - -2.87
- - 2.28 5.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.97 - - - - - - - - - - - 5.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.73 - - - - - - - - - - - - 3.42 - - - - - - - - 3.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.42 - - - - - - - - - - - 3.88 3.76 - - - - - - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.51 2.14 2.22 1.67 1.13 0.95 1.52 -1.93 -0.16 -0.32 -1.17 -0.46 -2.06 -0.34 -0.67 3.28 -6.1 -0.72 -1.97 -4.96 -4.61 -2.27 -4.91 1.71 1.43 1.07 -8.18 -5.21 -4.68 -5.3 -0.14 -6.7 -6.88 - -5.19 -5.26 -3.61 -6.2 -5.39 -4.78 -6.58 -3.22 -4.96 -7.36 -3.43 -4.71 -0.71
2.37 0.53 1.88 4.16 -5.28 -0.8 -1.81 -3.35 -1.5 -2.93 -2.09 -1.64 -1.68 -2.22 -2.4 3.24 0.35 0.55 -4.04 -1.1 -3.18 -0.95 -3.75 0.08 -0.66 -1.39 -1.95 -3.04 -1.69 -4.47 -6.31 -5.32 -6.2 - -3.36 - -5.25 -3.4 - -3.59 -3.79 -4.95 -2.05 - -4.36 -5.32 -3.41 -4.71
- 2.05 0.46 2.91 - - - - - - - - - - -4.57 4.23 3.26 -1.43 - - - - - - - 2.61 - - - -15.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.95
-4.64 - -3.82 3.91 2.63 0.77 -0.16 -0.39 -0.2 -8.41 -7.34 -7.5 -5.44 - -4.17 -3.04 -5.75 -1.81 - -4.85 - -5.49 -4.17 1.84 0.69 3.96 -0.05 - -7.4 -7.68 -7.76 - -9.21 - -7.05 - - - - - -5.54 - - - - - - -5.42
- - - 4.49 1.3 1.56 2.06 2.27 - - - - - - - 1.52 2.97 - - - - - - - - - - - - -1.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.27 - - 3.27 - 2.9 - - - - - -0.99 - 3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.35 0.3 3.81 -0.98 -0.16 -0.32 1.58 - -1.08 -1.85 -0.89 - -2.64 -0.84 -1.2 0.21 0.82 -0.67 -0.87 -0.96 1.62 - 0.53 -2.3 -0.59 - -2.69 -2.34 -0.9 1.41 - -4.79 -3.15 - - -2.65 -1.63 - -0.12 1.16 -0.71 -0.17 -0.72 -1.57 -2.92 - 1.43
1.78 -1.22 - 4.67 0.16 - 3.34 0.43 0.06 - -2.64 - - - -4.76 -0.68 0.26 -2.64 - -3.38 - - -0.51 -3.06 -3.43 -0.46 - - -2.87 -3.1 - -3.81 - - -1.76 -3.65 - -2.26 - - - - - - - -3.66 - -2.72
- - - 3.94 1.35 2.74 -0.65 2.19 - - - - -1.3 - - - 1.72 2.51 - - - - 1.56 0.2 0.27 1.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.51 - - - - - - - - - - -3.73 - 0.28 -0.72 - - - - - - - -0.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.3 - - - - 0.99 - - - - - - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.23 1.93 4.57 - - - - - - - - - - - - 2.76 - - - - - - - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.56 0.92 - - - - - - - - - - 4.93 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.18 - - - - - - - - - - - - - 2.61 - - - - - - - 2.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.39 -1.59 -0.73 0.97 1.04 0.88 0.81 0.81 0.01 -0.2 -0.14 -1.1 -1.15 -2.01 -0.12 -1.12 2.89 -1.14 0.33 0.58 0.34 0.24 -1.75 -1.57 2.26 -0.12 0.65 0.14 -1.42 -0.84 -1.38 -0.35 -0.68 -0.41 -1.7 -1.05 -0.75 -1.58 -1.14 -1.12 -2.58 -1.87 -0.81 -0.46 -1.07 -1.53 -0.76 -0.59
- - - 2.74 - 3.05 - - - - - - - - -3.05 - 3.43 2.48 - - - - 2.1 2.91 - 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.85
- 1.31 2.6 4.41 -0.5 - - - - - - - - - -5.11 1.61 3.16 -0.95 - - - - - - - 2.27 - - - -4.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.01 2.2 -2.22 1.64 2.02 1.38 - -0.78 - -2.19 -0.67 -3.19 -0.02 3.02 2.25 1.6 - -1.33 - -0.69 -0.17 -0.29 -0.37 2.3 -0.46 -3.25 -0.02 -1.83 -2.9 -2.5 - -3.53 -1.68 -1.62 -2.78 -0.96 - -1.56 -1.39 - -1.42 - -3.38 -3.5 -3.28 -1.21
- - - 4.68 - - - - - - - - - - -0.57 - 4.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.48 - - - - - - - - - - - - 5.14 - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.35 - - - - - - - - - - -1.91 - 4.63 1.52 - - - - - 2.35 - 2.11 - - - -0.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.18 0.44 4.43 - - - - - - - - - - - - 3.36 -1.14 - 0.01 - - - -0.3 - 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.58 - - - - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.04 - - - - - - - - - - - - 4.32 - - - - - - - - 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.78 - - - - - - - - - - - 4.95 1.53 - - - - - - - - 3.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.28 3.06 4.58 -0.97 - - - - - - - - - -2.1 - 2.91 0.01 - - - - - - - 2.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.26 -3.65 -0.26 2.99 -4.34 -0.88 2.26 -2.47 2.41 -3.04 -0.45 0.51 -3.04 -2.43 -2.04 4.17 0.95 -2.51 - -4.58 - -2.7 - - -2.22 -0.08 -1.51 -2.8 -1.09 -0.93 -4.25 - -3.81 -3.36 -0.29 - -4.57 - -4.17 -2.77 - -4.67 -2.25 -3.9 -2.17 -4.86 -3.05 -3.18
-1.02 0.85 -1.01 4.67 -1.03 -0.09 -0.19 2.46 1.16 -9.05 - - -3.18 -2.39 -2.78 2.01 -0.47 -0.6 - - -3.18 - -0.65 -2.1 - -0.43 -5.37 -1.37 -2.48 -3.81 -1.76 -4.39 -5.23 - - - -1.71 - -3.0 -4.46 -3.0 - -3.25 -2.47 -3.18 -8.47 -4.63 -4.81
- - - 4.58 - - - - 3.04 - - - - - - - 3.82 - - - - - - - - 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.4 2.63 2.62 3.21 - - - - - - - -3.36 0.84 - - - - -0.54 0.64 - - - 0.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.46 0.84 3.44 - - - - - - - - - - - 2.9 3.32 0.61 - - - - - - - 3.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.26 -1.59 -2.98 4.53 -2.7 1.87 0.87 1.84 2.35 -2.23 -3.68 -3.18 -1.23 -1.9 -2.1 -0.46 -3.86 -2.8 -2.51 -2.28 -3.19 -3.43 -0.76 -4.69 -1.94 0.93 -2.55 -2.34 -3.24 -2.64 -2.36 -2.54 -3.42 -3.44 -3.14 -2.98 -2.23 -1.56 -4.31 -3.35 -2.63 -3.04 -3.06 -4.28 -4.24 -1.6 -3.58 -1.95
- - - 5.11 - - - - - - - - - - - - 2.22 - - - - - - - - 3.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.71 - - - - - - - - - - - - 3.29 - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.14 -1.98 4.75 -1.28 -0.52 0.39 -0.3 2.44 - - - - - -7.45 3.01 0.71 -3.03 - - - - - - - -3.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.85 - - - - - - - - - - - - 4.22 - - - - - - - - 3.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.53 - - - - - - - - - - - 4.58 3.5 - - - - - - 0.98 - - - - - -0.73 0.71 - - - - - - - - - - - - 1.48 - - - -
- - - 3.05 1.02 - - - - - - - - - - 4.89 2.44 - - - - - - 0.58 - 0.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.27 4.43 -0.19 - - - - - - - - - - - 2.05 0.95 - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.55 4.15 1.17 - - - - - - - - - - 1.77 3.11 - - - - - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.05 - - - - - - - - - - - - 4.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.3 4.2 -0.73 - -0.45 1.24 -0.49 -1.31 - - - - -2.05 - 1.77 0.04 - - -0.37 - - 0.32 2.93 1.82 -0.98 - - -1.75 -1.18 -0.88 - - - - - - - - 1.8 - - - - - -0.22 -
- - 1.97 4.4 - - - - - - - - - - - - 3.79 1.82 - - - - - - - 2.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.17 - - 4.25 - - - 1.45 3.38 - - - - - -2.08 1.71 2.25 - - - - - - - - 2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.