Heatmap: Cluster_208 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
19.56 15.57 37.68 8.52 50.13 41.79 39.68 30.87 18.05 19.8 8.46 9.23 21.55 13.51 19.24 11.52 6.95 8.14 25.17 28.89 34.14 23.84 13.44 2.49 21.66 7.92 17.72 15.41 7.38 11.07 16.88 14.04 13.97 12.45 7.97 15.96 15.7 17.59 8.18 11.03 9.95 7.32 12.11 10.74 10.27 17.87 11.74 13.25
35.43 34.58 58.98 18.73 74.54 64.24 84.18 74.85 37.92 53.27 24.23 24.32 45.42 26.76 44.92 22.65 42.84 29.29 41.34 53.81 48.34 37.23 11.05 10.79 40.82 32.66 34.87 44.08 34.22 31.85 48.6 34.89 36.34 33.88 35.37 48.42 38.45 41.45 17.58 29.2 21.97 19.65 28.5 28.03 21.86 38.24 36.19 29.85
1.89 3.01 5.33 0.53 15.53 19.3 13.99 15.11 2.34 9.67 0.81 0.82 5.71 2.57 7.49 1.95 3.77 2.52 5.36 7.94 7.47 9.9 0.55 1.57 5.31 1.46 1.07 2.35 1.02 3.57 5.17 3.47 2.86 2.49 0.82 1.73 4.34 6.87 1.25 4.96 4.59 3.51 5.26 3.07 2.16 5.9 2.54 2.86
5.23 9.03 11.29 3.01 18.96 20.89 22.04 18.13 5.89 10.87 2.66 2.37 9.55 5.35 10.72 3.2 11.06 5.59 17.68 16.12 14.45 14.3 21.94 2.09 14.19 6.13 9.65 12.23 11.19 9.04 10.63 8.61 8.93 11.84 9.49 10.05 13.04 10.33 4.71 7.16 7.1 6.39 8.07 5.33 5.91 9.78 6.4 12.93
14.17 9.89 10.6 3.01 25.93 23.73 32.63 27.47 11.55 14.69 2.59 2.92 12.96 7.01 14.01 6.54 17.13 11.73 21.66 22.92 22.8 15.42 23.91 6.39 14.45 9.61 12.27 12.94 9.96 10.21 10.91 8.26 9.53 9.61 7.85 10.08 12.14 16.81 4.93 6.95 5.37 4.56 9.42 8.15 7.93 15.42 6.99 9.68
1.62 11.18 9.24 2.08 18.21 13.6 12.4 15.02 6.19 11.36 0.98 0.83 8.82 4.73 9.76 1.57 5.22 4.74 5.72 7.74 10.98 8.11 1.35 1.85 7.74 6.29 6.11 9.67 3.92 5.75 8.9 6.45 8.37 8.01 0.93 3.98 9.97 9.17 3.76 6.76 3.77 3.53 7.62 6.63 6.22 8.97 6.56 5.29
11.07 15.58 31.4 2.52 47.62 29.75 43.53 52.73 17.09 17.1 6.07 6.69 11.73 6.77 14.29 9.26 15.14 15.83 25.49 23.92 23.85 22.63 7.89 14.38 16.21 5.41 11.2 19.78 12.14 13.66 17.01 13.31 13.24 13.81 8.22 9.87 18.28 17.95 7.38 12.35 8.25 7.67 12.29 12.17 10.34 17.4 10.72 12.2
9.42 11.36 21.84 5.14 27.75 24.35 25.92 21.62 14.5 16.73 9.66 9.5 13.44 12.94 14.79 9.84 8.99 6.73 16.89 19.55 21.2 23.79 5.58 3.3 15.15 8.38 13.45 14.22 10.63 9.08 14.99 16.63 11.39 10.56 13.61 11.98 13.78 10.72 4.97 7.56 9.47 7.47 10.36 8.98 8.37 9.63 10.71 10.62
12.08 25.33 22.71 6.39 23.9 42.63 51.07 42.33 10.42 21.21 7.77 8.6 16.7 5.4 18.15 12.61 19.01 16.31 26.44 27.7 27.02 22.71 3.18 7.45 19.15 14.17 11.16 21.58 14.29 16.09 22.93 15.76 17.26 19.29 12.03 24.48 21.23 21.59 9.59 9.84 7.04 5.87 11.26 15.14 11.09 21.18 18.64 16.53
8.96 5.72 10.4 2.65 18.03 23.12 25.42 29.46 14.44 14.86 3.94 3.24 10.71 4.23 12.45 7.66 12.33 11.79 16.89 17.9 18.08 15.62 3.94 5.89 15.45 10.01 6.94 14.45 9.65 9.52 14.6 9.24 11.63 10.06 11.8 11.8 16.42 13.21 4.45 7.39 4.69 3.4 10.58 8.12 6.42 12.43 9.66 7.37
5.15 7.0 8.43 10.27 27.08 25.59 24.84 23.91 9.95 10.65 1.79 1.79 8.85 3.6 9.74 8.33 10.88 9.02 18.82 16.54 12.95 9.8 12.57 3.45 9.96 8.21 9.37 10.18 5.48 7.7 10.07 7.98 7.56 8.1 5.53 9.5 12.24 9.17 4.04 5.42 4.52 3.27 5.76 6.73 4.98 8.55 7.25 6.58
2.13 4.23 10.33 2.65 12.17 13.92 14.77 13.45 3.73 7.22 2.3 2.37 6.99 5.01 6.07 7.0 6.79 5.73 9.41 11.25 10.12 9.48 3.34 2.71 10.26 9.09 8.22 6.36 3.42 4.99 8.43 5.93 5.53 4.54 2.94 4.66 6.16 7.27 3.87 4.68 4.59 3.99 4.8 4.35 4.21 7.39 5.03 7.12
4.64 4.27 13.21 1.51 18.2 16.48 20.45 20.25 2.96 12.44 2.06 1.99 8.79 4.63 10.96 1.76 5.6 3.44 30.12 17.56 16.52 18.11 6.1 0.98 6.84 2.1 5.69 9.4 2.89 6.74 10.58 10.53 9.41 8.66 2.98 8.0 11.63 8.14 4.88 7.26 6.08 4.96 8.14 6.84 6.82 8.16 5.35 10.23
6.77 11.38 18.52 5.8 22.07 25.92 29.85 31.41 13.5 13.16 1.82 1.88 10.61 7.82 9.44 9.71 12.32 9.96 15.23 16.89 13.54 14.01 2.88 7.45 12.57 9.78 9.77 14.67 8.96 9.95 15.89 8.24 9.19 8.33 6.45 10.34 11.87 14.52 5.84 8.5 7.71 6.9 10.45 9.09 5.65 14.01 10.1 9.56
10.63 24.32 51.39 6.07 57.75 47.5 57.07 49.38 21.18 28.65 15.56 14.93 33.55 48.46 30.28 12.3 18.58 16.54 18.04 35.71 60.34 64.51 2.78 14.36 36.59 39.48 32.67 16.52 15.76 13.63 17.57 18.43 16.92 20.74 9.07 15.02 20.34 12.12 9.58 13.8 14.95 11.6 17.17 14.21 10.97 12.07 12.37 14.82
7.62 10.24 23.83 6.45 40.36 23.23 25.77 24.42 5.47 17.4 3.93 4.18 10.98 4.87 14.68 12.42 12.83 14.44 35.66 20.56 33.29 41.2 7.99 8.46 21.76 10.59 12.92 7.41 5.05 8.23 10.24 6.72 7.24 8.17 3.31 7.09 7.4 10.15 4.53 7.92 9.82 9.16 10.11 10.72 5.85 10.21 10.16 11.05
12.13 13.55 31.95 4.06 32.77 40.43 48.54 51.46 13.62 25.48 9.91 9.85 21.48 8.71 20.81 11.27 19.51 13.31 42.34 30.32 28.63 29.96 6.88 16.86 21.01 21.53 17.6 18.76 10.7 14.29 21.53 13.77 15.95 14.41 8.21 20.66 22.0 18.74 7.64 10.6 8.09 6.67 12.5 10.82 9.69 19.01 12.64 14.02
4.3 8.32 9.97 8.81 21.79 19.99 18.73 18.02 4.39 10.41 5.26 4.92 10.51 7.95 8.9 3.45 6.62 5.48 15.04 14.85 12.17 14.37 4.92 2.96 11.77 9.38 8.85 5.49 3.11 4.67 6.71 6.46 5.2 4.35 3.21 6.98 7.07 7.07 2.91 4.78 5.3 5.43 6.11 5.11 3.68 6.81 5.35 5.72
24.25 15.84 34.41 6.48 41.5 52.86 50.02 56.67 37.3 32.91 10.68 10.63 21.41 10.66 33.41 10.46 19.63 22.79 30.44 28.0 27.8 19.07 14.08 15.42 34.26 30.49 26.99 35.07 14.8 19.18 32.12 22.57 21.29 19.13 14.53 31.68 28.96 28.58 10.18 11.61 8.09 5.92 13.99 13.26 10.01 26.31 23.93 21.15
11.79 11.34 24.63 2.19 26.77 44.03 46.48 45.72 24.4 22.1 13.25 12.83 8.03 2.94 20.75 11.33 12.61 13.26 35.48 40.11 37.27 32.63 17.37 6.11 25.31 14.83 16.81 22.25 9.56 11.95 22.11 12.6 13.52 11.41 16.09 14.13 19.94 17.46 4.4 6.29 3.72 2.38 9.8 8.82 4.47 17.04 15.22 11.52
22.32 32.02 43.44 20.19 59.27 58.13 52.31 50.12 28.67 39.99 7.86 7.51 34.59 28.74 36.63 17.65 47.45 32.86 43.02 50.26 43.79 40.53 13.04 16.41 29.84 25.7 16.41 34.47 24.51 27.05 35.5 26.31 38.45 42.65 21.87 40.94 38.72 41.47 29.49 27.19 22.07 20.6 30.45 29.09 34.03 40.05 33.31 24.18
5.46 4.44 13.26 2.0 14.71 23.44 28.14 29.56 13.8 9.69 4.22 4.27 7.49 4.16 7.08 6.2 4.72 7.49 12.95 16.25 9.44 9.36 3.88 2.87 10.06 7.02 9.6 8.17 2.73 6.97 10.41 7.4 5.63 5.1 1.8 4.04 7.09 12.25 2.31 5.46 4.98 4.76 5.54 3.75 3.33 12.07 4.86 7.21
9.08 4.67 8.78 2.86 18.65 17.93 14.96 15.08 4.24 6.08 1.26 1.12 6.34 4.52 6.43 7.48 4.67 4.12 8.68 11.16 11.15 9.03 2.42 5.14 8.4 4.53 8.96 4.5 2.47 3.61 5.01 3.94 4.3 3.57 1.77 3.21 6.04 5.31 2.47 4.94 5.76 4.58 6.42 4.61 4.43 5.25 3.76 4.02
24.57 10.98 20.31 2.82 36.96 88.89 73.45 77.32 15.83 23.34 9.59 9.43 20.34 10.46 24.59 6.37 8.49 8.78 23.07 46.48 55.02 34.62 2.44 4.21 20.02 6.97 15.81 12.3 8.35 10.92 17.9 20.24 13.97 10.99 3.6 12.73 18.6 14.54 6.74 10.99 6.32 5.02 14.52 12.28 10.38 14.05 12.25 11.94
61.19 45.54 95.25 11.89 106.81 124.3 157.4 158.39 76.21 34.54 9.43 10.29 27.6 8.28 45.49 42.28 39.0 31.31 50.38 64.41 54.11 51.4 16.57 12.49 80.53 68.14 57.89 58.64 25.96 33.86 50.75 22.54 26.87 26.25 46.26 43.4 48.51 45.98 13.47 22.9 28.56 19.64 25.26 18.19 11.77 43.2 28.21 55.38
3.96 7.54 11.93 9.35 22.28 22.04 18.74 16.07 4.62 9.66 1.83 1.67 6.78 4.15 9.45 9.04 7.41 8.34 12.27 15.06 13.02 11.47 5.54 3.88 15.15 6.44 9.95 7.61 4.95 6.25 9.54 7.59 8.83 8.44 3.53 10.17 9.09 6.97 5.06 5.4 5.87 4.8 6.45 7.48 6.47 6.45 6.93 7.26
43.73 45.22 59.35 8.99 127.31 105.97 105.22 102.7 49.81 69.87 43.04 39.76 52.87 30.97 58.7 31.08 53.43 35.73 94.78 102.67 107.41 84.76 45.5 26.63 102.74 50.21 64.0 44.42 40.43 29.8 48.48 35.46 40.02 38.97 68.96 31.18 45.67 41.72 26.33 42.47 39.95 37.6 58.48 43.95 34.51 43.48 45.31 34.17
22.42 34.98 36.2 6.82 177.76 100.28 85.92 86.37 45.61 66.03 39.67 33.51 51.7 28.74 53.37 30.64 38.46 38.64 84.58 89.68 111.07 69.21 113.07 18.74 74.88 22.36 63.47 38.33 41.2 31.67 45.62 39.68 45.19 41.73 71.42 42.64 44.71 48.68 25.27 45.03 30.78 25.12 73.56 53.34 37.18 46.44 43.39 30.28
1.75 2.68 3.03 1.29 17.97 23.4 20.69 16.59 2.96 6.49 0.89 1.0 6.65 5.85 9.09 0.75 4.53 0.82 10.49 10.92 9.72 7.19 16.88 0.65 4.97 2.23 2.23 11.64 7.35 5.8 5.86 2.71 5.87 5.99 6.37 6.46 7.54 4.48 7.96 6.38 6.89 4.83 8.58 5.45 4.25 4.03 7.18 9.38
8.06 7.99 19.51 5.93 18.43 36.98 40.44 42.41 10.22 15.06 5.18 4.93 9.14 3.99 13.21 5.66 8.9 4.29 12.08 19.07 28.66 20.49 7.18 2.38 12.51 6.2 6.85 7.12 6.05 7.39 10.57 15.04 9.3 7.25 5.99 8.21 11.7 10.47 3.03 7.88 4.2 3.01 8.3 8.3 5.53 10.34 4.85 8.48
4.68 7.02 10.37 7.13 15.67 13.92 14.72 13.73 16.61 12.54 4.67 5.01 9.42 4.07 11.35 4.93 10.15 11.35 10.76 9.88 10.73 10.9 7.37 5.95 16.49 13.48 14.74 10.06 5.95 7.21 11.47 10.73 7.82 7.24 4.95 9.97 10.47 9.06 3.54 5.64 5.23 3.57 6.69 8.08 5.57 8.46 7.82 7.82
22.16 14.82 38.21 2.38 77.34 57.42 54.65 59.03 27.03 38.17 12.45 11.95 33.89 22.73 26.39 8.74 18.06 8.44 31.85 45.38 38.62 31.33 2.12 6.2 28.98 19.4 18.2 18.24 11.95 16.26 28.18 22.32 19.42 15.71 10.44 15.29 28.26 22.8 8.92 17.96 22.17 21.82 26.32 15.34 12.42 21.62 16.74 13.44
3.99 8.37 11.67 1.67 23.58 25.07 28.29 23.53 3.31 11.89 0.15 0.09 8.29 3.45 11.19 4.46 12.77 10.87 18.56 17.35 16.45 13.05 10.3 4.19 11.21 9.91 7.18 15.93 7.83 9.18 14.7 6.67 11.42 10.45 6.23 15.36 15.56 14.84 4.87 6.56 4.13 3.08 6.84 6.22 5.65 13.61 7.06 9.27
2.11 6.75 8.34 2.81 16.19 12.34 16.91 15.49 6.06 6.85 0.98 0.99 6.05 5.45 5.36 1.63 7.37 5.06 9.83 11.64 10.42 5.95 5.37 1.05 5.93 3.37 5.47 8.77 4.08 5.04 9.58 6.96 5.57 5.3 3.33 5.07 8.84 9.22 3.1 4.97 5.22 3.73 5.1 4.72 4.16 9.33 5.44 4.87
17.99 19.23 27.24 3.75 87.9 46.65 44.36 45.58 27.14 31.56 8.33 7.04 27.28 16.08 29.73 12.02 38.66 31.53 57.13 57.32 55.94 45.23 35.46 19.71 48.68 16.9 43.35 22.73 21.52 18.94 28.41 14.11 25.1 23.14 27.29 24.96 33.22 22.91 19.13 30.01 18.23 17.09 40.32 27.02 19.04 22.02 24.64 18.62
8.12 11.07 12.8 3.91 11.89 19.55 23.85 18.83 5.88 11.12 2.2 2.4 6.25 2.3 9.47 6.43 13.41 9.63 16.45 15.0 13.73 11.28 18.45 2.9 10.46 5.53 9.09 11.83 3.73 7.97 11.49 8.32 7.67 7.15 2.64 12.17 9.46 11.0 3.59 4.26 2.31 2.12 5.48 5.37 4.11 10.28 9.56 9.03
2.73 9.89 22.62 1.58 30.08 19.53 22.52 21.82 10.93 15.94 1.1 0.86 10.76 3.63 13.3 9.87 11.24 10.57 13.42 16.26 15.92 18.89 0.5 4.11 14.59 10.11 6.77 12.46 9.33 8.41 13.0 9.05 10.38 8.47 5.65 8.12 14.18 15.72 4.35 8.27 3.83 3.23 9.85 9.42 6.91 14.77 10.03 5.24
10.01 12.83 15.28 4.41 31.02 24.55 38.45 32.23 9.58 13.21 1.7 1.73 9.93 6.56 9.4 7.57 9.8 9.84 20.87 21.75 17.89 11.94 5.93 4.27 16.22 6.67 13.34 13.7 8.0 8.84 13.35 8.8 9.14 8.75 6.9 11.34 15.06 15.25 5.35 8.6 5.48 4.34 8.26 7.52 6.71 14.91 9.45 8.98
20.75 44.63 57.72 7.81 75.82 51.68 70.87 74.09 31.22 45.59 12.64 11.2 33.88 11.13 36.81 24.35 52.82 47.37 45.6 44.45 48.6 55.62 21.92 22.28 46.31 25.59 21.45 32.33 34.07 31.27 37.02 20.29 36.13 36.51 28.28 28.7 35.21 48.1 17.94 28.7 17.58 18.82 32.92 30.14 26.29 47.13 35.31 24.73
10.92 14.95 21.74 4.85 35.11 30.71 35.1 27.77 14.04 20.19 6.32 5.89 22.32 13.53 17.79 16.91 18.29 14.8 21.89 25.07 23.04 23.97 4.08 5.73 19.16 19.56 11.82 12.56 5.83 8.71 15.45 12.65 9.23 8.51 5.34 7.31 15.49 13.54 5.39 9.71 10.05 7.87 11.3 9.45 5.82 12.95 10.22 9.59
28.3 24.44 65.32 21.68 46.51 41.7 78.5 75.75 23.18 49.91 14.52 13.61 31.45 14.28 42.23 28.94 57.48 35.63 59.56 55.06 55.01 56.48 19.39 16.29 28.94 34.25 22.0 38.11 39.37 36.37 40.41 34.32 40.63 41.8 24.04 42.47 41.66 45.02 19.51 25.95 16.94 19.06 33.03 38.73 30.39 44.25 40.47 32.07
7.36 5.94 12.17 2.26 23.59 23.21 21.13 21.25 7.59 10.05 4.71 4.5 8.12 5.2 10.93 7.96 7.79 7.17 14.62 16.02 18.3 16.23 13.52 6.04 16.33 8.94 14.99 11.71 6.49 6.24 9.26 8.33 9.46 7.93 8.93 11.01 12.88 8.25 4.93 5.51 5.24 4.17 6.73 6.82 5.95 7.71 6.92 8.06
5.66 3.83 10.34 0.12 26.08 27.81 29.77 26.61 9.03 11.03 1.18 0.88 6.02 1.83 11.4 5.98 8.52 2.28 22.85 20.69 25.91 18.49 10.7 0.44 4.28 1.63 3.23 8.92 4.76 5.33 8.35 4.56 6.88 4.13 8.23 12.01 10.64 8.45 2.46 4.38 2.96 2.05 7.19 5.47 3.13 7.75 4.37 9.1

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)