Heatmap: Cluster_181 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_10420V3.1	-	-	-	-	2.85	-	-	-	5.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c10_9140V3.1	-	-	0.34	-0.81	0.34	-	-	-	4.73	-1.72	1.39	-	0.47	-0.07	-1.82	-	2.33	0.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.33	-	-	-	-	-	-	-	0.34	-	-	-	-	-	-	0.69	1.87	-	-
Pp3c11_10880V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_17130V3.1	-	-	-	-	3.6	-	-	-	4.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_3740V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_6156V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_25422V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_3960V3.1	-	-	-	2.88	-	-	-	-	5.21	-	-	-	-	-	-3.81	1.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_3970V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.12	-	-	-	-	-	-	-	0.76	-	-	-	-0.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_22400V3.1	2.1	-	-	1.86	0.27	-	-	1.12	2.55	-	-	-	-	-	-2.98	1.96	3.62	-	-	-	-	-	-	-0.22	2.67	2.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.34	-	-	-	-	-	-	-	-0.34	-	-
Pp3c15_4320V3.1	-	2.21	1.47	3.74	-	-	-	-	3.83	-	-	-	-	-	-	-	-	2.35	-	-	-	-	-	-	-	2.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_26095V3.1	-	-	0.81	0.53	-	-	-	-	4.87	-	-	-	-	-	-	3.54	1.43	-	-	-3.8	-	-	-	-	-	-0.59	-1.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.47	-	-
Pp3c17_22939V3.1	-	1.44	-4.33	-0.09	-4.12	0.37	0.77	1.41	2.88	-5.9	1.86	2.66	-4.05	-	-1.92	-0.56	0.97	3.03	-	-	-	-3.6	-	-0.06	-0.04	1.55	-0.08	-2.89	-0.55	-1.73	-3.13	-4.91	-5.06	-3.38	0.92	-4.75	-4.04	-	-	-3.86	-4.23	-	-4.31	-3.8	-4.64	-	-	-0.85
Pp3c17_8820V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_20330V3.1	-	-	-	-	-0.6	3.07	1.93	2.36	2.13	-0.21	-	-	-	-	-2.04	-	0.7	3.17	-0.68	0.35	-1.49	-0.81	1.61	-0.06	-0.28	1.4	-	-	-0.99	-2.03	-0.79	-	-2.86	-2.16	-1.11	-0.73	-1.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.96	-	-1.64
Pp3c18_22320V3.1	-	-	-2.89	-	-	-	-	-	5.13	-	-	-	-	-	-3.5	1.88	0.95	-0.77	-	-	-	-	-	-2.04	-	2.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_6600V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_16290V3.1	-	1.32	-	-2.7	-0.95	-0.12	0.34	1.25	4.42	-1.03	-1.54	-2.7	-0.12	-1.33	-4.36	2.68	0.93	-	-	-	-	-	-	-2.28	-2.25	-2.53	-	0.08	-	-2.19	-0.39	-1.03	-0.86	-1.38	-	-0.5	-1.04	-2.54	-0.87	-0.84	-	-2.19	-1.12	-	-2.78	-0.63	-2.06	-
Pp3c1_24295V3.1	-	-	0.67	0.9	-	-	-	-	4.93	-	-	-	-	-	-	-	2.92	-1.44	-	-	-	-	-	-	-	2.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_28870V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.12	-	-	-	-	-	-	-	2.92	4.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_28891V3.1	-	-	1.06	2.5	-	-	-	-	4.55	-	-	-	-	-	-	-	1.66	3.34	-	-	-	-	-	-	-	1.66	-	-	-	-1.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_35800V3.1	-	2.81	-	-	-1.28	-	1.06	-	5.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.82	-	-	-	-3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_36680V3.1	-	-	-	1.39	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	2.84	2.62	-	-	-	-	-	-	-	1.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_7040V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.49	-	-	-	-	-	-3.54	-	0.47	-	-	-	-	-	-	-	-	0.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_13450V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.02	-	-	-	-	-	-	3.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_15870V3.1	-	-	-	0.76	-	-	-	-	4.98	-	-	-	-	-	-	-	3.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_15529V3.1	-	-	1.05	1.84	-0.02	-	-	-	2.51	-2.96	-1.07	0.41	-	-	-2.4	0.68	2.29	3.03	2.12	-1.07	-0.15	0.78	-	1.51	1.58	0.69	-3.4	-1.85	-2.36	-1.53	-	-1.26	-2.55	-1.55	-	-3.14	-2.85	-	-2.45	-	-2.62	-2.96	-2.63	-1.89	-2.56	-3.15	-2.93	-0.71
Pp3c21_8540V3.1	-	2.47	0.7	1.82	-3.89	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	2.28	-0.78	-	-	-	-	-	-	-	0.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_1660V3.1	-	1.48	-	-	1.24	-	-	-	4.69	-	-	-	-	-	-	1.92	2.21	-	-	-	-	-	-	1.79	-	2.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_1830V3.1	1.6	-	1.1	3.8	-0.2	1.33	-	2.51	2.73	-	-	-	-	-	-5.23	2.14	0.49	0.06	-	-	0.28	0.35	-	-	-	-0.15	0.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.18	-	-	-	-	-	-0.82	-0.74	-1.45	-	-	-	-
Pp3c23_12080V3.1	-	-	0.44	2.81	-	-	-	-	3.5	-	-	-	-	-	-	3.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_18690V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.29	-	-	-	-	-	-	-	1.67	-	-	-	-	-	-	-	-	2.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_20700V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.05	-	-	-	-	-	-	-	3.59	-	-	-	-	-	-	-	-	1.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_2840V3.1	-	-	-	1.4	-	-	-	-	5.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_5200V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_9740V3.1	-	3.61	-	4.23	-	-	-	-	3.93	-	-	-	-	-	-	-	0.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_1068V3.1	-	-	-	-1.2	-2.03	-	-	-	5.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.04	-	-	-0.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.7	-	-	-	-	-	-
Pp3c24_490V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.43	-	-	-	-	-	-	-	2.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c26_14650V3.1	-	-	0.86	1.22	-	-	-	-	4.94	-	-	-	-	-	-	3.08	0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	1.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_20608V3.1	-	-	2.37	2.98	-	-	-	-	3.83	-	-	-	-	-	-	3.4	2.38	-	-	-	-	-	-	-	-	2.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_21320V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	-	-	-	-	-	-	2.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_34170V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.93	-	-	-	-	-	-	2.75	1.04	0.45	-	-	-	-	-	-	-	2.09	-	-	-	-2.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.52	-
Pp3c2_7450V3.1	-	-	-1.9	1.12	-	-	-	-	3.75	-0.27	-	-	-	-	-4.32	2.57	0.72	3.55	-	-0.17	-	-	-	-	0.77	1.87	-0.59	-1.09	-1.73	-	-0.73	-1.49	-1.37	-	-	-1.11	-1.27	-0.78	-	-1.41	-	-0.05	-	-	-	-	-	-2.94
Pp3c3_1792V3.1	-	-	-	-	-0.9	-	-	-	5.25	-	-	-	-	-	-	-	2.86	-	-	-	-	-	-	-	-	1.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_18830V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.9	-	-	-	-	-	-	0.27	2.86	-0.94	-	-	-	-	-	-	-	3.18	-	-	-	-4.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_1160V3.1	1.16	1.33	-0.2	1.53	-2.53	-	-	-	4.75	-	-	-	-	-	-4.55	1.57	2.07	-	-	-	-	-	-	-	-	2.39	-	-	-	-5.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_13700V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.79	-	-	-	-	-	-	-	2.82	-	-	-	-	-	-	-	-	3.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_2160V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_460V3.1	-	-	0.81	3.95	-	-	-	-	3.29	-	-	-	-	-	-	3.62	1.87	0.82	-	-	-	-	-	-	-	1.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_12060V3.1	-	-	-	3.89	-	-	-	-	3.94	-	-	-	-	-	-	-	4.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_1410V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	4.41	-	-	-	-	-	-	3.18	1.3	-	-	-	-	-	-	-	-	3.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_1830V3.1	-	1.18	1.13	2.74	-0.57	0.31	0.55	-0.75	1.7	-1.84	0.22	0.7	-1.71	-3.45	-3.0	1.28	0.66	1.22	0.17	0.31	-1.16	-0.89	-	-1.49	-1.11	-0.0	-2.31	-0.03	-0.8	-1.48	-0.83	-0.18	-1.56	0.11	-1.6	-0.29	-3.26	0.44	-1.22	-2.43	-1.24	-	-1.58	1.32	-2.09	0.21	0.33	-1.14
Pp3c5_9040V3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_27070V3.1	-	-	-0.23	-0.21	-0.97	-	0.46	-	4.97	-	-	-	-	-	-	2.83	0.59	-	-	-	-	-	-	-	-	1.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_16070V3.1	-	-	-	3.97	-	-	-	-	5.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_23690V3.1	-	3.0	-	3.57	-	-	-	-	3.62	-	-	-	-	-	-	-	3.19	-	-	-	-	-	-	-	-	2.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_23708V3.1	-	-	1.78	2.86	0.4	-	-	-	3.43	-	-	-0.97	-	-	-2.92	-	1.14	0.78	-	-	-	-	-	-0.06	-	2.86	-0.47	-	2.54	-3.42	-	-	-	-	0.18	-	-	-	-	-	-	-	1.78	-	-	-	-	0.24
Pp3c8_23770V3.1	-	3.0	-	3.57	-	-	-	-	3.62	-	-	-	-	-	-	-	3.19	-	-	-	-	-	-	-	-	2.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_4620V3.1	-	2.39	1.37	-	-	-	-	-	5.1	-	-	-	-	-	-5.75	-	1.33	-0.69	-	-	-	-	-	-	-	1.44	-	-	-	-4.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_1850V3.1	2.27	2.74	1.09	1.67	1.44	-0.24	-	1.97	2.59	-	-	-	-	-	-	1.72	2.44	0.23	-	-	-	-	-	-	-	2.95	-	-	-	-3.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.