Heatmap: Cluster_24 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - 4.13 1.49 -0.28 2.05 0.92 - - - - - - - - - 0.18 2.69 - - - 0.85 - 0.83 0.65 -0.28 2.85 - - -3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.69 0.5 -1.84 - - - - - - - - - - - 2.89 2.4 0.5 0.4 - -0.62 - - 1.07 -0.66 1.1 - - - 1.59 - - - - - - - - 0.95 1.91 -0.59 0.48 0.49 - - - -2.13
- - 3.84 - - - - - - - - - - - - - 4.71 - - - - - - - - 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.14 1.6 3.65 -0.42 0.84 0.82 -2.05 2.77 - - - -2.01 - - -6.37 2.62 0.13 0.03 -2.05 - - - - - -1.22 1.5 -3.58 - - - - - - - - - - - - - - - -3.31 - - - - -
- - 3.83 3.67 - - 2.87 - - - - - - - - - 1.49 - - - - - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.3
- 2.33 3.48 - - - -1.2 - - 0.91 - - - - 0.1 -0.96 1.19 -2.18 0.68 0.66 2.29 1.18 0.45 - -1.3 - - -0.2 2.41 -1.78 -2.07 - -1.5 -0.51 - - -1.55 -0.29 0.1 -1.69 -0.37 - - -1.88 - -1.59 -0.11 -0.59
- - 3.57 2.8 - - - - 3.56 - - - - - - 1.88 3.5 - - - - - - - - 1.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.62 3.33 - - - - - - - - - - - - - 3.35 - - - - - - 1.61 - 4.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.74 - -1.82 0.13 3.74 2.38 - - - - - - -4.22 - 2.83 -1.43 - - -0.41 - - -0.27 -0.64 1.8 - - - - - - - - - - - - - - - 0.5 - - - - - -
- - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.04 2.68 1.93 -2.74 - - - 2.9 -3.38 - - - - -5.5 3.3 3.26 -0.01 - -1.04 - - - -2.29 - 2.66 -2.24 - - -4.22 - - - - - - - - - - -2.41 - - - - -3.49 - -
- - 4.94 - - - - - - - - - - - - - - 4.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.99 -0.21 - - - - 4.31 - - - - - - 1.66 0.41 - - - - - - - - 2.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.47 -0.67 -2.42 - - - - -2.27 2.43 2.11 -1.75 -0.05 -3.15 4.41 1.05 -2.02 - - - - - -1.18 - - - - -1.85 -2.14 -0.5 0.54 -2.36 -1.66 -0.61 - - - - -0.93 -0.93 - - -0.13 - -1.46 - -3.06
- 2.59 3.56 1.64 - - - - - - - - - - -3.48 3.69 3.31 -0.07 - - - - - - - 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.77 - -0.23 - - - - - - - - - -5.14 - 3.38 0.6 - - - - - - - 2.92 - - - -1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.06 2.41 -0.89 3.27 0.86 1.89 -0.07 -2.12 0.75 -0.84 0.25 -0.4 -2.98 1.48 -1.55 1.15 0.58 - -0.98 1.06 2.07 - 0.2 -0.2 1.05 - - -3.68 -3.8 -2.71 - - - - - - -2.73 - -3.36 - - -1.21 -0.8 -2.17 -1.34 - -0.7
- - 2.96 0.42 1.63 2.7 2.73 2.31 - -1.21 1.31 -0.25 - - -2.28 - -1.56 -0.41 - 0.49 -1.12 -0.43 - - 1.55 0.65 1.37 -1.34 -1.98 -4.66 - - - - - - - 0.58 - - - - - -1.85 - - -1.08 -
- 2.53 3.94 2.19 - - - - - - - - - - - - 2.35 - - - - - - - - 4.05 - - - -0.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.02 - - - - - - - - - - - - 3.89 2.05 - - - - - - - - 2.6 1.31 - - - - - - - - - - 1.78 - - - - - - - - - -0.11
- 1.47 4.12 2.06 - - - - 1.55 -12.95 -0.03 - - - -2.4 1.91 1.68 - - - - - - 1.53 - 2.91 0.37 - - -1.18 -2.96 - -1.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.47 4.29 - 0.23 - - - - - - - - - -1.87 - 1.67 2.84 - - - - - - 1.41 - - - - -2.74 - - - - - - - 1.39 - - - 1.55 - - - 1.17 1.69 -
- - 3.52 - 0.45 - - - - - - - - - - 4.64 2.11 -0.62 - 1.11 - - - - -0.48 1.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -2.71 2.95 1.32 -2.37 - -0.19 - -1.84 -1.89 0.08 0.14 -0.97 -2.4 0.25 2.86 2.74 1.17 0.55 0.07 0.66 0.18 - 0.52 -0.06 0.88 -0.87 -1.71 -1.3 -2.71 -1.3 - -1.73 - 0.11 -3.0 - -0.79 -2.32 -1.75 -0.69 -2.64 - -3.27 - -0.86 - -1.05
0.93 0.34 2.27 -0.05 1.5 2.48 1.8 2.11 -2.32 -0.15 -1.46 -1.95 -1.7 -0.51 -1.41 2.3 0.78 0.44 -0.55 0.34 -0.22 -0.47 -4.09 -1.17 -0.77 0.54 -1.66 -3.88 -1.62 -1.6 -4.54 0.51 -2.63 -3.22 - -5.14 -4.85 -1.3 -2.87 -1.42 -2.32 -0.88 -2.04 -3.09 -2.0 -1.82 -3.78 -2.78
- - 4.93 -1.8 - - - - - - - - - - - 3.66 1.21 - - - - - - - - 1.17 - - - -4.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.16 0.4 - 0.78 1.05 0.82 - -1.34 1.47 1.91 -1.35 - -0.26 1.01 -0.78 -1.03 - - - -0.89 - 0.34 -2.41 -2.02 - -0.8 -1.26 0.39 -0.19 0.21 0.73 -1.17 - -0.83 - 1.29 -1.09 0.32 0.47 0.32 -1.61 -1.1 0.94 -0.55 - 0.59
- -1.27 2.91 -0.49 - - - - - -2.61 0.89 - - - -2.91 - 2.29 1.49 - - 1.75 - - -1.01 -0.24 1.94 - -0.06 1.1 -0.27 -0.25 -1.48 -0.17 0.61 1.41 -0.35 -1.18 -0.08 -0.78 - - -1.1 0.61 0.38 0.4 -1.45 1.3 -0.95
- - 3.8 0.18 - - - - - - - - - - - - 4.53 - - - - - - - - 3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.94 3.0 -1.81 - - - - - - - - - - -5.73 4.74 2.67 0.57 - - - - - -1.4 - 1.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.92 -0.1 -1.03 0.81 - 2.21 -0.06 - - - - 0.33 -3.93 4.09 2.57 0.11 - 0.31 - - - - - 2.06 - - -0.37 -2.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.8 0.37 2.68 -0.82 - -0.51 -2.15 - - -0.29 -1.42 - -0.36 -0.05 0.41 2.87 1.11 2.98 - - 0.32 0.46 - 0.47 -1.06 1.54 -2.76 -0.15 -2.54 -1.66 -0.84 - -1.8 -1.62 - - -0.2 -0.77 - -1.59 - -2.32 -1.99 0.65 -0.56 -1.5 -1.29 -2.94
-1.05 1.87 3.12 0.21 -1.79 - 1.11 - 0.59 - - - -0.58 - - 3.54 3.24 - - - -0.11 - - - -0.85 2.48 - - - -4.46 - - -1.96 - - - - - - - - - -1.06 - - -1.08 - -
- - 4.45 - - 2.23 - - - - - - - - - - 2.25 - - - - - - - 2.19 3.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.4 -12.58 2.01 0.66 -0.76 1.01 -13.5 0.89 4.18 -2.52 -13.92 -20.19 -13.14 -13.0 -4.27 -12.79 2.05 0.94 -13.1 -1.1 -12.65 -12.22 1.26 0.46 -0.38 1.54 -1.19 -0.82 -12.68 -1.75 -1.08 -0.4 -12.82 -0.5 -12.89 -12.6 -12.51 -12.62 -12.65 -12.39 -13.27 -13.9 -12.55 -0.12 -12.7 -12.79 -12.58 -2.75
- 2.52 2.93 - -0.98 - - - 4.56 - - - - - - 0.82 1.21 0.12 - - - - - 0.36 - 2.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.29 -0.29 -3.44 - - - 2.67 -2.92 - - -1.55 -1.87 -2.13 4.05 2.16 -0.71 - - - - - - -0.99 2.17 -1.14 - - -0.87 -2.93 - - - - - - - - - -0.95 0.17 -2.03 -2.74 - -2.48 - -3.84
- - 5.06 - 2.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.78 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - 2.38 - 1.25 - - - 1.22 - - 3.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.82 2.8 -0.65 -0.8 - -2.63 - 3.77 - - - - - -7.03 3.06 2.45 -1.54 - - - - - - - 2.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.79 -0.98 1.98 -0.47 -1.15 -0.97 -0.3 -1.48 2.65 -1.47 - -3.17 - -3.56 -2.99 - 1.05 2.44 1.41 1.1 0.61 1.13 - 1.82 -2.22 -1.19 -1.69 -1.15 -2.43 -1.0 0.29 - -2.75 -3.89 -2.78 -1.98 -2.68 -0.03 -2.03 -0.43 -0.26 -0.05 -0.8 -2.06 - -0.01 -1.96 -0.39
- 2.07 2.75 1.4 -2.66 -0.23 -1.29 -2.79 3.62 - - - - - -5.16 1.72 3.16 -0.01 - - - - - -1.9 - 2.79 - - -3.2 -3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.3 3.11 3.64 1.49 - - - - 0.66 - - - - - -2.0 2.93 2.67 -0.53 - -0.15 - - - - - 2.54 - - - -4.7 - - - - - - - -1.29 - - - - - - - - - -
- - 2.71 -2.49 -1.83 1.19 0.6 1.85 -2.97 -0.02 -0.26 - 0.47 0.32 0.75 3.59 1.86 -0.72 - -2.78 -2.9 -1.21 - -2.15 -2.4 1.68 -3.61 -1.93 - -2.3 -2.67 -3.36 -1.74 -2.48 - -1.42 -0.25 -0.59 -2.67 -1.62 -1.83 -1.03 -0.73 -1.21 -1.58 -1.58 -3.14 -1.18
- 1.82 0.44 -1.05 - - - - 3.63 - - - - - - 4.52 2.19 - - - - - - -0.47 - 1.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.26 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.85 - 2.76 -1.59 -3.05 1.01 1.02 0.22 1.8 -1.7 -0.64 - 0.08 -1.88 -2.95 3.5 1.79 0.9 -0.77 -0.11 0.93 -0.48 - -0.29 0.71 0.68 -0.47 - -2.26 -2.26 -1.92 -1.16 -2.89 - -3.24 -1.72 - -3.03 - -1.32 -2.52 -0.72 - -0.68 - -3.05 -2.83 -2.88
-0.43 - 3.03 -0.41 - 1.52 - 1.45 - -0.6 -0.24 - - - 0.24 - - - 0.65 1.77 1.16 -1.01 - 1.52 0.82 0.84 1.72 - -1.14 0.78 - 0.77 -1.13 0.11 0.41 - - 0.96 - - - - -11.01 -0.23 0.4 - - 0.85
- - 3.78 1.18 -2.39 1.76 -0.88 - - -0.1 0.01 -0.67 -1.41 -1.26 -0.93 - 1.44 1.85 -0.08 0.87 -0.49 0.77 - 0.51 -1.72 -2.0 - - 0.26 -0.76 -1.43 -2.27 0.03 - -0.29 - -1.05 -0.31 -0.28 -0.86 - -1.17 -2.93 -0.43 -0.33 0.22 - -1.4
- - 4.92 - - - - - - 0.08 - - - - -1.5 1.26 - 2.19 - - - - - - - - - - - 1.78 - 0.57 - - - - - - - - - - - - - - - 2.14
- - 2.84 - - 3.17 - - - - - - - - - - 3.57 - - - - - - - - 4.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.84 2.25 1.32 1.49 2.41 2.97 2.24 2.14 -2.82 - - - - -2.81 -2.92 -0.28 1.05 1.57 -1.13 -0.7 - - -1.84 -1.17 -3.54 - 0.12 -2.38 -2.0 -4.29 -3.57 -1.31 -0.73 - -1.06 -0.88 -1.84 - -2.06 - - -3.05 -1.42 -1.2 -2.3 -2.35 -2.52
- - 3.28 0.89 - - - - -0.17 - - - - - - 4.61 1.05 - - 2.46 - - - 1.04 - 0.47 - - - -3.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.0 4.27 - -0.17 - - - - - - - - - -3.08 - - - - - - - - - - 3.52 - - - -2.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.17 3.64 - - - - - - - - - - - - 4.78 1.13 - - - - - - - - 0.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.42 - 4.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.57 - - - - - 3.19 - - - - - -2.05 4.75 0.86 - - - - - - - - 1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.55 2.96 0.12 0.31 1.03 1.58 - - - - - - - -3.73 - 2.84 3.02 - 0.54 0.62 - - - -0.1 1.98 - - - -0.06 - - - - - 0.48 - - - - - - - - - - 0.48 -
- - 4.09 - - 1.96 - - - -0.08 - 0.83 - - -1.92 - 1.45 - - - - 2.32 - - 1.98 - - 1.53 1.75 0.99 - 0.96 - - - 1.19 - - - - - - - - - - - -
- - 4.02 1.36 - - - - - - - - - - -2.38 - 4.67 - - - - - - - - 1.7 - - - -1.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.11 -0.39 - 1.52 - - - -0.81 2.13 2.1 0.78 - -1.6 0.48 - 0.4 - - - -0.1 -0.2 0.93 1.1 0.57 1.16 0.6 2.61 0.1 -2.25 -1.41 -0.83 0.39 0.16 -0.67 - - - - -0.74 -1.07 1.01 - - - - -1.09
- - 4.43 - - - - - - - - - - - - - 4.19 0.88 - - - - - 0.99 - 2.04 - - - -2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.37 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.52 - 2.17 1.44 1.89 1.54 0.28 -1.06 0.65 0.49 1.07 -0.64 -0.14 - -0.17 2.98 1.49 1.37 - -1.24 0.54 0.6 - 1.23 1.87 -0.15 -4.38 -3.83 - -2.56 - -4.28 - - - - - - - -1.49 -3.6 -1.62 - -4.39 -4.01 - - -
-1.32 2.26 2.49 1.09 -0.59 1.25 -1.33 - 3.2 -0.99 - - - - -0.39 -0.77 1.7 - -0.42 1.38 0.69 1.02 - - 0.41 2.13 0.01 - - -0.1 - - - - - - - -1.14 - -1.17 - -1.51 - - - -1.7 - 0.15
- -2.17 3.07 2.92 0.01 0.45 2.34 0.8 3.21 - 1.6 1.78 - - -3.39 - 0.68 0.34 - - - - - -0.98 -0.23 1.11 - -3.04 -4.0 -4.3 - - - - -3.76 - - - - - - - - - - - - -2.43
- - 4.52 1.31 - - - - - - - - - - - - 4.09 - - - - - - - - 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.8 2.57 3.2 2.48 - 2.2 - - - - - - - - - 2.94 3.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.37 - 2.19 3.43 1.35 1.59 - 0.4 - -1.03 -0.4 - - 0.76 0.23 - 0.38 - -0.43 - - - 0.98 1.3 - - - -1.72 - - -2.74 -0.52 -1.05 -0.88 0.4 0.42 - 0.37 - - - -0.25 - 0.88 -0.38 -1.22
- - 2.29 0.31 1.62 0.44 1.68 - 2.41 - - - - - - 4.04 2.56 - - - - - - - -0.92 2.44 -0.81 - - -4.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.95 - - - 0.89 - - - - - - - - - 2.69 - - - - - - - 2.58 0.65 0.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.02 - 3.39 - - - - 2.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.69 3.04 0.11 0.0 -0.19 1.5 0.67 - 0.31 - - -1.19 -2.06 0.42 1.0 1.88 0.92 -0.04 1.06 -0.75 1.77 - 0.59 -0.84 -0.42 -1.2 -2.47 -3.12 -1.44 -2.69 -2.37 -4.77 - - - -2.03 0.49 - -2.98 -2.38 - -1.42 -0.9 - -0.61 -2.69 -3.76
- - 4.82 2.41 - - 0.56 - - - - - - - -3.2 - 3.11 -0.77 - - - - - - - 1.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.09 0.96 - - - - - - - - - - - - 2.93 - - - - - - - - 2.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.61 1.75 - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - 1.48 - 1.92 - - - -1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.05 - 4.91 - 2.15 - 0.21 - - - 0.09 1.24 - - - 2.26 - 0.11 - - - - - - - 1.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.27 3.55 1.71 -1.77 0.3 0.55 - - -1.59 0.38 1.29 - -1.4 -1.71 - 1.66 2.39 - -0.42 2.07 1.72 - 1.15 0.11 -0.09 - -0.41 - -2.42 -2.1 - - -1.73 -1.86 - - - -1.01 - - -1.33 -1.69 -0.75 - - -1.49 -
- 0.44 3.29 -0.77 -1.15 - - - 2.4 - - - - - -7.16 4.15 2.81 0.22 - - - - - - - 2.22 - - - -6.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.47 -0.56 - -1.23 -0.06 -1.83 - -1.13 - - - - -1.39 - 3.24 1.62 1.59 2.24 1.92 1.11 - -0.87 -0.99 0.82 - - -2.04 -3.54 -1.56 -2.16 -2.87 -0.82 - -2.0 - 0.2 - - - - - - -2.23 0.26 - -1.65
- - 2.74 -0.6 - - - -2.41 4.63 -2.6 -1.72 - -3.09 -0.95 -0.72 0.72 1.1 - -1.52 - -2.43 -0.91 - -1.51 -3.15 0.29 - -2.23 - -0.87 -0.36 -1.26 -1.37 -1.0 - -1.78 -0.37 -2.58 - -1.9 -2.26 - -2.77 -0.81 -1.31 -1.18 -0.99 -0.13
- 2.32 2.2 2.15 0.42 0.52 0.03 -0.49 - -0.12 1.53 -0.26 -0.76 -1.57 0.18 -1.22 1.07 0.77 - -1.3 - - - 1.35 1.55 1.77 -1.17 -1.59 -0.73 -1.41 -0.89 -1.4 -3.74 -2.51 -0.52 -0.1 -0.52 -1.01 -2.19 -1.35 - -1.53 -1.4 -1.92 -1.39 -1.11 - 0.03
- 2.55 4.93 - 2.29 - - - - - - - - - - - 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.37 3.17 1.63 - - - - - - - - - - 3.38 1.67 - - - - - - - - 0.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.01 2.78 -0.61 - - 0.35 - - -3.03 0.8 0.87 -0.44 -1.58 0.18 - - -2.45 0.51 - - -1.36 - -0.35 -2.15 0.14 2.29 -0.6 1.88 0.69 0.42 1.96 -1.59 0.33 -0.58 0.53 - - - -0.38 - -1.52 -0.41 -0.08 0.71 -1.89 0.11 0.69

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.