Heatmap: Cluster_119 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.15 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.13 0.04 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.04
0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.03 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.68 0.0 0.0 0.0 11.44 0.0 3.57 4.34 0.0 2.32 0.0 0.0 22.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.24 0.0 0.77 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.91 0.0 2.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.41 0.88 1.16 3.54 2.85 5.8 5.37 6.81 1.3 0.44 0.29 0.65 1.47 0.2 15.6 6.55 0.61 1.29 0.67 0.94 0.7 2.32 0.22 0.39 2.51 1.57 6.15 0.92 8.03 9.66 1.36 0.25 1.23 0.67 0.16 1.0 2.04 0.32 0.42 0.73 0.16 0.26 0.37 2.93 5.07 0.17 0.71 2.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.06 0.04 0.01 0.16 0.29 0.33 0.02 0.0 0.84 0.25 0.1 0.16 0.07 0.14 0.0 0.0 0.22 0.08 0.24 0.22 0.14 0.39 0.27 0.13 0.03 0.31 0.2 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.3 0.02 0.16 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.05 0.13 0.42 0.49 0.35 0.37 0.02 0.19 0.0 0.0 0.07 0.09 0.57 0.08 0.15 0.55 0.0 0.17 0.09 0.71 0.0 1.02 0.91 1.66 0.49 0.02 0.05 0.25 0.19 0.01 0.32 0.86 1.14 0.21 0.19 0.37 0.37 0.22 0.03 0.08 0.04 0.42 0.65 0.3 0.26 0.12
0.0 0.0 0.21 0.25 0.83 0.13 0.09 0.22 0.0 1.0 0.56 0.41 1.81 2.93 2.03 0.0 0.08 0.09 1.32 1.66 1.44 0.86 0.0 3.61 2.25 0.16 1.36 1.18 0.39 0.63 1.27 0.3 0.8 0.51 0.98 0.7 1.92 1.09 1.54 1.69 2.44 1.65 1.11 1.51 0.86 1.76 1.01 1.03
0.0 0.0 0.42 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.07 0.06 0.42 0.15 0.12 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.46 0.0 0.66 0.18 0.16 0.23 0.07 0.12 0.0 0.22 0.0 0.19 0.31 0.28 0.1 0.21 0.73 0.0 0.17 0.08 0.0 0.0 0.18
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.67 0.0 1.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.1 0.08 0.05 0.06 0.0 0.26 0.61 0.29 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.14 0.0 0.03 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.1 0.21 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.36 0.06 1.17 0.06 0.39 0.0 0.0 0.05 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.78 0.0 0.08 0.0 0.28 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.25 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.44 0.31 0.45 0.09 0.16 0.0 0.03 0.03 0.0 0.07 0.17 0.0 0.07 0.49 0.0 0.0 0.03 0.16 0.0 0.1 0.06 0.5 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.51 0.0 0.0 0.0 5.76 0.0 0.0 0.0 0.0 15.53 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.85 0.46 0.0 0.0 2.14 3.33 0.0 3.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.47 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 2.1 0.0 1.23 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93
0.04 0.0 0.02 0.17 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.22 0.14 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.06 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.27 0.0 0.16 1.2 0.71 1.49 0.0 0.07 0.0 0.0 0.42 0.35 0.66 0.0 0.52 0.32 2.84 1.68 0.0 0.83 0.0 0.33 1.91 0.19 6.22 0.18 0.0 0.12 0.18 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.29 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 7.24 6.5 3.31 11.27 8.52 8.63 10.78 2.38 1.58 0.2 0.43 2.83 1.11 25.35 0.1 6.77 6.8 2.14 2.12 10.11 22.36 0.35 16.2 12.82 71.26 11.73 0.54 3.39 4.22 2.08 0.13 0.7 0.8 0.91 0.55 0.73 0.95 0.36 0.77 0.37 0.76 0.88 0.34 3.45 1.12 0.2 1.32
0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.28 0.05 0.27 0.0 0.1 0.43 0.67 0.1 1.86 0.2 0.13 0.1 0.45 2.54 5.66 0.22 0.7 0.39 1.59 2.81 6.78 4.43 0.04 0.06 0.18 0.13 0.03 0.38 18.29 4.09 6.19 0.29 1.67 1.96 1.96 0.37 1.53 0.27 0.09 0.54 0.54 1.27 0.31 0.42 5.85 0.23 0.14 2.66
54.19 109.94 62.21 18.27 2273.13 24.05 2957.9 1611.78 158.29 4.09 3.3 5.51 3.87 1.94 8385.54 28.4 48.62 123.33 7.44 21.69 8.87 18.56 160.22 45.32 6.34 18.83 5.32 5.6 3.44 17.62 2.94 3.1 2.66 3.34 5.54 2.62 2.72 12.08 3.4 5.8 1.7 3.7 6.89 5.16 3.63 10.49 2.65 358.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.31 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.88 3.3 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.0 0.0 0.17 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 5.44 0.18 0.5 0.0 0.0 1.38 0.0 0.43 0.0 0.21 0.28 0.12 0.0 0.07 0.14 0.09 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.5 0.0 0.25 0.47 0.18 0.19
0.0 0.04 0.58 1.37 0.0 1.68 2.13 0.34 0.83 0.44 0.0 0.6 0.39 0.74 1.91 0.0 0.57 1.6 0.09 1.04 0.83 0.31 0.0 1.35 0.76 4.63 0.0 0.0 0.06 0.77 0.51 0.0 0.44 0.05 0.23 0.0 0.34 0.36 0.29 0.45 0.91 0.44 0.63 0.09 0.71 0.0 0.0 1.62
0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.11 0.04 0.11 0.3 0.51 0.02 0.0 0.04 0.45 0.25 0.0 0.0 0.16 0.31 0.09 0.23 0.13 0.09 0.23 0.12 0.06 0.18 0.05 0.22 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.04 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.28 0.15 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0
4.06 0.91 0.76 1.66 2.88 6.57 5.39 6.38 5.34 21.12 0.58 0.39 20.18 3.54 42.81 0.96 1.39 0.79 0.14 0.38 0.13 0.23 0.07 10.18 3.35 0.47 11.97 1.63 7.17 8.59 24.62 0.72 12.26 9.36 0.86 4.8 10.63 16.12 4.77 25.98 1.38 1.62 20.26 20.43 47.26 15.23 9.8 0.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.51 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.15 0.58 0.0 0.0 0.08 0.29 0.0 0.15 0.0 0.23 0.0 0.63 0.06 0.0 0.14 0.0 0.1 0.0 0.38 0.07 0.0 0.08 0.0 0.0 0.34 0.22 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.11 0.6 0.0 0.17 0.0 0.21 2.0 0.47 0.2 0.4 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.33 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.04 0.09 0.07 0.08 0.06 0.03 0.0 0.03 0.04 0.1 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.03 0.03 0.0 0.04 0.34
4.47 1.74 3.17 0.7 22.92 7.94 9.08 7.41 2.41 22.42 1.51 1.06 20.34 15.01 54.23 3.06 16.08 2.58 17.32 12.79 11.71 11.37 0.0 2.12 17.54 9.76 34.23 2.93 8.85 7.52 7.0 4.01 16.76 7.3 2.38 8.92 21.33 9.25 3.88 5.44 6.9 6.48 12.81 7.62 20.27 8.79 3.16 5.0
0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.28 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.45 0.12 0.82 0.0 0.16 0.0 0.08 0.0 0.0 0.33 0.13 0.02 0.0 0.17 0.2 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.51 0.71 0.0 0.72 0.17 0.06 0.12 0.03 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.31 0.0 0.65 0.0 0.0 0.14 0.24
0.0 0.86 0.27 0.36 0.38 0.37 1.16 0.63 0.06 0.1 0.04 0.09 0.05 0.51 1.39 0.0 0.14 0.46 0.0 0.1 0.0 0.23 0.28 0.4 1.59 1.43 0.6 0.01 0.01 0.05 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.09 0.08 0.05 0.03 0.03 0.06 0.03 0.12 0.05 0.04 0.07
5.04 5.63 7.09 2.08 54.95 16.13 16.68 19.2 18.0 28.13 13.92 15.53 34.93 26.8 101.18 4.89 43.51 25.24 60.8 33.26 18.26 29.71 5.45 32.56 61.98 92.22 98.57 0.32 4.83 3.88 0.79 0.16 0.81 0.41 0.28 0.6 1.7 6.31 0.54 2.99 0.27 0.93 8.38 3.37 4.62 5.94 0.89 1.17
2.41 0.75 0.03 0.32 0.13 0.75 0.64 0.24 0.0 0.31 0.05 0.02 0.57 0.15 6.96 0.95 0.41 0.05 0.36 0.02 0.0 0.16 0.74 0.01 0.05 0.18 0.0 3.2 0.52 0.96 0.7 0.04 0.05 0.09 0.03 0.0 0.1 0.11 0.19 0.26 0.17 0.13 0.49 0.76 0.9 0.13 1.01 0.21
0.0 0.0 0.14 0.77 1.63 0.0 0.79 2.02 0.0 1.85 0.21 0.38 1.4 0.54 1.41 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.16 0.0 0.0 0.49 1.19 1.08 2.07 0.19 1.79 1.18 3.43 0.66 1.52 0.45 0.74 2.64 3.25 1.83 1.38 1.81 1.6 0.42 1.55 1.37
0.0 0.09 0.1 0.08 0.02 0.0 0.16 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.59 0.0 2.36 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.34 0.13 0.26 0.55 1.47 0.49 0.63 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.14 0.04 0.03 0.0 0.0 0.78 0.06 0.0 0.27

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)