Heatmap: Cluster_244 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_21520V3.1	0.15	-0.77	0.64	-3.14	0.89	-0.23	-0.19	0.07	0.64	-0.19	0.81	0.88	-0.69	-2.66	-0.43	-1.87	0.41	0.29	0.52	0.61	0.22	0.11	1.07	-1.42	0.12	-0.26	0.58	0.55	-1.64	0.31	-0.71	0.42	-0.11	0.38	-0.78	0.25	-0.5	-0.15	-0.38	-0.74	-1.58	-2.29	-0.46	-0.02	-0.45	-0.15	0.55	0.32
Pp3c10_5710V3.1	-0.18	0.16	0.32	-2.31	0.85	-0.29	0.08	-0.31	-0.53	-0.21	0.45	0.47	-0.57	-2.04	-0.27	-1.25	0.13	-0.52	0.42	0.13	-0.43	-0.32	0.4	-1.4	-0.08	-0.34	0.41	0.97	-1.58	0.41	-0.46	0.73	0.3	0.55	0.31	0.7	-0.36	-0.01	-0.73	-0.05	-1.07	-1.21	-0.02	0.11	-0.13	0.08	0.59	0.75
Pp3c12_11030V3.1	-0.44	-0.01	0.85	-0.32	0.6	0.88	1.08	0.8	-0.2	-0.34	-0.45	-0.29	-0.74	-1.44	-0.51	-0.42	0.2	-0.26	0.82	0.68	0.76	0.6	-0.11	-1.24	-0.21	-0.87	-0.42	0.42	-1.09	-0.07	-0.66	0.04	-0.1	0.15	-0.73	0.4	-0.55	-0.04	-0.48	-0.23	-0.97	-0.83	-0.27	0.1	-0.46	-0.06	0.29	0.35
Pp3c12_14030V3.1	-0.23	0.35	0.75	0.47	-0.64	-0.71	-0.64	-0.78	0.46	0.24	-0.02	-0.06	0.02	-1.47	-0.2	-0.33	0.5	0.04	0.82	0.4	0.44	0.45	-1.21	-1.18	0.03	-0.39	-0.13	0.22	0.04	0.26	0.1	-0.06	-0.28	0.19	-0.59	-0.23	-0.22	0.3	-0.95	-0.11	-0.19	-0.15	0.01	0.17	-0.45	0.42	0.49	0.22
Pp3c12_7570V3.1	-1.21	-0.49	0.58	-0.12	1.24	0.31	0.34	0.21	-0.16	-0.28	0.29	0.3	-0.4	-0.86	-0.58	-0.04	0.64	0.1	0.88	1.01	0.67	0.34	1.14	-1.25	-0.02	-0.64	-0.05	-0.23	-0.93	-0.26	-0.61	0.23	-0.16	-0.22	-1.15	-0.31	-0.64	-0.16	-0.96	-0.35	-0.58	-0.47	-0.23	-0.36	-0.13	-0.16	-0.17	0.16
Pp3c12_7620V3.1	-0.68	0.19	0.87	-1.3	0.41	1.05	1.06	1.0	-0.66	-0.57	-0.76	-0.74	-1.33	-1.98	-0.55	-3.23	0.69	-0.33	1.36	1.04	0.77	0.8	1.41	-0.6	-0.77	-1.02	-0.63	-0.15	-1.53	0.21	-0.5	-0.24	-0.19	0.1	-1.9	-0.92	-0.71	-0.03	-0.78	-0.24	-1.39	-1.03	-0.1	0.01	-0.51	0.1	0.02	0.81
Pp3c14_1940V3.1	0.03	0.01	0.69	-2.08	0.9	0.71	0.66	0.68	0.7	-0.28	-1.26	-1.21	-1.24	-3.53	-0.22	-0.04	0.96	-0.56	0.98	0.7	0.61	0.62	0.65	-1.28	-0.67	-0.19	-0.57	0.62	-0.62	0.39	-0.09	0.53	-0.09	0.37	-1.84	-0.11	-0.42	-0.17	-1.21	-0.98	-2.68	-2.95	-0.53	-0.39	-0.91	-0.13	0.22	1.07
Pp3c14_9040V3.1	-1.76	-0.14	1.02	-2.75	0.48	1.21	0.85	0.64	0.46	-0.37	-0.7	-0.73	-1.25	-2.96	-0.5	-0.79	1.05	-0.26	1.36	0.95	0.45	0.56	1.58	-1.74	-0.35	-0.9	-0.32	0.09	-2.62	0.28	-0.69	0.49	-0.28	0.18	-2.73	-0.17	-0.97	-0.17	-1.09	-0.8	-2.01	-2.72	-0.29	-0.12	-0.55	-0.05	0.6	0.58
Pp3c14_9440V3.1	-0.5	0.36	0.76	-1.34	-0.85	0.58	0.99	1.01	-0.06	-0.31	-1.95	-1.7	-0.65	-1.14	-0.57	-0.24	0.02	-0.73	1.28	1.07	0.93	0.65	-0.36	-0.9	0.42	-1.4	0.21	0.02	-0.61	-0.14	-0.35	-0.46	-0.01	-0.08	-1.07	-0.74	-0.34	0.06	-0.58	0.13	-0.29	0.15	0.38	0.3	-0.01	0.14	0.02	-0.25
Pp3c15_15310V3.1	-0.13	-0.61	0.97	-3.15	-1.13	0.17	-0.45	-0.49	-0.76	-0.48	-0.97	-0.71	-1.21	-2.02	-0.92	-0.83	1.19	-0.62	1.15	0.88	0.43	0.31	2.1	-1.99	-0.25	-0.96	-0.02	0.56	-1.16	0.3	-0.47	0.67	0.27	0.57	-1.38	0.29	-0.77	0.07	-0.61	-0.27	-1.44	-1.09	-0.01	0.07	0.06	0.17	0.59	0.29
Pp3c15_21580V3.1	-2.34	-0.23	0.14	-3.03	0.6	0.28	0.07	0.16	-0.75	-0.18	-0.56	-0.57	-0.58	-0.82	-0.27	-1.56	0.87	-0.16	1.11	0.97	0.35	-0.05	1.02	-1.41	0.15	-1.12	0.57	0.72	-0.44	0.06	-0.43	0.55	0.1	0.31	-0.43	0.08	-0.29	-0.06	-0.5	-0.02	-0.6	-0.9	0.02	0.18	0.24	0.06	0.25	0.13
Pp3c15_22440V3.1	-0.45	-0.37	0.3	-1.86	0.12	-0.59	1.13	0.69	-0.1	-0.14	-1.13	-0.96	-0.73	-0.82	-0.59	-1.67	0.56	-0.41	1.16	0.83	0.6	0.63	0.87	-1.07	0.18	-0.88	-0.04	-0.03	-1.17	-0.15	-0.41	-0.38	0.05	0.02	-0.89	-0.01	-0.48	-0.03	-0.07	0.19	0.15	0.19	0.24	0.03	-0.3	0.02	0.51	0.37
Pp3c16_10600V3.1	0.15	-0.15	0.99	-2.74	0.38	-0.43	0.32	0.09	-0.13	-0.64	-0.32	-0.16	-1.18	-2.54	-0.74	-0.61	1.26	-0.38	1.48	0.9	0.68	0.72	1.77	-1.78	-0.93	-1.12	-0.68	0.32	-2.46	0.23	-0.75	0.12	-0.1	0.22	-2.7	-0.37	-0.84	0.08	-0.66	-0.05	-1.44	-1.39	-0.04	0.01	-0.06	0.18	0.52	0.33
Pp3c16_11800V3.1	-0.63	-0.84	-0.04	-3.83	-0.55	-1.07	-1.56	-1.74	-0.92	-0.45	-1.78	-1.32	-0.56	-0.42	-0.71	-0.62	0.96	0.25	0.59	0.31	0.04	0.7	1.34	-1.02	-0.93	-0.93	-0.69	0.74	-0.3	0.42	-0.25	0.92	0.41	-0.07	-0.15	1.13	-0.37	0.58	-0.05	-0.12	0.06	-0.39	-0.12	0.59	0.17	0.57	0.88	0.43
Pp3c16_15780V3.1	-0.37	0.02	0.5	-1.77	0.21	0.61	0.57	0.7	-0.94	0.08	-1.34	-1.23	0.01	-0.72	-0.13	-0.09	0.96	-0.01	0.65	0.92	0.67	0.28	0.55	0.18	0.08	0.04	-0.18	0.21	-0.68	-0.11	-0.11	0.35	-0.22	0.22	-0.59	0.01	-0.15	-0.21	-0.89	-0.48	-0.68	-0.67	-0.36	-0.39	-0.7	-0.09	-0.31	0.39
Pp3c16_16520V3.1	-0.56	-0.08	1.04	-3.17	0.1	0.25	0.55	0.79	-0.92	0.1	-0.52	-0.56	-0.39	-2.1	-0.19	-0.29	0.91	-0.04	0.98	0.54	0.66	0.69	-2.08	-1.8	-0.03	-0.52	-0.17	0.47	-0.06	0.15	0.13	0.12	0.01	0.27	0.21	0.54	0.11	0.01	-0.83	-0.72	-1.39	-1.83	-0.43	-0.05	-0.76	0.11	0.42	0.52
Pp3c16_20170V3.1	-0.42	-0.31	0.58	-2.14	0.01	0.24	0.04	0.1	-2.18	0.08	-0.59	-0.69	-0.29	-1.61	-0.06	-2.6	0.63	-0.88	1.46	0.64	0.58	0.62	-0.2	-3.13	-0.56	-0.9	-0.03	0.81	-1.62	0.46	-0.48	0.98	0.11	0.51	-0.57	0.86	-0.41	0.16	-0.61	-0.22	-1.38	-1.7	-0.09	0.1	0.11	0.34	0.56	0.95
Pp3c17_13450V3.1	0.39	0.14	0.4	-2.6	0.99	0.25	0.45	0.13	0.13	-0.19	0.2	0.05	-1.16	-1.89	-0.42	-1.79	0.36	-0.48	0.67	0.63	0.2	-0.25	1.61	-2.68	-0.07	-0.87	0.39	0.81	-1.52	0.26	-0.43	0.51	-0.06	-0.06	-2.05	-0.29	-0.18	0.15	-1.05	-0.12	-0.86	-1.29	-0.07	0.18	-0.15	-0.04	0.38	0.44
Pp3c17_17170V3.1	-0.77	0.55	-0.03	-5.42	0.59	0.17	-0.32	-0.19	-0.99	0.43	-0.5	-0.13	-0.15	-1.5	0.06	-0.37	0.84	-0.23	0.5	0.51	0.3	0.1	0.26	-1.46	0.2	0.09	0.22	0.89	-0.58	0.32	0.42	0.48	0.06	0.35	-0.86	-0.35	0.41	0.51	-0.87	-0.44	-1.18	-1.51	-0.16	-0.12	-0.34	0.43	0.37	0.14
Pp3c18_8470V3.1	-0.37	-0.43	0.41	-0.18	1.49	0.27	1.0	0.54	0.15	-0.37	-0.62	-0.51	-1.12	-2.03	-0.25	-0.8	0.43	-0.92	0.7	0.69	0.57	0.48	0.34	-2.46	-0.21	-1.16	-0.01	0.36	-0.26	0.28	-0.46	0.41	-0.03	0.05	-1.38	-0.02	-0.23	0.1	-0.64	-0.31	-1.16	-1.5	-0.1	0.17	-0.11	0.06	0.29	0.57
Pp3c19_4700V3.1	0.26	0.47	0.65	-1.98	-2.76	-1.61	-1.47	-1.48	1.04	-0.67	-1.21	-1.02	-0.66	-0.76	-1.31	0.48	0.67	0.19	0.98	0.52	0.27	0.02	1.75	-0.17	-0.82	-0.52	-1.08	0.15	-0.17	0.45	-0.54	0.06	-0.02	0.37	0.13	-0.71	-0.63	0.42	-0.43	0.34	-0.94	-0.38	0.17	0.07	0.16	0.44	0.47	0.01
Pp3c19_4890V3.1	0.69	-0.48	0.49	-3.06	0.95	-0.53	-0.34	-0.78	-0.13	-0.38	-0.03	0.25	-0.26	-0.46	-0.05	-0.05	0.73	-0.21	0.47	0.66	0.19	-0.04	0.95	-1.8	-0.08	-0.08	0.48	0.45	-1.21	0.23	-1.06	0.26	-0.28	0.16	-0.25	-0.09	-0.42	0.22	-0.54	-0.1	-0.72	-0.9	-0.21	0.2	0.03	0.46	-0.13	0.4
Pp3c1_10040V3.1	-0.73	-0.35	0.61	-2.31	0.74	0.2	0.42	0.18	-0.31	-0.28	-0.37	-0.34	-0.44	-1.49	-0.08	-0.7	1.05	-0.19	1.2	1.18	0.82	0.35	0.84	-0.96	-0.35	-1.03	-0.35	0.04	-1.05	-0.0	-0.56	-0.02	0.02	-0.02	-0.87	0.2	-0.34	-0.22	-0.54	-0.01	-0.57	-0.62	0.12	0.16	-0.23	-0.23	0.06	0.44
Pp3c1_18050V3.1	-0.58	-0.13	0.5	-2.55	-0.49	0.52	0.54	0.03	-0.41	-0.1	-0.42	-0.51	-0.41	-1.39	-0.21	0.18	0.36	-0.36	1.07	0.68	0.59	0.62	0.88	-1.64	-0.27	-0.53	-0.39	0.56	-0.96	0.23	-0.42	0.23	0.12	0.6	0.43	0.45	-0.11	0.05	-0.75	-0.59	-1.45	-1.71	-0.3	-0.05	-0.44	0.07	0.34	0.65
Pp3c1_22540V3.1	-1.6	-0.37	0.32	-3.56	0.83	0.07	0.27	0.18	0.22	-0.29	0.29	0.36	-1.27	-3.07	-0.56	-0.41	0.29	-0.93	0.55	0.53	0.21	-0.09	1.21	-2.38	-0.16	-0.97	0.44	0.81	-0.34	0.43	-0.26	0.54	0.22	0.5	-0.53	0.53	-0.17	0.07	-0.74	-0.32	-1.34	-1.93	-0.07	0.24	-0.45	0.09	0.88	0.3
Pp3c1_25970V3.1	-0.17	-0.13	0.78	-4.19	1.42	0.19	0.27	-0.38	-0.87	-0.18	-0.14	-0.27	-0.55	-2.22	-0.42	-3.22	0.66	-0.62	1.07	0.9	0.61	0.4	0.92	-1.22	-0.11	-1.03	0.33	0.47	-1.84	0.27	-0.28	0.46	-0.05	0.34	-1.83	-0.05	-0.2	-0.14	-0.65	-0.18	-1.16	-1.44	-0.04	0.14	-0.27	-0.1	0.73	0.58
Pp3c1_35350V3.1	-0.24	-0.01	0.4	-0.28	1.31	0.3	0.03	-0.03	0.27	-0.21	-0.79	-0.44	-0.87	-1.74	-0.68	-1.04	0.69	-0.25	0.94	0.87	0.41	0.51	0.9	-0.59	-0.29	-0.71	-0.44	0.15	-1.12	0.09	-0.36	0.39	0.06	0.14	-1.96	-0.3	-0.36	0.27	-0.74	-0.19	-0.8	-1.0	-0.05	0.04	-0.0	0.28	0.5	0.27
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Pp3c5_10580V3.1	-0.3	-0.3	0.98	-0.17	1.46	0.62	0.88	0.81	-0.58	-0.15	-0.24	-0.04	-0.51	-1.97	-0.28	-0.67	0.72	-0.48	0.77	0.58	0.56	0.31	0.5	-1.29	0.03	-0.36	0.26	0.15	-1.39	-0.05	-0.69	0.46	-0.3	0.04	-1.63	0.12	-0.58	-0.09	-1.24	-0.59	-1.43	-1.89	-0.34	-0.25	-0.52	-0.05	0.31	0.21
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Pp3c5_20270V3.1	-1.76	0.68	1.35	-2.43	1.26	1.4	0.95	1.7	0.92	-1.6	-0.72	-0.8	-1.13	-2.91	-1.88	-2.13	1.29	-1.0	1.18	1.17	1.4	0.85	1.49	-1.57	-0.69	-1.37	-2.95	0.2	-1.9	-0.46	-1.38	-0.2	-0.45	-0.44	-4.06	-0.83	-1.02	-0.85	-1.19	-1.13	-2.31	-2.24	-0.6	-1.36	-0.67	-1.18	-0.58	0.88
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Pp3c5_4450V3.1	-0.0	0.35	0.27	-1.66	1.25	0.17	0.3	0.62	-0.94	0.06	-0.21	-0.05	-0.73	-1.7	-0.02	-2.69	0.96	0.19	0.64	0.68	0.56	0.17	-1.0	-1.97	-0.17	-0.13	-0.09	0.69	-2.67	0.26	-0.47	0.42	0.14	0.17	-1.6	0.43	-0.3	-0.07	-0.44	-0.21	-1.34	-1.17	-0.01	-0.06	-0.16	-0.04	0.7	0.61
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Pp3c9_1560V3.1	-1.4	0.13	-0.02	-3.97	0.6	0.44	0.78	0.39	-0.74	-0.3	-0.8	-0.92	-0.18	-0.52	-0.47	0.17	0.5	-1.21	1.02	1.0	0.27	0.18	1.6	-2.51	-0.18	0.15	-0.54	0.7	-0.77	-0.04	-0.31	-0.11	-0.24	0.37	-0.21	-1.27	0.01	-0.17	-0.43	-0.4	-0.67	-0.19	-0.03	-0.15	-0.26	-0.22	0.28	0.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.