Heatmap: Cluster_92 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_14050V3.1	-	-	-	2.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.19	-	-	-	-	-	-	-	-	4.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_22310V3.1	-	-	4.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_23190V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.31	3.6	2.42	-	-	-	-	-	-	-	4.01	-	-	-	-	-	-	0.75	1.45	1.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.08
Pp3c10_4180V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.69	-	-	-	-	-	-	-	-	5.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_25610V3.1	-	-	2.72	2.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_27010V3.1	-	-	3.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.89	-	-	-	-	-	4.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_18430V3.1	-	-	4.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.15	-	3.84	-	-	-	-	-	-	-	-	3.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_21180V3.1	-	-	4.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.56	-	-	-	-1.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_7530V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.57	-	-	-	-	-	-	3.36	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_13150V3.1	-	-	2.26	1.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.34	1.66	-	-	-	-	-	2.39	-	4.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_19021V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.4	-	-	-	-	-	-	-	-	4.75	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_13240V3.1	-	-	-	-	-0.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.13	1.96	-	-	-	-	-	-	-	4.67	-	-	-	-2.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_22710V3.1	-	2.28	2.99	0.36	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.23	3.33	1.52	-	-	-	-	-	-	-	4.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_3990V3.1	-	-	4.59	-	-	-	-	-	2.61	-	-	-	-	-	-	-	2.97	-	-	-	-	-	-	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_13750V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	3.35	-	-	-	-	-	-	-	4.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_14270V3.1	-	-	4.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_15820V3.1	-	-	3.55	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.26	-	4.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_3060V3.1	-	-	3.56	-	3.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.26	-	-	-	-	-	-	-	-	3.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.13	-	-
Pp3c17_12640V3.1	-	-	4.49	-	3.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_12770V3.1	-	-	2.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_15090V3.1	-	-	-	3.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_4910V3.1	-	-	-	1.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.09	-	-	-	-	-	-	-	-	4.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_11110V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.17	2.71	-	-	-	-	-	-	-	4.52	-	-	-	-1.36	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_18730V3.1	-	-	3.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.89	-	-	-	-	-	-	-	-	5.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_21250V3.1	-	-	3.65	0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.98	2.79	2.83	-	-	-	-	-	-	2.65	-	3.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_50V3.1	-	-	4.33	-	2.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.73	-24.48	-	-	-	-	-0.03	-	4.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_6830V3.1	-	1.17	0.39	2.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.73	1.21	-	-	-	-	-	-	-	4.53	-	-	-	-3.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_12420V3.1	-	-	1.51	2.95	-	-	-	2.47	-	-	-	-	-	-	-	-	3.36	-	-	-	-	-	-	-	-	4.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_19690V3.1	-	-	4.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_21700V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_23030V3.1	-	-	-	2.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.38	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_3810V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.75	-	-	-	-	-	-	-	-	4.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_39710V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.29	-	-	-	-	-	-	-	-	4.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_15820V3.1	-	-	2.76	-	3.11	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.07	-0.1	-	-	-	-	-	-	0.51	3.64	2.88	-	-	-0.61	-	-	-	-	-	-	-	-0.11	-	-	-	1.14	-	-	-	-	0.38	-
Pp3c20_3930V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.88	-	-	-	-	-	-	-	-	5.03	-	-	-	-0.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_4110V3.1	-	-	0.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.67	-	-	-	-	-	-	-	-	5.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_14700V3.1	-	-	1.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.99	2.02	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_2620V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.62	-	-	-	-	-	-	-	-	5.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_9680V3.1	-	-	-	-	2.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.13	-	-	-	-	-	-	-	-	5.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_11910V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.71	2.8	-	-	-	-	-	-	-	4.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_12130V3.1	-	-	2.24	1.45	-	2.0	-	-	-	0.04	-	-	1.49	2.06	-3.12	-	1.68	0.03	-	-	-	-	-	-	0.23	4.03	-	-	-0.39	-0.88	-0.99	-	-	-0.2	-	0.59	-	-	-	0.53	-	-	0.02	-	-	-	-	-
Pp3c22_7125V3.1	-	-	1.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.13	-	3.47	-	-	-	-	-	-	-	-	5.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_17450V3.1	-	-	3.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_5410V3.1	-	-	3.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_16290V3.1	-	1.87	1.01	-	1.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.23	3.54	-	-	-	-	-	-	-	-	4.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_8020V3.1	-	-	4.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c25_2550V3.1	-	-	4.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_11990V3.1	-	-	4.05	-	2.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_20460V3.1	-	-	2.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.71	-	-	-	-	-	-	-	-	4.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_30100V3.1	-	-	1.24	0.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.02	1.24	-	-	-	-	-	-	-	4.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_32120V3.1	-	-	-	1.63	0.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.54	2.78	-	-	-	-	-	-	-	4.12	1.51	-	-	-0.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.95	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_4110V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.19	-	-	-	-	-	-	-	-	5.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_18210V3.1	-	-	1.5	3.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.91	-	2.71	0.51	-	-	-	-	-	-	-	4.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_29680V3.1	-	-	2.3	-	-	-	-	-	0.29	-	-	-	-	-	-2.02	1.13	2.81	-	-	-	-	-	-	0.81	-	4.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_14800V3.1	-	-	4.09	3.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.9	-	1.24	0.93	-	-	-	-	-	0.68	-	3.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_15120V3.1	-	-	3.67	2.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.49	-	1.49	1.65	-	-	-	-	-	-	-	4.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_18500V3.1	-	-	4.0	0.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.61	1.36	-	-	-	-	-	-	-	1.18	4.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_30310V3.1	-	-	3.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.06	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_7230V3.1	-	-	4.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_12860V3.1	-	-	-	-	1.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.36	-	-	-	-	-	-	-	-	4.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_3950V3.1	-	-	4.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_15700V3.1	-	2.6	3.68	1.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.51	1.19	-	-	-	-	-	-	-	3.72	-	-	-	-1.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_22510V3.1	-	-	1.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.62	0.17	-	-	-	-	-	2.47	-	4.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.63
Pp3c6_9670V3.1	-	-	-	2.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.25	-	-	-	-	-	-	-	-	4.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_1020V3.1	-	-	2.32	-	1.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.1	-	3.01	-	-	-	-	-	-	-	-	4.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_3520V3.1	-	-	3.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.51	-	-	-	-	-	-	-	-	4.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_4090V3.1	-	-	2.51	2.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.11	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_500V3.1	-	-	3.58	2.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.04	-	2.91	-	-	-	-	-	-	-	-	4.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_12670V3.1	-	-	-	1.84	0.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.94	1.4	-	-	-	-	-	-	-	5.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_17770V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.88	2.94	-	-	-	-	-	-	-	-	5.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_17780V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.88	2.94	-	-	-	-	-	-	-	-	5.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_23470V3.1	-	-	3.6	-	-	3.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.93	-	-	-	-	-	2.45	-	3.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_7160V3.1	-	-	-	3.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s38_160V3.1	-	-	-	-	1.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.48	-	-	-	-	-	-	2.35	-	4.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s52_120V3.1	-	-	3.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.67	-	-	-	-	-	-	-	-	5.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s67_100V3.1	-	-	3.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.41	2.0	-	-	-	-	-	-	-	4.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s794_20V3.1	-	1.73	3.25	1.22	-	-	-	-	2.23	-	-	-	-	-	-0.16	-	3.27	-	-	-1.32	-	-	-	-	-	4.1	-	-	-	-5.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.