1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_59 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.15 0.26 0.27 0.15 0.1 0.01 0.09 0.01 0.06 0.04 0.06 0.0 0.06 0.26 0.14 0.22 0.17 0.13 0.1 0.24 0.09 0.18 0.2 0.14 0.09 0.2 0.31 0.16 0.1 0.05 0.18 0.21 0.21 0.29 0.17 0.14 0.38 0.2 0.84 0.02 0.07 0.5 0.26 0.19 0.23 1.0 0.11 0.11
AT1G04110 (SDD1)
 1.0 0.23 0.1 0.1 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.17 0.52 0.0 0.0 0.11 0.2 0.09 0.84 0.32 0.03 0.0 0.01 0.0 0.14 0.04 0.0 0.06 0.35 0.31 0.15 0.07 0.03 0.01 0.07 0.03 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.28 0.26 0.26 0.24 0.18 0.16 0.1 0.1 0.02 0.09 0.04 0.46 0.03 0.15 0.32 0.13 0.12 0.03 0.16 0.43 0.17 0.13 0.26 0.1 0.3 0.11 0.34 0.47 0.11 1.0 0.09 0.19 0.15 0.09 0.09 0.18 0.28 0.18 0.65 0.04 0.0 0.86 0.27 0.17 0.3 0.0 0.01 0.06
0.34 0.53 0.69 0.93 0.57 0.39 0.81 0.14 0.13 0.03 0.05 0.01 0.08 0.49 0.54 0.33 0.49 0.41 0.23 0.52 0.48 0.37 0.47 0.36 0.21 0.36 0.31 0.56 1.0 0.14 0.5 0.46 0.34 0.49 0.42 0.54 0.52 0.4 0.28 0.11 0.13 0.62 0.66 0.45 0.63 0.98 0.12 0.35
AT1G15990 (CNGC7)
 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.24 0.03 1.0 0.43 0.09 0.11 0.01 0.45 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT1G32480 (IDH-IV)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.25 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT1G36370 (SHM7)
 0.14 0.13 0.06 0.06 0.06 0.05 0.06 0.05 0.03 0.02 0.02 0.0 0.02 0.11 0.12 0.07 0.09 0.06 0.06 0.1 0.07 0.03 0.05 0.11 0.04 0.09 0.25 0.09 0.31 0.04 0.14 0.05 0.1 0.08 0.05 0.1 0.45 0.12 0.08 0.13 1.0 0.14 0.07 0.04 0.08 0.06 0.25 0.04
0.01 0.12 0.03 0.04 0.01 0.01 0.03 0.05 0.12 0.03 0.1 0.0 0.0 0.29 0.64 0.93 0.04 0.07 0.03 0.18 0.27 0.78 0.35 0.39 0.04 0.8 0.68 0.04 0.03 0.0 0.02 0.29 0.73 0.16 0.04 0.22 0.86 0.35 1.0 0.66 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.02 0.04 0.03 0.0 0.03 0.01 0.03 0.05 0.0 0.03 0.01 0.06 0.03 0.05 0.03 0.07 0.04 0.76 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
AT1G68910 (WIT2)
 0.16 0.48 0.06 0.04 0.04 0.05 0.05 0.05 0.02 0.01 0.01 0.0 0.16 0.54 0.71 0.35 0.31 0.21 0.11 0.46 0.26 0.22 0.3 0.47 0.08 0.41 1.0 0.32 0.7 0.03 0.5 0.37 0.44 0.41 0.37 0.38 0.65 0.38 0.73 0.21 0.17 0.58 0.49 0.15 0.43 0.0 0.0 0.23
0.05 0.39 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.12 0.15 0.15 0.09 0.07 0.39 0.16 0.11 0.16 0.19 0.11 0.17 0.5 0.21 0.44 0.11 0.29 0.3 0.12 0.16 0.25 0.12 0.34 0.19 0.23 0.04 0.05 0.3 0.35 0.28 0.23 1.0 0.12 0.2
1.0 0.18 0.04 0.02 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.1 0.03 0.05 0.07 0.01 0.02 0.01 0.03 0.07 0.02 0.05 0.05 0.07 0.03 0.04 0.04 0.02 0.03 0.04 0.05 0.11 0.68 0.4 0.23 0.14 0.1 0.19 0.08 0.08
AT1G74720 (QKY)
 0.06 0.81 0.07 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.47 0.26 0.37 0.33 0.33 0.14 0.77 0.25 0.49 0.75 0.35 0.2 0.32 0.36 0.97 0.4 0.14 0.57 0.72 0.42 0.32 1.0 0.43 0.21 0.31 0.27 0.04 0.02 0.2 0.22 0.6 0.37 0.06 0.02 0.33
0.83 0.43 0.4 0.44 0.36 0.37 0.47 0.1 0.05 0.01 0.01 0.0 0.02 0.31 0.15 0.13 0.22 0.24 0.13 0.31 1.0 0.13 0.19 0.21 0.03 0.13 0.13 0.12 0.46 0.02 0.57 0.11 0.06 0.1 0.24 0.14 0.13 0.14 0.09 0.02 0.01 0.07 0.26 0.24 0.23 0.46 0.07 0.2
AT1G79330 (MC5)
 1.0 0.11 0.04 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.05 0.01 0.0 0.01 0.04 0.04 0.02 0.43 0.04 0.13 0.0 0.08 0.07 0.03 0.09 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.73 0.21 0.16 0.43 0.0 0.0 0.1
0.17 0.03 0.26 0.22 0.28 0.24 0.17 1.0 0.57 0.76 0.32 0.03 0.33 0.02 0.21 0.01 0.02 0.02 0.43 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.07 0.09 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.1 0.11 0.02 0.03 0.13 0.03 0.0 0.01 0.09
AT1G80080 (TMM)
 0.01 0.65 0.06 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.2 0.41 0.31 0.01 0.02 0.1 0.94 0.05 0.69 1.0 0.04 0.02 0.03 0.03 0.26 0.03 0.0 0.06 0.87 0.76 0.48 0.21 0.02 0.0 0.31 0.06 0.34 0.32 0.01 0.0 0.12 0.02 0.0 0.0 0.03
0.57 0.63 0.54 0.42 0.5 0.35 0.39 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.24 0.41 0.34 0.28 0.24 0.09 0.51 0.38 0.36 0.52 0.4 0.03 0.35 0.06 0.41 1.0 0.03 0.55 0.43 0.24 0.19 0.33 0.38 0.25 0.33 0.13 0.09 0.03 0.17 0.36 0.52 0.32 0.07 0.25 0.31
0.15 0.24 0.2 0.12 0.14 0.17 0.15 0.25 0.3 0.31 0.35 0.05 0.04 0.2 0.09 0.15 0.2 0.17 0.28 0.19 0.11 0.13 0.18 0.1 0.12 0.12 0.34 0.14 0.1 0.09 0.16 0.17 0.12 0.29 0.14 0.16 0.36 0.13 0.18 0.2 0.33 0.43 0.63 0.3 0.31 1.0 0.09 0.26
0.0 0.0 0.0 0.19 0.04 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.27 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.12 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0
AT2G26140 (ftsh4)
 0.13 0.12 0.13 0.16 0.12 0.08 0.15 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.11 0.1 0.08 0.1 0.11 0.08 0.12 0.13 0.1 0.14 0.07 0.08 0.07 0.14 0.19 0.12 0.05 0.13 0.12 0.08 0.08 0.14 0.07 0.11 0.09 0.08 0.06 1.0 0.11 0.1 0.13 0.13 0.05 0.05 0.1
0.09 0.82 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.43 0.34 0.34 0.39 0.14 0.79 0.23 0.55 0.69 0.14 0.39 0.12 0.06 0.78 0.16 0.46 0.46 0.34 0.21 0.28 1.0 0.09 0.44 0.41 0.06 0.18 0.04 0.11 0.37 0.6 0.33 0.32 0.91 0.31
0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.83 1.0 0.17 0.16 0.13 0.11 0.18 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.47 0.46 0.48 0.31 0.19 0.88 0.43 0.54 0.72 0.4 0.16 0.42 0.46 0.94 0.65 0.12 0.74 0.54 0.34 0.42 0.73 0.38 0.62 0.48 0.54 0.27 0.15 0.32 0.46 0.84 0.54 0.74 0.43 0.47
AT2G47900 (TLP3)
 0.26 0.61 0.21 0.14 0.21 0.12 0.11 0.04 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.26 0.18 0.19 0.2 0.22 0.1 0.43 0.25 0.21 0.27 0.14 0.05 0.15 0.15 0.43 0.45 0.06 0.18 0.2 0.18 0.25 0.32 0.17 0.17 0.24 0.18 0.15 0.09 0.27 0.33 0.49 0.21 0.62 1.0 0.26
0.51 0.21 0.4 0.39 0.4 0.53 0.4 0.14 0.07 0.01 0.01 0.0 0.02 0.2 0.13 0.16 0.31 0.23 0.07 0.21 0.2 0.11 0.13 0.17 0.07 0.17 0.16 0.09 1.0 0.06 0.14 0.18 0.11 0.32 0.12 0.18 0.35 0.2 0.39 0.24 0.09 0.33 0.62 0.18 0.29 0.33 0.33 0.23
AT3G04240 (SEC)
 0.42 0.38 0.19 0.15 0.13 0.08 0.17 0.14 0.2 0.08 0.21 0.0 0.05 0.33 0.16 0.22 0.28 0.18 0.18 0.33 0.13 0.19 0.23 0.19 0.14 0.23 0.54 0.27 0.23 0.11 0.24 0.16 0.21 0.25 0.25 0.21 0.52 0.3 0.59 1.0 0.49 0.36 0.24 0.23 0.2 0.12 0.16 0.12
0.63 0.34 0.29 0.24 0.24 0.31 0.26 0.4 0.33 0.13 0.15 0.01 0.08 0.38 0.45 0.25 0.37 0.41 0.26 0.32 0.31 0.24 0.27 0.27 0.28 0.29 0.45 0.41 0.66 0.23 0.34 0.3 0.26 0.42 0.28 0.31 0.37 0.31 0.46 0.2 0.72 0.45 0.57 0.27 0.55 1.0 0.15 0.32
0.35 0.25 0.65 0.43 0.5 0.41 0.46 0.41 0.43 0.34 0.44 1.0 0.18 0.17 0.14 0.11 0.15 0.09 0.17 0.2 0.12 0.1 0.13 0.15 0.07 0.14 0.16 0.24 0.19 0.08 0.15 0.15 0.11 0.15 0.11 0.18 0.22 0.21 0.21 0.09 0.23 0.21 0.45 0.35 0.18 0.16 0.04 0.36
0.02 0.01 0.02 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.13 0.11 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.03 0.01 0.04 0.01 0.05 0.02 0.09 0.0 0.02 0.07 0.01 0.15 0.0 0.0 1.0 0.1 0.01 0.14 0.0 0.12 0.01
0.54 0.68 1.0 0.94 0.63 0.46 0.94 0.16 0.09 0.02 0.03 0.01 0.14 0.26 0.19 0.18 0.11 0.13 0.16 0.66 0.28 0.21 0.33 0.21 0.14 0.17 0.12 0.35 0.45 0.19 0.54 0.2 0.12 0.12 0.41 0.16 0.39 0.27 0.13 0.09 0.37 0.07 0.12 0.4 0.14 0.0 0.02 0.19
0.36 0.8 0.77 0.77 0.73 0.59 0.84 0.15 0.16 0.08 0.08 0.01 0.15 0.83 0.37 0.68 0.85 0.6 0.32 0.75 0.83 0.54 0.63 0.57 0.6 0.57 1.0 0.71 0.31 0.66 0.58 0.77 0.39 0.52 0.61 0.48 0.82 0.61 0.61 0.09 0.02 0.59 0.67 0.7 0.52 0.18 0.37 0.52
AT4G27920 (PYL10)
 0.1 0.17 0.14 0.16 0.0 0.59 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.15 0.0 0.0 0.18 0.11 0.0 0.0 0.0 1.0 0.14 0.58 0.15 0.0 0.65 0.0 0.52 0.17 0.1 0.0 0.19 0.98 0.35 0.1 0.04 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0
0.03 0.06 0.8 0.07 0.12 0.0 0.13 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.15 0.12 0.0 0.02 0.02 0.29 0.0 0.07 0.1 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.07 0.18 0.04 0.0 0.12 0.2 0.77 1.0 0.0 0.13 0.07 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0
0.21 0.1 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04 0.01 0.1 0.16 0.07 0.07 0.04 0.04 0.08 0.09 0.05 0.05 0.07 0.05 0.09 0.19 0.07 1.0 0.04 0.06 0.06 0.08 0.07 0.04 0.05 0.1 0.08 0.09 0.11 0.25 0.09 0.06 0.06 0.04 0.03 0.07 0.03
1.0 0.13 0.13 0.1 0.12 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.07 0.05 0.03 0.04 0.15 0.07 0.06 0.07 0.06 0.05 0.07 0.14 0.03 0.07 0.04 0.04 0.18 0.06 0.07 0.07 0.06 0.07 0.11 0.07 0.03 0.02 0.04 0.02 0.02 0.03 0.19 0.0 0.02
0.18 0.12 0.08 0.08 0.08 0.09 0.08 0.19 0.3 0.21 0.3 1.0 0.2 0.11 0.13 0.06 0.09 0.04 0.13 0.09 0.07 0.06 0.07 0.14 0.09 0.07 0.13 0.06 0.08 0.13 0.24 0.08 0.06 0.11 0.06 0.08 0.17 0.09 0.21 0.14 0.1 0.24 0.12 0.09 0.11 0.1 0.41 0.05
AT5G08160 (PK3)
 0.36 0.19 0.45 0.55 0.5 0.62 0.64 0.33 0.22 0.05 0.07 0.0 0.06 0.21 0.1 0.1 0.14 0.22 0.07 0.18 0.15 0.11 0.17 0.17 0.02 0.15 0.1 0.18 0.24 0.01 0.19 0.25 0.11 0.22 0.17 0.2 0.1 0.21 0.09 0.03 0.33 0.36 0.63 0.36 0.42 1.0 0.15 0.4
AT5G09410 (CAMTA1)
 1.0 0.62 0.43 0.51 0.44 0.41 0.45 0.11 0.06 0.02 0.03 0.0 0.02 0.6 0.35 0.31 0.36 0.29 0.14 0.52 0.41 0.37 0.44 0.36 0.1 0.43 0.43 0.51 0.43 0.08 0.45 0.33 0.29 0.33 0.26 0.33 0.58 0.36 0.57 0.49 0.36 0.28 0.51 0.48 0.37 0.53 0.41 0.3
0.22 0.11 0.32 0.31 0.24 0.09 0.28 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.04 0.1 0.12 0.11 0.14 0.12 0.09 0.16 0.12 0.11 0.16 0.16 0.18 0.12 0.14 0.24 0.08 0.14 0.18 0.2 0.06 0.09 0.19 0.22 0.19 0.11 0.18 1.0 0.19 0.11 0.09 0.2 0.12 0.1 0.64 0.17
AT5G19040 (IPT5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.09 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.06 0.01 0.04 0.01 0.06 0.1 0.04 0.0 0.0 0.01 0.16 0.1 0.27 0.02 0.02 0.43 0.14 0.01 0.01 0.01 1.0 0.29 0.01 0.99 0.0 0.0 0.01
0.34 0.19 0.4 0.43 0.32 0.22 0.4 0.28 0.33 0.3 0.27 0.03 0.05 0.23 0.2 0.18 0.15 0.14 0.44 0.2 0.23 0.12 0.13 0.17 0.17 0.15 0.32 0.21 0.87 0.15 0.2 0.19 0.15 0.21 0.17 0.15 0.3 0.17 0.37 0.41 0.71 0.26 0.17 0.16 0.17 0.21 1.0 0.12
0.31 0.33 1.0 0.99 0.54 0.06 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.2 0.15 0.07 0.07 0.12 0.38 0.12 0.21 0.32 0.16 0.18 0.12 0.09 0.31 0.48 0.17 0.32 0.37 0.16 0.18 0.36 0.16 0.32 0.28 0.31 0.05 0.18 0.1 0.11 0.81 0.39 0.01 0.2 0.41
AT5G59420 (ORP3C)
 0.27 0.17 0.19 0.17 0.16 0.1 0.16 0.04 0.03 0.0 0.01 0.03 0.05 0.25 0.13 0.13 0.15 0.14 0.16 0.17 0.15 0.08 0.11 0.14 0.12 0.14 0.62 0.16 0.44 0.08 0.16 0.17 0.13 0.22 0.13 0.17 0.44 0.19 0.56 0.22 1.0 0.26 0.19 0.1 0.13 0.74 0.43 0.08
AT5G62090 (SLK2)
 0.2 0.3 0.02 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.06 0.12 0.13 0.09 0.07 0.29 0.14 0.11 0.14 0.11 0.07 0.12 0.17 0.28 0.22 0.06 0.23 0.07 0.1 0.09 0.18 0.11 0.25 0.14 0.27 1.0 0.46 0.1 0.09 0.11 0.08 0.05 0.1 0.06
AT5G62640 (ELF5)
 0.89 0.27 0.38 0.3 0.36 0.16 0.34 0.06 0.07 0.05 0.05 0.06 0.02 0.21 0.2 0.17 0.18 0.18 0.16 0.28 0.17 0.23 0.29 0.16 0.23 0.14 0.24 0.47 0.39 0.25 0.25 0.28 0.19 0.21 0.25 0.17 0.22 0.2 0.27 0.3 1.0 0.19 0.24 0.26 0.21 0.96 0.46 0.26
0.24 0.04 0.06 0.05 0.06 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.06 0.02 0.03 0.02 0.05 0.05 0.08 0.08 0.03 0.02 0.04 0.01 0.09 0.09 0.02 0.04 0.08 0.02 0.02 0.07 0.03 0.03 0.04 0.02 0.79 0.02 0.01 0.01 0.07 0.03 0.43 1.0 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)