Heatmap: Cluster_101 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - 1.33 3.2 -0.05 1.68 - - - - - - - - -3.08 3.22 2.86 2.56 - - - - - - - 3.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.48 -0.49 - - - - -0.12 - - - - -2.26 5.06 1.49 1.49 - - - - - 0.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.49 1.5 -0.65 - - - - - - - - - - - 5.15 1.41 -0.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.45 0.31 - 0.17 -0.2 -0.56 -0.29 1.81 1.26 - - - - - -2.25 4.23 2.9 0.05 -0.29 -1.26 - - - - - 2.82 - - - -2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.32 -3.58 -0.45 -2.1 -1.84 0.09 -0.85 -3.35 0.21 - -3.04 -2.79 -4.17 -4.95 -4.39 5.08 -1.57 -3.73 - -3.51 -3.13 -0.32 -3.15 -4.92 -4.07 -0.96 -4.96 -5.81 0.13 -1.11 -6.58 -2.64 -0.77 -0.56 -1.46 - -5.27 -1.02 -1.04 -3.25 -5.58 - -2.63 -5.25 -0.94 -0.69 -4.06 -1.6
2.55 -0.14 0.18 -1.59 - -0.38 -0.37 -0.59 0.32 - -8.08 -4.25 -2.95 -1.18 -4.59 4.84 -0.91 - -3.27 -0.97 -0.02 -0.4 -3.99 - - -0.59 - - 0.83 -2.17 - - - -2.52 - - - - -4.61 - -0.73 -1.35 -3.9 - - - - -2.48
- 3.31 0.61 0.74 - - - - - - - - - - -2.35 4.05 3.17 -0.51 - - - - - - - 3.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.52 3.26 - - 1.38 2.4 3.56 - - - - - - 2.76 1.04 - - - - - - - - 3.05 - - - -2.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -2.61 - - - - - - - - - - - - - 5.5 0.29 -3.61 - - - - - -2.45 - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.7 1.16 2.65 -1.11 1.11 0.22 2.36 2.63 - - -1.54 - -2.24 -4.54 1.89 2.23 0.69 - -2.12 - - - -0.54 -2.17 1.99 - - - -1.88 -2.86 -0.87 - -2.43 - - - -2.19 - 0.23 -0.87 - -0.96 -1.66 - 0.04 -2.18 -2.12
-0.56 -1.18 0.23 2.48 3.03 -0.51 1.11 1.25 2.97 -6.58 -7.81 -5.8 -6.39 -7.53 -6.67 -1.16 0.58 1.72 0.83 0.01 -0.21 -0.7 2.32 1.05 -0.96 0.53 -3.27 -7.27 -7.86 -5.85 -8.55 -6.84 -6.16 -8.04 -7.01 -7.24 -6.65 -5.71 - -6.34 -6.01 -6.46 -7.39 -8.1 -8.05 -6.05 -7.61 -6.8
- - - 2.58 - - - - - - - - - - - 4.67 3.2 0.38 - - - - - - - 2.56 - - - -2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.63 2.78 1.6 2.85 -1.78 -2.81 - - 2.72 -4.63 - - - - -5.98 3.12 2.31 -0.61 - - - - - -0.63 - 3.0 - - -3.98 - - -3.59 - - - - - - - - - - - - - - - -4.42
- 3.0 3.36 2.92 0.98 - - - - - - - - - -0.24 1.21 2.45 - - - - - - - - 3.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -3.39 - - 0.66 1.12 0.02 -1.62 - -1.23 -0.8 -1.68 1.57 -0.22 -0.85 4.71 -1.2 -0.48 0.01 -0.86 -2.65 -2.11 -0.67 -2.45 -0.22 -2.81 -3.4 -2.54 -3.79 -3.49 -0.59 -1.87 -0.89 - - -3.47 -0.83 -0.61 -1.69 -2.85 - -3.4 -1.45 -1.17 -1.15 -0.9 -1.13 -3.45
- 2.04 1.5 2.53 - - - -0.86 - - - - - - - 4.85 0.91 0.73 - - - - - -0.65 - 0.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.29 0.07 -0.9 -4.01 1.81 0.44 0.38 0.53 0.08 0.9 -6.64 -7.94 0.0 -1.22 0.21 3.58 -0.27 0.74 0.89 1.78 1.31 1.38 -2.44 -6.0 -2.85 -6.05 - -9.76 -10.45 -4.71 -2.55 -10.06 -6.11 - -10.21 - - 0.45 -4.84 -0.54 -8.53 -2.43 1.15 -0.5 -3.83 0.25 -3.59 -
- 1.78 3.12 4.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.81 1.4 -1.54 -2.16 -1.3 -1.77 - - - - - - - 5.22 0.87 - - - - - - - - 0.51 - - - -4.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.16 - 1.5 1.36 - - - - - - - - 4.61 3.09 - - - - - - - - -0.47 - - - -3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.03 - - - - 1.25 - - - - - - 4.04 3.41 - - - - - - - - 3.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.32 - - - - - 0.16 - - - - - - 4.81 2.52 - - - - - - - - 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.08 - -
- - - 1.56 - - - - 0.02 - - - - - - 4.29 3.92 - - 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.75 0.79 - - - - - 2.26 - - - - - - 4.89 2.32 - - - - - - - - 1.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.56 - - - - 2.2 - - - - - - 4.52 2.88 2.31 - - - - - - - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.97 1.34 - - - - - - - - - - -4.03 5.34 -0.93 -1.61 - - - - - - - 1.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.44 -0.23 2.68 - - - - - -2.7 1.59 -0.33 -1.17 - -1.66 3.17 1.64 -2.22 - - - - - -1.38 1.24 1.99 2.05 - -0.35 -1.28 -2.06 -1.67 -0.97 -1.87 - - -1.36 -1.64 0.62 -1.74 - - -0.41 2.07 -0.88 -1.66 -0.29 -0.41
- -1.9 -1.18 2.11 -1.92 -2.2 -1.96 - 0.65 -1.58 1.52 1.5 -2.05 - -2.49 4.0 -0.22 1.11 - -0.47 1.15 - 1.3 1.67 -0.33 0.2 -1.21 -0.83 -1.04 -1.6 -3.59 -0.48 -1.91 - -2.88 - -2.91 - - -1.71 - -2.83 - -1.08 -3.42 - -1.29 -3.71
0.74 0.61 0.41 3.44 3.33 -0.06 1.22 1.35 2.66 -0.87 -1.87 -1.05 -3.49 -6.27 -3.84 0.92 -1.03 -0.43 -1.52 -6.32 -3.37 -1.75 - -4.99 -4.6 0.04 -4.8 -2.58 - -2.44 -0.33 -0.82 -4.47 -3.87 - - -4.73 -0.96 -3.89 -2.5 -2.69 -3.79 -2.33 -5.4 -7.09 -1.51 -1.22 -4.74
-0.39 - - 3.39 3.94 2.36 1.3 3.25 2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.66 1.79 - - - - - - - - - - - - 4.02 2.39 - - - - - - - - 3.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.24 -0.44 -0.19 -0.42 -1.28 0.89 - - -1.08 -0.37 -0.02 - -1.45 -0.9 4.59 1.51 - - - - - - -0.91 -1.09 1.37 -0.86 - -0.74 -2.03 -2.05 - -2.92 -1.08 -0.64 - -1.99 -0.32 -0.22 -2.13 - -1.87 - - -2.28 - -0.84 0.37
- - - - - - - - - - - - - - - 4.73 3.98 - - - - - - - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.15 - - - - - - - - - 3.52 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.93 -3.54 -2.26 -6.81 -0.63 -1.87 -2.02 -2.32 -0.79 -4.97 -11.3 -11.06 -4.63 -5.74 -4.1 5.49 -10.26 - -4.91 -11.23 - - -7.51 - -10.27 -11.66 -12.65 - - -8.46 -6.55 -9.26 -10.57 - - - - -5.6 -11.7 -6.02 - -7.92 -4.42 -5.83 -8.34 -5.98 -6.1 -13.64
- - - 3.29 - - - 0.32 - - - - - - - 5.11 1.21 - - - - - - - - - - - - -2.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.01 0.83 - - 1.45 - 1.06 - - - - - - 4.75 3.36 - - - - - - - - 1.2 -0.69 - - -1.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.17 1.95 - - - - - - - - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.32 1.95 -2.4 0.02 1.21 1.6 1.16 1.23 - -4.2 - - - -5.94 4.31 0.57 1.36 - -1.7 -0.36 -0.29 0.41 -0.59 -0.39 -0.95 -0.93 -3.92 - -6.05 - -4.22 -5.08 - - - - -4.2 -3.53 -2.28 -3.69 - - -2.1 - -4.22 - -
- - 2.17 - - - - - - - - - - - - 3.94 2.85 0.73 2.24 - - 0.5 - - 0.19 3.02 1.67 - -0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.29 4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.37 -3.05 -6.0 -3.98 1.66 1.24 1.03 0.81 -0.1 -1.84 -5.43 -5.52 -1.46 -2.45 -1.53 4.21 1.27 -5.58 2.43 2.23 -0.1 -2.19 -0.47 -5.15 -2.3 -3.94 -4.55 -7.52 -7.01 -4.84 -3.1 -5.44 -6.63 - -8.27 -8.86 - -3.03 -7.39 -2.39 -6.56 -3.51 -0.24 -2.7 -4.55 -2.9 -4.98 -10.63
- - 2.47 3.95 - - - - - - - - - - - - 2.53 1.89 - - - - - - - 4.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.31 2.85 -1.21 -1.76 - - - - - - - - - -4.78 3.67 3.28 1.23 - - - - - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.03 3.02 - - - - - - - - - - - 0.93 3.01 2.3 - - - - - - - - - - 1.52 1.88 -1.88 0.87 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.54 1.67 -1.74 -0.28 -0.63 - -1.33 -1.14 1.19 0.77 -1.2 -0.86 -1.82 4.39 0.53 1.16 0.22 -0.35 -0.47 0.34 - -1.59 -0.43 0.85 -1.12 -2.43 -2.42 -3.84 -4.32 -2.94 -4.73 - - - - -0.62 - -0.78 -2.79 -1.92 -2.1 -4.13 -2.27 -2.87 -1.57 -1.67
- - - - - - - - - - - - - - - 5.19 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.22 - 1.42 - 1.01 - - - - - - - 4.9 1.8 - - - - - - - - 2.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.31 1.34 -0.66 - - - - - - - - - - -6.27 4.74 2.31 0.46 - - - - - - -2.57 3.16 - - - -3.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.4 0.85 - 3.18 - - - - 0.08 - - - - - - 4.5 2.61 - - - - - - - - 2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.07 3.43 - - - - - - - - 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.41 - 3.12 - - - - - 0.66 2.75 2.42 - - - 3.77 1.24 - - - - - - - - 2.19 - - - -1.96 - - - - - - - - - - - - 1.13 - - - - -
- - -2.04 - -1.54 -0.82 - -1.11 - -3.64 -0.2 -0.41 - - -7.2 5.14 - - - - - - -1.03 0.33 -1.63 0.56 -1.32 0.08 0.24 -2.38 -2.05 - -4.44 - - -0.79 - -1.2 -0.76 -2.67 - - - - - -0.66 -2.38 -1.84
-0.11 -0.73 1.59 0.12 -0.63 - - - -1.56 - - - - - - 4.87 2.44 0.46 - 0.56 - - - -1.2 - 1.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.2 -0.04 1.93 1.62 1.3 1.95 1.25 0.64 -4.28 -1.97 -3.22 - - -4.26 4.3 -0.06 -0.55 -3.39 -1.35 -0.58 -2.02 1.01 -0.57 -0.96 -1.34 -3.92 -2.69 -0.88 -2.47 -5.12 - -6.51 -3.16 -2.86 - -4.6 -4.64 - - - -2.77 -2.1 -3.71 - - - -2.76
- 3.37 2.18 2.75 -0.42 - - - - - - - - - -3.37 - 2.67 1.05 - - - - - - - 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.0 3.78 - - - - 1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.28 2.9 0.71 - - - - - - - - - - -0.24 - 3.32 - 2.12 - - - - - - 3.97 - 1.14 - -0.41 - - - - - 1.43 - - - - - - - - - - - -
- -0.39 - - - - - - - - - - - - -1.76 4.97 3.06 2.25 - - - - - - -0.51 0.79 - - - -2.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.25 - - - - - - 5.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.23 2.92 2.8 - - - - - - - - - - - 1.45 1.44 2.65 - - - - - - 3.22 2.77 2.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.01 -2.31 -4.41 -6.98 2.98 0.91 -0.04 0.26 0.63 -1.97 -6.06 -5.82 -1.82 -3.23 -1.59 4.9 -2.82 -8.94 -2.36 -5.62 -8.59 -6.0 -4.63 -7.99 -4.6 -7.31 -5.41 -8.79 -3.87 -5.35 -4.25 -9.12 -5.98 -8.6 -8.94 -9.45 -8.61 -4.14 -6.38 -3.63 -5.61 -3.25 -2.18 -3.77 -5.36 -4.44 -4.07 -3.86
1.06 - -1.38 -5.38 1.82 1.2 0.33 0.3 1.02 -3.4 - - -3.52 -5.77 -1.81 5.05 -1.93 -4.96 -1.94 -2.22 -3.09 -2.1 -2.29 -6.43 -5.7 -4.84 -7.38 - - - -8.03 - - - - - - - - -5.83 - -5.8 -3.53 -5.2 - - -7.35 -
- - 1.04 - - - - - 1.05 - - - - - - 4.59 3.43 - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.19 -1.82 2.8 4.12 1.34 0.61 0.79 2.84 - - - - - -3.65 - 2.52 -0.81 - - - - - - - 1.17 - - - -2.99 - - - - - - - - - - - - - - -1.13 - - -
0.17 -7.0 -0.19 2.61 -1.88 2.81 0.91 2.66 2.96 - - - -4.92 -7.04 -7.25 -3.08 1.46 -3.31 -0.03 -3.42 -5.75 - 0.57 -4.71 0.99 2.8 1.01 -6.96 -7.6 -9.17 -6.27 - - - - - - - - - - -7.02 - -7.47 - - -6.99 -
- - 3.26 4.52 - - - - - - - - - - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.01 0.03 - 0.36 -0.15 - - - -1.27 - - - - 5.12 1.64 -0.39 - - - - - - - 2.0 - - - - -1.55 - -1.94 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.22 3.84 - - - 2.82 1.18 - - - - - - 3.44 3.09 - - - - - - 1.07 - 0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.5 -0.75 -0.3 -1.54 - - - - - - - - -1.29 5.16 0.44 -0.54 0.57 1.63 - 0.3 - -2.79 - -0.6 - - - -5.29 -2.73 - - -2.27 - - - - -2.1 - - - - - - -3.07 - -
- 0.53 1.0 3.66 -2.28 -0.44 2.23 1.39 -0.29 - - - - - - 3.25 2.56 -1.31 - - - - - -0.73 - 2.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.82 - - 1.86 - - - - 1.45 - - - - - - 4.73 0.98 - - - 0.85 - 2.05 - 1.51 0.6 - - 0.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.84 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.35 -0.5 0.52 1.36 - - - - - - 0.28 - - - 4.79 2.7 0.82 - - - - - 0.67 - 0.59 - - - - - -0.49 - - - - - - - - - - - - - - -0.02 -
1.65 -3.48 -4.47 - 1.87 1.37 0.52 0.77 0.37 -0.34 -4.74 -5.13 -0.76 0.37 -0.93 4.57 -3.69 -7.96 -1.66 -5.85 - -8.24 -3.0 - -9.08 -6.49 - -7.83 -9.79 -3.05 -0.12 -5.47 -3.82 -6.3 -8.0 -8.07 -6.09 0.45 -6.63 -0.89 -0.67 -3.46 -0.76 -2.57 -3.67 0.67 -2.49 -5.81
- - 2.57 1.39 -2.43 - - - - - - - - - -2.66 5.01 1.86 - - - - - - - - 1.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.26 4.52 - - - - - - - - - - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.