Heatmap: Cluster_288 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.88 -0.55 0.2 -1.11 -0.53 0.89 1.2 1.22 -0.32 0.37 -1.84 -1.76 -0.59 -1.9 0.37 -1.03 -0.17 0.17 0.69 1.16 1.11 0.61 0.81 -0.71 1.55 0.37 0.85 -0.5 -0.47 -0.44 -0.01 -0.8 -0.55 -0.64 -1.07 -0.69 -0.27 0.28 -2.01 -1.08 -0.74 -0.89 -0.54 -0.7 -0.96 0.16 -0.23 -0.3
-0.51 -0.18 -0.24 -1.75 1.18 0.5 0.42 0.45 -0.34 0.23 -0.98 -0.72 0.23 0.21 -0.07 0.19 -0.02 -0.4 0.14 0.69 0.24 0.29 -0.85 -1.53 0.75 0.0 0.47 -0.25 -0.73 -0.21 0.21 0.23 -0.01 -0.21 -0.08 -0.61 0.46 0.16 -0.6 0.0 -0.01 -0.23 -0.04 -0.36 -0.24 0.08 -0.45 0.1
-0.94 -1.03 0.37 -3.48 0.14 1.18 1.18 1.07 -1.32 0.23 0.69 0.46 -1.6 -4.01 -0.02 -1.26 -0.4 0.1 -0.0 0.3 -0.15 0.21 -0.9 -1.26 0.92 0.2 1.65 0.36 -0.33 0.05 0.4 1.26 -0.14 -0.45 -1.01 -0.07 0.53 0.21 -2.22 -1.51 -1.51 -2.48 -1.32 -0.79 -1.71 0.22 -0.05 0.32
-0.28 -0.11 0.25 -1.28 -0.18 0.53 0.96 1.0 -0.88 0.29 0.49 0.62 -0.02 -0.92 -0.07 -0.33 0.24 -0.26 0.76 0.66 0.58 0.44 -1.24 -0.34 0.38 -0.03 -0.06 -0.55 -0.23 -0.41 -0.05 -0.07 -0.16 -0.11 -0.56 0.01 -0.15 0.09 -0.6 -0.38 -0.32 -0.3 -0.29 -0.28 -0.85 0.06 -0.0 -0.23
-0.56 -0.46 -0.13 -2.05 1.01 -0.08 -0.2 -0.17 -0.84 0.28 -0.41 -0.6 0.21 0.03 -0.19 0.33 -0.06 -0.18 0.4 0.75 0.55 0.16 -2.04 -1.22 0.93 -0.14 0.5 -0.3 -0.36 -0.39 -0.0 0.09 0.02 -0.24 -0.11 -0.05 0.02 0.16 -0.72 0.05 0.37 0.48 0.46 0.16 -0.19 0.27 -0.19 -0.31
-0.82 -0.15 0.56 -0.91 0.7 0.61 0.2 0.65 -0.75 0.35 -0.51 -0.43 -0.03 -0.87 0.33 -1.17 0.63 0.03 0.45 0.6 0.48 0.44 0.67 -1.01 -0.05 -0.48 -0.31 -0.3 -0.35 0.09 -0.14 0.19 0.17 0.04 -0.74 -0.13 -0.09 0.03 -0.8 -0.15 -0.45 -0.4 0.05 -0.01 -0.06 0.12 -0.1 0.03
-0.51 -0.04 0.02 -1.28 0.96 0.65 0.79 0.99 -0.08 -0.18 -0.5 -0.35 0.14 -0.39 -0.11 -0.14 0.52 0.3 0.35 0.66 0.72 0.3 0.18 0.66 0.93 -0.05 0.23 -0.42 -0.5 -0.41 -0.14 -0.62 -0.58 -0.65 -0.25 -0.85 -0.44 0.01 -1.19 -0.58 -0.25 -0.47 -0.26 -0.6 -0.78 0.02 -0.5 -0.29
-1.81 -0.23 0.34 -5.12 0.69 1.07 0.41 0.58 -3.15 1.07 -4.05 -5.54 1.11 0.3 0.85 1.97 0.14 0.1 -1.9 0.9 0.04 0.65 -1.02 -1.18 0.51 0.65 -0.2 -0.04 -1.92 -0.57 0.15 -0.17 -0.25 -1.46 -3.55 -0.62 0.26 0.85 -2.01 -0.66 -0.71 -0.76 -0.52 -1.78 -1.22 0.94 -1.48 0.37
-1.13 -1.58 -0.32 -1.89 0.58 0.9 1.21 1.46 -0.95 0.47 -4.05 -4.08 0.16 -0.5 0.23 -1.46 -0.98 -1.15 -0.57 0.11 0.34 0.09 -1.1 -0.29 0.28 -0.7 1.81 0.73 -0.1 -0.21 0.78 -0.34 0.14 -0.1 0.4 1.11 0.72 -0.08 -0.88 -0.42 -0.95 -1.36 -0.56 -0.76 -1.08 -0.14 -0.06 -0.34
-1.79 0.08 0.12 -2.44 0.44 0.54 0.03 0.34 -0.64 0.63 -0.35 -0.33 0.67 -0.05 0.22 0.52 0.37 -0.1 0.19 0.64 0.38 0.41 -1.31 -1.4 0.49 0.85 0.07 -0.31 -1.03 -0.37 0.08 0.11 0.03 -0.36 -1.27 -0.65 0.44 0.59 -1.06 -0.49 -0.15 -0.14 -0.15 -0.31 -0.21 0.52 -0.14 -0.09
-0.04 0.47 -0.42 -1.81 0.64 1.33 1.45 1.48 0.54 0.32 0.3 0.35 0.62 -0.29 0.14 -0.57 -0.03 0.32 -0.44 0.17 0.14 0.21 -2.11 -0.4 0.27 1.34 -0.11 -1.4 -1.53 -0.36 -0.11 -0.35 -1.06 -0.7 -2.73 -1.6 -0.93 -0.16 -1.93 -0.52 0.05 0.01 -0.46 -0.73 -1.21 -0.02 -0.54 0.02
-1.48 -0.72 -0.2 -2.24 0.66 0.96 0.9 1.01 0.14 -0.09 0.88 0.76 -0.82 -2.74 0.12 -1.54 -0.76 -1.11 0.1 0.08 0.2 0.09 -0.07 0.77 0.95 -0.88 1.76 -0.15 -0.59 -0.29 -0.39 0.54 -0.07 -0.33 -0.39 0.07 -0.3 -0.22 -1.33 -0.56 -1.15 -2.05 -0.28 -0.04 -0.76 -0.25 -0.11 0.2
-1.05 -1.65 -0.59 -1.77 0.42 0.65 1.62 1.42 -2.02 0.59 -1.69 -2.01 -0.64 -1.92 0.26 -2.71 -1.95 -0.93 0.45 0.98 0.83 0.51 -0.1 -0.07 1.51 -1.35 0.78 0.24 -0.86 -0.12 0.56 0.4 -0.09 0.01 -1.88 -0.73 0.03 0.03 -1.15 -0.21 -0.41 -1.11 0.26 0.04 -0.74 0.03 0.28 -0.1
0.07 0.42 -0.0 -3.17 0.67 0.56 1.2 1.0 1.21 -0.71 0.94 0.95 -1.28 -2.45 -0.32 0.03 0.48 -0.99 0.71 0.51 0.55 0.53 0.68 -2.39 -0.65 -0.89 -0.49 0.36 -1.53 -0.11 -0.92 0.41 -0.39 -0.06 -0.86 -0.25 -1.11 -0.22 -0.57 -0.53 -1.52 -1.74 -0.42 -0.48 -0.74 -0.12 -0.1 0.7
-0.6 0.29 0.07 -1.74 0.27 0.83 1.14 1.1 -0.43 0.37 0.79 0.76 0.4 -0.49 0.18 -0.63 0.03 0.31 0.87 1.42 0.16 0.5 -2.6 -0.75 0.82 0.93 0.9 -0.29 -0.67 -0.66 -0.2 -0.25 -1.08 -0.98 -1.58 -0.75 -0.29 -0.04 -1.94 -1.23 -1.47 -1.61 -1.2 -1.22 -1.92 0.0 -0.43 -0.29
0.22 0.23 0.28 -2.82 0.38 0.83 1.21 1.16 0.6 0.23 -0.44 -0.05 -0.04 -1.2 0.22 -0.48 0.41 0.81 0.53 0.82 0.46 0.53 -1.51 0.65 0.66 0.24 0.42 -0.85 -0.47 -0.5 -0.51 -0.93 -0.71 -0.95 -0.7 -0.73 -0.45 0.11 -1.9 -0.54 -1.03 -0.72 -0.75 -0.7 -0.97 0.08 -0.32 -0.22
-1.34 -0.44 0.13 -2.19 1.35 0.45 0.59 0.87 -0.59 0.72 -1.03 -0.97 0.76 0.43 0.38 1.54 0.16 -0.74 -0.18 0.35 0.33 0.21 -1.19 -1.86 0.13 0.46 -0.04 -0.83 -1.68 -0.36 -0.16 -1.26 -0.02 -0.26 -2.88 -0.6 -0.65 0.59 -0.9 0.21 0.06 0.16 0.03 -0.1 -0.08 0.56 -0.42 -0.77
-0.29 -0.66 0.58 -2.07 0.14 0.43 0.72 0.62 -0.08 0.04 0.69 0.52 -0.3 -1.19 -0.01 -0.99 0.08 -0.06 0.49 0.53 0.22 0.03 0.64 -1.51 0.35 -0.02 1.23 -0.19 -0.52 -0.16 -0.27 0.93 -0.3 -0.15 -1.04 -0.8 -0.06 -0.08 -1.07 -0.44 -0.39 -0.55 -0.3 0.04 -0.5 -0.06 -0.28 -0.05
-0.8 -1.02 -0.75 -1.63 0.78 1.06 0.83 1.0 -0.31 0.28 -0.92 -1.17 -0.48 -1.63 0.31 -2.09 -0.94 -1.19 -1.08 -0.36 0.08 0.18 -1.95 -2.55 0.53 -0.36 1.7 0.71 -0.36 0.06 0.27 0.6 0.34 0.34 -0.97 1.11 0.38 -0.31 -0.42 -0.22 -0.84 -0.88 -0.09 0.35 -0.55 -0.39 0.77 0.1
-1.51 -0.34 -0.43 -2.28 0.64 0.83 1.09 1.16 -0.97 0.49 -0.63 -0.61 0.21 -0.53 0.14 -0.62 -0.35 0.28 0.51 0.77 0.56 0.52 -2.43 -0.6 1.37 0.71 1.29 -0.21 -0.62 -0.5 -0.1 -0.18 -0.56 -0.63 -1.05 -0.49 0.04 0.38 -1.41 -1.06 -0.2 -0.7 -0.59 -0.9 -1.24 0.29 -0.73 0.19
-1.61 -0.84 -0.63 -1.28 0.98 1.36 1.22 1.3 -1.37 -0.3 0.58 0.51 -0.67 -1.52 -0.28 -1.32 -1.16 -0.98 -0.37 -0.28 -0.48 -0.31 -2.14 -0.2 1.1 -0.26 1.83 -0.24 0.41 -0.27 -0.14 -0.11 -0.16 -0.02 0.77 -0.11 -0.15 -0.61 -0.86 -0.27 -0.0 -0.31 -0.08 -0.52 -0.58 -0.54 -0.39 -0.23
-2.56 -0.91 -0.73 -1.03 1.02 1.59 1.3 1.46 -1.0 0.09 -1.18 -1.11 -0.35 -1.51 -0.08 -1.3 -1.16 -1.31 -0.47 0.29 0.19 0.18 -0.78 0.78 0.91 -0.55 2.18 0.08 -1.02 -0.31 0.11 0.11 -0.06 -0.22 -1.54 0.1 0.03 -0.45 -0.91 -0.59 -0.58 -0.83 -0.45 -0.54 -0.61 -0.52 -0.32 0.02
-1.29 -0.47 -0.39 -3.69 0.93 0.65 1.74 1.67 -0.68 -0.08 -0.91 -0.6 -1.38 -2.36 -0.25 -2.11 -0.58 -1.73 1.46 1.7 1.19 0.19 0.82 -0.57 0.44 -2.16 0.8 0.1 -0.77 -0.37 -0.33 -0.08 -0.54 -0.51 -0.69 -0.2 -0.62 0.36 -1.81 -0.6 -1.34 -1.95 -0.27 -0.57 -1.31 0.42 -0.23 -0.31
-1.68 -0.91 -0.32 -3.36 0.14 0.86 1.31 1.34 -0.26 0.54 -1.1 -0.9 -0.08 -0.76 -0.16 -0.58 -0.92 -0.1 0.94 1.02 0.66 0.26 -0.81 -3.87 1.35 -1.07 1.36 0.1 -1.45 -0.46 0.0 0.01 -0.12 -0.18 -1.72 -0.53 0.1 0.32 -1.09 -0.1 -0.71 -0.62 -0.14 0.04 -0.25 0.27 -0.17 -0.59
-0.77 -0.15 0.39 -1.28 0.86 -0.02 0.03 0.67 -0.23 0.31 0.21 0.17 0.19 -1.29 0.22 -0.87 0.76 -0.12 0.49 0.67 0.64 0.54 -0.52 -0.41 0.16 0.57 -0.02 -0.3 -0.8 -0.13 -0.11 0.15 0.17 -0.22 -0.71 -0.24 0.35 -0.02 -1.04 -0.41 -0.67 -0.97 -0.21 0.01 -0.11 -0.07 -0.15 0.03
0.02 0.55 0.89 -3.69 -0.01 0.55 0.93 1.31 0.31 0.09 -1.18 -1.14 -0.07 -0.51 -0.1 -0.02 0.58 0.5 1.29 1.0 0.52 0.39 0.23 -0.84 0.21 0.04 0.08 0.13 -1.59 -0.28 -0.32 -0.31 -0.51 -0.26 -2.8 -0.71 -0.32 0.03 -1.04 -0.59 -1.15 -1.07 -0.45 -0.25 -0.66 0.07 -0.4 -0.22
-1.66 -1.32 -1.39 -2.71 0.84 1.17 1.33 1.19 -0.7 -0.17 1.22 1.2 -0.71 -1.65 -0.56 -0.68 -2.04 -1.88 0.18 0.29 0.09 -0.25 -1.8 -1.98 1.06 -1.48 1.7 -0.11 0.88 -0.15 0.3 -0.14 -0.07 0.05 0.57 -0.19 -0.3 -0.67 -1.12 -0.51 -0.54 -0.93 -0.2 -0.54 -0.63 -0.66 -0.06 -0.4
-0.77 -0.83 -0.99 -2.91 -5.04 0.93 2.54 2.61 -0.6 0.32 -1.24 -1.24 -1.88 -3.31 0.26 -3.46 -1.39 -2.43 0.3 1.51 2.29 1.83 -0.83 -3.56 1.13 -2.02 0.38 -0.41 -1.14 -1.01 0.08 -0.82 -0.81 -1.26 -1.59 -0.3 -0.33 -0.75 -3.01 -2.07 -2.64 -3.55 -1.37 -1.05 -2.39 -0.82 -0.55 -0.57
-0.29 0.41 1.42 -0.68 0.21 0.54 -0.17 0.41 -1.23 0.22 -1.21 -1.43 -0.24 -1.32 0.33 -1.1 0.67 0.44 0.79 0.92 0.8 0.61 0.36 -0.73 0.14 -0.17 -0.38 -0.07 -0.54 -0.12 -0.1 -0.15 -0.29 0.12 -1.33 -0.55 -0.14 0.26 -0.89 -0.41 -0.59 -0.6 -0.3 -0.05 -0.75 0.19 0.15 0.21
-0.89 -0.29 -0.77 -2.97 1.08 0.62 1.2 1.12 0.14 0.28 -2.1 -2.2 -0.01 -0.14 0.36 -1.28 0.17 0.52 0.84 1.04 1.0 1.07 -1.26 -1.16 0.99 0.16 0.28 -0.22 -1.42 -0.54 -0.06 -0.57 -0.56 -0.9 -1.72 -0.51 -0.26 0.71 -2.1 -0.63 0.13 -0.09 -0.38 -0.68 -1.39 0.6 -1.35 -0.1
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-4.26 -1.41 -1.18 -0.54 -0.72 1.98 1.91 1.94 -2.02 0.16 0.77 0.45 -0.3 -0.33 -0.2 -5.73 -2.01 -2.24 -1.56 -0.72 -0.29 -0.15 -3.56 -0.52 1.23 -0.79 1.81 -0.35 -0.3 -1.02 0.3 0.68 0.04 -0.58 -0.56 -0.09 0.65 -1.35 -1.91 -0.55 0.12 -0.53 0.03 -0.56 -0.74 -0.85 -0.44 -1.04
-0.65 0.01 0.8 -2.32 0.62 1.19 1.67 1.48 0.02 0.66 -0.84 -0.89 0.54 -0.94 0.39 -0.05 1.8 0.14 0.68 1.14 1.55 1.86 -2.62 -0.84 1.52 1.33 0.4 -5.89 -5.74 -2.94 -2.15 -1.0 -2.91 -4.1 -5.55 -4.04 -1.95 -0.97 -4.42 -2.21 -2.21 -2.34 -1.2 -2.16 -3.15 -1.06 -2.79 -1.71
-0.78 -0.65 0.41 -2.68 -0.76 1.35 1.39 1.72 -0.59 0.22 0.54 0.63 -0.28 -1.01 -0.67 -0.54 -0.3 0.05 -0.03 -0.41 -0.16 -0.5 -1.88 -2.18 -0.07 -0.66 -0.16 0.71 0.01 -0.09 0.28 0.63 -0.09 0.09 -0.15 0.2 0.2 0.58 -0.86 -0.42 -1.17 -0.91 -0.65 -0.29 -0.74 0.57 -0.04 -0.3
-0.52 -1.12 -0.87 -2.42 -0.13 0.61 1.51 1.09 -0.67 0.35 -0.76 -0.49 -0.46 -1.54 0.28 -1.27 -1.57 -1.58 0.04 0.59 0.43 0.04 -1.33 -1.79 1.0 -1.22 0.69 0.3 0.07 0.2 0.72 -0.24 0.03 -0.0 -0.36 -0.03 0.19 0.21 -0.81 0.22 0.28 -0.35 0.22 0.18 -0.5 0.09 0.52 0.31
-7.55 -4.25 -3.17 -1.74 0.92 1.88 2.08 2.14 -2.44 0.6 -0.44 -0.54 -0.24 -1.1 -1.15 -2.87 -2.04 -3.3 -2.09 -0.43 -0.61 -0.93 -4.08 -3.71 0.52 -1.62 2.81 0.08 -0.4 -0.65 0.66 -0.09 -0.26 -0.14 -3.08 0.15 -0.69 0.17 -1.38 -0.93 -0.85 -1.2 -0.57 -0.36 -1.11 -0.04 0.61 -0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.