Heatmap: Cluster_237 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_13820V3.1	-1.41	-0.84	0.48	-1.32	1.49	0.83	0.42	0.24	-0.6	0.53	-0.59	-0.76	0.57	0.41	-0.01	-0.41	-0.06	-0.46	-0.2	0.29	0.02	0.27	-1.72	-1.07	0.1	-0.07	-0.52	-0.26	-0.19	-0.05	0.17	0.11	0.37	0.08	-0.82	-0.27	0.54	0.21	-0.4	-0.16	-0.08	-0.12	-0.02	-0.12	0.01	0.23	0.06	-0.2
Pp3c10_18980V3.1	-2.03	-1.56	-1.34	-2.47	0.56	0.32	0.56	0.5	-1.31	0.68	-0.19	-0.3	0.53	0.35	0.28	-1.35	-1.05	-0.84	-0.3	0.04	0.19	0.11	-2.85	-1.46	0.12	-0.59	0.22	0.1	0.14	0.07	0.4	0.37	0.51	0.34	-0.79	0.2	0.59	0.39	-0.21	0.36	0.34	0.21	0.48	0.21	0.17	0.37	0.11	0.01
Pp3c10_300V3.1	-0.65	-0.66	0.3	-3.4	1.43	0.7	0.39	0.18	-0.27	0.06	-2.71	-2.79	-0.84	-1.3	-0.45	-1.11	-0.37	-1.72	0.0	0.63	0.36	0.16	-1.77	-2.48	0.11	-0.98	1.66	0.07	0.03	0.15	0.21	-0.21	0.51	0.38	-0.66	-0.67	0.32	0.72	-0.5	0.57	-0.08	-0.57	0.53	0.31	0.16	0.68	0.17	-0.65
Pp3c11_12590V3.1	-1.28	-1.48	-1.73	0.17	1.83	0.77	0.67	0.58	-1.07	0.42	-2.03	-2.56	0.09	-0.88	0.03	-1.67	-0.85	-0.97	-0.84	-0.36	-0.23	-0.33	-1.09	-0.24	0.65	-0.52	0.19	0.26	0.75	-0.16	0.79	0.03	0.51	0.26	-0.61	0.23	0.81	0.18	-0.48	-0.25	-0.11	-0.23	-0.02	0.06	0.07	0.19	0.24	-0.13
Pp3c11_14450V3.1	-1.33	-1.48	-0.09	-1.05	1.43	0.49	0.18	0.19	-0.7	0.33	-0.08	-0.25	-0.06	-1.01	0.19	-1.49	-0.48	-0.73	0.15	0.22	0.44	0.25	-1.06	-1.32	0.37	-0.68	0.73	0.1	0.24	-0.18	0.24	0.17	0.45	0.1	-0.52	0.47	0.33	-0.08	-0.42	0.13	0.13	-0.25	0.35	0.01	-0.12	-0.04	0.07	0.09
Pp3c11_20840V3.1	-3.15	-2.1	0.12	-1.48	1.03	1.05	0.68	0.53	-1.69	0.25	-0.93	-1.06	-0.17	-0.97	0.35	-1.91	-0.74	-1.14	0.07	0.4	0.42	-0.09	-1.06	-1.24	0.51	-0.23	0.75	0.36	-0.06	0.16	0.54	0.45	0.49	-0.25	-1.37	0.79	0.51	0.1	-0.26	-0.15	-0.28	-0.55	-0.01	0.05	0.17	0.03	0.21	0.54
Pp3c11_21360V3.1	-0.57	-0.52	-1.47	-0.89	0.83	0.31	0.34	-0.05	-0.99	0.17	-1.17	-1.31	0.55	0.24	-0.25	-0.79	-0.31	-0.42	-0.63	-0.29	-0.14	0.17	-2.86	-2.5	0.54	-0.19	0.06	0.73	-0.1	-0.05	0.62	-0.64	0.44	0.47	0.83	0.24	0.61	0.41	0.26	-0.14	0.12	-0.04	0.28	-0.23	0.03	0.51	0.01	0.3
Pp3c11_21850V3.1	-2.39	-2.45	-0.36	-2.08	1.23	0.53	0.12	0.33	-1.78	0.43	-0.33	-0.47	-0.0	-0.89	0.01	-1.4	-0.94	-0.49	0.29	0.62	0.84	0.47	-0.37	-1.92	0.65	-1.52	0.3	0.11	-0.13	-0.12	0.2	0.1	0.5	0.26	-0.22	0.38	0.31	0.23	-0.49	0.25	-0.06	-0.16	0.47	0.18	0.06	0.29	0.21	0.05
Pp3c11_24680V3.1	-1.13	-1.8	-0.58	-2.32	0.96	0.16	0.12	0.1	-0.5	0.06	0.37	0.2	0.06	-0.45	0.0	-1.18	-0.84	-1.45	0.74	0.73	0.68	0.06	0.37	-2.05	0.4	-1.38	0.7	0.07	-0.38	-0.08	-0.16	0.39	0.31	-0.02	-1.35	-0.19	0.15	0.22	-0.72	0.37	0.41	0.05	0.57	0.42	0.15	0.09	0.21	-0.29
Pp3c12_11630V3.1	-0.86	-0.65	-0.41	-3.37	0.86	0.57	0.3	0.27	-0.34	-0.06	-0.16	-0.08	0.16	-0.11	-0.2	-1.21	-0.37	-0.55	0.57	0.73	0.64	0.24	0.14	-0.45	0.84	-0.45	1.08	-0.2	-0.46	-0.12	-0.39	-0.17	-0.01	-0.13	-0.53	-0.84	-0.08	0.3	-0.74	0.27	0.13	-0.01	0.4	-0.01	-0.03	0.38	-0.42	-0.45
Pp3c12_26140V3.1	-1.34	-0.43	0.18	-3.12	1.61	-0.13	-0.47	-0.39	-1.1	-0.05	0.08	0.19	-0.52	-1.4	-0.02	-1.01	-0.06	-0.79	0.52	0.71	0.74	0.3	-0.39	-2.06	0.22	-0.97	1.05	0.25	-0.77	0.11	-0.31	0.31	0.2	0.05	-0.5	0.3	-0.14	0.25	-0.7	0.26	-0.32	-0.72	0.23	0.54	0.04	0.33	0.28	0.32
Pp3c12_5150V3.1	0.33	-0.75	-0.58	-1.92	0.38	0.38	0.36	0.37	-0.42	0.52	-0.3	-0.36	0.75	-0.24	0.26	-0.89	-0.59	-0.73	0.07	0.29	0.07	-0.06	-1.51	-1.92	0.25	-0.25	0.67	0.03	-0.22	-0.17	0.22	0.2	0.15	0.09	-0.47	0.32	0.42	0.32	-0.33	0.09	0.08	-0.05	0.31	0.19	-0.09	0.24	-0.05	0.08
Pp3c13_10420V3.1	-1.24	-1.31	0.39	-1.13	1.67	0.16	0.14	0.42	-0.39	0.16	0.79	0.6	-0.71	-2.24	-0.21	-1.6	-0.09	-0.71	0.74	0.57	0.8	0.41	-1.69	-1.62	0.22	-0.81	0.49	0.32	-0.11	-0.07	0.29	0.58	0.3	0.06	-1.12	0.1	0.29	-0.17	-0.88	-0.3	-0.85	-1.17	-0.02	0.05	-0.32	-0.17	0.24	-0.05
Pp3c14_16580V3.1	-1.29	-0.49	-0.82	-3.98	0.63	0.28	0.45	-0.2	-1.03	0.21	-2.3	-2.63	-0.17	-0.94	-0.4	-1.06	-0.6	-0.37	-0.41	-0.19	0.27	0.14	-0.63	-1.52	0.4	-0.88	0.75	1.14	0.07	0.02	0.72	-0.61	0.65	1.11	0.87	0.52	0.85	-0.0	0.49	-0.1	-0.28	-0.65	0.24	-0.12	0.13	0.09	0.35	-0.02
Pp3c14_20610V3.1	-0.78	-0.79	0.41	-1.29	0.91	0.56	0.56	0.53	-1.99	0.33	-1.16	-1.47	0.01	-1.33	0.24	-0.36	0.08	-0.26	-0.07	0.41	0.16	-0.02	-0.87	-1.39	0.35	0.01	0.24	0.85	-0.65	0.19	0.19	0.28	0.44	0.54	-1.53	0.45	0.45	-0.09	-0.2	-0.44	-0.72	-0.86	-0.14	0.43	-0.06	-0.16	0.84	0.02
Pp3c14_2460V3.1	-0.7	-1.26	-0.33	-3.22	1.18	0.77	0.43	0.52	-0.77	0.33	-0.54	-0.71	0.42	-0.07	0.07	-1.13	-0.03	-0.89	-0.13	0.2	0.33	0.0	-1.03	-2.34	0.01	-0.38	-0.23	-0.25	0.21	-0.05	-0.05	-0.11	0.35	0.43	-0.56	-0.44	0.32	0.2	-0.39	0.52	0.57	0.57	0.55	0.16	0.36	0.26	-0.27	-0.23
Pp3c14_3370V3.1	-1.38	-0.55	0.18	-1.91	1.24	0.44	-0.21	0.17	-1.02	0.14	0.12	0.28	0.08	-0.78	0.2	-1.49	0.2	-0.74	0.36	0.22	0.04	-0.2	-0.79	-1.49	0.24	-0.13	0.31	0.66	-0.37	0.1	-0.0	0.66	0.28	0.13	-0.93	0.56	0.26	-0.0	-0.27	-0.3	-0.5	-0.76	-0.16	0.32	0.11	0.01	0.66	0.23
Pp3c15_10420V3.1	-0.93	-1.05	-0.6	-1.19	0.77	0.84	0.21	0.7	-0.76	0.35	-3.38	-3.81	0.8	0.61	0.01	0.37	-0.16	-0.08	-1.22	-0.28	0.36	0.13	-4.22	-2.15	0.43	-0.65	-0.89	-0.04	-0.2	0.08	0.33	-0.94	0.14	0.62	0.52	0.82	0.3	0.59	-0.7	-0.18	0.59	0.43	0.05	-0.64	-0.2	0.48	-0.47	0.56
Pp3c15_20810V3.1	-0.27	-1.14	-0.4	-2.75	1.12	1.18	0.96	0.86	-0.8	0.47	-1.52	-1.63	0.58	-0.75	-0.04	-0.98	-0.04	-1.01	0.66	0.72	0.63	0.56	-1.95	-2.47	-0.02	-0.04	-0.11	0.06	-0.48	-0.33	0.15	0.22	0.16	0.42	-1.78	-0.15	0.4	0.29	-0.68	-0.06	0.04	-0.3	0.0	-0.08	-0.09	0.29	-0.18	-0.12
Pp3c15_22112V3.1	-3.35	-1.67	-0.04	-2.13	1.15	0.6	-0.79	-0.03	-3.1	0.15	0.15	0.21	-0.1	-0.78	0.16	-1.34	0.09	-0.68	0.89	1.13	0.78	0.21	-1.81	-1.3	0.87	0.07	0.85	0.37	-0.32	-0.05	0.25	0.45	-0.13	-0.22	-0.41	-0.37	0.22	0.13	-1.05	-0.06	-0.39	-0.34	0.23	-0.06	-0.17	0.2	0.25	0.13
Pp3c15_5210V3.1	-0.56	-1.22	0.36	-3.17	1.53	0.18	-0.08	0.03	-0.4	0.09	0.16	0.08	-0.35	-1.84	-0.15	-1.49	-0.08	-0.87	1.02	0.78	0.69	0.41	1.01	-2.18	0.27	-0.63	1.03	0.23	-0.97	-0.1	-0.22	0.68	0.08	0.01	-2.33	-0.22	-0.07	-0.03	-0.93	-0.26	-0.66	-1.03	-0.03	0.0	-0.15	0.01	0.42	0.04
Pp3c15_8680V3.1	-1.72	-1.22	-0.17	-3.21	1.1	1.41	1.06	1.29	-1.3	-0.2	0.69	0.47	-0.27	-0.92	-1.09	-0.43	-1.15	-2.06	0.52	0.79	0.41	0.35	-4.03	-3.45	0.56	-1.38	0.81	-0.57	-1.04	-0.25	-0.14	0.47	0.15	-0.51	-0.14	-1.22	0.46	0.71	-1.63	0.29	0.32	-0.06	0.15	-0.2	-0.41	0.72	-0.69	-0.6
Pp3c16_18660V3.1	-0.85	-1.58	-0.62	-1.65	0.65	0.12	0.4	0.56	-1.19	0.31	-0.36	-0.47	0.5	-0.07	0.11	-2.18	-0.52	-0.86	0.37	0.5	0.22	-0.17	-1.64	-1.93	0.44	-0.69	0.63	0.32	0.0	-0.14	0.2	0.39	0.38	0.22	-0.54	0.41	0.6	0.33	-0.24	0.23	0.24	0.07	0.31	0.18	0.22	0.26	-0.05	-0.16
Pp3c16_24260V3.1	-1.89	-1.57	-0.62	-1.97	1.19	-0.0	-0.3	-0.34	-1.64	0.24	-0.38	-0.38	0.16	-0.47	0.11	-1.31	-0.7	-0.69	-0.06	0.16	0.12	0.17	-1.66	-1.1	0.5	-0.78	0.47	0.28	0.33	0.22	0.42	0.36	0.47	0.47	0.11	0.18	0.56	0.39	-0.07	0.33	0.09	-0.04	0.43	0.25	0.15	0.36	0.32	0.16
Pp3c16_2580V3.1	-1.21	-1.55	-0.87	-0.03	-0.01	0.28	0.71	0.64	-0.76	0.13	-1.56	-1.5	-0.12	-0.75	0.27	-2.79	-0.82	-2.24	-0.72	-0.53	0.19	-0.12	-2.11	-2.59	0.19	-0.67	1.21	0.24	0.08	0.15	0.56	-0.94	0.57	0.41	-0.22	0.33	0.68	0.47	-0.23	0.59	0.44	0.46	0.92	0.39	0.15	0.47	0.39	0.14
Pp3c16_4650V3.1	-1.04	-1.51	-0.35	-2.72	1.11	-0.03	0.16	0.38	-1.8	0.38	0.39	0.32	0.33	0.14	0.2	-1.42	-0.55	-0.82	-0.42	0.28	0.29	-0.01	-2.5	-1.96	-0.04	-0.73	-0.28	0.39	0.33	0.18	0.06	0.41	0.34	0.19	-0.07	0.11	0.37	0.32	-0.28	0.32	0.1	0.17	0.38	0.36	0.1	0.28	0.25	0.04
Pp3c17_11090V3.1	-2.47	-0.64	1.9	-2.59	2.2	2.28	1.91	2.08	-1.37	-0.5	-	-8.84	-2.39	-3.12	-1.53	-3.96	-0.41	-6.99	0.89	0.04	0.31	-1.34	0.86	-7.25	-3.17	-3.84	-7.05	0.47	-1.35	-1.08	-0.39	-4.3	-1.38	-0.75	-7.12	-2.54	-2.79	1.09	-0.73	0.56	-0.22	-0.77	0.6	0.14	-1.37	1.25	0.26	-3.16
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Pp3c6_8810V3.1	-1.45	-1.75	-1.57	-2.72	1.36	0.64	0.52	0.17	-0.93	0.47	-0.33	-0.39	0.34	-0.24	0.38	-0.53	-1.32	-1.2	-0.34	-0.06	0.21	0.08	-0.9	-1.52	0.47	-0.94	0.51	-0.22	-0.08	0.03	0.41	0.12	0.48	0.07	-0.33	-0.33	0.71	0.16	-0.63	0.42	0.56	0.28	0.54	0.2	0.3	0.12	0.03	-0.08
Pp3c6_940V3.1	-0.48	-1.37	-0.46	-0.78	1.41	0.01	0.29	-0.1	-0.95	0.51	-0.15	-0.13	0.38	-0.42	0.19	-1.06	-0.66	-1.03	0.24	0.17	0.5	0.55	-2.6	-1.82	0.44	-0.76	0.42	-0.12	0.32	-0.07	0.17	-0.21	0.27	0.3	0.38	0.07	0.19	0.01	-0.53	0.12	0.23	0.17	0.2	0.1	-0.06	0.09	0.04	-0.19
Pp3c7_14180V3.1	-0.77	-1.12	-0.57	-2.88	1.24	0.56	0.35	0.37	-1.24	0.41	-0.96	-1.06	0.07	-1.0	0.22	-0.51	-0.93	-1.03	0.27	0.55	0.83	0.75	-0.54	-1.88	0.26	-0.96	0.12	0.1	-0.23	0.07	0.27	-0.18	0.55	0.37	0.61	-0.04	0.55	0.01	-0.39	0.13	-0.03	-0.13	0.47	0.06	0.14	-0.04	-0.26	-0.31
Pp3c7_4470V3.1	-0.99	-1.15	-0.17	-2.61	1.69	0.45	0.43	0.48	-1.19	0.05	-0.25	-0.34	0.09	-0.34	0.02	-1.43	-0.57	-1.06	0.31	0.33	0.15	0.07	-0.72	-1.47	-0.01	-1.25	0.18	0.33	0.12	0.07	-0.13	0.25	0.44	0.33	-0.41	0.45	0.16	0.36	-0.44	0.26	-0.39	-0.49	0.34	0.11	0.27	0.33	0.01	0.19
Pp3c7_5900V3.1	-0.67	-0.14	-0.06	-1.97	0.45	0.21	-0.08	-0.19	-0.58	0.41	-0.66	-0.77	0.29	-0.04	-0.46	-0.38	0.36	-0.16	0.74	0.72	0.94	1.02	0.91	-0.55	0.81	-0.18	0.85	-0.87	-0.76	-0.58	0.09	-0.89	-0.17	-0.44	-0.89	-1.05	-0.31	0.32	-0.41	-0.03	0.08	0.07	0.33	-0.33	-0.61	0.33	-0.01	-0.68
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Pp3c8_12820V3.1	-0.15	-0.4	-0.19	-1.78	1.02	0.27	1.03	-0.19	0.27	0.28	-0.79	-1.21	-0.18	-0.37	-0.07	-1.84	-0.43	-0.8	-0.09	0.2	0.12	-0.27	-1.73	-2.24	1.08	-0.5	1.79	0.28	0.02	-0.21	0.25	0.24	0.11	0.08	-0.53	-0.38	0.48	-0.08	-0.75	0.09	-0.33	-0.62	0.03	0.2	0.08	-0.13	0.24	-0.36
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Pp3c8_19610V3.1	-2.27	-1.04	-0.17	-3.14	0.66	0.28	0.55	0.7	-1.48	0.71	-0.2	-0.3	0.64	0.33	0.15	-1.14	-0.76	-0.65	-0.8	-0.41	-0.53	-0.51	-2.75	-0.13	0.54	0.04	0.58	0.4	-0.18	0.04	0.67	0.37	0.33	0.21	-0.79	0.27	0.93	0.37	-0.71	-0.01	0.33	0.08	-0.01	-0.14	-0.23	0.29	0.06	-0.13
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Pp3c8_3890V3.1	-2.35	-1.48	-0.45	-3.0	1.48	-0.06	-0.21	-0.29	-0.76	0.14	-0.09	-0.22	-0.39	-1.08	0.05	-1.2	-0.48	-1.32	0.04	0.15	0.12	-0.2	-0.32	-2.14	0.55	-0.62	1.55	0.5	0.18	-0.02	0.02	0.64	0.47	0.11	-0.78	0.1	0.52	0.11	-0.6	0.23	0.01	-0.28	0.46	0.36	0.32	0.11	0.22	0.15
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Pp3c9_10010V3.1	-0.82	-1.29	-0.16	-0.97	0.71	-0.11	0.5	0.54	-1.27	0.59	-0.49	-0.64	0.44	0.0	0.3	-1.39	-0.49	-0.94	-0.12	0.21	-0.19	-0.1	-1.68	-1.81	0.39	-0.28	1.11	0.26	0.2	0.04	0.66	0.24	0.27	0.08	-0.29	0.36	0.82	0.12	-0.74	-0.26	0.38	0.02	-0.17	-0.36	-0.39	0.02	0.13	0.38
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Pp3c9_3640V3.1	-1.76	-0.78	-0.35	-2.17	1.23	0.09	-0.12	-0.49	-0.1	0.43	-1.09	-1.42	0.61	0.32	0.28	-1.47	-0.01	-0.45	0.03	0.38	0.29	0.42	-1.23	-0.88	0.39	-0.53	0.26	-0.08	-0.3	-0.13	0.28	0.05	0.36	0.41	-0.3	0.13	0.42	0.29	-0.11	0.03	0.03	-0.01	0.2	0.12	0.2	0.29	0.09	0.28
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Pp3c9_4950V3.1	-2.04	-1.36	-0.08	-3.21	1.24	0.18	0.28	0.09	-0.35	0.33	0.31	0.11	0.41	-0.41	0.09	-1.77	-0.18	-0.64	0.12	0.22	0.22	-0.39	-0.55	-2.73	0.41	-0.35	1.24	0.14	-0.75	-0.11	0.29	0.9	0.2	0.06	-2.33	-0.08	0.55	0.18	-0.82	0.02	0.18	-0.25	-0.03	0.23	0.01	0.25	0.15	0.11
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Pp3c9_9860V3.1	-4.39	-2.81	-0.53	-0.71	1.7	0.9	0.84	0.38	-28.93	0.57	-1.27	-1.38	0.61	-0.81	0.18	-1.62	0.18	-0.18	0.38	0.1	-0.58	0.09	-3.07	-0.29	0.67	-0.21	1.25	0.41	-0.48	-0.12	0.57	0.05	0.04	0.03	0.21	0.44	0.64	0.28	-1.12	-0.49	-0.99	-0.54	-0.12	-0.18	-0.52	0.13	0.05	-0.44

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.