Heatmap: Cluster_142 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-1.29 -0.45 -0.86 -2.9 -0.11 0.5 0.38 0.49 -1.2 0.46 0.09 0.08 0.75 0.23 0.49 -1.4 -0.27 -0.37 -0.31 0.34 0.14 0.66 -1.79 -1.78 1.22 1.45 0.96 0.06 0.89 -0.21 0.3 0.61 -0.36 -0.72 -0.37 -0.05 0.55 -0.4 -1.4 -0.53 -0.99 -1.48 -0.34 0.25 -1.13 -0.51 -0.09 -0.51
-0.16 -2.15 -0.45 -3.17 0.14 0.8 1.47 1.33 -0.13 0.17 -4.66 -4.77 -0.6 -0.82 0.13 -0.42 0.08 -0.67 -0.94 -0.75 -0.32 0.01 -2.23 -0.57 -0.22 -1.27 0.43 0.91 -0.87 0.31 1.07 -2.27 0.56 0.86 1.59 0.51 1.19 0.3 -0.36 -0.07 -3.12 -2.61 0.21 -0.49 -0.47 0.16 -0.05 -0.45
-0.47 -0.57 -0.93 -0.7 1.08 0.71 0.95 0.55 -1.29 0.13 -1.05 -0.91 -0.31 -1.55 -0.24 -0.79 -0.32 -0.81 -0.58 -0.22 -0.37 -0.48 -1.72 -2.12 0.24 -0.71 0.07 0.69 1.55 0.17 0.42 -0.31 0.22 0.4 1.8 1.14 0.69 -0.01 -0.94 -0.78 -1.38 -1.45 -0.6 -0.58 -0.65 -0.1 -0.22 0.34
-0.25 0.21 -0.16 -0.82 0.11 -0.86 -1.32 -1.38 0.66 -0.35 -1.77 -1.49 -1.22 -1.92 0.05 0.58 -0.08 -0.83 -0.73 -0.69 -0.26 -0.44 -0.3 -1.6 -1.21 -1.62 -1.5 0.7 0.19 0.54 -0.03 0.3 0.36 0.49 1.98 0.71 0.27 -0.14 0.62 0.04 -0.58 -0.04 -0.04 0.59 0.99 -0.27 0.86 0.25
-0.48 -1.5 -0.3 -1.31 -1.08 0.34 0.02 0.17 -1.86 -0.05 -2.98 -2.83 0.06 0.09 -0.22 -0.28 -0.92 -0.15 -2.37 -1.4 -1.14 -0.92 -4.2 -1.74 -0.02 0.34 0.16 0.76 0.56 0.65 0.63 -0.81 0.7 0.9 2.05 0.88 0.52 0.72 -0.64 0.01 -0.19 0.01 -0.23 -0.41 0.27 0.85 -0.14 0.45
-1.52 -1.48 -1.22 -2.81 -1.07 -0.23 0.16 -0.13 -2.54 -0.03 -2.99 -2.94 -0.2 0.29 -0.44 -2.28 0.34 -1.84 0.06 0.9 0.72 -0.1 0.6 -3.63 0.79 -2.39 -0.95 0.26 1.29 -0.17 -0.32 -1.63 -0.5 -0.5 2.75 -0.96 -0.78 0.56 -0.93 0.03 0.75 0.58 0.25 0.35 -0.83 0.63 -0.39 0.47
-1.66 -0.08 -0.35 0.35 0.48 0.57 1.07 0.84 0.56 -0.39 -3.18 -3.02 0.12 -0.25 -0.49 -1.61 -0.46 0.45 -0.37 0.19 0.28 1.16 -3.64 1.34 0.53 0.7 -0.28 1.54 1.34 -0.9 -1.2 -2.87 -0.56 0.0 0.41 -1.4 1.33 -0.59 0.04 -1.4 -2.03 -1.9 -0.76 -0.94 -1.07 -0.66 -1.58 -0.16
-0.63 -0.41 0.13 -0.76 -1.29 -0.13 -0.55 -0.54 -0.36 -0.09 -1.0 -1.23 -0.25 -1.19 -0.3 0.29 0.81 0.06 0.48 0.47 0.48 0.48 -0.99 -0.21 0.16 -0.63 -0.74 0.21 0.81 0.21 0.22 -0.55 0.1 0.8 0.38 -0.53 0.35 0.5 -0.32 0.1 -0.43 -0.11 0.4 0.37 -0.09 0.56 0.36 -0.18
-1.57 -1.04 -1.12 -2.34 -0.17 -0.12 -0.17 -0.6 -1.85 -0.37 -0.97 -0.98 -0.8 -0.32 -0.81 -3.28 0.31 -1.92 -0.59 -1.11 -1.29 0.01 0.25 -0.61 -0.53 -0.46 -1.64 0.26 -1.18 0.88 0.33 -1.67 1.05 1.49 2.37 -0.66 0.18 0.15 0.36 0.42 0.52 0.78 0.38 -0.03 0.91 0.01 0.27 0.38
- -4.53 -0.32 -3.28 0.94 1.0 1.7 0.26 1.75 -0.13 -5.62 -2.42 0.04 -1.37 -0.01 - -0.21 0.78 -1.33 0.37 0.09 0.14 -2.63 2.49 1.23 -3.02 1.58 -0.25 2.07 -0.11 -0.8 -2.56 -2.35 -1.98 -0.62 -3.77 -2.53 0.07 -4.08 -1.76 -0.22 -1.27 -0.71 -1.95 -2.11 0.23 -3.06 0.02
- -0.37 1.45 -1.43 0.8 2.37 2.06 1.38 - -1.76 - - 0.6 -1.2 -3.52 -2.12 -2.62 - 0.66 0.05 -2.68 -3.74 -3.04 -3.88 0.83 -2.61 0.57 - - 0.74 0.75 -2.8 -0.2 -0.75 -5.25 -0.97 -0.12 0.57 -3.4 0.16 2.03 1.73 0.46 -1.42 -2.4 0.45 - 0.53
-1.15 0.04 0.48 -1.67 0.9 -0.49 -0.13 -0.26 -0.96 0.35 -1.83 -1.72 -0.15 -0.87 -0.2 -0.66 0.24 0.38 0.29 0.54 0.72 0.85 -1.83 0.35 0.77 0.2 -0.02 0.38 -0.93 -0.22 0.21 -0.45 0.18 0.03 -0.55 0.13 0.17 0.44 -0.25 -0.14 -0.12 -0.05 -0.02 0.28 -0.27 0.44 0.44 -0.34
0.94 0.39 -0.56 -1.6 0.83 0.2 0.94 0.58 0.24 -0.51 -1.48 -1.25 -1.2 -1.49 -0.75 0.53 0.03 -1.42 0.08 0.11 0.29 -0.26 -1.34 -2.0 -0.32 -0.92 -1.93 0.79 0.76 0.26 0.29 -0.68 0.43 0.59 0.72 -0.41 0.59 0.35 -0.18 0.22 -0.8 -0.69 0.23 0.28 0.15 0.41 -0.15 -0.66
-3.98 -2.63 -5.32 3.13 1.27 1.87 2.15 0.69 2.94 -2.68 -1.01 -0.56 -1.74 -3.11 -2.65 -2.32 -0.54 -3.68 -3.53 -4.72 -1.78 -2.28 -1.94 -4.72 -0.45 -1.04 -0.9 -4.43 3.2 -0.08 -3.04 -5.15 -3.19 -2.62 -0.8 -3.12 -3.28 -2.68 - -3.47 -0.83 -1.5 -3.24 -5.26 -5.22 -3.23 -3.09 -0.61
0.77 -0.01 -0.44 -1.44 -0.1 -1.53 -1.36 -1.03 0.24 -0.13 -1.51 -1.78 -0.24 -1.16 -0.21 1.19 -0.0 -1.65 -0.8 -0.73 -0.36 -0.5 -1.13 1.16 -1.48 -2.3 -2.92 0.18 1.33 0.52 0.2 -0.59 0.58 0.78 1.33 -0.34 0.24 0.9 -1.24 0.46 0.19 0.39 0.25 -0.1 0.06 1.0 -0.36 -0.26
-0.51 -0.12 0.49 -1.13 0.01 -0.36 -0.39 -0.56 -0.34 0.14 -0.68 -0.94 -0.16 -1.13 -0.3 -0.54 0.54 0.57 0.61 0.31 0.36 0.68 -1.63 0.78 0.2 -0.24 -0.91 0.0 0.36 0.19 0.4 -0.65 0.14 0.1 -0.35 -0.53 0.23 0.54 -0.77 0.04 0.06 0.37 0.36 0.03 -0.22 0.54 0.17 -0.11
-0.13 -1.01 -0.94 -1.53 1.07 0.94 0.8 0.94 -0.04 0.42 0.7 0.7 0.16 -0.27 -0.67 0.99 0.83 -1.71 0.31 1.06 0.33 0.2 -3.14 -1.76 1.11 0.05 -0.32 -3.26 0.6 -0.26 -1.69 -1.47 -1.24 -0.53 -0.55 -3.65 -1.24 0.6 -1.84 -0.69 0.23 0.78 -0.1 -0.77 -0.67 0.68 -2.31 0.03
-1.62 -0.43 -0.56 -4.45 0.73 -0.03 0.39 0.36 0.11 -0.05 -3.73 -4.14 -0.96 -1.95 -0.42 -2.45 0.6 -0.61 1.33 1.02 0.98 0.44 -1.09 -1.55 -0.58 -0.83 -2.16 0.73 0.12 0.11 0.48 -0.51 0.59 0.49 1.41 0.73 0.58 0.25 0.03 -0.21 -0.65 -1.05 -0.27 -0.01 0.03 0.36 0.01 -0.3
-0.64 -1.12 -0.43 -2.47 0.49 0.31 0.9 0.76 -0.69 0.1 -1.36 -1.39 -0.6 -1.36 -0.36 -0.54 -0.42 -0.81 0.7 0.46 0.47 0.43 -1.25 -1.69 0.3 -1.51 -0.83 0.63 1.18 0.02 0.76 -0.2 0.32 0.38 1.15 0.1 0.31 0.3 -0.88 -0.08 -0.24 0.04 0.09 -0.2 -0.39 0.33 -0.24 0.01
-0.58 -1.11 1.41 1.12 0.84 1.69 1.7 1.74 0.35 -1.77 -5.56 -5.88 -1.97 -2.73 -4.15 1.24 0.63 1.19 - - -1.04 -0.07 -1.49 -1.79 -0.27 -1.76 -2.13 -0.38 -0.09 1.03 0.45 -1.98 -0.98 -0.4 -0.78 -3.38 -0.26 0.26 -0.76 0.87 0.12 -0.33 0.54 0.41 -1.43 0.23 -1.46 -1.29
-0.2 0.58 0.71 -1.54 1.26 0.99 1.38 1.09 0.52 -0.33 -1.15 -1.23 -1.13 -1.93 -0.76 -0.57 0.64 -0.98 0.02 -0.06 -0.01 0.27 -0.68 -2.59 -0.05 -0.36 -0.33 0.59 0.88 0.4 0.39 -0.27 -0.22 0.27 -0.13 -0.77 0.22 -0.21 -1.09 -0.77 -1.08 -0.71 -0.42 -0.27 -0.62 -0.22 0.18 0.17
-0.54 -0.32 -0.38 -2.13 -0.76 -0.04 0.78 0.86 0.29 0.48 -1.17 -1.43 0.2 -1.39 -0.1 -0.09 -0.21 -0.43 -0.3 -0.29 -0.05 -0.25 -1.82 0.57 0.29 -1.14 -0.2 -0.56 0.23 0.25 0.41 -0.58 -0.18 0.54 0.76 -0.87 0.04 0.08 -0.75 0.51 1.04 0.91 0.4 0.2 -0.05 0.18 0.12 -0.14
- - -2.24 - -4.46 -0.5 -1.63 -2.11 - -1.94 - - -1.21 -2.03 - - -0.66 -1.88 -0.64 0.14 0.26 -2.96 -2.44 -1.19 -2.27 -1.77 - 1.91 1.62 0.02 0.82 0.16 -0.07 0.87 2.13 0.13 0.77 2.41 0.27 -0.11 0.27 1.31 0.04 -0.29 -0.28 2.16 -0.47 -0.36
-0.08 0.59 1.11 -2.22 0.24 -0.66 0.09 -0.17 0.19 0.12 0.95 0.51 0.05 0.01 -0.24 0.2 0.39 0.63 0.18 0.08 -0.21 0.41 -1.66 -0.27 -0.18 -1.07 -0.68 -0.63 -0.5 0.03 -0.35 0.16 0.2 0.43 0.07 -0.96 -0.2 0.07 -0.31 0.13 -0.27 0.03 0.11 -0.36 -0.07 0.12 -0.45 -0.35
1.07 1.47 1.06 -1.64 0.51 0.37 0.16 -0.64 -0.25 -0.15 -3.74 -5.66 -1.17 -1.68 -1.13 -0.51 0.71 -0.61 -0.64 0.79 -0.33 0.09 -3.23 -1.32 1.06 -3.42 0.08 1.3 0.53 0.18 0.46 0.89 0.36 0.67 -0.69 0.57 0.86 -0.31 -0.63 -0.73 -3.27 -2.63 -0.86 0.13 -0.1 -0.32 -0.36 -0.54
-0.68 -0.15 -0.59 -3.29 -0.01 0.07 0.7 -0.08 -0.4 0.16 -2.13 -2.04 -0.18 -0.99 -0.45 -0.74 0.9 -0.83 0.79 0.32 0.57 0.56 -1.32 -2.23 -0.25 -1.05 -1.94 -0.44 0.5 0.66 0.75 -0.25 -0.48 0.59 1.55 -2.24 -0.84 0.83 0.05 0.02 0.65 0.33 0.35 -0.31 -0.86 0.97 0.2 -0.14
-1.43 1.18 0.63 -0.29 -0.13 0.96 0.75 1.19 -0.91 0.19 -1.41 -1.36 -0.3 -0.71 -0.55 0.49 0.39 -0.76 0.28 -0.11 -0.3 -0.07 -1.72 1.02 -0.11 -0.81 -1.15 -0.09 0.16 0.61 -0.09 -0.93 -0.56 0.49 0.59 -1.44 -0.62 -0.19 -1.05 0.15 0.31 0.2 0.26 -0.1 -0.76 -0.07 -0.69 0.42
-2.17 -0.12 0.42 -2.39 0.3 -1.08 -0.92 -1.05 -2.01 0.24 -0.53 -0.91 -0.04 -0.9 -0.46 -1.59 -0.3 0.81 -0.18 -0.12 -0.54 0.53 -2.67 0.56 0.18 -0.4 -0.7 0.21 0.61 0.38 0.5 -0.62 0.46 0.79 -0.47 -0.18 0.5 1.04 0.08 0.23 0.02 0.24 0.34 0.25 0.11 1.1 0.16 0.37
-2.33 -0.4 -1.45 -0.24 -0.88 -0.06 -0.87 -0.38 -5.08 0.03 -5.45 -3.36 0.66 0.14 -0.13 - 0.75 -1.87 0.54 0.38 -0.57 -0.54 -0.26 -3.57 -1.43 0.55 -1.7 1.21 0.26 0.47 0.03 -1.41 -0.14 0.37 2.12 1.27 -0.08 0.85 -0.34 -0.29 0.22 -0.08 0.1 -0.3 -0.02 1.05 0.18 0.38
-1.51 -0.28 -0.92 -2.06 -3.08 -0.37 0.74 0.44 0.32 0.31 0.32 0.31 0.32 0.11 0.12 -0.79 -1.5 -0.55 -0.27 -0.26 -0.04 -0.01 -3.42 0.11 0.91 -0.01 0.22 0.11 0.01 0.38 0.22 -0.28 0.08 0.28 -0.25 -0.35 0.15 0.4 -0.3 0.26 0.28 0.76 0.23 0.47 -0.06 0.32 0.15 -0.28
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-1.59 1.13 1.51 -2.4 -1.15 -0.19 -0.11 -0.09 0.47 -0.95 -5.77 -6.04 -0.85 -2.42 -0.61 0.28 -0.07 -0.66 0.29 0.15 0.29 0.27 -0.77 1.54 -0.7 -2.0 -2.92 1.81 2.1 0.01 0.81 -1.95 0.14 0.75 1.09 0.12 0.83 -1.62 -0.93 -2.09 -1.74 -2.29 -1.61 -1.82 -0.22 -1.56 -1.63 0.64

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.